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Heatmap: Cluster_107 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.2 0.57 0.09 -0.1 0.21 -0.03 -0.56 -0.45 -0.37 -0.03 -0.64 -0.36 -0.3 0.62 -0.13 -0.38 -0.01 1.87 -0.65 -0.83 -0.44 -0.56 -1.08 -0.86 -1.03 -0.32 -0.22 -0.29 0.28 1.1
0.15 0.2 -0.17 -0.12 0.25 -0.02 -0.34 -0.52 -0.11 -0.12 -0.18 -0.1 -0.21 0.63 0.07 0.01 -0.03 0.76 -0.3 -0.27 -0.0 -0.07 -0.13 -0.1 -0.18 -0.05 0.03 0.03 -0.02 0.22
0.1 0.17 -0.16 -0.34 0.34 -0.2 -0.32 0.04 -0.46 -0.08 -0.38 -0.42 -0.05 0.97 0.13 0.15 0.09 1.18 -0.3 -0.29 -0.24 -0.34 0.02 -0.25 -0.39 -0.25 -0.33 -0.19 0.05 0.11
0.49 0.02 -0.05 0.04 0.04 -0.06 -0.53 -0.55 -0.28 -0.16 0.11 -0.2 0.13 0.78 -0.01 -0.06 0.07 1.03 -0.45 -0.24 -0.35 -0.33 -0.14 -0.21 -0.16 -0.26 0.0 0.18 -0.2 0.06
0.23 0.31 -0.1 -0.46 0.51 0.07 -0.4 -0.2 -0.53 0.05 -0.53 -0.32 -0.58 1.11 0.18 0.03 0.02 0.86 -0.49 -0.38 -0.18 -0.23 -0.34 -0.18 -0.5 -0.14 -0.09 -0.14 0.2 0.36
0.19 0.08 -0.22 -0.29 0.17 0.0 -0.11 -0.41 -0.21 -0.1 -0.3 -0.18 -0.13 0.75 0.25 0.18 0.07 1.03 -0.12 -0.37 -0.3 -0.08 0.07 -0.06 -0.51 -0.09 -0.16 -0.22 -0.17 0.09
0.12 0.14 -0.12 -0.5 0.37 -0.43 -0.71 -0.2 -0.03 0.02 -0.15 -0.38 -0.52 1.2 0.0 -0.15 0.15 1.39 -0.49 -0.6 0.16 -0.09 -0.22 -0.01 -0.52 -0.25 -0.63 -0.38 -0.04 0.24
-0.84 -1.15 -0.96 -0.5 0.15 0.18 -0.6 -0.38 -1.67 -0.81 -0.92 0.66 -1.38 0.32 -0.43 -0.44 -0.73 2.63 -0.46 -0.2 -0.45 -0.03 -1.2 -0.93 -0.42 -0.31 -0.68 -2.28 0.46 1.67
0.31 0.04 -0.34 0.12 -0.14 -0.49 -0.4 -0.1 -0.41 -0.2 -0.06 0.07 0.06 0.78 -0.1 0.08 0.13 1.32 -0.6 -0.44 0.01 -0.43 -0.07 -0.42 -0.74 -0.0 -0.23 -0.15 0.22 0.27
0.07 0.29 -0.04 -0.16 0.17 -0.13 -0.33 0.12 -0.52 -0.4 -0.32 -0.35 -0.2 0.71 -0.03 -0.11 -0.08 1.04 -0.05 -0.24 -0.28 -0.44 0.17 0.07 -0.32 -0.18 -0.29 -0.16 0.17 0.5
0.2 0.28 0.06 -0.11 0.31 -0.18 -0.11 -0.07 -0.48 -0.11 -0.24 -0.4 -0.33 0.58 -0.31 0.04 -0.36 0.86 -0.12 -0.14 -0.2 -0.22 0.23 -0.02 -0.18 -0.23 -0.36 -0.06 0.17 0.44
0.2 0.49 0.01 -0.01 0.42 -0.24 -1.09 -0.9 -0.39 0.01 -0.25 -0.39 -0.5 1.09 0.04 -0.03 0.0 0.96 -0.25 -0.46 0.16 -0.43 -0.19 -0.04 -0.28 0.0 0.01 -0.28 0.1 0.12
0.3 0.25 -0.49 -0.46 0.1 0.18 -0.44 0.07 -0.69 -0.61 -0.75 -0.71 -0.01 1.47 -0.12 -0.12 -0.27 1.6 -0.53 -0.24 -0.32 -0.3 0.11 -0.21 -0.27 -0.27 -0.41 0.1 0.04 -0.79
-0.27 0.05 -0.58 -1.14 0.41 0.06 -0.16 -0.29 -0.18 0.14 -0.52 -0.41 -0.3 1.36 -0.01 -0.47 -0.4 1.74 -0.51 -0.37 -0.48 -0.42 0.45 -0.55 -0.59 -0.38 -0.46 0.42 -0.03 -0.28
0.04 0.16 -0.48 -0.31 0.46 -0.35 -0.3 -0.54 -0.65 -0.04 -0.4 -0.43 0.34 1.09 -0.33 -0.19 -0.24 1.6 -0.35 -0.53 -0.23 -0.23 0.01 -0.23 -0.17 -0.01 -0.1 -0.04 -0.28 -0.04
-0.03 0.02 -0.34 -0.66 0.48 0.25 -0.08 -0.52 -0.43 -0.24 -0.29 -0.13 -0.15 0.97 0.05 0.06 -0.01 1.05 -0.18 -0.17 -0.04 -0.1 -0.06 -0.1 -0.33 -0.14 -0.1 -0.23 -0.21 0.14
0.24 0.1 -0.11 -0.59 0.27 0.2 -0.08 -0.11 -0.29 -0.22 -0.48 -0.45 -0.07 1.09 -0.12 0.21 -0.32 1.3 -0.24 -0.47 -0.18 -0.23 -0.6 -0.22 -0.25 -0.16 -0.07 0.08 -0.06 -0.22
0.05 0.0 -0.33 -0.44 0.13 0.06 0.05 -0.29 -0.21 -0.02 -0.07 -0.12 -0.31 0.92 0.04 -0.07 0.01 1.09 -0.2 -0.23 -0.18 -0.16 -0.35 -0.06 -0.17 -0.0 -0.32 -0.08 0.0 0.03
0.62 0.45 -0.52 -0.6 0.52 0.46 0.02 -0.48 -0.97 -0.69 -0.52 -0.38 -0.2 1.63 0.08 0.13 -0.0 1.33 -0.56 -0.5 -0.51 -0.45 -0.32 -0.43 -0.92 -0.68 -0.7 -0.06 -0.56 0.27
0.15 -0.11 -0.32 -0.23 0.15 -0.06 -0.38 -0.32 -0.11 -0.05 -0.25 -0.13 -0.28 1.0 0.06 -0.05 -0.07 1.2 -0.26 -0.46 -0.01 -0.17 0.08 0.01 -0.33 -0.11 -0.12 0.07 -0.02 -0.41
-0.47 0.17 -1.17 -1.79 0.84 -0.0 -0.59 -1.08 -0.67 -0.05 -0.88 -0.73 -0.1 1.66 -0.12 -0.17 -0.34 1.99 -0.37 -0.79 -0.18 -0.37 0.12 0.17 -0.62 -0.32 -0.41 -0.06 -0.04 -0.45
-0.17 0.04 -0.06 -0.05 0.1 0.05 -0.06 0.03 -0.12 -0.12 -0.22 -0.1 -0.07 0.47 -0.07 0.13 0.01 1.21 -0.49 -0.35 -0.09 -0.36 0.11 -0.48 -0.6 -0.22 -0.14 -0.01 -0.15 0.49
0.33 0.09 -0.28 -0.6 0.54 0.09 -0.35 -1.28 -0.32 -0.16 -0.42 -0.12 -0.56 1.52 0.01 -0.19 -0.22 1.46 -0.2 -0.15 -0.17 -0.2 -0.35 -0.19 -0.57 -0.0 -0.51 -0.58 -0.05 -0.15
0.41 0.43 -0.29 -1.03 0.31 -0.16 -0.32 -0.23 -0.39 -0.17 -0.39 -0.32 -0.26 1.29 -0.08 -0.11 -0.27 1.35 -0.53 -0.37 -0.34 -0.47 0.35 -0.42 -0.5 -0.19 -0.06 -0.01 -0.08 -0.01
-0.04 0.06 -0.25 -0.18 0.04 -0.19 -0.42 -0.45 -0.26 0.14 -0.2 -0.06 -0.12 1.14 -0.06 -0.0 0.05 1.25 -0.23 -0.22 -0.16 -0.21 -0.4 -0.12 -0.11 -0.31 -0.31 -0.13 -0.06 0.08
0.44 0.35 -0.26 -0.75 0.38 0.1 -0.32 -0.5 -0.39 -0.12 -0.46 -0.33 -0.41 1.43 -0.1 -0.23 -0.28 1.56 -0.5 -0.68 -0.33 -0.41 0.01 -0.24 -0.58 -0.41 -0.42 0.25 0.07 -0.47
0.09 0.32 -0.02 -0.58 0.56 -0.12 -0.26 -0.0 -0.19 0.35 -0.4 -0.31 -0.45 1.0 -0.15 0.04 0.01 0.83 -0.27 -0.45 -0.27 -0.29 -0.27 -0.03 -0.34 -0.09 -0.31 -0.46 0.21 0.25
0.43 0.76 -0.25 -0.55 -0.47 0.02 -0.51 -0.12 -0.41 -0.15 -0.36 -0.68 -0.22 1.1 -0.02 -1.47 0.2 1.84 -2.7 -0.5 -1.05 -0.45 -0.34 -0.37 -0.63 -0.15 -0.51 -0.18 0.62 0.71
0.24 0.11 -0.15 -0.44 0.23 0.01 -0.2 -0.16 -0.24 0.13 -0.24 -0.28 0.2 0.92 0.03 -0.15 -0.19 1.0 -0.38 -0.53 -0.21 -0.29 -0.32 -0.29 -0.3 -0.12 -0.09 0.21 0.09 0.04
0.03 0.18 -0.18 -0.32 0.18 -0.09 -0.55 -0.16 0.0 0.37 -0.18 -0.08 0.01 0.78 -0.12 0.02 0.01 0.89 -0.28 -0.34 -0.21 -0.16 -0.21 -0.07 0.05 -0.21 -0.36 -0.09 -0.07 0.14
Spov3_chr3.04324 (UMAMIT33)
 0.04 -0.57 -1.24 -3.74 0.78 0.28 0.13 -0.85 -0.43 0.08 -0.7 0.07 -1.62 2.1 -0.07 -1.11 -0.77 2.59 -1.1 -1.02 -0.1 -0.41 -3.84 -1.15 -1.55 -0.98 -0.86 0.04 -0.2 -0.59
0.36 0.28 -0.05 -0.53 -0.34 0.11 -0.61 -0.28 -0.42 -0.49 -0.39 -0.25 -0.36 1.56 -0.1 -0.0 -0.2 0.89 -0.25 -0.44 -0.22 0.14 -0.37 -0.01 -0.41 -0.38 -0.17 0.08 0.2 0.18
0.46 0.36 -0.24 -0.34 0.32 0.48 -0.14 -0.51 -0.31 -0.39 -0.53 -0.55 0.04 1.33 -0.17 -0.01 -0.03 1.42 -0.34 -0.52 -0.41 -0.35 0.13 -0.46 -0.74 -0.5 -0.58 -0.05 -0.17 -0.45
0.24 0.1 -0.22 -0.28 0.41 0.09 -0.3 -0.13 -0.32 -0.15 -0.45 -0.73 -0.28 1.18 -0.56 0.02 -0.25 1.34 -0.4 -0.34 -0.09 -0.11 -0.15 -0.24 -0.69 -0.11 -0.21 -0.27 0.1 0.36
0.23 0.19 -0.51 -0.65 0.43 -0.23 -0.66 -0.69 -1.07 -0.06 -0.38 -0.23 0.01 1.46 -0.24 -0.26 -0.4 1.51 -0.12 -0.67 -0.44 -0.22 0.28 -0.33 -0.54 -0.12 -0.01 0.09 -0.09 0.0
0.32 0.32 -0.05 -0.29 0.18 0.14 -0.34 -0.35 -0.16 0.11 -0.21 -0.15 -0.41 0.89 0.12 0.07 -0.09 0.99 -0.39 -0.33 -0.18 -0.38 0.08 -0.32 -0.31 -0.3 -0.23 -0.15 -0.01 0.09
0.3 0.18 -0.21 -0.06 0.08 -0.06 -0.07 -0.31 -0.28 -0.21 -0.03 -0.03 -0.25 0.66 -0.05 -0.05 0.14 1.1 -0.34 -0.44 -0.31 -0.25 -0.15 -0.14 -0.42 -0.14 -0.21 -0.28 0.15 0.43
0.34 0.23 -0.63 -1.25 -0.08 0.3 -0.11 -0.19 -0.54 -0.24 -0.49 -0.31 -0.46 1.46 0.0 -0.02 -0.36 1.15 -0.32 -0.43 -0.26 -0.11 -0.69 -0.25 -0.25 -0.17 -0.26 0.11 0.65 0.04
0.05 0.2 -0.2 -0.07 0.27 -0.07 -0.43 -0.35 -0.19 -0.11 -0.09 -0.14 -0.1 0.72 0.05 -0.02 -0.04 0.78 -0.09 -0.23 0.08 -0.24 -0.05 0.01 -0.09 -0.09 -0.16 -0.08 -0.05 -0.0
0.15 0.2 -0.14 -0.21 0.3 -0.17 -0.59 -0.76 -0.2 0.1 -0.28 -0.37 -0.26 1.25 0.0 -0.04 -0.08 1.19 -0.06 -0.36 -0.11 -0.11 -0.33 -0.27 -0.17 -0.16 -0.16 -0.09 -0.24 -0.12
Spov3_chr5.01104 (CYP704A2)
 -0.51 -0.14 -0.55 -0.72 0.59 0.37 -0.68 -0.79 -0.63 -0.16 -0.78 -1.42 0.46 1.95 -0.1 -0.13 0.02 2.3 -1.01 -1.35 -0.25 -0.61 -0.59 -1.72 -1.17 -0.53 -0.47 -0.99 -0.64 0.28
0.04 0.09 -0.23 -0.32 0.2 0.06 -0.06 -0.2 -0.17 -0.28 -0.32 -0.07 -0.42 0.87 0.01 0.06 -0.01 0.97 -0.19 -0.15 -0.12 -0.15 0.1 0.0 -0.31 -0.18 -0.29 -0.06 0.18 -0.11
0.23 0.18 -0.16 -0.16 0.13 0.11 -0.15 -0.42 -0.31 0.02 -0.31 -0.27 -0.18 0.98 0.23 0.07 0.09 0.76 -0.31 -0.24 -0.23 -0.18 -0.01 -0.38 -0.28 -0.06 -0.18 -0.2 0.04 0.12
Spov3_chr5.03669 (UGT74E2)
 -0.09 0.01 -0.08 -0.31 0.4 -0.39 -0.66 -0.14 -0.53 -0.29 -0.42 -0.56 0.02 0.67 0.1 -0.13 0.11 1.5 -0.33 -0.15 -0.32 -0.54 0.31 -0.65 -0.41 -0.42 -0.15 -0.21 0.39 0.69
-0.28 0.16 -0.23 -0.77 0.35 -0.27 -0.45 -0.1 -0.11 0.23 0.1 -0.48 -0.09 1.32 -0.07 -0.31 -0.2 1.6 -0.37 -0.07 0.1 -0.19 -0.21 -0.64 -0.71 -0.06 -0.26 -0.88 -0.58 0.1
0.08 0.19 -0.25 -0.43 0.25 0.01 -0.11 0.07 -0.25 -0.08 -0.34 -0.28 -0.31 0.98 -0.14 -0.18 -0.0 1.21 -0.19 -0.82 -0.1 -0.33 0.18 -0.07 -0.21 -0.19 -0.29 -0.05 0.07 -0.12
0.21 0.2 -0.19 -0.37 0.06 0.19 -0.1 -0.29 -0.32 0.04 -0.26 -0.15 0.04 0.96 -0.07 0.05 -0.01 1.09 -0.53 -0.61 -0.34 -0.27 -0.36 -0.09 -0.36 -0.21 -0.31 0.06 0.2 0.18
-0.44 -0.15 -0.31 -0.56 0.32 0.19 -0.34 0.18 -0.35 -0.19 -0.32 -0.26 0.06 1.06 -0.12 0.08 -0.04 1.19 -0.23 -0.28 -0.11 -0.24 -0.45 -0.26 -0.27 -0.12 -0.12 -0.0 0.37 -0.09
0.03 0.06 -0.2 -0.23 -0.05 -0.08 -0.62 0.07 -0.04 0.27 -0.42 -0.11 -0.22 1.16 -0.06 -0.09 -0.04 1.09 -0.31 -0.26 -0.1 -0.36 -0.06 0.08 -0.13 -0.15 -0.33 -0.16 -0.11 -0.2
0.24 0.24 -0.41 -0.34 0.43 -0.07 -0.27 -0.52 -0.44 -0.37 -0.45 -0.43 -0.29 1.26 0.27 0.27 0.08 1.5 -0.39 -0.31 -0.41 -0.43 -0.0 -0.55 -0.72 -0.31 -0.36 -0.71 0.1 0.24
0.09 0.11 0.1 0.06 0.35 -0.3 -0.36 -0.57 -0.49 -0.04 -0.38 -0.39 -0.36 0.99 0.11 0.05 0.0 1.29 -0.09 -0.58 -0.39 -0.34 -0.16 -0.33 -0.44 -0.03 -0.14 0.01 -0.11 0.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.