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Heatmap: Cluster_117 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.47 0.47 0.04 0.0 0.25 0.04 -0.26 -0.22 -0.23 -0.1 -0.27 -0.18 -0.23 0.98 -0.2 -0.16 -0.19 0.06 -0.48 -0.51 -0.18 -0.15 0.25 -0.11 -0.27 -0.27 -0.26 0.23 0.26 0.14
0.53 0.48 0.09 0.03 0.25 -0.33 -0.44 -0.38 -0.07 0.04 -0.2 -0.12 -0.25 0.9 -0.12 -0.1 -0.11 0.19 -0.3 -0.42 -0.28 -0.32 0.24 -0.04 -0.12 -0.22 -0.17 0.31 0.16 -0.27
0.23 0.25 -0.07 -0.24 0.26 0.19 -0.03 -0.68 0.05 0.08 -0.23 -0.14 -0.38 0.97 0.18 0.09 -0.11 0.21 -0.43 -0.54 -0.21 -0.22 0.46 -0.11 -0.44 -0.06 -0.27 0.14 0.15 -0.25
0.69 0.48 0.01 -0.03 0.35 0.37 -0.68 -1.11 -1.04 -2.37 -0.82 -0.87 0.3 2.09 -0.4 -0.52 -0.67 0.86 -1.28 -0.65 -0.87 -0.56 1.75 -1.19 -1.11 -1.47 -1.0 0.78 -1.03 -0.83
0.62 0.42 0.04 -0.1 0.22 -0.11 -0.22 -0.33 -0.01 0.08 -0.21 -0.04 -0.34 0.97 -0.14 -0.28 -0.48 0.63 -0.27 -0.36 -0.31 -0.32 0.02 -0.15 -0.43 -0.18 -0.27 0.38 0.11 -0.29
0.61 0.41 -0.02 -0.11 0.26 -0.14 -0.41 -0.38 -0.21 -0.11 -0.21 -0.12 -0.35 0.96 -0.14 -0.29 -0.07 0.44 -0.41 -0.36 -0.13 -0.31 0.17 -0.07 -0.23 -0.28 -0.09 0.31 0.22 -0.14
0.22 0.16 -0.02 0.0 0.22 -0.03 -0.17 -0.29 0.03 0.11 -0.14 -0.18 -0.28 0.91 -0.06 -0.05 -0.08 0.14 -0.24 -0.39 -0.17 -0.17 0.39 -0.18 -0.21 -0.04 -0.2 0.03 0.23 -0.26
0.28 0.23 -0.31 -0.66 0.79 -0.18 -0.3 -0.63 -0.14 -0.13 -0.28 -0.03 -0.19 0.96 -0.31 -0.21 -0.3 0.86 -0.29 0.0 -0.34 -0.28 0.83 0.48 -0.32 -0.32 -0.61 -0.15 -0.22 -0.42
0.39 0.27 0.0 0.02 0.18 -0.19 -0.14 0.05 -0.19 -0.0 -0.16 -0.12 -0.16 0.63 -0.1 -0.22 -0.1 -0.06 -0.22 -0.38 -0.12 -0.14 0.28 -0.08 -0.15 -0.16 -0.14 0.34 0.14 0.02
0.4 0.43 -0.0 0.05 0.18 -0.09 -0.23 -0.32 -0.06 0.09 -0.17 -0.13 -0.26 0.69 0.07 0.03 -0.0 -0.04 -0.35 -0.47 -0.17 -0.21 0.16 -0.07 -0.28 -0.11 -0.09 0.24 0.14 -0.07
0.49 0.17 -0.18 -0.18 0.22 -0.05 0.01 -0.23 -0.3 -0.14 -0.22 -0.36 -0.17 0.89 -0.03 -0.1 -0.16 0.0 -0.22 -0.21 -0.12 -0.26 0.38 -0.12 -0.21 -0.22 -0.32 0.6 0.12 -0.02
0.36 0.42 -0.02 -0.21 0.0 -0.25 -0.2 0.07 -0.33 -0.24 -0.29 -0.27 0.03 1.13 0.03 -0.18 -0.2 0.26 -0.41 -0.35 -0.31 -0.25 0.38 -0.2 -0.06 -0.2 -0.18 0.44 -0.07 -0.18
0.37 0.39 -0.02 -0.04 0.19 -0.1 -0.2 -0.09 -0.03 0.03 -0.32 -0.19 -0.38 0.96 0.03 0.01 -0.05 0.22 -0.44 -0.49 -0.16 -0.31 0.15 -0.13 -0.34 -0.15 -0.16 0.16 0.23 -0.08
0.32 0.32 -0.23 -0.66 0.37 0.13 -0.17 -0.9 0.07 0.3 -0.13 -0.08 -0.48 1.16 -0.09 -0.04 -0.2 0.21 -0.39 -0.47 -0.22 -0.35 0.45 -0.05 -0.19 -0.08 -0.26 0.24 0.16 -0.39
0.09 -0.04 -0.35 -0.49 0.46 0.1 0.11 -0.19 -0.25 0.11 -0.17 -0.09 -0.3 0.82 0.1 -0.11 0.04 0.41 -0.2 -0.28 0.01 -0.16 0.12 -0.12 -0.13 0.18 -0.03 -0.15 -0.05 -0.16
-0.15 0.46 -0.25 -0.53 0.2 0.09 -0.23 -0.23 -0.27 -0.48 -0.41 -0.48 -0.18 1.13 0.11 0.21 -0.05 0.16 -0.67 -0.54 -0.13 -0.12 0.57 -0.12 -0.34 -0.42 -0.19 0.78 -0.1 0.31
0.26 0.24 -0.01 -0.22 0.54 0.11 -0.28 -0.44 -0.04 0.12 -0.04 -0.08 -0.16 0.69 -0.03 -0.07 0.0 0.12 -0.25 -0.29 -0.09 -0.19 0.23 -0.13 -0.3 -0.16 -0.05 0.01 -0.07 -0.05
0.4 0.25 0.09 -0.05 0.2 0.04 -0.22 -0.16 -0.15 -0.03 -0.29 -0.14 -0.3 0.95 -0.12 -0.17 -0.04 0.22 -0.42 -0.55 -0.27 -0.28 0.47 -0.13 -0.38 -0.1 -0.26 0.26 0.15 0.01
0.5 0.31 -0.15 -0.48 0.76 0.09 0.03 -0.63 -0.48 -0.18 -0.54 -0.02 -0.82 0.86 -0.26 -0.5 -0.17 1.12 -0.67 -0.37 -0.19 -0.48 0.62 0.03 -0.16 -0.56 -0.44 0.28 0.1 -0.16
0.07 -0.09 -0.71 -2.43 1.27 -0.51 -0.57 -0.7 -0.62 -0.31 -0.95 -0.9 0.0 1.93 0.23 -0.14 -1.31 1.37 -1.46 -0.46 -0.01 0.09 0.74 0.13 -1.9 -0.12 -1.46 0.36 0.45 -1.66
0.51 0.49 0.02 -0.28 0.87 0.08 -0.17 -0.57 -0.42 -0.0 -0.39 -0.38 -0.19 1.23 -0.19 -0.26 -0.25 -0.02 -0.5 -0.73 -0.47 -0.36 0.62 -0.25 -0.44 -0.28 -0.37 0.55 0.03 -0.22
0.2 0.51 -0.43 -0.83 1.09 0.25 -0.77 -0.55 -0.49 -0.33 -1.18 -0.94 -1.46 1.85 -0.0 -0.06 -0.43 -0.26 -0.69 -0.7 -0.2 -0.28 0.7 -0.37 -1.12 -0.41 -0.67 1.2 -0.14 0.26
-0.03 0.11 -0.49 -0.69 0.61 0.07 -0.02 -0.38 -0.34 -0.2 -0.31 -0.2 0.01 0.99 -0.06 -0.19 -0.23 0.7 -0.06 -0.17 -0.19 -0.08 0.58 0.21 -0.36 -0.29 -0.31 0.16 0.05 -0.43
Spov3_chr4.03291 (ICME-LIKE2)
 0.53 0.28 0.08 0.12 0.41 -0.18 -0.46 -0.23 0.02 0.17 -0.11 -0.16 -0.55 0.93 -0.27 -0.1 -0.18 0.15 0.03 -0.19 -0.16 -0.27 -0.29 -0.16 -0.27 0.02 0.05 0.2 -0.22 -0.19
0.44 0.25 -0.43 -0.37 0.71 0.29 -0.44 -0.84 -0.33 -0.41 -0.33 -0.27 -0.41 1.23 0.02 -0.01 -0.08 0.46 -0.24 -0.33 -0.48 -0.24 0.86 -0.04 -0.45 -0.41 -0.31 0.39 -0.23 -0.45
0.35 0.68 0.01 -0.35 0.52 -0.14 -0.13 -0.17 -0.33 -0.36 -0.53 -0.56 -0.46 1.38 -0.05 -0.46 -0.4 0.21 -0.58 -0.4 -0.69 -0.58 0.78 -0.51 -0.47 -0.5 -0.35 1.07 0.12 -0.4
0.32 0.29 -0.04 -0.39 0.31 0.03 -0.13 -0.2 -0.08 0.2 -0.22 -0.14 -0.52 1.1 -0.02 -0.01 -0.1 0.39 -0.47 -0.63 -0.36 -0.55 0.24 -0.05 -0.37 -0.06 -0.25 0.33 0.23 -0.25
0.45 0.23 0.03 -0.4 0.81 -0.34 -0.37 -0.37 0.04 0.33 -0.22 -0.2 -0.58 1.34 -0.06 -0.28 -0.42 0.43 -0.1 -0.18 -0.03 -0.14 -0.2 -0.82 -0.66 -0.05 -0.07 0.22 0.1 -0.79
0.41 0.31 -0.0 -0.14 0.42 -0.01 -0.26 -0.17 -0.24 -0.03 -0.25 -0.24 -0.11 0.91 -0.1 -0.1 -0.28 0.06 -0.51 -0.37 -0.28 -0.21 0.14 -0.16 -0.3 -0.25 -0.11 0.33 0.24 0.29
0.46 0.45 0.05 -0.02 0.28 -0.15 -0.36 -0.16 -0.18 -0.0 -0.21 -0.22 -0.25 0.66 -0.05 -0.16 -0.17 -0.06 -0.2 -0.41 -0.06 -0.26 0.25 0.0 -0.23 -0.2 -0.05 0.37 0.2 -0.03
0.16 0.6 -0.39 -1.05 1.05 -0.4 -0.77 -0.52 -0.4 0.32 -0.87 -0.62 -0.39 1.72 -0.72 -0.6 -0.86 0.95 -0.84 -0.54 -0.67 -0.46 1.02 -0.05 -1.05 -0.56 -0.78 1.02 -0.19 -0.36
0.21 0.23 -0.66 -0.74 1.13 -0.4 -0.48 -0.08 -0.48 0.2 -0.75 -0.93 -0.54 1.46 -0.66 -0.27 -0.49 1.08 -0.21 -0.48 -0.39 -0.76 0.68 0.12 -1.47 -0.82 -0.85 1.01 0.28 -0.36
0.27 0.26 -0.0 -0.34 0.43 0.04 -0.34 -0.39 -0.15 0.05 -0.16 -0.24 -0.43 0.98 0.06 -0.09 -0.06 0.35 -0.25 -0.34 -0.22 -0.19 0.61 -0.1 -0.23 -0.1 -0.31 0.21 0.03 -0.53
0.15 0.18 -0.06 -0.25 0.63 0.13 -0.17 -0.35 -0.16 0.03 -0.19 -0.17 -0.46 0.83 -0.03 0.01 0.04 0.36 -0.1 -0.22 -0.04 -0.16 0.07 -0.11 -0.22 0.01 -0.04 -0.09 -0.18 -0.19
0.37 0.49 0.11 -0.07 -0.05 0.03 -0.24 -0.26 -0.09 -0.02 -0.29 -0.14 -0.25 0.93 -0.17 -0.0 -0.01 0.38 -0.4 -0.46 -0.12 -0.26 0.15 -0.14 -0.36 -0.15 -0.21 0.17 0.14 -0.02
0.06 0.24 0.12 -0.35 0.99 0.19 -0.32 -0.41 0.18 0.23 -0.22 -0.13 -0.45 1.12 -0.26 -0.18 -0.33 0.2 -0.3 -0.5 -0.22 -0.33 0.18 -0.13 -0.48 0.0 -0.21 0.11 0.11 -0.71
0.43 0.8 -0.37 -0.66 0.81 0.29 -0.41 -0.66 -0.32 -0.2 -0.72 -0.38 -1.09 1.36 0.0 0.14 -0.27 0.11 -0.62 -0.74 -0.28 -0.34 0.62 -0.12 -0.56 -0.34 -0.61 0.82 0.07 -0.35
0.35 0.33 -0.11 -0.25 0.45 -0.09 -0.3 -0.42 0.03 0.12 -0.3 -0.18 -0.38 1.13 -0.08 -0.29 -0.3 0.19 -0.36 -0.38 -0.24 -0.32 0.65 0.04 -0.3 -0.23 -0.2 0.32 0.1 -0.51
0.54 0.85 0.4 -0.39 1.15 -0.24 -0.82 -0.62 0.02 0.36 -0.55 -0.41 -0.84 1.55 -0.19 0.02 0.13 0.64 -0.56 -0.9 -0.1 -0.88 -1.08 -1.07 -0.89 -0.14 -0.26 0.09 -0.28 -0.3
0.19 0.26 -0.08 -0.13 0.22 0.16 -0.11 -0.13 -0.22 -0.05 -0.07 -0.16 0.07 0.61 -0.08 -0.11 -0.1 0.23 -0.4 -0.34 -0.25 -0.16 0.05 -0.03 -0.17 -0.13 -0.04 0.24 0.17 0.11
Spov3_chr6.02201 (AUXILIN-LIKE4)
 0.28 0.38 0.22 0.04 0.18 -0.03 -0.3 -0.08 -0.22 -0.06 -0.25 -0.19 -0.14 0.92 -0.06 -0.16 -0.22 -0.19 -0.58 -0.66 -0.12 -0.24 0.31 -0.26 -0.27 -0.19 -0.03 0.32 0.26 0.28
Spov3_chr6.02343 (HSF A4A)
 0.34 0.36 -0.02 0.04 0.26 -0.18 -0.08 -0.37 -0.3 -0.12 -0.16 -0.41 -0.44 0.9 0.13 -0.09 -0.01 0.33 -0.42 -0.32 -0.37 -0.42 0.83 -0.29 -0.39 -0.3 -0.25 0.44 -0.1 -0.03
Spov3_S08.00036 (CAMBP25)
 0.98 0.66 -0.84 -1.74 0.78 -0.26 -0.95 -2.03 -1.65 -0.88 -1.61 -1.58 -0.67 2.41 0.1 -0.32 -0.5 0.14 -1.39 -1.46 -0.95 -1.11 1.45 -0.42 -0.95 -0.78 -1.05 1.54 -0.28 -0.67
0.46 0.4 -0.02 0.01 0.35 0.08 -0.14 -0.23 -0.15 0.09 -0.28 -0.16 -0.36 0.78 0.01 -0.02 -0.21 0.02 -0.29 -0.54 -0.28 -0.32 0.35 -0.11 -0.39 -0.2 -0.23 0.21 0.24 0.03
0.37 0.23 0.04 0.01 0.42 -0.07 -0.36 -0.33 -0.14 0.13 -0.21 -0.31 -0.21 0.94 -0.06 -0.04 -0.07 0.04 -0.25 -0.47 -0.23 -0.29 0.08 -0.14 -0.25 -0.12 -0.1 0.16 0.05 0.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.