1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_254 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.28 0.4 0.4 0.2 0.63 0.43 0.24 0.37 0.35 0.32 0.28 0.25 0.35 0.56 0.72 0.35 0.43 1.0 0.33 0.2 0.32 0.23 0.53 0.35 0.25 0.3 0.4 0.31 0.27 0.41 0.31
Bra000807 (PDF2)
 0.49 0.61 0.7 0.65 0.89 0.67 0.51 0.43 0.7 0.61 0.62 0.53 0.48 1.0 0.83 0.72 0.59 0.78 0.65 0.63 0.51 0.53 0.41 0.82 0.7 0.75 0.68 0.76 0.85 0.61 0.62
Bra000962 (BSK3)
 0.29 0.26 0.24 0.18 0.56 0.52 0.29 0.28 0.39 0.33 0.39 0.35 0.32 0.61 0.6 0.44 0.47 1.0 0.59 0.44 0.4 0.38 0.38 0.46 0.45 0.38 0.41 0.5 0.47 0.38 0.45
Bra001038 (RRT2)
 0.05 0.04 0.04 0.07 0.31 0.38 0.28 0.19 0.28 0.24 0.23 0.26 0.25 0.56 0.42 0.38 0.33 1.0 0.59 0.33 0.23 0.26 0.12 0.31 0.3 0.21 0.28 0.35 0.3 0.24 0.27
Bra003021 (UF3GT)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.1 0.49 0.4 0.0 0.0 1.0 0.06 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra003126 (PAL2)
 0.1 0.09 0.16 0.25 0.18 0.27 0.38 0.25 0.11 0.15 0.12 0.1 0.24 0.32 0.34 0.26 0.24 1.0 0.48 0.28 0.24 0.2 0.38 0.13 0.12 0.12 0.12 0.12 0.11 0.07 0.08
Bra003209 (CHI)
 0.06 0.03 0.04 0.05 0.22 0.29 0.46 0.24 0.12 0.17 0.17 0.11 0.39 0.66 0.54 0.52 0.33 1.0 0.68 0.42 0.31 0.3 0.23 0.27 0.23 0.16 0.2 0.24 0.18 0.14 0.13
0.08 0.01 0.02 0.06 0.37 0.5 0.14 0.08 0.28 0.18 0.14 0.2 0.2 0.82 0.69 0.28 0.33 1.0 0.53 0.3 0.34 0.17 0.18 0.49 0.41 0.35 0.31 0.46 0.51 0.16 0.25
Bra005370 (KUP11)
 0.18 0.17 0.19 0.21 0.32 0.47 0.49 0.37 0.35 0.38 0.32 0.36 0.55 0.49 0.5 0.43 0.46 1.0 0.77 0.49 0.32 0.4 0.26 0.47 0.46 0.35 0.46 0.48 0.61 0.37 0.46
Bra006118 (NDL2)
 0.11 0.13 0.1 0.25 0.5 0.43 0.41 0.4 0.37 0.38 0.34 0.32 0.28 0.59 0.62 0.5 0.43 1.0 0.45 0.4 0.32 0.31 0.11 0.31 0.3 0.29 0.26 0.32 0.3 0.19 0.19
Bra006224 (CHS)
 0.0 0.0 0.0 0.01 0.12 0.16 0.25 0.04 0.02 0.05 0.04 0.02 0.18 0.31 0.23 0.35 0.23 1.0 0.34 0.24 0.14 0.11 0.07 0.1 0.08 0.05 0.04 0.17 0.04 0.01 0.0
Bra006361 (PIN5)
 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.09 0.1 0.1 0.21 0.12 0.1 0.0 0.1 0.41 0.38 0.13 0.31 1.0 0.09 0.23 0.33 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.04 0.03 0.05 0.19 0.35 0.55 0.42 0.23 0.27 0.28 0.23 0.52 0.54 0.51 0.5 0.36 1.0 0.64 0.4 0.47 0.35 0.79 0.47 0.34 0.42 0.46 0.24 0.29 0.14 0.33
0.46 0.42 0.37 0.35 0.5 0.55 0.62 0.58 0.33 0.41 0.34 0.36 0.66 0.59 0.55 0.49 0.53 1.0 0.72 0.48 0.44 0.51 0.37 0.53 0.53 0.39 0.52 0.55 0.42 0.35 0.47
Bra007744 (ASAT1)
 0.36 0.12 0.04 0.04 0.51 0.4 0.19 0.13 0.54 0.2 0.37 0.32 0.49 0.89 0.87 0.37 0.2 1.0 0.48 0.28 0.36 0.35 0.49 0.72 0.63 0.34 0.51 0.68 0.74 0.26 0.42
Bra008421 (PGK)
 0.17 0.15 0.11 0.17 0.34 0.34 0.44 0.36 0.21 0.37 0.31 0.3 0.44 0.35 0.46 0.54 0.57 1.0 0.62 0.48 0.42 0.44 0.62 0.4 0.41 0.33 0.44 0.28 0.21 0.24 0.33
Bra010189 (GBSS1)
 0.29 0.19 0.13 0.2 0.44 0.79 0.45 0.27 0.44 0.36 0.38 0.36 0.27 0.97 0.9 0.48 0.44 0.8 1.0 0.46 0.47 0.4 0.12 0.45 0.45 0.37 0.4 0.53 0.53 0.29 0.36
Bra010960 (PUB6)
 0.17 0.1 0.11 0.17 0.5 0.69 0.42 0.26 0.46 0.37 0.44 0.32 0.3 1.0 0.96 0.57 0.44 0.78 0.7 0.52 0.43 0.38 0.22 0.44 0.45 0.37 0.47 0.48 0.53 0.28 0.42
Bra011841 (MIC60)
 0.02 0.1 0.14 0.08 0.31 0.38 0.15 0.34 0.43 0.28 0.36 0.44 0.45 1.0 0.95 0.28 0.3 0.9 0.28 0.45 0.1 0.64 0.27 0.14 0.06 0.01 0.1 0.02 0.1 0.06 0.05
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.05 0.58 0.0 0.44 0.1 0.16 0.35 0.99 1.0 0.07 0.0 0.45 0.16 0.48 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra013009 (GSM1)
 0.06 0.01 0.01 0.01 0.26 0.4 0.08 0.05 0.76 0.33 0.46 0.38 0.24 0.68 1.0 0.43 0.23 0.93 0.7 0.56 0.41 0.41 0.47 0.65 0.68 0.45 0.5 0.82 0.86 0.29 0.41
Bra013265 (AGD8)
 0.14 0.13 0.11 0.11 0.28 0.29 0.32 0.3 0.26 0.37 0.24 0.23 0.62 0.48 0.52 0.48 0.47 1.0 0.49 0.28 0.33 0.31 0.21 0.22 0.2 0.14 0.21 0.18 0.13 0.11 0.14
Bra015976 (SIS8)
 0.21 0.22 0.26 0.18 0.33 0.59 0.38 0.29 0.3 0.34 0.39 0.28 0.34 0.67 0.59 0.5 0.5 1.0 0.53 0.53 0.46 0.46 0.4 0.26 0.29 0.25 0.26 0.24 0.31 0.16 0.24
Bra016081 (CEPR2)
 0.2 0.16 0.18 0.17 0.57 0.45 0.14 0.19 0.22 0.19 0.17 0.19 0.24 0.5 0.64 0.24 0.19 1.0 0.51 0.36 0.28 0.3 0.19 0.39 0.36 0.45 0.33 0.33 0.38 0.35 0.35
0.21 0.11 0.11 0.23 0.37 0.34 0.23 0.17 0.28 0.24 0.25 0.22 0.22 0.41 0.37 0.29 0.29 1.0 0.86 0.29 0.21 0.24 0.18 0.21 0.18 0.35 0.18 0.2 0.2 0.16 0.14
Bra017788 (ELO4)
 0.02 0.04 0.04 0.0 0.29 0.29 0.08 0.09 0.23 0.16 0.15 0.15 0.11 0.72 0.73 0.36 0.27 1.0 0.57 0.25 0.29 0.2 0.06 0.34 0.17 0.16 0.24 0.44 0.4 0.14 0.11
0.22 0.3 0.21 0.2 0.75 0.76 0.24 0.33 0.17 0.17 0.32 0.36 0.38 0.85 0.79 0.2 0.15 1.0 0.33 0.31 0.23 0.31 0.24 0.3 0.11 0.16 0.16 0.24 0.25 0.16 0.15
0.09 0.12 0.13 0.15 0.65 0.35 0.19 0.15 0.36 0.37 0.26 0.26 0.2 0.92 0.94 0.32 0.22 1.0 0.29 0.37 0.2 0.24 0.07 0.12 0.11 0.2 0.22 0.19 0.23 0.13 0.13
Bra020782 (PRXIIF)
 0.54 0.6 0.47 0.45 0.78 0.64 0.46 0.42 0.61 0.58 0.57 0.61 0.7 0.9 0.9 0.71 0.56 1.0 0.76 0.62 0.61 0.67 0.65 0.81 0.77 0.68 0.8 0.68 0.73 0.73 0.81
Bra021354 (ATL51)
 0.14 0.11 0.18 0.13 0.32 0.4 0.24 0.18 0.23 0.2 0.19 0.23 0.17 0.35 0.37 0.31 0.26 1.0 0.44 0.31 0.25 0.3 0.1 0.21 0.2 0.18 0.14 0.16 0.19 0.16 0.13
0.01 0.01 0.01 0.02 0.24 0.31 0.27 0.2 0.27 0.25 0.21 0.22 0.21 0.43 0.44 0.33 0.38 1.0 0.58 0.3 0.28 0.24 0.15 0.39 0.35 0.15 0.27 0.3 0.25 0.16 0.11
Bra022816 (ERD13)
 0.05 0.07 0.11 0.06 0.39 0.18 0.2 0.16 0.12 0.17 0.11 0.12 0.12 0.25 0.15 0.25 0.24 1.0 0.34 0.15 0.18 0.27 0.15 0.13 0.14 0.11 0.12 0.15 0.12 0.08 0.04
Bra023084 (MAT3)
 0.1 0.1 0.11 0.11 0.38 0.56 0.37 0.49 0.22 0.23 0.22 0.22 0.48 0.63 0.6 0.48 0.4 1.0 0.4 0.34 0.29 0.29 0.5 0.33 0.32 0.24 0.29 0.32 0.36 0.3 0.34
Bra023594 (UGT78D2)
 0.25 0.3 0.31 0.37 0.43 0.55 0.59 0.46 0.33 0.39 0.33 0.34 0.46 0.74 0.62 0.77 0.57 1.0 0.54 0.72 0.54 0.54 0.23 0.4 0.43 0.32 0.4 0.41 0.33 0.27 0.32
Bra023602 (TT19)
 0.0 0.0 0.0 0.02 0.17 0.2 0.25 0.1 0.06 0.09 0.06 0.05 0.26 0.62 0.38 0.31 0.3 1.0 0.24 0.16 0.16 0.13 0.08 0.12 0.09 0.04 0.06 0.17 0.07 0.03 0.06
Bra023893 (MRP6)
 0.14 0.07 0.08 0.08 0.59 0.12 0.23 0.3 0.24 0.23 0.13 0.25 0.45 0.65 0.47 0.23 0.15 1.0 0.32 0.15 0.19 0.21 0.06 0.11 0.18 0.11 0.14 0.29 0.34 0.22 0.13
Bra024265 (XYP1)
 0.12 0.14 0.12 0.17 0.42 0.43 0.53 0.44 0.39 0.53 0.5 0.46 0.65 0.69 0.8 0.88 0.75 0.96 0.78 0.61 0.59 0.58 1.0 0.6 0.58 0.49 0.53 0.37 0.3 0.31 0.44
Bra024285 (NPH3)
 0.22 0.12 0.29 0.14 0.86 0.6 0.45 0.46 0.71 0.57 0.69 0.59 0.74 0.94 0.83 0.54 0.49 1.0 0.79 0.58 0.57 0.52 0.57 0.74 0.71 0.52 0.58 0.78 0.7 0.56 0.53
Bra024568 (PGM3)
 0.22 0.21 0.16 0.22 0.42 0.46 0.41 0.4 0.34 0.44 0.34 0.34 0.43 0.51 0.53 0.47 0.53 1.0 0.7 0.5 0.46 0.45 0.48 0.35 0.37 0.34 0.37 0.34 0.28 0.28 0.35
0.05 0.06 0.02 0.08 0.33 0.81 0.29 0.26 0.35 0.2 0.19 0.22 0.42 0.62 0.5 0.38 0.31 1.0 0.7 0.34 0.26 0.25 0.31 0.67 0.54 0.16 0.43 0.48 0.53 0.15 0.38
Bra025288 (ATPK7)
 0.02 0.03 0.03 0.04 0.31 0.33 0.23 0.22 0.32 0.17 0.24 0.27 0.23 0.58 0.35 0.27 0.21 1.0 0.48 0.32 0.21 0.18 0.25 0.45 0.39 0.18 0.31 0.33 0.45 0.24 0.34
Bra026773 (MBD10)
 0.14 0.09 0.12 0.12 0.32 0.37 0.19 0.15 0.33 0.19 0.21 0.18 0.28 0.44 0.47 0.43 0.26 1.0 0.78 0.34 0.2 0.22 0.1 0.19 0.2 0.2 0.14 0.14 0.23 0.16 0.23
Bra029482 (MEE51)
 0.05 0.14 0.07 0.07 0.12 0.3 0.26 0.16 0.17 0.26 0.23 0.3 0.22 0.26 0.37 0.29 0.39 1.0 0.81 0.25 0.16 0.32 0.26 0.29 0.29 0.25 0.29 0.33 0.34 0.35 0.46
Bra029836 (CPY)
 0.24 0.14 0.19 0.16 0.29 0.3 0.16 0.12 0.24 0.21 0.23 0.19 0.18 0.39 0.46 0.25 0.16 1.0 0.34 0.19 0.17 0.17 0.08 0.27 0.33 0.24 0.26 0.35 0.29 0.25 0.27
Bra029875 (MES17)
 0.14 0.05 0.14 0.01 0.41 0.34 0.17 0.08 0.4 0.28 0.27 0.23 0.41 0.89 0.97 0.48 0.16 1.0 0.75 0.24 0.46 0.28 0.56 0.67 0.53 0.51 0.34 0.56 0.58 0.18 0.36
Bra030461 (GA2OX7)
 0.08 0.14 0.17 0.12 0.54 0.4 0.22 0.23 0.31 0.28 0.23 0.22 0.29 0.66 0.68 0.32 0.16 1.0 0.34 0.38 0.22 0.23 0.1 0.12 0.13 0.16 0.16 0.2 0.2 0.12 0.15
Bra032651 (KEA1)
 0.34 0.26 0.25 0.33 0.5 0.55 0.55 0.52 0.41 0.46 0.45 0.46 0.52 0.65 0.62 0.6 0.53 1.0 0.7 0.54 0.43 0.48 0.59 0.4 0.43 0.44 0.45 0.5 0.54 0.42 0.46
Bra033574 (ROC1)
 0.24 0.18 0.04 0.06 0.4 0.43 0.26 0.24 0.38 0.2 0.29 0.25 0.2 0.46 0.53 0.27 0.25 1.0 0.52 0.29 0.33 0.25 0.03 0.4 0.38 0.34 0.36 0.45 0.51 0.34 0.26
0.18 0.19 0.18 0.18 0.37 0.36 0.29 0.39 0.29 0.3 0.29 0.26 0.37 0.46 0.51 0.54 0.34 1.0 0.41 0.36 0.31 0.36 0.31 0.17 0.16 0.18 0.15 0.19 0.15 0.13 0.24
0.08 0.09 0.04 0.08 0.95 0.68 0.0 0.12 0.06 0.0 0.0 0.42 0.32 1.0 0.93 0.22 0.53 0.86 0.36 0.1 0.06 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
Bra036262 (XT2)
 0.49 0.6 0.46 0.42 0.72 0.59 0.37 0.42 0.58 0.54 0.51 0.52 0.43 0.87 0.93 0.61 0.49 1.0 0.69 0.58 0.52 0.55 0.34 0.74 0.79 0.64 0.75 0.88 0.92 0.6 0.47
0.11 0.09 0.14 0.08 0.35 0.34 0.34 0.28 0.29 0.3 0.31 0.28 0.57 0.38 0.42 0.53 0.33 1.0 0.49 0.41 0.34 0.38 0.35 0.29 0.33 0.12 0.3 0.21 0.29 0.28 0.47
0.12 0.04 0.07 0.07 0.26 0.17 0.25 0.23 0.3 0.29 0.26 0.22 0.24 0.49 0.39 0.37 0.27 1.0 0.52 0.29 0.32 0.33 0.21 0.28 0.3 0.22 0.24 0.26 0.23 0.14 0.15
Bra037903 (PBL17)
 0.2 0.2 0.24 0.17 0.29 0.31 0.25 0.26 0.36 0.25 0.27 0.28 0.25 0.5 0.47 0.37 0.29 1.0 0.6 0.35 0.32 0.4 0.2 0.35 0.35 0.19 0.33 0.28 0.35 0.3 0.29
0.4 0.31 0.27 0.22 0.87 0.82 0.51 0.47 0.68 0.55 0.48 0.53 0.6 0.78 0.95 0.57 0.62 1.0 0.75 0.59 0.62 0.64 0.55 0.69 0.67 0.54 0.58 0.63 0.65 0.52 0.63
Bra039362 (CHI)
 0.04 0.08 0.04 0.06 0.37 0.26 0.49 0.26 0.12 0.14 0.14 0.07 0.39 0.57 0.43 0.49 0.3 1.0 0.67 0.42 0.33 0.22 0.18 0.28 0.26 0.18 0.19 0.3 0.27 0.17 0.21
Bra039936 (scpl10)
 0.12 0.11 0.17 0.29 0.15 0.2 0.41 0.18 0.1 0.1 0.11 0.09 0.24 0.37 0.22 0.31 0.23 1.0 0.2 0.17 0.18 0.14 0.09 0.12 0.11 0.13 0.11 0.15 0.09 0.05 0.09
Bra040512 (VMA10)
 0.23 0.23 0.24 0.22 0.38 0.26 0.42 0.4 0.3 0.3 0.46 0.31 0.39 0.74 0.74 0.51 0.44 1.0 0.42 0.33 0.32 0.36 0.2 0.21 0.2 0.2 0.22 0.23 0.22 0.17 0.21
Bra041166 (CASPL3A2)
 0.34 0.35 0.42 0.29 0.79 0.6 0.23 0.14 0.73 0.51 0.56 0.51 0.2 1.0 0.86 0.48 0.4 0.87 0.81 0.53 0.46 0.58 0.25 0.47 0.61 0.6 0.74 0.55 0.61 0.43 0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)