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Heatmap: Cluster_122 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.52 0.34 0.19 0.24 0.2 -0.18 -0.03 -0.04 -0.08 0.08 -0.13 -0.19 -0.06 -0.64 -0.33 -0.2 -0.14 -0.29 -0.41 -0.49 -0.19 -0.17 0.02 -0.08 0.06 -0.13 -0.11 0.45 0.49 0.44
0.08 0.13 0.12 0.52 0.23 -0.63 -0.74 -0.42 -0.05 0.17 -0.11 -0.04 0.37 -0.22 -0.71 -0.27 -0.2 0.2 -0.23 -0.33 -0.0 -0.2 -0.0 -0.12 0.04 0.17 0.24 0.38 0.31 0.33
0.13 0.16 0.34 0.58 0.02 0.01 -0.3 0.43 -0.1 -0.01 -0.33 -0.19 -0.22 -0.14 -0.02 0.26 0.16 -0.09 -0.41 -0.47 -0.1 -0.2 0.14 -0.32 -0.31 -0.14 0.07 0.22 0.17 0.02
-0.04 0.17 0.27 0.47 0.04 -0.17 -0.61 0.06 -0.07 -0.07 -0.23 -0.11 0.2 0.28 0.06 -0.05 0.04 -0.06 -0.26 -0.19 -0.08 -0.29 -0.22 -0.32 -0.12 -0.09 0.18 0.14 0.2 0.35
0.23 0.19 0.54 0.89 0.06 -0.33 -0.51 0.21 -0.2 -0.19 0.04 0.06 -0.27 -0.89 -0.12 -0.07 -0.01 -0.56 -0.68 -0.29 0.0 -0.18 -0.24 -0.22 -0.11 -0.06 0.34 0.36 0.42 0.17
0.04 -0.01 0.03 0.16 -0.14 -0.25 -0.11 -0.02 0.06 0.11 0.07 -0.03 0.03 0.13 0.02 0.01 0.03 -0.03 -0.13 -0.14 -0.02 0.02 0.14 -0.2 -0.1 -0.0 0.07 0.06 -0.04 0.15
0.31 0.4 0.25 0.22 0.11 -0.25 -0.3 -0.07 -0.13 -0.05 -0.15 -0.13 -0.02 0.21 0.01 -0.03 -0.07 -0.44 -0.47 -0.49 -0.17 -0.12 0.36 -0.15 -0.14 -0.09 0.02 0.26 0.25 0.27
-0.23 0.39 0.49 1.08 -0.49 -0.63 -0.78 0.27 -0.38 -0.29 -0.04 0.04 0.26 -0.72 -0.25 -0.04 -0.01 -0.25 -0.37 -0.61 -0.1 -0.07 -0.09 -0.17 -0.02 0.06 0.31 0.52 0.23 0.16
0.25 0.23 0.11 0.49 0.04 -0.41 -0.41 -0.13 -0.2 0.09 -0.17 -0.17 -0.0 -0.04 -0.2 -0.16 -0.12 0.28 -0.25 -0.42 0.06 -0.12 0.23 -0.01 -0.07 -0.02 0.18 0.29 0.14 0.05
-0.14 0.1 0.11 0.92 -0.01 -0.78 -0.84 0.19 -0.16 0.11 -0.11 -0.04 -0.08 -0.48 -0.3 -0.19 -0.12 0.22 -0.31 -0.43 0.05 0.01 0.25 0.11 -0.02 -0.08 0.3 0.3 0.31 -0.05
0.2 0.12 0.03 0.1 0.05 -0.26 -0.19 0.11 -0.08 0.11 0.03 -0.07 0.04 0.25 0.1 -0.05 -0.04 -0.14 -0.07 -0.18 0.0 0.03 0.0 -0.13 -0.17 -0.11 0.09 0.07 0.02 -0.0
0.25 0.23 -0.03 0.12 -0.1 -0.04 -0.19 -0.13 0.13 0.09 -0.13 -0.08 -0.13 0.6 -0.07 -0.06 -0.05 -0.19 -0.2 -0.32 -0.09 -0.11 0.2 0.02 -0.14 -0.06 -0.04 0.25 0.09 -0.19
0.22 0.2 0.43 0.79 -0.25 -0.51 -0.65 0.41 0.18 -0.0 0.03 -0.19 0.03 -0.85 -0.22 -0.07 0.09 0.29 -0.18 -0.17 -0.17 -0.31 0.32 -0.68 -0.38 -0.24 -0.02 0.35 0.07 0.2
0.15 0.17 0.21 0.41 0.16 -0.24 -0.19 0.12 -0.14 -0.02 -0.12 -0.14 0.09 -0.26 -0.02 -0.08 -0.04 -0.15 -0.29 -0.28 -0.1 -0.09 0.24 -0.2 -0.08 -0.05 0.08 0.19 0.16 0.17
0.32 0.29 0.38 0.42 0.03 -0.28 -0.24 -0.07 -0.11 0.1 0.03 -0.01 0.08 -0.37 -0.17 -0.26 -0.08 -0.46 -0.33 -0.35 -0.0 -0.09 -0.31 -0.15 -0.05 0.01 -0.02 0.43 0.36 0.22
-0.09 0.16 0.15 0.42 -0.07 -0.36 -0.39 0.37 -0.31 -0.2 -0.17 -0.25 0.18 0.41 -0.13 -0.16 -0.07 0.35 -0.45 -0.33 0.05 -0.2 0.46 -0.35 -0.06 0.01 0.13 -0.07 0.06 0.2
0.03 0.0 -0.09 0.68 -0.09 -0.27 -0.41 0.24 -0.1 -0.3 -0.06 -0.3 0.29 -0.03 -0.16 0.17 -0.0 0.16 -0.14 -0.34 -0.31 -0.03 0.43 -0.13 0.03 -0.26 -0.08 -0.03 0.03 0.42
0.01 -0.01 0.04 0.03 -0.02 -0.22 -0.11 0.24 -0.12 -0.09 -0.07 -0.09 0.28 -0.08 0.15 -0.03 0.04 0.15 -0.18 -0.13 -0.04 0.0 0.35 -0.26 -0.17 -0.07 0.07 -0.04 -0.06 0.2
0.02 0.18 0.27 0.27 0.02 -0.22 -0.26 0.02 0.15 0.28 -0.14 -0.05 -0.14 -0.65 0.06 0.04 -0.01 -0.33 -0.23 -0.33 -0.08 -0.22 0.26 -0.18 -0.07 0.0 -0.01 0.31 0.38 0.15
0.57 0.57 0.39 0.58 0.08 0.04 -0.1 0.22 -0.2 -0.23 -0.1 -0.21 -0.08 -0.29 -0.13 -0.22 -0.21 -0.35 -0.78 -0.65 -0.27 -0.14 0.26 -0.17 -0.18 -0.35 -0.13 0.39 0.29 0.23
0.37 0.34 0.09 0.34 -0.05 -0.25 -0.15 0.01 -0.03 0.01 -0.09 -0.18 0.05 0.27 -0.07 -0.12 -0.12 -0.01 -0.3 -0.33 -0.13 -0.13 0.44 -0.25 -0.2 -0.14 -0.01 0.2 0.07 -0.05
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-0.12 0.14 0.36 0.83 -0.04 -0.26 -0.8 0.15 -0.1 -0.06 -0.14 -0.29 0.06 -0.8 -0.04 -0.06 0.06 -0.13 -0.23 -0.22 0.03 -0.13 0.46 -0.75 -0.19 0.18 0.24 -0.18 0.31 0.47
-0.14 0.07 0.03 0.34 -0.07 -0.08 -0.43 0.34 -0.41 -0.15 -0.32 -0.23 0.24 0.33 0.03 0.1 0.19 0.4 -0.26 -0.34 0.14 -0.02 0.33 -0.31 -0.19 -0.24 -0.12 -0.05 -0.16 0.35
0.31 0.33 0.25 0.43 -0.01 -0.17 -0.11 0.21 0.11 0.06 -0.09 -0.09 -0.16 0.11 0.01 -0.12 -0.13 -0.6 -0.36 -0.34 -0.18 -0.13 -0.25 -0.23 -0.19 -0.01 0.1 0.3 0.24 0.15
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0.29 0.33 0.24 0.47 0.2 -0.56 -0.61 -0.43 -0.23 0.1 -0.17 -0.15 0.41 -0.07 -0.29 -0.29 -0.31 0.19 -0.48 -0.57 -0.06 -0.18 -0.05 -0.27 -0.15 0.04 0.34 0.31 0.49 0.38
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Spov3_S08.00053 (TFIIIA)
 0.12 0.11 0.04 0.27 0.04 -0.22 -0.12 0.42 -0.32 -0.43 -0.2 -0.35 0.12 0.11 0.15 0.07 0.18 0.27 -0.15 -0.22 0.01 -0.13 0.27 -0.11 -0.22 -0.15 0.02 -0.03 -0.21 0.21

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.