1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_91 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.64 0.65 0.9 0.78 0.68 0.63 0.63 0.8 0.85 0.49 0.53 0.88 0.77 1.0 0.57 0.85 0.69 0.59 0.48 0.39 0.38 0.5 0.66 0.47 0.64 0.59 0.42 0.73 0.87 0.94
0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.02 0.04 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.0 0.1 0.01 0.07 0.04 0.05 0.02 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.06 0.0 0.04 0.0 0.13 0.05 0.1 0.0
5.74 4.18 0.72 0.34 2.2 0.8 1.29 2.62 0.91 3.24 0.0 2.09 3.84 2.09 2.62 0.34 0.0 0.27 3.77 2.51 1.83 1.81 3.03 3.88 0.72 2.66 5.8 6.87 5.42 0.57
0.01 0.03 0.05 0.06 0.01 0.04 0.01 0.03 0.06 0.07 0.04 0.04 0.03 0.02 0.01 0.04 0.04 0.05 0.04 0.01 0.03 0.02 0.02 0.03 0.01 0.03 0.0 0.04 0.03 0.06
0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.06 0.0 0.17 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.14 0.07 0.0 0.12 0.12 0.13 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.06 0.25 0.0 0.05 0.0
0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0
0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.02 0.0 0.01
0.05 0.12 0.11 0.09 0.03 0.08 0.08 0.16 0.12 0.09 0.07 0.08 0.12 0.07 0.03 0.08 0.13 0.12 0.05 0.06 0.07 0.04 0.14 0.09 0.11 0.06 0.07 0.07 0.08 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.13 0.0 0.0 0.1 0.0 0.12 0.0 0.1 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09
0.05 0.05 0.03 0.03 0.04 0.01 0.02 0.04 0.05 0.02 0.06 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.07 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.03 0.02 0.03 0.07 0.01 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.48 0.48 0.28 0.28 0.46 0.37 0.33 0.33 0.42 0.31 0.29 0.29 0.24 0.36 0.25 0.32 0.36 0.42 0.24 0.28 0.17 0.25 0.08 0.28 0.44 0.21 0.4 0.42 0.36 0.41
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0
0.07 0.09 0.11 0.05 0.12 0.04 0.08 0.02 0.12 0.06 0.06 0.11 0.08 0.08 0.04 0.1 0.07 0.05 0.02 0.06 0.1 0.07 0.07 0.04 0.07 0.12 0.1 0.14 0.06 0.08
6.2 7.62 4.58 5.85 7.4 1.26 4.87 1.57 5.9 0.98 2.48 4.79 2.37 0.21 1.37 7.17 5.41 2.43 2.02 2.71 4.49 2.25 0.63 4.33 2.36 4.45 3.41 5.56 6.18 4.32
0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.33 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.08 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01
0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.02
0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
1.32 1.74 1.27 0.69 1.13 0.72 1.26 1.13 1.07 1.26 0.43 0.55 1.07 1.14 0.22 0.57 1.23 0.88 0.81 0.49 0.67 0.13 0.52 0.75 1.1 0.22 1.14 0.16 0.45 1.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.12 0.24 0.34 0.27 0.15 0.09 0.18 0.09 0.25 0.23 0.11 0.23 0.31 0.13 0.07 0.26 0.22 0.12 0.14 0.02 0.24 0.0 0.22 0.23 0.05 0.07 0.12 0.03 0.11 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0
0.0 0.24 0.0 0.24 0.17 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0
0.12 0.5 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.14 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.28 0.0 0.0 0.0 0.86 0.37 0.43 0.0
0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01
Spov3_chr4.04287 (NPF5.14)
 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02
0.6 1.89 0.42 0.41 1.34 0.74 1.01 0.33 1.48 0.84 1.22 0.65 0.74 0.29 0.38 0.85 0.77 0.7 0.73 0.24 0.4 0.73 0.27 0.0 0.4 0.85 1.44 0.55 0.59 1.15
0.3 0.37 0.21 0.34 0.51 0.42 0.31 0.22 0.27 0.3 0.3 0.13 0.24 0.5 0.36 0.13 0.1 0.11 0.11 0.08 0.16 0.11 0.22 0.48 0.17 0.37 0.49 0.07 0.33 0.41
1.48 1.88 2.59 2.68 1.91 1.12 0.77 1.7 1.86 2.26 1.4 3.55 2.76 1.62 0.69 1.34 1.73 1.8 1.42 0.92 2.42 1.34 1.5 2.25 1.13 0.77 2.35 2.62 2.55 2.79
0.0 0.0 0.0 0.11 0.05 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.04 0.14 0.14 0.04 0.0
0.34 0.53 0.67 0.36 0.26 0.32 0.32 0.44 0.57 0.21 0.27 0.56 0.45 0.51 0.21 0.4 0.64 0.24 0.3 0.16 0.55 0.15 0.33 0.44 0.27 0.31 0.49 0.35 0.62 0.69
0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.02 0.01 0.05 0.0 0.0 0.02 0.05 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.03 0.08 0.0 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.13 0.1 0.17 0.04 0.09 0.19 0.07 0.25 0.06 0.06 0.05 0.1 0.0 0.25 0.04 0.05 0.17 0.02 0.3 0.13 0.06 0.06 0.2 0.06 0.03 0.17 0.12 0.18 0.1
0.06 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.01 0.03 0.02
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.05 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.0 0.0
0.01 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.02 0.0 0.06 0.03 0.01 0.03 0.05 0.07 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.02 0.0 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01
1.45 0.79 1.24 0.49 0.42 0.34 0.41 0.92 0.75 0.65 0.49 0.76 1.12 1.05 0.73 0.47 0.88 0.78 0.36 0.96 0.54 0.71 0.27 0.94 0.87 0.69 0.41 0.92 1.36 1.23
0.4 0.36 0.28 0.31 0.52 0.48 0.41 0.49 0.37 0.38 0.25 0.42 0.53 0.64 0.39 0.44 0.3 0.43 0.26 0.18 0.26 0.35 0.35 0.37 0.28 0.36 0.44 0.35 0.47 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.05 0.05 0.02 0.13 0.11 0.05 0.04 0.05 0.15 0.06 0.09 0.08 0.14 0.22 0.11 0.04 0.11 0.08 0.07 0.04 0.07 0.13 0.09 0.09 0.06 0.05 0.06 0.07 0.06 0.03
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)