1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_123 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.47 0.2 0.45 0.58 0.1 0.51 1.0 0.74 0.39 0.11 0.59 0.47 0.34 0.11 0.37 0.35 0.18 0.26 0.24 0.33 0.18 0.28 0.31 0.29 0.32 0.18 0.12 0.44 0.55 0.06
0.45 0.46 0.37 0.25 0.27 0.31 0.19 0.1 0.21 0.3 0.15 0.17 0.11 0.89 0.16 0.19 0.12 1.0 0.18 0.18 0.15 0.18 0.28 0.25 0.07 0.14 0.1 0.26 0.52 0.73
0.55 0.71 0.59 0.61 0.53 0.57 0.63 0.81 0.62 0.65 0.67 0.49 0.47 0.73 0.51 1.0 0.59 0.39 0.55 0.4 0.57 0.41 0.51 0.41 0.62 0.52 0.58 0.44 0.42 0.37
0.41 0.27 0.11 0.07 0.25 0.4 0.21 0.11 0.15 0.17 0.06 0.09 0.04 0.61 0.09 0.12 0.04 0.08 0.13 0.12 0.06 0.08 0.08 0.07 0.04 0.04 0.07 0.15 0.44 1.0
0.63 0.47 0.48 0.36 0.53 0.69 0.66 0.51 0.51 0.36 0.45 0.49 0.31 0.59 0.48 0.59 0.33 0.56 0.5 0.41 0.3 0.48 0.31 0.41 0.28 0.31 0.29 0.48 0.66 1.0
0.32 0.26 0.15 0.09 0.33 0.49 0.35 0.23 0.18 0.16 0.18 0.19 0.14 0.45 0.17 0.27 0.11 0.17 0.24 0.16 0.11 0.23 0.13 0.17 0.11 0.14 0.11 0.23 0.34 1.0
0.65 0.55 0.66 0.58 0.44 0.83 0.71 0.43 0.61 0.51 0.68 0.79 0.77 0.59 0.7 0.61 0.58 0.56 0.73 0.83 0.65 0.69 0.87 1.0 0.59 0.5 0.4 0.43 0.46 0.42
0.89 0.61 0.52 0.53 0.55 0.95 1.0 0.59 0.62 0.65 0.65 0.73 0.43 0.67 0.78 0.56 0.69 0.48 0.49 0.6 0.56 0.59 0.58 0.65 0.46 0.51 0.39 0.59 0.59 0.44
0.25 0.33 0.16 0.09 0.29 0.49 0.22 0.09 0.13 0.15 0.1 0.14 0.08 0.82 0.17 0.27 0.11 0.36 0.16 0.11 0.1 0.15 0.08 0.09 0.1 0.12 0.13 0.17 0.22 1.0
0.25 0.26 0.47 0.57 0.25 1.0 0.88 0.88 0.44 0.37 0.47 0.62 0.76 0.5 0.54 0.46 0.59 0.38 0.57 0.73 0.39 0.55 0.84 0.36 0.31 0.39 0.31 0.31 0.31 0.54
0.69 0.44 0.35 0.24 0.36 1.0 0.79 0.29 0.39 0.33 0.39 0.55 0.32 0.75 0.85 0.57 0.44 0.22 0.31 0.42 0.33 0.46 0.72 0.53 0.38 0.32 0.28 0.44 0.23 0.11
0.1 0.15 0.17 0.38 0.13 0.69 1.0 0.49 0.14 0.17 0.55 0.35 0.44 0.24 0.72 0.43 0.72 0.25 0.21 0.36 0.18 0.39 0.23 0.27 0.25 0.26 0.22 0.21 0.25 0.36
0.32 0.29 0.4 0.45 0.32 0.65 0.96 0.87 0.53 0.43 0.61 0.62 0.83 0.33 0.54 0.57 0.51 0.77 0.67 1.0 0.52 0.79 0.52 0.58 0.42 0.46 0.44 0.32 0.33 0.42
0.32 0.31 0.2 0.26 0.46 0.41 0.25 0.38 0.16 0.17 0.26 0.19 0.19 0.45 0.39 0.49 0.46 0.11 0.35 0.23 0.29 0.17 1.0 0.66 0.27 0.38 0.28 0.29 0.34 0.34
0.41 0.44 0.33 0.29 0.77 0.7 0.48 0.44 0.35 0.36 0.41 0.44 0.35 1.0 0.75 0.64 0.69 0.11 0.42 0.39 0.45 0.43 0.86 0.82 0.5 0.52 0.47 0.35 0.35 0.35
0.31 0.36 0.15 0.28 0.34 1.0 0.61 0.53 0.27 0.29 0.26 0.35 0.82 0.95 0.6 0.42 0.4 0.07 0.22 0.32 0.26 0.18 0.48 0.3 0.3 0.29 0.32 0.38 0.12 0.29
0.83 0.51 0.61 0.52 0.5 0.69 0.74 0.63 0.58 0.53 0.85 0.92 0.96 1.0 0.95 0.76 0.88 0.93 0.63 0.84 0.62 0.75 0.79 0.9 0.68 0.57 0.43 0.55 0.69 0.66
0.32 0.21 0.39 0.44 0.15 0.99 0.52 0.26 0.29 0.3 0.46 0.4 0.45 0.77 0.7 0.51 0.34 0.21 0.34 0.48 0.29 0.53 0.47 0.27 0.17 0.23 0.14 0.19 0.33 1.0
0.54 0.43 0.63 0.64 0.52 1.0 0.66 0.43 0.75 0.63 0.8 0.9 0.65 0.71 0.81 0.7 0.69 0.49 0.59 0.68 0.53 0.66 0.75 0.73 0.46 0.45 0.38 0.51 0.56 0.57
0.29 0.35 0.25 0.33 0.43 0.87 1.0 0.95 0.23 0.34 0.34 0.44 0.68 0.39 0.45 0.68 0.52 0.45 0.45 0.55 0.1 0.4 0.88 0.2 0.19 0.36 0.38 0.11 0.11 0.3
0.64 0.63 0.35 0.28 0.6 0.52 0.26 0.23 0.17 0.43 0.23 0.23 0.21 1.0 0.24 0.22 0.21 0.69 0.15 0.19 0.23 0.2 0.14 0.24 0.13 0.24 0.17 0.32 0.65 0.95
0.25 0.33 0.31 0.26 0.23 0.51 0.52 0.8 0.56 0.38 0.45 0.51 0.46 0.29 0.53 0.68 0.52 1.0 0.3 0.43 0.36 0.38 0.46 0.36 0.37 0.37 0.29 0.46 0.33 0.32
0.28 0.1 0.35 0.43 0.21 1.0 0.88 0.47 0.51 0.25 0.42 0.38 0.28 0.69 0.64 0.43 0.3 0.27 0.36 0.46 0.24 0.43 0.39 0.27 0.29 0.18 0.15 0.18 0.4 0.98
0.54 0.48 0.4 0.29 0.7 0.73 0.46 0.22 0.41 0.46 0.39 0.4 0.31 1.0 0.52 0.42 0.43 0.81 0.41 0.36 0.38 0.34 0.37 0.41 0.27 0.34 0.4 0.38 0.54 0.78
0.39 0.41 0.16 0.07 0.2 0.26 0.17 0.13 0.15 0.19 0.13 0.17 0.11 0.9 0.26 0.19 0.16 1.0 0.29 0.14 0.16 0.15 0.23 0.21 0.2 0.27 0.13 0.2 0.24 0.78
0.31 0.38 0.11 0.18 0.59 1.0 0.56 0.92 0.3 0.37 0.32 0.11 0.68 0.66 0.31 0.15 0.21 0.6 0.08 0.39 0.0 0.44 0.44 0.37 0.14 0.28 0.61 0.35 0.47 0.08
0.09 0.16 0.18 0.22 0.08 0.66 0.58 0.12 0.09 0.18 0.3 0.26 0.46 0.41 0.32 0.29 0.28 0.2 0.39 0.32 0.25 0.25 0.05 0.44 0.14 0.25 0.28 0.18 0.3 1.0
0.39 0.54 0.64 0.58 0.64 0.96 1.0 0.78 0.62 0.59 0.69 0.72 0.57 0.88 0.66 0.68 0.69 0.44 0.67 0.74 0.55 0.59 0.52 0.48 0.31 0.54 0.44 0.58 0.48 0.7
0.68 0.67 0.63 0.52 0.73 0.74 0.58 0.42 0.59 0.56 0.57 0.58 0.61 1.0 0.77 0.79 0.74 0.69 0.57 0.6 0.6 0.56 0.6 0.56 0.47 0.51 0.48 0.5 0.41 0.52
0.32 0.12 0.32 0.34 0.04 0.66 0.36 0.26 0.34 0.21 0.29 0.33 0.51 1.0 0.38 0.29 0.21 0.21 0.25 0.3 0.15 0.32 0.31 0.16 0.09 0.16 0.12 0.22 0.28 0.87
0.48 0.44 0.44 0.36 0.32 0.8 0.4 0.24 0.31 0.34 0.37 0.45 0.27 1.0 0.47 0.42 0.34 0.18 0.38 0.39 0.31 0.36 0.63 0.4 0.23 0.26 0.2 0.36 0.57 0.97
0.49 0.39 0.64 0.68 0.55 1.0 0.94 0.63 0.85 0.49 0.73 0.74 0.72 0.46 0.65 0.61 0.55 0.83 0.61 0.81 0.58 0.62 0.81 0.65 0.49 0.55 0.43 0.61 0.45 0.5
0.85 0.67 0.79 0.8 0.54 0.89 0.95 0.99 0.87 0.78 0.81 0.81 0.86 0.47 0.89 0.89 0.88 0.67 0.73 0.69 0.72 0.77 1.0 0.85 0.73 0.71 0.64 0.8 0.72 0.71
Spov3_chr4.02851 (UMAMIT13)
 0.31 0.4 0.5 0.38 0.53 1.0 0.92 0.66 0.46 0.39 0.61 0.67 0.6 0.73 0.84 0.68 0.56 0.47 0.6 0.7 0.44 0.56 0.82 0.77 0.35 0.44 0.39 0.42 0.2 0.24
0.58 0.54 0.31 0.18 0.51 0.51 0.45 0.37 0.21 0.29 0.21 0.3 0.28 0.55 0.35 0.36 0.28 0.29 0.23 0.27 0.25 0.26 0.06 0.28 0.23 0.28 0.23 0.33 0.5 1.0
0.61 0.47 0.67 0.8 0.43 1.0 0.87 0.56 0.73 0.4 0.66 0.77 0.5 0.44 0.73 0.55 0.64 0.17 0.48 0.61 0.43 0.54 0.56 0.71 0.61 0.38 0.35 0.41 0.71 0.49
0.52 0.19 0.54 0.5 0.39 0.41 0.83 0.52 0.52 0.37 1.0 0.61 0.51 0.5 0.48 0.32 0.43 0.32 0.36 0.51 0.36 0.48 0.53 0.82 0.35 0.36 0.34 0.39 0.48 0.16
0.53 0.51 0.46 0.35 0.73 1.0 0.76 0.52 0.49 0.52 0.57 0.6 0.35 0.66 0.64 0.61 0.63 0.47 0.49 0.62 0.53 0.56 0.37 0.61 0.39 0.5 0.36 0.5 0.5 0.5
0.46 0.35 0.32 0.25 0.12 0.35 0.28 0.19 0.17 0.15 0.21 0.25 0.19 1.0 0.32 0.28 0.23 0.16 0.21 0.29 0.2 0.22 0.4 0.42 0.16 0.18 0.13 0.21 0.35 0.47
Spov3_chr5.00008 (UMAMIT19)
 0.69 0.62 0.56 0.39 0.98 0.97 0.6 0.29 0.55 0.64 0.55 0.56 0.49 1.0 0.78 0.72 0.67 0.41 0.49 0.54 0.47 0.53 0.9 0.63 0.4 0.51 0.42 0.49 0.42 0.35
Spov3_chr5.00320 (CYP86C4)
 0.47 0.37 0.48 0.5 0.15 0.65 0.42 0.26 0.35 0.33 0.33 0.3 0.24 0.73 0.57 0.53 0.41 0.11 0.36 0.38 0.33 0.36 0.34 0.32 0.21 0.28 0.21 0.27 0.58 1.0
0.74 0.67 0.68 0.65 0.65 0.86 1.0 0.85 0.82 0.76 0.84 0.9 0.98 0.85 0.78 0.72 0.76 0.75 0.76 0.87 0.73 0.76 0.72 0.75 0.72 0.7 0.76 0.71 0.71 0.7
0.87 0.83 0.79 0.83 0.87 1.0 0.99 0.86 0.76 0.75 0.78 0.81 0.7 0.92 0.79 0.92 0.89 0.75 0.8 0.81 0.91 0.85 0.88 0.78 0.86 0.78 0.73 0.75 0.7 0.75
0.45 0.51 0.58 0.57 0.6 0.46 0.79 0.8 0.49 0.75 0.36 0.41 0.69 0.69 0.34 0.7 0.76 1.0 0.42 0.25 0.39 0.37 0.96 0.36 0.69 0.53 0.41 0.17 0.48 0.28
0.72 0.66 0.71 0.57 0.84 0.91 0.96 0.87 0.72 0.65 0.68 0.67 0.81 1.0 0.75 0.73 0.74 0.73 0.72 0.84 0.71 0.66 0.58 0.69 0.64 0.67 0.66 0.69 0.67 0.78
0.21 0.16 0.26 0.53 0.15 0.87 0.93 0.54 0.35 0.18 0.42 0.43 0.47 0.38 0.5 0.5 0.32 0.09 0.32 0.55 0.16 0.44 0.24 0.2 0.14 0.24 0.14 0.17 0.33 1.0
0.68 0.62 0.59 0.51 0.58 0.58 0.73 0.91 0.63 0.35 0.44 0.49 0.47 0.15 0.47 0.51 0.27 0.34 0.36 0.37 0.34 0.37 0.34 0.49 0.6 0.38 0.49 1.0 0.61 0.49
0.35 0.0 0.0 0.16 0.43 0.27 0.29 0.66 0.16 0.35 0.87 0.0 0.0 0.62 0.0 1.0 0.33 0.0 0.32 0.84 0.36 0.0 0.29 0.42 0.15 0.74 0.0 0.46 0.0 0.13
0.56 0.49 0.55 0.51 0.41 0.78 0.51 0.3 0.38 0.4 0.38 0.44 0.23 0.73 0.49 0.49 0.43 0.34 0.44 0.42 0.37 0.42 0.5 0.42 0.29 0.36 0.3 0.34 0.63 1.0
0.44 0.42 0.4 0.37 0.26 0.53 0.31 0.17 0.29 0.32 0.29 0.3 0.15 0.74 0.4 0.38 0.32 0.55 0.35 0.36 0.33 0.35 0.33 0.36 0.21 0.3 0.22 0.27 0.54 1.0
0.11 0.04 0.16 0.14 0.05 0.43 0.4 0.18 0.18 0.14 0.16 0.23 0.32 0.44 0.44 0.29 0.22 0.25 0.22 0.17 0.05 0.29 0.08 0.13 0.07 0.13 0.19 0.11 0.18 1.0
0.26 0.22 0.25 0.35 0.1 0.7 0.3 0.21 0.2 0.26 0.22 0.22 0.12 1.0 0.38 0.34 0.24 0.16 0.24 0.28 0.15 0.22 0.25 0.26 0.09 0.12 0.11 0.14 0.38 0.91
0.3 0.25 0.35 0.27 0.03 0.64 1.0 0.9 0.53 0.35 0.73 0.63 0.62 0.17 0.6 0.56 0.43 0.82 0.47 0.77 0.44 0.66 0.09 0.41 0.38 0.4 0.32 0.33 0.17 0.33
Spov3_S21.00001 (SWEET9)
 0.25 0.62 0.33 0.6 0.85 0.71 0.98 0.95 0.14 0.34 0.68 0.63 0.64 0.37 0.31 0.3 0.47 0.37 0.09 0.5 0.39 0.31 1.0 0.66 0.48 0.57 0.49 0.21 0.4 0.97

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)