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Heatmap: Cluster_123 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.42 -0.8 0.38 0.71 -1.87 0.54 1.51 1.07 0.14 -1.72 0.76 0.42 -0.04 -1.68 0.1 -0.02 -0.93 -0.42 -0.52 -0.11 -0.92 -0.34 -0.19 -0.29 -0.11 -0.96 -1.5 0.33 0.64 -2.6
0.63 0.66 0.32 -0.2 -0.09 0.09 -0.59 -1.55 -0.49 0.05 -0.98 -0.78 -1.42 1.61 -0.9 -0.59 -1.23 1.78 -0.73 -0.66 -0.95 -0.7 -0.05 -0.23 -1.97 -1.08 -1.49 -0.18 0.83 1.32
-0.04 0.34 0.06 0.11 -0.1 0.03 0.15 0.52 0.14 0.21 0.25 -0.21 -0.27 0.37 -0.14 0.83 0.07 -0.55 -0.04 -0.51 0.03 -0.48 -0.13 -0.46 0.15 -0.13 0.04 -0.35 -0.41 -0.6
1.16 0.53 -0.78 -1.44 0.42 1.1 0.18 -0.76 -0.3 -0.15 -1.54 -1.01 -2.28 1.73 -1.06 -0.58 -2.21 -1.28 -0.54 -0.59 -1.66 -1.13 -1.24 -1.37 -2.04 -2.35 -1.47 -0.34 1.26 2.43
0.38 -0.03 -0.0 -0.43 0.14 0.53 0.46 0.08 0.09 -0.42 -0.09 0.01 -0.66 0.29 -0.01 0.3 -0.56 0.21 0.06 -0.24 -0.68 0.01 -0.64 -0.22 -0.78 -0.61 -0.73 0.0 0.46 1.05
0.41 0.11 -0.67 -1.4 0.45 1.03 0.53 -0.05 -0.42 -0.58 -0.45 -0.35 -0.8 0.91 -0.5 0.17 -1.15 -0.49 0.01 -0.57 -1.19 -0.09 -0.83 -0.52 -1.14 -0.74 -1.18 -0.04 0.51 2.06
0.05 -0.18 0.07 -0.11 -0.53 0.4 0.17 -0.53 -0.05 -0.3 0.11 0.34 0.29 -0.09 0.17 -0.04 -0.11 -0.18 0.23 0.4 0.05 0.14 0.46 0.67 -0.09 -0.32 -0.64 -0.53 -0.44 -0.58
0.54 -0.01 -0.25 -0.19 -0.15 0.64 0.71 -0.06 0.03 0.08 0.1 0.26 -0.51 0.12 0.34 -0.12 0.16 -0.34 -0.32 -0.03 -0.13 -0.04 -0.07 0.08 -0.42 -0.25 -0.63 -0.06 -0.06 -0.49
0.18 0.55 -0.48 -1.3 0.37 1.12 -0.02 -1.26 -0.77 -0.56 -1.2 -0.67 -1.45 1.88 -0.38 0.29 -1.05 0.71 -0.48 -1.02 -1.14 -0.53 -1.56 -1.23 -1.2 -0.88 -0.82 -0.38 -0.03 2.17
-1.02 -0.96 -0.1 0.16 -1.03 0.97 0.79 0.78 -0.22 -0.47 -0.12 0.29 0.58 -0.04 0.1 -0.15 0.21 -0.44 0.16 0.51 -0.38 0.11 0.72 -0.49 -0.72 -0.41 -0.74 -0.71 -0.71 0.08
0.62 -0.04 -0.35 -0.9 -0.33 1.15 0.8 -0.63 -0.22 -0.45 -0.22 0.3 -0.48 0.74 0.91 0.33 -0.02 -1.0 -0.53 -0.09 -0.46 0.02 0.68 0.24 -0.22 -0.51 -0.69 -0.04 -1.0 -2.06
-1.79 -1.16 -0.98 0.15 -1.44 1.0 1.54 0.51 -1.27 -1.05 0.68 0.02 0.36 -0.5 1.08 0.31 1.06 -0.46 -0.7 0.05 -0.94 0.18 -0.57 -0.36 -0.49 -0.39 -0.62 -0.72 -0.46 0.07
-0.79 -0.9 -0.47 -0.3 -0.78 0.25 0.81 0.66 -0.06 -0.36 0.16 0.19 0.59 -0.73 -0.01 0.05 -0.11 0.49 0.28 0.87 -0.07 0.53 -0.09 0.09 -0.4 -0.26 -0.31 -0.77 -0.74 -0.4
-0.08 -0.1 -0.75 -0.35 0.45 0.28 -0.4 0.2 -1.05 -0.97 -0.39 -0.79 -0.83 0.42 0.23 0.56 0.45 -1.56 0.05 -0.56 -0.23 -0.98 1.58 0.97 -0.33 0.17 -0.23 -0.22 0.01 0.02
-0.27 -0.18 -0.6 -0.76 0.64 0.5 -0.06 -0.19 -0.5 -0.48 -0.27 -0.18 -0.5 1.01 0.59 0.38 0.48 -2.21 -0.24 -0.35 -0.14 -0.2 0.8 0.73 0.01 0.07 -0.07 -0.49 -0.51 -0.5
-0.29 -0.07 -1.37 -0.47 -0.18 1.39 0.68 0.47 -0.52 -0.42 -0.54 -0.13 1.1 1.31 0.64 0.12 0.08 -2.36 -0.79 -0.24 -0.55 -1.07 0.33 -0.33 -0.37 -0.39 -0.28 -0.01 -1.68 -0.4
0.21 -0.49 -0.24 -0.46 -0.51 -0.06 0.05 -0.2 -0.3 -0.44 0.24 0.36 0.42 0.48 0.41 0.08 0.29 0.37 -0.2 0.22 -0.21 0.07 0.15 0.33 -0.07 -0.34 -0.73 -0.37 -0.05 -0.11
-0.33 -0.92 -0.06 0.1 -1.48 1.29 0.35 -0.67 -0.49 -0.43 0.2 -0.01 0.16 0.93 0.79 0.34 -0.26 -0.94 -0.24 0.23 -0.46 0.37 0.22 -0.6 -1.24 -0.81 -1.52 -1.11 -0.28 1.3
-0.22 -0.54 0.01 0.04 -0.28 0.67 0.07 -0.54 0.25 0.02 0.35 0.51 0.05 0.17 0.36 0.16 0.13 -0.36 -0.09 0.11 -0.23 0.07 0.26 0.21 -0.44 -0.48 -0.73 -0.31 -0.17 -0.13
-0.59 -0.29 -0.78 -0.4 -0.01 1.01 1.21 1.13 -0.92 -0.34 -0.36 0.02 0.65 -0.15 0.05 0.66 0.25 0.05 0.05 0.33 -2.1 -0.13 1.02 -1.15 -1.21 -0.26 -0.2 -2.02 -1.97 -0.54
0.84 0.81 -0.02 -0.36 0.74 0.53 -0.49 -0.66 -1.06 0.27 -0.65 -0.63 -0.75 1.48 -0.56 -0.69 -0.8 0.95 -1.26 -0.93 -0.65 -0.87 -1.34 -0.58 -1.44 -0.6 -1.11 -0.14 0.87 1.41
-0.81 -0.4 -0.49 -0.73 -0.92 0.24 0.27 0.88 0.38 -0.19 0.04 0.23 0.08 -0.58 0.28 0.64 0.26 1.21 -0.52 -0.01 -0.27 -0.21 0.09 -0.28 -0.24 -0.24 -0.56 0.1 -0.4 -0.43
-0.53 -2.1 -0.22 0.09 -0.98 1.3 1.12 0.22 0.34 -0.71 0.03 -0.12 -0.56 0.76 0.66 0.07 -0.46 -0.6 -0.17 0.16 -0.78 0.09 -0.05 -0.59 -0.47 -1.16 -1.48 -1.16 -0.03 1.27
0.21 0.05 -0.21 -0.68 0.6 0.65 -0.01 -1.09 -0.17 -0.02 -0.26 -0.22 -0.59 1.1 0.15 -0.15 -0.1 0.8 -0.18 -0.38 -0.31 -0.46 -0.35 -0.17 -0.8 -0.44 -0.21 -0.29 0.22 0.75
0.54 0.61 -0.75 -1.98 -0.43 -0.03 -0.69 -1.07 -0.87 -0.49 -1.07 -0.65 -1.25 1.74 -0.06 -0.47 -0.78 1.9 0.1 -0.94 -0.71 -0.81 -0.22 -0.37 -0.42 -0.01 -1.04 -0.4 -0.18 1.55
-0.31 -0.02 -1.76 -1.05 0.63 1.39 0.57 1.27 -0.33 -0.02 -0.27 -1.83 0.84 0.79 -0.28 -1.3 -0.84 0.67 -2.17 0.03 - 0.2 0.2 -0.05 -1.42 -0.47 0.67 -0.13 0.32 -2.18
-1.62 -0.89 -0.73 -0.41 -1.84 1.18 1.01 -1.3 -1.67 -0.68 0.02 -0.14 0.66 0.49 0.13 0.01 -0.08 -0.57 0.42 0.13 -0.22 -0.21 -2.56 0.61 -1.06 -0.2 -0.05 -0.7 0.06 1.78
-0.69 -0.2 0.03 -0.1 0.04 0.62 0.68 0.33 -0.01 -0.08 0.16 0.21 -0.14 0.5 0.09 0.12 0.15 -0.51 0.1 0.25 -0.17 -0.07 -0.26 -0.38 -1.02 -0.2 -0.49 -0.11 -0.37 0.18
0.16 0.15 0.06 -0.24 0.26 0.28 -0.07 -0.53 -0.04 -0.12 -0.08 -0.08 0.01 0.71 0.34 0.37 0.27 0.18 -0.09 -0.02 -0.02 -0.11 -0.02 -0.11 -0.36 -0.25 -0.34 -0.28 -0.57 -0.24
0.01 -1.43 0.02 0.13 -2.91 1.08 0.22 -0.25 0.11 -0.61 -0.09 0.05 0.71 1.67 0.29 -0.12 -0.58 -0.6 -0.33 -0.07 -1.07 0.02 -0.0 -1.02 -1.81 -0.98 -1.41 -0.49 -0.14 1.47
0.17 0.05 0.05 -0.21 -0.41 0.92 -0.08 -0.81 -0.46 -0.3 -0.2 0.1 -0.66 1.24 0.15 -0.02 -0.33 -1.22 -0.14 -0.1 -0.46 -0.22 0.57 -0.07 -0.9 -0.69 -1.08 -0.24 0.42 1.2
-0.38 -0.7 0.02 0.1 -0.21 0.65 0.56 -0.02 0.43 -0.38 0.2 0.22 0.18 -0.45 0.02 -0.06 -0.2 0.39 -0.06 0.36 -0.14 -0.03 0.35 0.03 -0.38 -0.21 -0.56 -0.06 -0.5 -0.34
0.12 -0.22 0.01 0.04 -0.53 0.19 0.28 0.34 0.15 0.0 0.05 0.05 0.14 -0.72 0.18 0.18 0.18 -0.23 -0.09 -0.17 -0.12 -0.03 0.35 0.12 -0.11 -0.14 -0.29 0.03 -0.13 -0.13
Spov3_chr4.02851 (UMAMIT13)
 -0.86 -0.46 -0.16 -0.55 -0.07 0.85 0.73 0.26 -0.28 -0.52 0.13 0.27 0.1 0.39 0.6 0.3 0.01 -0.23 0.11 0.33 -0.34 0.02 0.57 0.47 -0.66 -0.32 -0.5 -0.39 -1.48 -1.19
0.73 0.62 -0.18 -0.97 0.55 0.55 0.35 0.09 -0.73 -0.27 -0.71 -0.22 -0.33 0.66 0.01 0.03 -0.31 -0.25 -0.59 -0.35 -0.51 -0.41 -2.63 -0.31 -0.63 -0.31 -0.58 -0.1 0.51 1.51
0.09 -0.28 0.22 0.48 -0.42 0.79 0.59 -0.04 0.35 -0.54 0.19 0.42 -0.22 -0.39 0.34 -0.08 0.16 -1.73 -0.26 0.07 -0.41 -0.1 -0.05 0.29 0.09 -0.59 -0.72 -0.5 0.3 -0.22
0.15 -1.28 0.2 0.09 -0.27 -0.21 0.81 0.16 0.15 -0.36 1.09 0.37 0.11 0.09 0.03 -0.55 -0.12 -0.56 -0.4 0.12 -0.4 0.02 0.17 0.81 -0.44 -0.36 -0.46 -0.26 0.04 -1.59
-0.04 -0.1 -0.26 -0.64 0.42 0.88 0.49 -0.06 -0.16 -0.06 0.06 0.14 -0.63 0.27 0.23 0.16 0.22 -0.2 -0.16 0.2 -0.05 0.03 -0.56 0.16 -0.48 -0.11 -0.58 -0.13 -0.12 -0.11
0.71 0.31 0.19 -0.21 -1.28 0.29 -0.01 -0.61 -0.71 -0.95 -0.42 -0.17 -0.57 1.81 0.18 -0.05 -0.31 -0.84 -0.44 0.01 -0.54 -0.36 0.5 0.57 -0.83 -0.65 -1.14 -0.41 0.32 0.73
Spov3_chr5.00008 (UMAMIT19)
 0.23 0.08 -0.07 -0.6 0.74 0.72 0.02 -1.0 -0.09 0.12 -0.09 -0.06 -0.27 0.77 0.41 0.29 0.19 -0.52 -0.26 -0.12 -0.33 -0.14 0.61 0.11 -0.57 -0.2 -0.49 -0.25 -0.47 -0.75
Spov3_chr5.00320 (CYP86C4)
 0.26 -0.09 0.29 0.35 -1.4 0.71 0.07 -0.6 -0.18 -0.26 -0.26 -0.38 -0.7 0.89 0.52 0.43 0.07 -1.88 -0.15 -0.07 -0.25 -0.14 -0.22 -0.3 -0.94 -0.48 -0.89 -0.57 0.56 1.34
-0.05 -0.2 -0.18 -0.24 -0.25 0.16 0.37 0.13 0.09 -0.02 0.13 0.21 0.34 0.14 0.01 -0.1 -0.03 -0.05 -0.03 0.17 -0.08 -0.02 -0.1 -0.05 -0.09 -0.14 -0.01 -0.11 -0.13 -0.13
0.08 0.02 -0.05 0.01 0.08 0.28 0.26 0.07 -0.12 -0.13 -0.08 -0.02 -0.24 0.15 -0.06 0.15 0.11 -0.13 -0.04 -0.03 0.14 0.04 0.09 -0.07 0.06 -0.08 -0.17 -0.13 -0.24 -0.13
-0.28 -0.08 0.11 0.07 0.14 -0.23 0.54 0.56 -0.15 0.47 -0.59 -0.42 0.36 0.34 -0.65 0.36 0.48 0.88 -0.35 -1.14 -0.47 -0.54 0.83 -0.61 0.35 -0.04 -0.4 -1.66 -0.16 -0.94
-0.03 -0.15 -0.06 -0.37 0.2 0.31 0.39 0.25 -0.03 -0.17 -0.11 -0.13 0.15 0.45 0.04 -0.01 0.02 -0.01 -0.03 0.19 -0.05 -0.16 -0.34 -0.09 -0.2 -0.14 -0.15 -0.1 -0.14 0.09
-0.85 -1.21 -0.52 0.51 -1.31 1.22 1.31 0.54 -0.1 -1.08 0.17 0.2 0.32 0.03 0.41 0.42 -0.21 -2.05 -0.2 0.55 -1.24 0.22 -0.66 -0.9 -1.42 -0.64 -1.4 -1.1 -0.2 1.42
0.42 0.31 0.23 0.0 0.2 0.21 0.53 0.85 0.32 -0.52 -0.21 -0.03 -0.12 -1.78 -0.09 0.03 -0.91 -0.57 -0.51 -0.46 -0.58 -0.44 -0.58 -0.05 0.24 -0.43 -0.05 0.99 0.28 -0.05
0.19 - - -0.98 0.48 -0.18 -0.08 1.11 -0.98 0.19 1.51 - - 1.01 - 1.71 0.09 - 0.08 1.46 0.23 - -0.09 0.47 -1.06 1.27 - 0.59 - -1.21
0.28 0.09 0.24 0.13 -0.18 0.75 0.13 -0.64 -0.3 -0.22 -0.28 -0.08 -1.01 0.66 0.09 0.08 -0.1 -0.45 -0.08 -0.13 -0.33 -0.14 0.11 -0.13 -0.68 -0.38 -0.64 -0.46 0.45 1.11
0.24 0.15 0.08 -0.01 -0.5 0.49 -0.29 -1.14 -0.37 -0.21 -0.38 -0.31 -1.36 0.98 0.08 0.0 -0.25 0.56 -0.12 -0.05 -0.18 -0.1 -0.2 -0.04 -0.82 -0.32 -0.79 -0.45 0.52 1.42
-1.02 -2.33 -0.49 -0.66 -2.05 0.94 0.82 -0.37 -0.37 -0.67 -0.51 0.0 0.48 0.96 0.95 0.35 -0.06 0.14 -0.04 -0.44 -2.07 0.34 -1.51 -0.8 -1.77 -0.82 -0.23 -1.04 -0.33 2.14
-0.14 -0.37 -0.22 0.28 -1.48 1.28 0.03 -0.45 -0.56 -0.14 -0.37 -0.4 -1.25 1.79 0.41 0.22 -0.25 -0.86 -0.26 -0.07 -0.95 -0.4 -0.21 -0.16 -1.74 -1.23 -1.45 -1.09 0.38 1.65
-0.65 -0.91 -0.41 -0.78 -4.11 0.46 1.11 0.95 0.2 -0.42 0.66 0.44 0.41 -1.45 0.36 0.28 -0.13 0.82 0.03 0.73 -0.06 0.51 -2.4 -0.19 -0.28 -0.23 -0.55 -0.47 -1.47 -0.5
Spov3_S21.00001 (SWEET9)
 -1.06 0.26 -0.64 0.2 0.71 0.45 0.92 0.87 -1.91 -0.63 0.38 0.27 0.3 -0.48 -0.77 -0.79 -0.14 -0.48 -2.53 -0.07 -0.43 -0.77 0.94 0.33 -0.12 0.14 -0.08 -1.3 -0.39 0.9

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.