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Heatmap: Cluster_116 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.01 0.12 0.46 1.13 -0.24 -0.28 -0.78 1.36 0.22 0.09 -0.29 -0.06 -0.43 -0.72 -0.2 -0.01 -0.14 -0.93 -0.69 -0.5 -0.28 -0.45 0.06 -0.91 -0.59 -0.34 -0.22 0.36 0.49 0.52
0.15 0.14 0.08 0.61 -0.17 -0.14 -0.38 0.57 -0.34 -0.13 -0.24 -0.1 0.15 -0.31 0.08 0.21 0.15 -0.15 -0.29 -0.29 -0.1 -0.09 0.13 -0.49 -0.19 -0.14 0.11 0.08 0.01 0.35
0.1 -0.09 0.15 0.8 -0.04 -0.44 -0.39 0.58 -0.35 -0.4 -0.21 -0.26 0.45 -0.45 -0.08 0.03 -0.09 -0.09 -0.22 -0.25 -0.2 -0.17 0.71 -0.29 -0.18 -0.27 0.05 0.04 0.03 0.36
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-0.29 -0.39 0.15 1.12 -0.46 -0.53 -0.76 1.19 -0.48 -0.17 -0.27 -0.26 0.52 -0.7 0.02 -0.06 0.17 -0.39 -0.5 -0.48 -0.27 -0.36 0.93 -0.91 -0.37 -0.23 0.24 0.11 0.06 0.32
-0.02 0.04 0.24 0.79 -0.12 -0.2 -0.36 0.72 -0.3 -0.44 -0.24 -0.32 0.23 0.03 0.11 0.14 0.26 -0.28 -0.35 -0.27 -0.21 -0.24 0.56 -0.32 -0.19 -0.37 -0.08 -0.01 -0.1 0.19
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Spov3_chr1.00499 (AtICP55)
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-0.11 -0.15 0.2 0.77 -0.12 -0.32 -0.29 0.67 -0.33 -0.62 -0.14 -0.36 0.5 -0.12 -0.09 -0.14 0.08 -0.01 -0.13 -0.21 -0.23 -0.04 0.52 -0.13 -0.04 -0.35 -0.15 0.22 -0.1 0.15
-0.36 -0.22 0.24 1.07 -0.22 -0.23 -0.56 1.09 -0.4 -0.58 -0.13 -0.52 0.22 -0.75 0.14 0.09 0.19 -0.08 -0.23 -0.2 -0.08 -0.23 0.53 -0.55 -0.38 -0.53 -0.01 0.07 0.01 0.45
-0.04 0.03 0.09 0.39 -0.06 -0.23 -0.22 0.49 -0.26 -0.11 -0.12 -0.13 0.38 -0.28 -0.06 0.08 0.06 -0.2 -0.27 -0.43 -0.28 -0.1 0.21 -0.14 -0.14 -0.12 0.06 0.21 0.27 0.35
-0.04 0.09 0.32 0.98 -0.27 -0.33 -0.56 0.82 -0.21 -0.33 -0.32 -0.43 0.23 -0.32 0.03 0.07 0.13 -0.21 -0.34 -0.36 -0.14 -0.27 0.38 -0.67 -0.28 -0.28 0.09 0.17 0.1 0.38
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0.03 0.1 0.21 0.65 -0.22 -0.14 -0.27 0.67 -0.24 -0.17 -0.11 -0.19 0.25 -0.45 -0.01 -0.01 0.02 -0.12 -0.28 -0.3 -0.06 -0.12 0.18 -0.23 -0.03 -0.17 0.01 0.18 0.01 0.14
0.1 0.11 0.14 0.79 -0.1 -0.31 -0.44 0.42 -0.21 -0.2 -0.13 -0.37 0.2 -0.08 -0.09 -0.11 -0.07 -0.06 -0.31 -0.27 -0.08 -0.1 0.25 -0.42 -0.17 -0.14 0.14 0.25 0.18 0.31
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-0.35 -0.31 0.41 1.28 -0.41 -0.31 -0.71 1.3 -0.37 -0.16 -0.36 -0.21 0.16 -1.0 -0.45 -0.18 -0.03 -0.55 -0.59 -0.59 -0.1 -0.48 0.61 -0.62 -0.03 -0.28 0.12 0.35 0.13 0.48
-0.11 0.0 0.08 1.22 -0.34 -0.47 -0.81 1.13 -0.65 -0.38 -0.3 -0.43 0.36 -0.47 -0.04 0.07 0.3 -0.02 -0.72 -0.69 -0.29 -0.46 0.8 -0.7 -0.53 -0.3 -0.09 -0.04 0.22 0.58
-0.26 -0.09 0.17 0.88 -0.17 0.08 -0.34 0.56 -0.43 -0.38 -0.18 -0.21 -0.02 -0.38 0.17 0.33 0.41 -0.21 -0.36 -0.39 -0.0 -0.15 0.44 -0.35 -0.12 -0.0 0.03 -0.02 -0.18 0.09
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0.11 0.09 0.4 0.82 0.11 -0.54 -0.38 0.55 -0.1 -0.19 -0.15 -0.31 0.24 -1.06 -0.12 -0.2 0.05 -0.61 -0.26 -0.2 -0.26 -0.1 0.71 -0.32 -0.19 -0.33 -0.08 0.38 0.22 0.15
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.