1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_147 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.08 0.28 0.23 -0.04 -0.31 -0.25 0.06 0.28 0.24 0.2 0.21 0.3 -0.56 -0.95 -0.3 -0.2 -0.07 -0.7 0.15 0.03 0.15 0.12 -0.94 0.1 0.14 0.27 0.28 0.22 0.09 -0.25
0.01 0.08 0.2 0.05 -0.29 -0.03 0.32 0.3 0.31 0.11 0.23 0.25 -0.36 -1.86 -0.21 -0.01 0.03 -1.7 0.19 0.12 0.2 0.16 -0.86 0.06 0.16 0.22 0.23 0.2 -0.02 -0.19
0.2 0.24 0.23 0.06 0.32 -0.02 0.13 0.18 0.33 0.33 0.16 0.19 -0.16 -1.03 -0.34 -0.29 -0.25 -1.13 0.03 -0.04 -0.09 -0.08 -0.89 0.02 0.11 0.07 0.11 0.37 0.32 -0.44
0.15 0.15 0.16 -0.01 0.19 -0.06 0.1 0.1 0.27 0.23 0.12 0.18 -0.3 -0.7 -0.26 -0.22 -0.19 -1.04 0.09 0.06 0.04 0.03 -0.71 0.15 0.14 0.07 0.11 0.33 0.23 -0.32
-0.11 0.01 0.08 -0.08 -0.06 -0.17 0.06 -0.09 0.44 0.36 0.29 0.26 -0.23 -1.35 -0.31 -0.2 -0.13 -1.29 0.31 0.27 0.23 0.21 -0.83 0.15 0.31 0.31 0.34 0.07 0.06 -0.63
0.14 0.11 0.07 -0.03 -0.15 0.07 0.27 0.25 0.18 0.03 0.03 0.14 -0.15 -0.28 -0.1 -0.04 -0.13 -1.01 0.1 0.06 0.02 0.04 -0.57 0.1 0.09 0.1 0.13 0.09 0.11 -0.25
0.08 0.16 0.11 -0.06 0.12 -0.02 0.11 0.08 0.33 0.27 0.17 0.23 -0.23 -0.61 -0.27 -0.22 -0.17 -1.17 0.18 0.16 0.11 0.14 -0.78 0.22 0.17 0.09 0.12 0.18 0.07 -0.64
0.15 0.19 0.15 -0.07 0.08 -0.0 0.2 0.21 0.21 0.09 0.14 0.15 -0.26 -0.42 -0.2 -0.23 -0.14 -1.2 0.03 -0.02 -0.04 0.03 -0.25 0.07 0.13 0.06 0.05 0.28 0.08 -0.14
0.16 0.06 0.08 -0.05 0.08 -0.16 0.08 -0.04 0.1 0.13 0.18 0.17 0.05 -0.67 -0.19 -0.12 -0.05 -0.92 0.02 -0.02 0.03 0.08 -0.59 0.2 0.22 0.13 0.04 0.29 0.21 -0.15
0.11 0.09 0.16 -0.17 0.23 -0.15 0.13 -0.06 0.46 0.38 0.28 0.33 -0.29 -1.95 -0.43 -0.22 -0.15 -1.36 0.15 0.12 0.03 0.05 -0.76 0.16 0.28 0.21 0.15 0.29 0.23 -0.36
0.04 0.11 0.13 -0.06 0.11 0.08 0.27 0.35 0.35 0.33 0.21 0.24 -0.34 -0.8 -0.32 -0.2 -0.23 -1.04 0.15 0.11 0.07 0.06 -1.13 0.03 0.13 0.16 0.15 0.16 0.15 -0.54
0.15 0.11 0.23 0.27 0.1 -0.12 0.14 -0.06 0.47 0.45 0.17 0.24 -0.27 -1.62 -0.47 -0.17 -0.17 -1.44 0.08 0.01 -0.02 -0.16 -0.75 -0.05 0.19 0.23 0.29 0.3 0.27 -0.29
0.19 0.12 0.15 -0.01 0.01 -0.17 -0.04 -0.15 0.19 0.15 0.09 0.17 0.04 -0.48 -0.19 -0.22 -0.17 -0.55 0.06 0.11 0.01 0.08 -0.29 0.04 0.13 -0.03 -0.01 0.29 0.2 -0.1
0.21 0.07 0.12 -0.06 -0.01 0.03 0.19 -0.08 0.27 0.19 0.1 0.22 -0.17 -0.22 -0.1 -0.11 -0.11 -0.72 0.16 0.01 -0.07 -0.04 -0.6 -0.03 0.06 -0.06 0.06 0.1 0.19 -0.03
0.2 0.15 0.21 0.01 0.05 -0.01 0.23 0.26 0.28 0.26 0.04 0.06 -0.37 -0.72 -0.29 -0.19 -0.31 -1.21 0.15 0.08 0.06 0.04 -0.76 0.07 0.15 0.13 0.21 0.24 0.28 -0.42
-0.01 0.13 0.03 -0.03 -0.02 0.06 0.23 0.24 0.35 0.3 0.18 0.23 -0.23 -0.35 -0.2 -0.11 -0.11 -1.11 0.11 0.1 0.05 0.11 -0.9 0.1 0.18 0.21 0.17 0.02 -0.04 -0.66
0.1 0.13 0.42 0.36 -0.68 -0.36 0.43 0.6 0.7 0.43 0.39 0.34 -0.85 -2.09 -0.62 -0.47 -0.35 -2.27 0.18 0.14 0.1 0.15 -1.09 -0.06 0.21 0.11 0.18 0.38 0.16 -0.67
0.09 0.13 0.23 0.08 -0.05 -0.07 0.2 0.18 0.19 0.05 0.17 0.17 -0.22 -1.56 -0.2 -0.15 -0.05 -1.27 0.28 0.16 0.14 0.16 -0.73 0.12 0.24 0.19 0.21 0.26 -0.04 -0.42
0.11 0.12 0.19 0.03 0.07 -0.1 0.1 0.08 0.37 0.32 0.26 0.29 -0.08 -1.07 -0.27 -0.22 -0.14 -1.26 0.11 0.08 0.03 0.04 -0.66 0.08 0.17 0.09 0.13 0.26 0.12 -0.47
0.02 0.08 0.23 0.15 0.06 -0.04 0.24 0.39 0.41 0.35 0.14 0.18 -0.36 -1.38 -0.43 -0.28 -0.32 -0.92 0.12 0.11 0.07 -0.0 -0.86 0.0 0.18 0.18 0.26 0.2 0.23 -0.47
0.16 0.26 0.22 0.06 -0.18 -0.06 0.03 0.01 0.39 0.35 0.25 0.25 -0.26 -0.56 -0.18 -0.11 -0.18 -1.09 0.07 -0.0 0.03 0.01 -0.76 0.02 0.08 0.16 0.14 0.34 0.1 -0.56
0.09 0.17 0.09 0.02 -0.0 -0.14 0.18 0.1 0.12 0.08 0.09 0.1 -0.11 -0.48 -0.14 -0.13 -0.12 -0.59 -0.01 -0.01 0.07 0.07 -0.66 0.2 0.23 0.08 0.14 0.16 0.12 -0.14
0.21 0.11 0.11 -0.09 0.02 -0.01 0.36 0.22 0.38 0.26 0.17 0.2 -0.19 -1.08 -0.2 -0.17 -0.22 -1.15 -0.02 0.02 -0.09 0.01 -0.7 0.12 0.14 0.09 0.11 0.28 0.23 -0.32
0.15 0.1 0.21 0.1 0.01 -0.29 0.0 0.15 0.31 0.21 0.22 0.1 -0.26 -0.95 -0.23 -0.16 -0.02 -0.69 0.06 0.13 0.09 0.12 -0.65 -0.08 0.07 0.27 0.3 0.1 -0.19 -0.0
0.21 0.27 0.19 -0.04 -0.36 -0.06 0.26 0.37 0.26 0.21 0.11 0.19 -0.08 -0.58 -0.2 -0.2 -0.25 -1.01 0.01 -0.02 -0.01 0.05 -0.68 0.09 0.07 0.1 0.14 0.44 0.05 -0.48
0.08 0.09 0.21 0.23 -0.03 0.04 0.22 0.32 0.44 0.39 0.25 0.27 -0.32 -1.17 -0.26 -0.1 -0.04 -1.26 0.02 -0.03 0.02 -0.05 -0.55 -0.06 0.15 0.1 0.13 0.23 -0.05 -0.68
0.18 0.25 0.13 0.03 0.11 0.13 0.16 -0.02 0.27 0.2 0.05 0.09 -0.35 -0.35 -0.18 -0.07 -0.22 -1.05 0.04 0.07 0.07 0.06 -0.88 0.1 0.15 0.19 0.19 0.16 0.1 -0.5
0.16 0.11 0.29 0.07 0.41 -0.16 0.21 0.21 0.31 0.15 0.13 0.17 -0.25 -1.75 -0.6 -0.46 -0.38 -0.86 0.11 0.06 -0.05 -0.03 -0.78 0.1 0.22 0.1 0.13 0.56 0.32 -0.35
0.08 -0.02 0.06 -0.04 -0.24 -0.27 0.09 0.33 0.43 0.35 0.37 0.44 -0.54 -0.71 -0.35 -0.35 -0.34 -0.19 0.04 -0.04 -0.04 -0.04 -0.67 0.1 0.21 0.19 0.26 0.47 0.07 -0.84
0.1 0.12 0.12 0.13 0.19 -0.0 0.07 0.08 0.06 -0.01 -0.01 -0.01 -0.08 -0.4 -0.05 0.03 -0.0 -0.5 0.06 -0.02 0.03 0.08 -0.56 -0.04 0.05 0.08 0.16 0.16 0.06 -0.21
0.06 -0.07 0.18 0.03 0.21 -0.16 0.28 0.03 0.38 0.31 0.34 0.3 -0.21 -2.48 -0.66 -0.41 -0.29 -1.43 0.13 0.15 0.0 -0.01 -0.67 0.22 0.35 0.13 0.19 0.42 0.27 -0.2
0.35 0.21 0.07 -0.1 -0.01 -0.35 -0.13 -0.05 0.45 0.35 0.24 0.23 -0.4 -0.28 -0.07 -0.21 -0.11 -0.74 -0.07 0.03 -0.02 0.0 -0.77 -0.0 0.16 0.05 0.08 0.49 0.2 -0.51
0.12 0.11 0.24 0.12 -0.16 -0.25 0.04 -0.0 0.46 0.3 0.33 0.33 -0.17 -1.29 -0.26 -0.23 -0.13 -1.02 0.15 0.12 0.07 0.07 -0.77 0.09 0.15 0.11 0.17 0.23 0.12 -0.37
0.18 0.29 0.26 0.01 0.32 -0.01 0.21 0.13 0.39 0.41 0.09 0.22 -0.13 -2.28 -0.55 -0.36 -0.36 -0.68 -0.02 -0.03 -0.12 -0.05 -0.59 -0.03 0.09 0.02 0.1 0.45 0.39 -0.39
0.11 0.16 0.02 -0.35 0.02 -0.09 0.19 -0.08 0.42 0.4 0.26 0.38 -0.23 -0.69 -0.34 -0.28 -0.26 -0.91 0.13 0.11 0.04 0.09 -0.72 0.22 0.19 0.15 0.13 0.35 0.12 -0.72
0.16 0.17 0.19 -0.02 0.03 0.12 0.25 0.04 0.24 0.14 0.14 0.16 -0.15 -0.8 -0.08 -0.05 -0.06 -1.45 0.08 0.04 -0.01 0.06 -0.49 0.23 0.21 0.06 0.06 0.16 0.06 -0.56
0.05 0.07 0.17 0.09 0.2 -0.11 0.14 0.25 0.23 0.12 0.17 0.23 -0.06 -0.56 -0.25 -0.2 -0.04 -0.56 -0.02 -0.15 -0.1 -0.04 -0.82 -0.04 0.11 0.09 0.09 0.11 0.14 0.1
0.24 0.23 -0.01 -0.21 -0.07 -0.12 -0.04 -0.24 0.2 0.24 0.14 0.28 -0.2 -0.21 -0.09 -0.11 -0.03 -0.85 0.11 -0.01 0.08 0.04 -0.64 0.24 0.08 0.08 -0.0 0.19 0.24 -0.15
0.01 -0.14 0.14 0.04 -0.15 -0.26 0.18 0.09 0.53 0.35 0.41 0.43 -0.14 -2.16 -0.46 -0.2 -0.08 -1.83 0.13 0.12 0.06 0.03 -0.78 0.18 0.34 0.12 0.19 0.33 0.22 -0.3
0.18 0.14 0.13 0.08 -0.07 -0.02 0.24 0.22 0.16 0.03 0.09 0.09 -0.12 -0.24 -0.14 -0.03 -0.04 -0.85 0.02 -0.0 0.07 0.03 -0.69 -0.09 0.01 0.02 0.14 0.14 0.13 -0.11
-0.01 0.12 0.05 -0.07 0.05 -0.08 0.17 0.19 0.44 0.4 0.13 0.15 -0.34 -0.77 -0.29 -0.12 -0.25 -1.19 0.22 0.23 0.17 0.06 -0.62 0.14 0.18 0.23 0.25 -0.01 0.03 -0.67
0.04 -0.13 0.14 0.22 0.12 -0.1 0.18 0.01 0.41 0.24 0.29 0.16 -0.14 -1.12 -0.18 -0.16 -0.13 -0.77 0.03 0.04 -0.01 0.01 -0.21 -0.06 0.07 0.13 0.06 0.25 0.11 -0.31
0.05 0.06 0.27 0.15 -0.01 -0.11 0.18 0.32 0.22 0.02 0.17 0.14 -0.36 -1.31 -0.31 -0.15 -0.12 -1.04 0.23 0.19 0.17 0.15 -0.65 0.01 0.23 0.18 0.26 0.22 -0.03 -0.36
0.19 0.28 0.18 0.03 0.17 0.13 0.19 0.19 0.34 0.26 0.17 0.26 -0.38 -0.59 -0.25 -0.14 -0.21 -1.37 0.05 -0.03 -0.03 -0.07 -0.99 0.03 -0.0 0.01 0.05 0.24 0.29 -0.21
0.09 0.04 0.13 0.02 -0.41 -0.21 0.15 0.07 0.29 0.15 0.26 0.31 -0.2 -0.58 -0.17 -0.2 -0.11 -1.0 0.15 0.11 0.04 0.06 -0.61 0.18 0.19 0.15 0.16 0.2 0.17 -0.28
0.16 0.08 0.05 0.01 0.03 0.0 0.2 0.13 0.2 0.19 0.05 0.13 -0.13 -0.16 -0.18 -0.09 -0.17 -0.71 -0.07 -0.06 -0.01 -0.09 -0.19 0.02 -0.02 -0.02 -0.01 0.17 0.24 -0.05
-0.15 -0.11 0.11 -0.07 -0.28 -0.03 0.39 0.05 0.46 0.3 0.35 0.42 -0.35 -2.2 -0.29 -0.09 -0.07 -1.73 0.24 0.17 0.21 0.14 -1.2 0.13 0.22 0.25 0.3 0.11 0.08 -0.1
0.11 0.21 0.13 -0.03 0.0 0.04 0.14 0.04 0.23 0.19 0.11 0.17 -0.28 -0.2 -0.23 -0.22 -0.17 -1.03 0.11 0.06 0.06 0.06 -0.71 0.18 0.12 0.13 0.13 0.17 0.15 -0.4

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.