Heatmap: Cluster_91 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.64 0.65 0.9 0.78 0.68 0.63 0.64 0.8 0.85 0.49 0.53 0.88 0.77 1.0 0.57 0.85 0.7 0.59 0.48 0.39 0.38 0.51 0.66 0.47 0.64 0.59 0.42 0.73 0.87 0.94
0.27 0.24 0.0 0.0 0.0 0.2 0.19 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.22 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.2 0.53 0.15 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.34 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.07 0.0 0.77 0.07 0.51 0.3 0.4 0.15 0.0 0.08 0.15 0.0 0.0 0.82 0.14 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.37 0.43 0.0 0.27 0.0 1.0 0.35 0.74 0.0
0.83 0.61 0.1 0.05 0.32 0.12 0.19 0.38 0.13 0.47 0.0 0.3 0.56 0.3 0.38 0.05 0.0 0.04 0.55 0.37 0.27 0.26 0.44 0.56 0.11 0.39 0.84 1.0 0.79 0.08
0.16 0.52 0.82 0.87 0.14 0.6 0.2 0.41 0.92 1.0 0.56 0.59 0.42 0.28 0.08 0.68 0.57 0.7 0.55 0.21 0.5 0.27 0.31 0.49 0.22 0.39 0.06 0.67 0.42 0.85
0.0 1.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.53
0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0
0.44 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.72 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 1.0 0.0
0.23 0.0 0.66 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.56 0.27 0.0 0.46 0.5 0.51 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.25 0.22 0.23 1.0 0.0 0.22 0.0
0.43 0.76 0.35 0.0 0.0 0.14 0.33 0.23 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.33 0.15 0.24 0.0 0.53 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.33 0.7 0.0
0.0 0.0 0.18 0.14 0.23 0.0 0.0 0.0 0.15 0.74 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.09 0.0 1.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.37 0.3 0.0 0.15
0.34 0.78 0.69 0.57 0.21 0.51 0.48 1.0 0.76 0.55 0.44 0.48 0.76 0.45 0.17 0.52 0.81 0.74 0.33 0.38 0.42 0.27 0.85 0.54 0.71 0.39 0.47 0.45 0.54 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.38 0.0 0.0 0.31 0.0 0.36 0.0 0.29 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26
0.76 0.66 0.38 0.47 0.54 0.2 0.23 0.5 0.7 0.26 0.81 0.42 0.0 0.11 0.12 0.16 1.0 0.06 0.0 0.69 0.0 0.0 0.51 0.47 0.21 0.42 0.96 0.12 0.0 0.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.99 0.58 0.59 0.95 0.76 0.69 0.68 0.87 0.64 0.6 0.6 0.5 0.76 0.52 0.66 0.75 0.87 0.5 0.57 0.35 0.53 0.17 0.58 0.92 0.44 0.83 0.86 0.75 0.86
0.27 0.13 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.13 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.79 0.0 0.16 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.38 0.82 0.75 1.0 0.0
0.49 0.62 0.77 0.35 0.86 0.27 0.6 0.11 0.83 0.42 0.4 0.78 0.55 0.59 0.32 0.73 0.48 0.33 0.15 0.43 0.74 0.49 0.47 0.31 0.51 0.85 0.69 1.0 0.43 0.6
0.81 1.0 0.6 0.77 0.97 0.17 0.64 0.21 0.77 0.13 0.32 0.63 0.31 0.03 0.18 0.94 0.71 0.32 0.27 0.35 0.59 0.3 0.08 0.57 0.31 0.58 0.45 0.73 0.81 0.57
0.0 0.19 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.14 0.23 0.0 0.0 0.13 0.43 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.13 0.0 1.0 0.9 0.55 0.12
0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.36 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.53 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 1.0 0.0 0.52 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.11 0.17 0.0 0.34 0.0 0.62 0.09 0.0 0.27 0.25 0.0 0.05 0.04 0.11 0.0 0.04 0.0 0.14 0.0 0.0 1.0 0.28
0.28 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.14 0.03 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.06 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.41 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.37 0.36
1.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.85 0.62 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0
0.76 1.0 0.73 0.39 0.65 0.41 0.72 0.65 0.61 0.72 0.25 0.31 0.62 0.65 0.13 0.33 0.7 0.51 0.46 0.28 0.38 0.08 0.3 0.43 0.63 0.12 0.65 0.09 0.26 0.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.36 0.7 1.0 0.8 0.45 0.27 0.53 0.26 0.74 0.67 0.33 0.66 0.9 0.37 0.21 0.77 0.65 0.34 0.41 0.07 0.7 0.0 0.65 0.68 0.14 0.21 0.34 0.1 0.33 0.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.2 0.0 0.0
0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.18 0.28 0.0 0.54 0.0 1.0 0.15 0.0 0.43 0.41 0.0 0.09 0.06 0.18 0.0 0.06 0.0 0.22 0.0 0.0 0.57 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.75 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.33 0.55 0.0 0.45 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.52
0.0 0.31 0.0 0.57 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.25 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.3 0.0 0.24 0.09 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.24 0.0 0.4 0.78 0.22 0.18 0.8 0.0 0.0 0.0 0.5 1.0 0.24 0.0 0.23 0.1 0.0 0.41 0.23 0.19 0.44 0.49 0.86 0.0 0.27 0.49 0.56 0.2 0.0
0.0 1.0 0.0 0.98 0.68 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0
0.0 0.54 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.74 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 1.0
0.0 0.33 0.0 0.32 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 1.0 0.28 0.0 0.92 0.28 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.27 0.0 0.28 0.54 0.0 0.62 0.0
0.14 0.58 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.16 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.33 0.0 0.0 0.0 1.0 0.44 0.5 0.0
0.66 0.78 0.88 0.43 0.44 0.37 0.58 0.32 0.56 0.78 0.35 0.17 0.78 0.69 0.16 0.65 1.0 0.75 0.08 0.08 0.42 0.14 0.84 0.08 0.39 0.47 0.84 0.41 0.38 0.6
Spov3_chr4.04287 (NPF5.14)
0.0 0.76 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 1.0
0.32 1.0 0.22 0.22 0.71 0.39 0.53 0.18 0.78 0.44 0.64 0.34 0.39 0.15 0.2 0.45 0.41 0.37 0.39 0.13 0.21 0.38 0.14 0.0 0.21 0.45 0.76 0.29 0.31 0.61
0.58 0.73 0.4 0.66 1.0 0.82 0.6 0.42 0.53 0.59 0.58 0.25 0.46 0.98 0.7 0.25 0.19 0.21 0.22 0.16 0.32 0.21 0.43 0.95 0.33 0.72 0.96 0.13 0.66 0.8
0.42 0.53 0.73 0.75 0.54 0.31 0.22 0.48 0.53 0.64 0.39 1.0 0.78 0.46 0.2 0.38 0.49 0.51 0.4 0.26 0.68 0.38 0.42 0.63 0.32 0.22 0.66 0.74 0.72 0.79
0.02 0.0 0.0 0.79 0.32 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.4 0.0 0.0 0.32 0.99 1.0 0.32 0.0
0.49 0.77 0.97 0.52 0.37 0.46 0.47 0.64 0.83 0.3 0.39 0.81 0.64 0.73 0.31 0.58 0.93 0.35 0.44 0.24 0.79 0.22 0.47 0.63 0.39 0.45 0.71 0.5 0.9 1.0
0.0 0.11 0.0 0.0 0.45 0.08 0.2 0.1 0.63 0.0 0.0 0.27 0.58 0.37 0.17 0.0 0.09 0.0 0.1 0.08 0.0 0.0 0.48 0.26 0.0 0.36 1.0 0.0 0.2 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.9 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.43 0.33 0.55 0.13 0.29 0.64 0.25 0.83 0.21 0.21 0.18 0.32 0.0 0.84 0.13 0.18 0.55 0.07 1.0 0.43 0.22 0.18 0.67 0.19 0.11 0.58 0.41 0.62 0.34
1.0 0.0 0.29 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.18 0.12 0.05 0.21 0.0 0.0 1.0 0.21 0.52 0.27
0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.43 0.18 0.0 0.0 0.18 0.0 0.21 0.17 0.64 0.0 0.19 0.17 0.18 0.0 0.0 0.0 1.0 0.88 0.0 0.0
0.15 0.27 0.28 0.32 0.0 0.12 0.29 0.06 0.83 0.41 0.15 0.39 0.7 1.0 0.25 0.24 0.17 0.09 0.0 0.0 0.0 0.49 0.6 0.31 0.0 0.14 0.59 0.09 0.17 0.14
1.0 0.54 0.85 0.34 0.29 0.23 0.28 0.64 0.52 0.45 0.34 0.53 0.77 0.73 0.5 0.32 0.61 0.53 0.25 0.67 0.37 0.49 0.19 0.65 0.6 0.48 0.29 0.64 0.94 0.85
0.63 0.57 0.44 0.48 0.82 0.75 0.63 0.77 0.58 0.59 0.38 0.66 0.83 1.0 0.61 0.68 0.47 0.68 0.4 0.29 0.41 0.55 0.55 0.57 0.44 0.57 0.68 0.55 0.74 0.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.22 0.09 0.58 0.5 0.21 0.17 0.21 0.65 0.29 0.42 0.38 0.63 1.0 0.47 0.17 0.51 0.34 0.33 0.18 0.29 0.6 0.4 0.42 0.26 0.24 0.26 0.31 0.25 0.15
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)