Heatmap: Cluster_146 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0005.00105 (WRKY27)	-0.3	-0.27	-0.04	0.45	-0.5	-0.34	-0.7	0.18	-0.39	-0.6	-0.17	-0.2	0.41	-0.0	0.22	0.15	0.17	0.59	-0.07	-0.1	0.01	0.04	0.96	-0.35	-0.08	0.04	-0.08	-0.31	-0.21	0.17
Spov3_C0258.00004 (ACR4)	0.02	-0.16	-0.06	0.34	-0.51	-0.41	-0.09	0.58	-0.81	-0.91	-0.16	-0.5	0.93	-0.89	0.55	0.45	0.63	-0.91	-0.13	0.17	-0.1	0.18	0.55	-0.05	0.2	-0.14	0.05	-0.3	-0.83	-0.14
Spov3_chr1.00096 (AAC1)	-0.05	-0.01	0.03	0.19	-0.41	-0.32	-0.02	0.44	-0.26	-0.35	-0.09	-0.23	0.35	-0.39	0.39	0.26	0.34	-0.34	-0.02	0.02	0.06	0.11	0.49	-0.23	-0.02	-0.02	0.12	-0.23	-0.46	-0.09
Spov3_chr1.00470 (EIF2 GAMMA)	-0.1	0.03	0.03	0.23	0.07	-0.14	-0.05	0.21	-0.27	-0.26	0.0	-0.3	0.23	0.26	0.26	0.18	0.18	0.21	-0.35	-0.18	-0.06	-0.27	0.43	-0.25	-0.27	-0.18	-0.01	-0.16	-0.09	0.16
Spov3_chr1.00496 (IMPA-4)	-0.11	-0.08	-0.07	0.1	-0.15	-0.25	-0.11	0.25	-0.24	-0.15	-0.07	-0.18	0.42	0.34	0.36	0.2	0.29	-0.16	-0.08	-0.16	-0.11	-0.06	0.37	-0.16	-0.06	-0.17	0.0	-0.13	-0.24	-0.02
Spov3_chr1.01299	-0.11	-0.11	-0.07	0.09	0.01	-0.03	-0.06	0.16	-0.07	-0.1	-0.0	-0.06	0.3	0.31	0.2	0.15	0.2	-0.16	-0.24	-0.22	-0.11	-0.05	0.43	-0.13	-0.1	-0.12	-0.01	-0.04	-0.23	-0.13
Spov3_chr1.01944 (CPK1)	-0.01	-0.08	0.1	0.22	0.13	-0.23	-0.08	0.07	-0.17	-0.22	-0.12	-0.27	0.19	-0.27	0.22	-0.06	0.11	0.05	-0.1	-0.17	-0.11	-0.14	0.65	-0.31	-0.11	-0.04	-0.07	0.02	0.08	0.28
Spov3_chr1.02021 (NAC2)	-0.1	-0.09	-0.0	0.16	-0.15	-0.24	-0.13	0.33	-0.28	-0.25	-0.01	-0.1	0.26	0.44	0.23	0.15	0.24	-0.09	-0.18	-0.21	-0.16	-0.11	0.23	-0.0	-0.01	-0.09	-0.05	-0.01	-0.13	0.01
Spov3_chr1.02064 (TS)	0.02	-0.07	0.02	0.18	-0.41	-0.03	0.09	0.28	-0.17	-0.34	0.02	-0.01	0.24	-0.57	0.37	0.29	0.37	-0.48	-0.12	-0.08	-0.02	0.06	0.14	-0.01	0.09	0.02	-0.06	0.05	-0.25	-0.18
Spov3_chr1.03518 (RR20)	-0.15	-0.03	-0.28	-0.16	0.0	-0.13	-0.14	0.23	-0.26	0.07	-0.12	0.14	0.07	0.63	0.32	0.14	0.03	0.35	-0.09	-0.25	-0.35	-0.04	0.18	0.0	-0.4	-0.25	-0.27	-0.21	-0.02	0.37
Spov3_chr1.03767 (AtYbeY)	-0.72	-0.55	-0.06	0.56	-0.24	-0.27	-0.27	0.43	-0.28	-0.37	0.19	-0.22	0.67	-0.37	0.49	0.48	0.53	-0.32	-0.13	0.02	0.02	0.09	0.18	-0.28	-0.02	-0.18	-0.02	-0.57	-0.33	0.18
Spov3_chr1.04140 (HSP91)	-0.07	-0.06	-0.08	0.13	-0.39	-0.22	0.17	0.5	-0.3	-0.33	-0.07	-0.14	0.66	0.0	0.34	0.24	0.29	-0.43	-0.18	-0.14	-0.07	-0.06	0.32	-0.23	-0.09	-0.08	0.0	-0.13	-0.34	0.03
Spov3_chr1.04546 (ASK2)	-0.07	-0.05	-0.06	0.24	-0.17	-0.39	-0.27	0.14	-0.31	-0.26	-0.07	-0.27	0.51	0.17	0.26	0.15	0.28	0.32	-0.04	-0.11	-0.06	-0.03	0.44	-0.17	-0.01	-0.07	0.12	-0.24	-0.46	-0.11
Spov3_chr1.04760 (ATB BETA)	-0.14	-0.13	-0.06	0.02	0.0	-0.16	0.0	0.17	-0.06	-0.11	-0.04	-0.07	0.2	0.32	0.2	0.07	0.15	-0.17	-0.15	-0.11	-0.1	-0.11	0.46	-0.15	-0.05	-0.1	0.01	0.01	-0.04	-0.1
Spov3_chr1.05181 (RPN1A)	0.01	0.04	0.0	0.13	-0.03	-0.11	-0.05	0.28	0.05	-0.1	-0.14	-0.15	0.13	0.37	0.16	0.01	0.1	-0.23	-0.26	-0.2	-0.1	-0.08	0.39	-0.15	-0.13	-0.12	-0.02	0.04	-0.07	-0.04
Spov3_chr2.00333	-0.3	-0.13	-0.05	0.36	-0.15	-0.11	-0.07	0.39	-0.56	-0.57	-0.12	-0.33	0.42	-0.74	0.5	0.5	0.56	-0.3	-0.06	-0.06	0.16	-0.02	0.32	-0.21	0.1	0.14	0.18	-0.31	-0.59	-0.13
Spov3_chr2.00405	-0.21	-0.2	0.01	0.44	-0.46	-0.27	-0.13	0.55	-0.16	-0.2	0.03	-0.03	0.33	-0.58	0.33	0.23	0.35	-0.33	-0.15	-0.01	-0.08	0.08	0.46	-0.3	-0.07	-0.11	0.06	-0.13	-0.29	0.04
Spov3_chr2.01601 (IMPA-2)	-0.05	-0.08	-0.05	0.2	-0.02	-0.04	-0.05	0.24	-0.24	-0.23	-0.13	-0.21	0.29	0.36	0.3	0.1	0.15	0.08	-0.28	-0.2	-0.2	-0.12	0.56	-0.3	-0.2	-0.23	-0.07	-0.17	-0.08	0.17
Spov3_chr2.02472 (PPO)	-0.01	-0.18	-0.13	0.1	-0.04	-0.17	0.06	0.29	-0.16	-0.17	0.03	0.03	0.15	0.3	0.22	0.09	0.05	-0.12	-0.12	-0.06	0.05	-0.11	0.41	-0.03	0.07	-0.15	-0.01	-0.07	-0.27	-0.32
Spov3_chr2.03307 (HAP15)	0.06	-0.06	-0.06	0.15	-0.16	-0.16	-0.15	0.18	-0.1	-0.12	-0.11	-0.12	0.19	0.19	0.3	0.27	0.24	-0.06	-0.19	-0.22	-0.02	-0.15	0.46	-0.14	-0.09	-0.07	-0.0	-0.05	-0.17	-0.16
Spov3_chr2.03985 (CHB4)	0.06	0.1	-0.0	0.05	0.13	-0.05	-0.15	0.05	-0.29	-0.16	-0.14	-0.08	0.28	0.39	0.25	0.21	0.2	-0.08	-0.17	-0.29	-0.18	-0.08	-0.27	-0.1	-0.11	-0.06	-0.05	0.11	-0.08	0.2
Spov3_chr2.04097 (KA120)	-0.02	0.0	0.1	0.21	-0.11	-0.1	0.01	0.39	-0.1	-0.21	-0.01	-0.03	0.18	0.07	0.17	0.11	0.18	-0.31	-0.13	-0.13	-0.07	-0.14	0.01	-0.13	-0.04	0.03	0.05	0.03	-0.23	0.02
Spov3_chr3.00828 (EMB3111)	-0.11	0.03	-0.19	-0.08	0.08	0.08	-0.1	0.32	-0.24	-0.34	-0.13	-0.0	0.37	0.44	0.14	0.26	0.14	-0.02	-0.32	-0.43	-0.09	-0.18	-0.15	-0.14	-0.11	-0.06	0.19	-0.1	0.07	0.23
Spov3_chr3.00945 (VPS39)	-0.04	-0.1	-0.03	0.11	-0.01	-0.09	-0.12	0.17	-0.14	-0.14	-0.02	-0.08	0.08	0.04	0.34	0.12	0.24	0.19	-0.2	-0.11	-0.14	-0.08	0.38	-0.38	-0.23	-0.07	-0.05	-0.13	0.01	0.21
Spov3_chr3.01433 (IBI1)	-0.12	-0.18	-0.14	0.21	-0.08	-0.02	0.03	0.34	-0.3	-0.28	-0.03	-0.11	0.23	-0.27	0.26	0.25	0.26	-0.03	-0.13	-0.03	-0.06	-0.04	0.33	-0.26	-0.12	-0.05	0.07	0.02	-0.22	0.14
Spov3_chr3.02938	-0.16	-0.08	-0.13	0.22	-0.27	-0.1	-0.04	0.4	-0.19	-0.24	-0.05	-0.07	0.26	0.19	0.24	0.2	0.28	-0.14	-0.21	-0.28	-0.11	-0.14	0.43	-0.11	-0.06	-0.07	-0.05	-0.13	-0.1	0.12
Spov3_chr3.03078 (TBR)	-0.21	-0.14	-0.13	-0.13	-0.09	-0.28	-0.12	0.29	-0.36	-0.17	-0.01	-0.11	0.38	0.16	0.29	-0.03	0.1	0.14	-0.05	-0.11	-0.09	-0.03	0.4	-0.17	-0.0	0.02	0.16	0.03	-0.15	0.05
Spov3_chr3.03826 (RH40)	-0.02	-0.03	0.03	0.29	-0.24	-0.11	-0.08	0.14	-0.12	-0.15	-0.06	-0.09	0.3	0.12	0.15	0.17	0.25	-0.09	-0.24	-0.21	-0.07	-0.06	0.19	-0.16	-0.15	-0.16	-0.05	0.06	-0.1	0.22
Spov3_chr3.03827 (ECT6)	-0.31	-0.28	-0.07	0.2	-0.29	-0.12	0.1	0.31	-0.19	-0.28	-0.01	-0.07	0.56	-0.17	0.41	0.25	0.29	-0.27	-0.18	-0.09	-0.07	0.03	0.22	-0.09	0.06	-0.02	0.11	-0.08	-0.3	-0.21
Spov3_chr3.04392 (CSLD2)	-0.31	-0.19	-0.1	0.21	-0.2	-0.46	-0.3	0.33	-0.31	-0.11	-0.04	-0.29	0.57	0.31	0.26	0.06	0.25	0.02	-0.16	-0.29	-0.01	-0.06	0.6	-0.28	0.02	-0.07	0.13	-0.02	-0.4	0.06
Spov3_chr3.04444 (eIF5B1)	-0.02	0.01	0.08	0.26	-0.13	-0.02	0.06	0.43	-0.34	-0.41	-0.12	-0.2	0.36	-0.21	0.22	0.08	0.16	-0.57	-0.33	-0.24	-0.21	-0.05	0.88	-0.18	-0.11	-0.25	-0.16	-0.02	-0.09	0.24
Spov3_chr3.04631	-0.32	-0.24	0.04	0.67	-0.3	-0.29	-0.24	0.2	-0.49	-0.45	-0.23	-0.39	0.49	-0.09	0.39	0.2	0.31	0.51	-0.18	-0.32	-0.19	-0.11	0.8	-0.21	-0.05	-0.17	0.1	-0.04	-0.4	-0.29
Spov3_chr3.04862	-0.25	-0.14	0.08	0.67	-0.65	-0.17	-0.21	0.8	-0.33	-0.5	-0.22	-0.21	0.43	-0.1	0.29	0.18	0.13	-0.76	-0.51	-0.21	-0.25	-0.03	0.97	0.01	-0.16	-0.48	-0.07	-0.05	-0.07	0.14
Spov3_chr3.04952 (IMB1)	-0.05	-0.04	0.14	0.43	-0.18	-0.23	-0.13	0.25	-0.07	-0.33	-0.06	-0.19	0.36	0.26	0.3	0.12	0.2	0.01	-0.26	-0.22	-0.16	-0.12	0.4	-0.37	-0.17	-0.18	-0.02	-0.22	-0.13	0.14
Spov3_chr3.05175 (GCN4)	-0.15	-0.16	-0.01	0.1	-0.14	-0.06	0.12	0.34	-0.29	-0.26	-0.07	-0.17	0.26	0.45	0.21	0.11	0.15	-0.06	-0.2	-0.14	-0.14	-0.07	0.43	-0.08	-0.13	-0.12	-0.03	-0.1	-0.13	-0.05
Spov3_chr4.02057 (CAD2)	-0.04	-0.08	-0.17	0.15	0.01	-0.21	-0.41	0.11	-0.15	-0.29	-0.13	-0.07	0.26	0.54	0.16	0.16	0.15	0.3	-0.3	-0.27	-0.0	-0.13	0.56	-0.17	-0.2	-0.18	-0.13	-0.06	-0.06	0.09
Spov3_chr4.02269	-0.34	-0.33	-0.02	0.34	-0.23	-0.12	0.05	0.5	-0.2	-0.37	-0.02	-0.12	0.56	-0.28	0.28	0.19	0.29	-0.53	-0.02	0.04	-0.1	0.04	0.29	-0.22	0.04	-0.16	0.03	-0.16	-0.31	0.18
Spov3_chr4.02346 (NAA10)	-0.13	-0.2	-0.06	0.2	-0.32	-0.02	-0.14	0.41	-0.2	-0.18	-0.01	-0.19	0.28	0.04	0.24	0.19	0.32	-0.02	-0.13	-0.06	-0.06	-0.09	0.29	-0.14	-0.09	-0.1	0.01	-0.08	-0.23	0.11
Spov3_chr4.02919	-0.12	-0.1	0.06	0.26	0.14	-0.12	-0.14	0.16	-0.02	-0.22	-0.2	-0.19	0.41	-0.14	0.22	0.08	0.31	0.41	-0.27	-0.22	-0.31	-0.31	0.56	-0.35	-0.33	-0.22	-0.14	0.0	-0.03	0.2
Spov3_chr4.03115 (VAN4)	-0.0	0.01	-0.1	-0.04	-0.06	-0.23	-0.11	0.18	-0.16	-0.02	-0.01	-0.07	0.15	0.43	0.28	0.07	0.08	-0.1	-0.27	-0.19	-0.1	0.01	0.45	-0.11	-0.01	-0.11	0.05	0.03	-0.14	-0.19
Spov3_chr4.03299	0.12	0.17	0.01	0.06	0.03	-0.03	-0.13	0.23	-0.35	-0.06	-0.2	-0.04	-0.04	0.39	0.18	0.1	0.24	-0.27	-0.19	-0.3	-0.11	-0.03	-0.2	-0.01	-0.18	-0.06	0.08	0.1	0.04	0.15
Spov3_chr4.03395	-0.16	-0.26	-0.01	0.3	-0.32	-0.05	-0.04	0.31	-0.04	-0.1	0.04	-0.1	0.23	-0.11	0.22	0.26	0.32	-0.52	-0.11	0.01	0.0	0.05	0.4	-0.07	0.03	-0.03	-0.05	-0.16	-0.26	-0.24
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Spov3_S03.00028	-0.11	0.02	-0.33	-0.06	-0.06	-0.05	-0.34	0.32	-0.35	-0.0	-0.01	-0.03	0.26	0.61	0.32	0.21	0.34	0.18	-0.51	-0.47	-0.16	-0.16	-0.17	-0.09	-0.13	-0.08	-0.16	-0.05	0.07	0.32
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.