1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_107 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.31 0.4 0.29 0.25 0.32 0.27 0.19 0.2 0.21 0.27 0.18 0.21 0.22 0.42 0.25 0.21 0.27 1.0 0.17 0.15 0.2 0.19 0.13 0.15 0.13 0.22 0.23 0.22 0.33 0.59
0.66 0.68 0.53 0.54 0.7 0.58 0.47 0.41 0.55 0.54 0.52 0.55 0.51 0.91 0.62 0.6 0.58 1.0 0.48 0.49 0.59 0.56 0.54 0.55 0.52 0.57 0.6 0.6 0.58 0.69
0.47 0.5 0.39 0.35 0.56 0.39 0.35 0.46 0.32 0.42 0.34 0.33 0.43 0.87 0.48 0.49 0.47 1.0 0.36 0.36 0.38 0.35 0.45 0.37 0.34 0.37 0.35 0.39 0.46 0.48
0.68 0.49 0.47 0.5 0.5 0.47 0.34 0.33 0.4 0.44 0.53 0.42 0.53 0.84 0.49 0.47 0.51 1.0 0.36 0.41 0.38 0.39 0.44 0.42 0.44 0.41 0.49 0.55 0.43 0.51
0.54 0.57 0.43 0.34 0.66 0.48 0.35 0.4 0.32 0.48 0.32 0.37 0.31 1.0 0.52 0.47 0.47 0.84 0.33 0.35 0.41 0.39 0.36 0.41 0.33 0.42 0.43 0.42 0.53 0.59
0.56 0.52 0.42 0.4 0.55 0.49 0.45 0.37 0.42 0.46 0.4 0.43 0.45 0.83 0.58 0.56 0.51 1.0 0.45 0.38 0.4 0.46 0.51 0.47 0.35 0.46 0.44 0.42 0.44 0.52
0.41 0.42 0.35 0.27 0.49 0.28 0.23 0.33 0.38 0.39 0.34 0.29 0.27 0.88 0.38 0.34 0.42 1.0 0.27 0.25 0.43 0.36 0.33 0.38 0.27 0.32 0.25 0.29 0.37 0.45
0.09 0.07 0.08 0.11 0.18 0.18 0.11 0.12 0.05 0.09 0.09 0.26 0.06 0.2 0.12 0.12 0.1 1.0 0.12 0.14 0.12 0.16 0.07 0.09 0.12 0.13 0.1 0.03 0.22 0.51
0.49 0.41 0.32 0.44 0.36 0.28 0.3 0.37 0.3 0.35 0.38 0.42 0.42 0.69 0.37 0.42 0.44 1.0 0.26 0.29 0.4 0.3 0.38 0.3 0.24 0.4 0.34 0.36 0.47 0.48
0.51 0.6 0.47 0.44 0.55 0.45 0.39 0.53 0.34 0.37 0.39 0.38 0.43 0.8 0.48 0.45 0.46 1.0 0.47 0.41 0.4 0.36 0.55 0.51 0.39 0.43 0.4 0.44 0.55 0.69
0.63 0.67 0.58 0.51 0.68 0.49 0.51 0.52 0.39 0.51 0.47 0.42 0.44 0.83 0.44 0.57 0.43 1.0 0.51 0.5 0.48 0.47 0.65 0.55 0.49 0.47 0.43 0.53 0.62 0.75
0.54 0.66 0.47 0.47 0.63 0.4 0.22 0.25 0.36 0.48 0.4 0.36 0.33 1.0 0.49 0.46 0.47 0.92 0.4 0.34 0.53 0.35 0.41 0.46 0.39 0.47 0.47 0.39 0.51 0.51
0.41 0.39 0.24 0.24 0.35 0.37 0.24 0.35 0.2 0.22 0.2 0.2 0.33 0.91 0.3 0.3 0.27 1.0 0.23 0.28 0.26 0.27 0.35 0.28 0.27 0.27 0.25 0.35 0.34 0.19
0.25 0.31 0.2 0.14 0.4 0.31 0.27 0.24 0.26 0.33 0.21 0.22 0.24 0.77 0.3 0.22 0.23 1.0 0.21 0.23 0.21 0.22 0.41 0.2 0.2 0.23 0.22 0.4 0.29 0.25
0.34 0.37 0.24 0.27 0.45 0.26 0.27 0.23 0.21 0.32 0.25 0.24 0.42 0.7 0.26 0.29 0.28 1.0 0.26 0.23 0.28 0.28 0.33 0.28 0.29 0.33 0.31 0.32 0.27 0.32
0.47 0.49 0.38 0.31 0.68 0.58 0.46 0.34 0.36 0.41 0.4 0.44 0.44 0.95 0.5 0.5 0.48 1.0 0.43 0.43 0.47 0.45 0.46 0.45 0.38 0.44 0.45 0.41 0.42 0.53
0.48 0.44 0.38 0.27 0.49 0.47 0.38 0.38 0.33 0.35 0.29 0.3 0.39 0.86 0.37 0.47 0.32 1.0 0.34 0.29 0.36 0.35 0.27 0.35 0.34 0.36 0.39 0.43 0.39 0.35
0.48 0.47 0.37 0.35 0.51 0.49 0.49 0.38 0.41 0.46 0.45 0.43 0.38 0.89 0.48 0.45 0.47 1.0 0.41 0.4 0.41 0.42 0.37 0.45 0.42 0.47 0.38 0.44 0.47 0.48
0.5 0.44 0.22 0.21 0.46 0.44 0.33 0.23 0.16 0.2 0.22 0.25 0.28 1.0 0.34 0.35 0.32 0.81 0.22 0.23 0.23 0.24 0.26 0.24 0.17 0.2 0.2 0.31 0.22 0.39
0.48 0.4 0.35 0.37 0.48 0.42 0.33 0.35 0.4 0.42 0.36 0.4 0.36 0.87 0.45 0.42 0.41 1.0 0.36 0.31 0.43 0.39 0.46 0.44 0.35 0.4 0.4 0.46 0.43 0.33
0.18 0.28 0.11 0.07 0.45 0.25 0.17 0.12 0.16 0.24 0.14 0.15 0.23 0.8 0.23 0.22 0.2 1.0 0.2 0.15 0.22 0.19 0.27 0.28 0.16 0.2 0.19 0.24 0.25 0.18
0.38 0.45 0.41 0.42 0.46 0.45 0.42 0.44 0.4 0.4 0.37 0.4 0.41 0.6 0.41 0.47 0.44 1.0 0.31 0.34 0.4 0.34 0.47 0.31 0.28 0.37 0.39 0.43 0.39 0.61
0.44 0.37 0.29 0.23 0.51 0.37 0.27 0.14 0.28 0.31 0.26 0.32 0.24 1.0 0.35 0.31 0.3 0.96 0.3 0.31 0.31 0.3 0.27 0.31 0.24 0.35 0.24 0.23 0.34 0.31
0.52 0.53 0.32 0.19 0.49 0.35 0.31 0.34 0.3 0.35 0.3 0.32 0.33 0.96 0.37 0.36 0.33 1.0 0.27 0.3 0.31 0.28 0.5 0.29 0.28 0.34 0.38 0.39 0.37 0.39
0.41 0.44 0.35 0.37 0.43 0.37 0.31 0.31 0.35 0.46 0.36 0.4 0.39 0.92 0.4 0.42 0.43 1.0 0.36 0.36 0.37 0.36 0.32 0.39 0.39 0.34 0.34 0.38 0.4 0.44
0.46 0.43 0.28 0.2 0.44 0.36 0.27 0.24 0.26 0.31 0.25 0.27 0.25 0.91 0.32 0.29 0.28 1.0 0.24 0.21 0.27 0.25 0.34 0.29 0.23 0.26 0.25 0.4 0.36 0.24
0.53 0.62 0.49 0.33 0.74 0.46 0.42 0.5 0.44 0.64 0.38 0.4 0.36 1.0 0.45 0.52 0.5 0.89 0.42 0.37 0.42 0.41 0.41 0.49 0.4 0.47 0.4 0.36 0.58 0.59
0.38 0.47 0.24 0.19 0.2 0.28 0.2 0.26 0.21 0.25 0.22 0.18 0.24 0.6 0.28 0.1 0.32 1.0 0.04 0.2 0.14 0.2 0.22 0.22 0.18 0.25 0.2 0.25 0.43 0.46
0.59 0.54 0.45 0.37 0.59 0.5 0.43 0.45 0.42 0.55 0.42 0.41 0.57 0.94 0.51 0.45 0.44 1.0 0.38 0.34 0.43 0.41 0.4 0.41 0.41 0.46 0.47 0.58 0.53 0.51
0.55 0.61 0.48 0.43 0.61 0.51 0.37 0.48 0.54 0.7 0.48 0.51 0.54 0.93 0.5 0.55 0.54 1.0 0.44 0.43 0.47 0.49 0.47 0.52 0.56 0.47 0.42 0.51 0.52 0.59
Spov3_chr3.04324 (UMAMIT33)
 0.17 0.11 0.07 0.01 0.28 0.2 0.18 0.09 0.12 0.18 0.1 0.17 0.05 0.71 0.16 0.08 0.1 1.0 0.08 0.08 0.15 0.12 0.01 0.07 0.06 0.08 0.09 0.17 0.14 0.11
0.44 0.41 0.33 0.24 0.27 0.37 0.22 0.28 0.25 0.24 0.26 0.29 0.26 1.0 0.32 0.34 0.3 0.63 0.29 0.25 0.29 0.37 0.26 0.34 0.26 0.26 0.3 0.36 0.39 0.39
0.52 0.48 0.32 0.29 0.47 0.52 0.34 0.26 0.3 0.29 0.26 0.26 0.38 0.94 0.33 0.37 0.37 1.0 0.3 0.26 0.28 0.29 0.41 0.27 0.22 0.26 0.25 0.36 0.33 0.27
0.47 0.42 0.34 0.33 0.53 0.42 0.32 0.36 0.32 0.36 0.29 0.24 0.32 0.9 0.27 0.4 0.33 1.0 0.3 0.31 0.37 0.37 0.36 0.33 0.24 0.37 0.34 0.33 0.42 0.51
0.41 0.4 0.25 0.22 0.47 0.3 0.22 0.22 0.17 0.34 0.27 0.3 0.35 0.97 0.3 0.29 0.27 1.0 0.32 0.22 0.26 0.3 0.43 0.28 0.24 0.32 0.35 0.37 0.33 0.35
0.63 0.63 0.48 0.41 0.57 0.55 0.4 0.39 0.45 0.54 0.43 0.45 0.38 0.93 0.55 0.53 0.47 1.0 0.38 0.4 0.44 0.39 0.53 0.4 0.41 0.41 0.43 0.45 0.5 0.54
0.57 0.53 0.4 0.45 0.49 0.45 0.44 0.38 0.38 0.4 0.46 0.46 0.39 0.74 0.45 0.45 0.51 1.0 0.37 0.34 0.38 0.39 0.42 0.42 0.35 0.42 0.4 0.38 0.52 0.63
0.46 0.43 0.24 0.15 0.34 0.45 0.34 0.32 0.25 0.31 0.26 0.29 0.27 1.0 0.37 0.36 0.28 0.81 0.29 0.27 0.3 0.34 0.23 0.31 0.31 0.32 0.3 0.39 0.57 0.38
0.6 0.67 0.51 0.55 0.7 0.56 0.43 0.46 0.51 0.54 0.55 0.53 0.55 0.96 0.61 0.58 0.57 1.0 0.55 0.5 0.62 0.49 0.56 0.59 0.55 0.55 0.52 0.55 0.56 0.58
0.47 0.48 0.38 0.36 0.52 0.37 0.28 0.25 0.37 0.45 0.35 0.33 0.35 1.0 0.42 0.41 0.4 0.96 0.4 0.33 0.39 0.39 0.33 0.35 0.37 0.38 0.38 0.4 0.36 0.39
Spov3_chr5.01104 (CYP704A2)
 0.14 0.18 0.14 0.12 0.31 0.26 0.13 0.12 0.13 0.18 0.12 0.08 0.28 0.79 0.19 0.19 0.21 1.0 0.1 0.08 0.17 0.13 0.14 0.06 0.09 0.14 0.15 0.1 0.13 0.25
0.53 0.54 0.44 0.41 0.59 0.53 0.49 0.45 0.46 0.42 0.41 0.49 0.38 0.94 0.51 0.53 0.51 1.0 0.45 0.46 0.47 0.46 0.55 0.51 0.41 0.45 0.42 0.49 0.58 0.47
0.59 0.57 0.45 0.45 0.55 0.54 0.46 0.38 0.41 0.51 0.41 0.42 0.44 1.0 0.59 0.53 0.54 0.86 0.41 0.43 0.43 0.45 0.5 0.39 0.42 0.48 0.45 0.44 0.52 0.55
Spov3_chr5.03669 (UGT74E2)
 0.33 0.36 0.33 0.28 0.47 0.27 0.22 0.32 0.24 0.29 0.26 0.24 0.36 0.57 0.38 0.32 0.38 1.0 0.28 0.32 0.28 0.24 0.44 0.23 0.27 0.26 0.32 0.31 0.47 0.57
0.27 0.37 0.28 0.19 0.42 0.27 0.24 0.31 0.31 0.39 0.35 0.24 0.31 0.83 0.31 0.27 0.29 1.0 0.26 0.32 0.36 0.29 0.29 0.21 0.2 0.32 0.28 0.18 0.22 0.36
0.46 0.49 0.36 0.32 0.52 0.44 0.4 0.45 0.36 0.41 0.34 0.36 0.35 0.85 0.39 0.38 0.43 1.0 0.38 0.25 0.4 0.34 0.49 0.41 0.37 0.38 0.35 0.42 0.45 0.4
0.54 0.54 0.41 0.36 0.49 0.54 0.44 0.39 0.38 0.48 0.39 0.42 0.48 0.91 0.45 0.49 0.47 1.0 0.33 0.31 0.37 0.39 0.37 0.44 0.37 0.41 0.38 0.49 0.54 0.53
0.32 0.39 0.35 0.3 0.55 0.5 0.35 0.5 0.34 0.38 0.35 0.37 0.46 0.91 0.4 0.46 0.43 1.0 0.37 0.36 0.4 0.37 0.32 0.37 0.36 0.4 0.4 0.44 0.56 0.41
0.46 0.47 0.39 0.38 0.43 0.43 0.29 0.47 0.44 0.54 0.34 0.41 0.38 1.0 0.43 0.42 0.44 0.96 0.36 0.37 0.42 0.35 0.43 0.47 0.41 0.41 0.36 0.4 0.42 0.39
0.42 0.42 0.27 0.28 0.48 0.34 0.29 0.25 0.26 0.27 0.26 0.26 0.29 0.85 0.43 0.43 0.38 1.0 0.27 0.29 0.27 0.26 0.35 0.24 0.21 0.29 0.28 0.22 0.38 0.42
0.43 0.44 0.44 0.43 0.52 0.33 0.32 0.28 0.29 0.4 0.31 0.31 0.32 0.81 0.44 0.42 0.41 1.0 0.39 0.27 0.31 0.32 0.37 0.32 0.3 0.4 0.37 0.41 0.38 0.51

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)