1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_117 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
9.09 9.08 6.75 6.59 7.83 6.75 5.47 5.62 5.58 6.15 5.44 5.8 5.6 13.01 5.74 5.87 5.75 6.85 4.72 4.62 5.79 5.93 7.83 6.08 5.44 5.43 5.5 7.71 7.87 7.24
42.32 40.61 31.18 29.84 34.7 23.29 21.59 22.38 27.85 29.94 25.38 26.9 24.5 54.48 26.85 27.31 27.13 33.27 23.79 21.86 24.01 23.43 34.55 28.37 26.82 25.03 25.88 36.22 32.68 24.22
9.24 9.34 7.51 6.69 9.42 8.98 7.69 4.92 8.13 8.3 6.73 7.17 6.07 15.42 8.92 8.39 7.32 9.13 5.87 5.41 6.82 6.78 10.84 7.27 5.79 7.55 6.51 8.68 8.77 6.62
10.59 9.17 6.63 6.42 8.39 8.52 4.09 3.05 3.19 1.27 3.71 3.61 8.12 28.04 4.98 4.58 4.15 11.95 2.71 4.19 3.6 4.48 22.08 2.88 3.04 2.38 3.28 11.27 3.23 3.71
20.6 17.87 13.77 12.47 15.56 12.45 11.5 10.66 13.28 14.14 11.57 13.07 10.58 26.21 12.16 11.05 9.62 20.8 11.11 10.41 10.82 10.77 13.61 12.04 9.95 11.85 11.13 17.48 14.51 10.93
6.39 5.55 4.11 3.87 5.01 3.79 3.14 3.22 3.6 3.87 3.61 3.84 3.27 8.09 3.79 3.41 3.98 5.67 3.14 3.25 3.81 3.37 4.68 3.99 3.57 3.44 3.92 5.17 4.86 3.78
16.24 15.5 13.72 13.93 16.18 13.59 12.4 11.42 14.26 15.02 12.65 12.29 11.45 26.18 13.33 13.41 13.2 15.33 11.82 10.63 12.37 12.33 18.19 12.28 11.99 13.54 12.13 14.17 16.27 11.65
3393.02 3277.68 2255.39 1771.05 4842.71 2479.44 2270.02 1805.38 2545.24 2558.91 2304.05 2755.2 2466.04 5444.35 2267.05 2426.05 2282.35 5094.92 2296.52 2808.1 2219.14 2309.24 4970.01 3906.75 2250.84 2238.23 1836.75 2531.66 2412.21 2088.22
18.89 17.41 14.46 14.66 16.37 12.67 13.05 14.96 12.63 14.42 12.94 13.26 12.94 22.25 13.45 12.41 13.48 13.83 12.4 11.05 13.23 13.09 17.57 13.61 12.96 12.87 13.08 18.27 15.9 14.62
14.86 15.2 11.24 11.68 12.77 10.54 9.58 9.02 10.78 11.99 9.99 10.28 9.41 18.18 11.81 11.47 11.24 10.95 8.85 8.12 9.99 9.71 12.57 10.7 9.27 10.42 10.6 13.24 12.38 10.72
18.66 15.03 11.75 11.77 15.48 12.86 13.41 11.4 10.86 12.06 11.42 10.42 11.89 24.63 13.02 12.44 11.96 13.37 11.44 11.54 12.25 11.12 17.36 12.29 11.55 11.42 10.7 20.22 14.52 13.13
22.17 23.14 17.05 14.95 17.24 14.53 14.96 18.15 13.73 14.65 14.09 14.31 17.62 37.77 17.58 15.25 15.03 20.7 13.02 13.55 13.95 14.52 22.4 15.0 16.48 15.03 15.26 23.45 16.38 15.27
9.09 9.24 6.99 6.85 8.06 6.58 6.16 6.65 6.93 7.19 5.66 6.21 5.42 13.72 7.23 7.1 6.81 8.22 5.22 5.01 6.32 5.71 7.82 6.47 5.56 6.38 6.32 7.9 8.25 6.68
16.35 16.35 11.17 8.33 17.04 14.41 11.65 7.02 13.81 16.17 12.04 12.41 9.4 29.33 12.34 12.78 11.44 15.23 10.02 9.51 11.3 10.29 17.93 12.7 11.53 12.41 10.99 15.48 14.71 9.99
12.6 11.57 9.32 8.43 16.27 12.71 12.79 10.44 9.99 12.77 10.51 11.13 9.62 20.97 12.68 11.0 12.22 15.73 10.31 9.77 11.96 10.61 12.93 10.93 10.87 13.42 11.65 10.67 11.47 10.62
5.25 8.02 4.9 4.04 6.68 6.2 4.95 4.97 4.84 4.18 4.37 4.18 5.15 12.71 6.29 6.73 5.62 6.5 3.65 4.01 5.33 5.36 8.65 5.36 4.6 4.35 5.1 10.01 5.42 7.2
78.48 77.03 64.86 55.94 95.14 70.6 53.84 48.19 63.39 71.02 63.4 62.0 58.48 105.53 63.99 62.36 65.5 71.1 55.02 53.45 61.36 57.37 76.41 59.91 52.95 58.42 63.15 65.99 62.45 63.24
3.13 2.82 2.54 2.29 2.73 2.45 2.04 2.14 2.14 2.32 1.94 2.16 1.93 4.59 2.19 2.11 2.32 2.78 1.78 1.62 1.97 1.97 3.29 2.17 1.83 2.22 1.98 2.86 2.65 2.4
2.81 2.47 1.79 1.43 3.39 2.13 2.04 1.29 1.43 1.76 1.37 1.96 1.13 3.63 1.67 1.41 1.78 4.34 1.25 1.54 1.75 1.43 3.08 2.03 1.78 1.36 1.47 2.42 2.13 1.79
1.57 1.41 0.91 0.28 3.62 1.05 1.01 0.92 0.98 1.2 0.78 0.8 1.5 5.69 1.76 1.36 0.61 3.86 0.54 1.09 1.49 1.6 2.5 1.64 0.4 1.38 0.54 1.92 2.04 0.47
7.81 7.73 5.58 4.54 10.02 5.82 4.89 3.71 4.11 5.48 4.2 4.22 4.8 12.86 4.8 4.59 4.63 5.41 3.88 3.32 3.97 4.28 8.44 4.61 4.06 4.51 4.24 8.05 5.63 4.73
41.9 52.04 27.08 20.58 77.88 43.63 21.41 25.03 26.03 29.02 16.14 19.02 13.33 132.13 36.59 35.03 27.16 30.48 22.67 22.48 31.8 30.09 59.5 28.32 16.86 27.62 22.97 84.37 33.25 43.71
281.83 310.39 204.25 178.86 438.86 301.57 282.64 221.6 227.8 249.6 232.66 250.03 290.27 572.12 275.02 251.85 244.37 468.67 276.55 256.05 252.24 272.54 429.22 333.24 224.22 235.56 232.19 322.16 297.21 213.3
Spov3_chr4.03291 (ICME-LIKE2)
 14.34 12.07 10.51 10.83 13.22 8.77 7.24 8.46 10.1 11.18 9.23 8.93 6.77 19.01 8.24 9.27 8.76 11.06 10.16 8.7 8.87 8.23 8.14 8.88 8.24 10.07 10.29 11.45 8.55 8.72
22.25 19.52 12.13 12.69 26.73 20.0 12.05 9.16 13.03 12.33 12.98 13.57 12.31 38.39 16.63 16.27 15.53 22.51 13.82 12.98 11.72 13.84 29.67 15.92 11.94 12.28 13.22 21.37 13.9 12.0
7.21 9.08 5.71 4.45 8.12 5.14 5.16 5.04 4.51 4.4 3.93 3.85 4.1 14.76 5.48 4.1 4.29 6.55 3.78 4.31 3.52 3.78 9.75 3.98 4.1 3.99 4.45 11.89 6.16 4.29
8.8 8.62 6.86 5.4 8.79 7.22 6.47 6.17 6.67 8.11 6.07 6.43 4.93 15.19 6.99 7.03 6.61 9.26 5.11 4.56 5.49 4.84 8.35 6.81 5.45 6.77 5.95 8.89 8.28 5.93
49.36 42.49 36.98 27.52 63.55 28.59 28.02 28.06 37.27 45.44 31.03 31.47 24.25 91.69 34.73 29.86 27.16 48.7 33.89 31.98 35.39 32.9 31.59 20.46 22.92 35.1 34.58 42.11 38.94 20.97
8.04 7.49 6.03 5.47 8.09 6.01 5.03 5.35 5.1 5.92 5.08 5.11 5.58 11.34 5.64 5.62 4.96 6.3 4.24 4.67 4.95 5.23 6.66 5.4 4.9 5.06 5.61 7.57 7.15 7.37
7.78 7.75 5.86 5.59 6.86 5.12 4.4 5.08 5.01 5.66 4.92 4.88 4.77 8.93 5.47 5.07 5.05 5.43 4.95 4.25 5.44 4.74 6.73 5.68 4.83 4.92 5.49 7.31 6.52 5.55
2.99 4.05 2.04 1.29 5.53 2.03 1.57 1.86 2.03 3.35 1.47 1.74 2.04 8.8 1.63 1.77 1.47 5.17 1.5 1.85 1.68 1.95 5.42 2.58 1.3 1.82 1.56 5.43 2.36 2.09
0.47 0.48 0.26 0.25 0.89 0.31 0.29 0.39 0.29 0.47 0.24 0.21 0.28 1.13 0.26 0.34 0.29 0.87 0.35 0.29 0.31 0.24 0.66 0.45 0.15 0.23 0.23 0.82 0.5 0.32
9.74 9.61 8.02 6.37 10.8 8.26 6.34 6.12 7.24 8.32 7.19 6.8 5.98 15.82 8.38 7.55 7.72 10.22 6.78 6.38 6.93 7.06 12.31 7.49 6.85 7.52 6.47 9.3 8.24 5.59
16.24 16.57 13.99 12.27 22.54 15.97 13.0 11.46 13.07 14.87 12.79 12.96 10.62 26.0 14.27 14.68 15.04 18.7 13.59 12.53 14.17 13.08 15.35 13.56 12.55 14.72 14.23 13.68 12.89 12.78
4.51 4.9 3.77 3.33 3.38 3.57 2.95 2.92 3.28 3.44 2.85 3.16 2.94 6.65 3.11 3.49 3.47 4.54 2.66 2.54 3.22 2.91 3.89 3.17 2.71 3.15 3.02 3.94 3.85 3.45
38.73 43.93 40.35 29.1 73.6 42.25 29.72 27.97 42.03 43.53 31.88 33.83 27.13 80.55 30.97 32.68 29.44 42.71 30.19 26.14 31.91 29.43 41.99 34.0 26.59 37.21 32.14 39.94 40.13 22.62
8.4 10.9 4.84 3.95 10.91 7.62 4.71 3.94 5.01 5.42 3.8 4.81 2.93 16.04 6.25 6.9 5.17 6.73 4.05 3.74 5.15 4.93 9.63 5.73 4.22 4.95 4.1 10.99 6.55 4.9
23.73 23.39 17.3 15.66 25.59 17.51 15.19 13.98 19.09 20.34 15.19 16.51 14.36 40.99 17.62 15.31 15.12 21.23 14.55 14.36 15.81 14.97 29.35 19.24 15.18 15.97 16.2 23.32 19.98 13.08
1.31 1.62 1.19 0.69 2.0 0.76 0.51 0.59 0.92 1.16 0.62 0.68 0.51 2.64 0.79 0.91 0.99 1.41 0.61 0.48 0.84 0.49 0.43 0.43 0.49 0.82 0.75 0.96 0.74 0.73
9.9 10.46 8.21 7.96 10.14 9.74 8.06 7.96 7.47 8.39 8.28 7.8 9.16 13.32 8.25 8.07 8.13 10.19 6.61 6.87 7.32 7.78 9.01 8.53 7.71 7.93 8.44 10.3 9.81 9.4
Spov3_chr6.02201 (AUXILIN-LIKE4)
 5.26 5.65 5.05 4.47 4.92 4.26 3.51 4.1 3.74 4.16 3.65 3.8 3.95 8.23 4.15 3.87 3.73 3.8 2.91 2.75 3.98 3.66 5.39 3.62 3.61 3.81 4.26 5.43 5.19 5.27
Spov3_chr6.02343 (HSF A4A)
 6.21 6.27 4.85 5.04 5.86 4.32 4.65 3.8 3.99 4.51 4.4 3.69 3.6 9.15 5.36 4.61 4.87 6.17 3.67 3.93 3.78 3.66 8.74 4.02 3.75 3.97 4.13 6.65 4.58 4.8
Spov3_S08.00036 (CAMBP25)
 24.49 19.66 6.96 3.72 21.34 10.43 6.43 3.05 3.97 6.74 4.07 4.17 7.85 66.02 13.36 9.98 8.78 13.76 4.75 4.52 6.44 5.78 33.9 9.33 6.45 7.26 6.01 36.14 10.28 7.82
9.42 9.02 6.72 6.85 8.7 7.22 6.21 5.8 6.16 7.29 5.64 6.11 5.31 11.7 6.85 6.74 5.88 6.93 5.57 4.7 5.62 5.48 8.67 6.33 5.21 5.93 5.82 7.89 8.06 6.97
11.93 10.82 9.48 9.3 12.36 8.8 7.23 7.38 8.38 10.12 7.97 7.47 7.97 17.75 8.86 8.98 8.84 9.48 7.8 6.69 7.88 7.59 9.79 8.39 7.78 8.51 8.63 10.36 9.58 11.29

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)