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Heatmap: Cluster_89 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.0 -0.11 -0.33 0.04 -0.02 -0.05 -0.14 0.1 -0.38 -0.18 -0.24 -0.3 0.27 0.66 0.09 0.07 -0.01 0.67 -0.11 -0.02 -0.14 -0.13 0.6 -0.02 -0.21 -0.21 -0.15 -0.11 -0.35 -0.08
-0.03 -0.12 -0.25 -0.15 -0.03 -0.45 -0.41 -0.23 -0.15 0.05 -0.04 -0.17 0.13 0.83 0.21 0.06 0.17 0.39 -0.21 -0.05 -0.06 -0.07 0.45 -0.03 -0.12 -0.07 -0.03 0.04 -0.23 -0.12
-0.2 0.1 -0.25 0.07 -0.19 -0.42 -0.68 -0.17 -0.22 -0.12 -0.17 -0.3 0.35 0.5 0.35 0.09 -0.05 0.78 0.01 -0.26 0.2 -0.01 0.73 -0.23 -0.15 -0.06 0.16 -0.08 -0.64 -0.37
-0.01 0.3 -0.42 -0.83 0.54 -0.51 -0.56 -0.48 -0.39 0.22 -0.07 -0.19 0.15 1.13 -0.6 -0.29 -0.64 1.28 -0.16 -0.11 0.11 0.32 -0.59 -0.37 -0.16 0.02 0.32 -0.1 -0.64 -0.03
-0.08 -0.06 -0.35 -0.12 -0.04 -0.42 -0.34 0.01 -0.17 0.12 -0.13 -0.21 0.25 0.56 0.09 0.14 0.23 0.69 -0.01 -0.17 0.07 -0.1 0.13 -0.19 -0.1 -0.01 0.19 -0.16 -0.31 -0.18
0.02 0.07 -0.08 -0.05 0.05 -0.24 -0.21 0.07 -0.27 -0.12 -0.07 -0.14 0.22 0.35 0.17 0.02 0.12 0.36 -0.11 -0.15 -0.02 -0.1 0.33 -0.16 -0.08 -0.02 -0.0 -0.08 -0.18 0.02
-0.47 -0.38 -0.58 -0.63 0.14 -0.33 -0.3 0.01 -0.18 0.1 -0.04 -0.17 0.21 1.48 0.03 0.09 0.13 0.82 -0.16 -0.24 0.06 -0.13 -0.52 -0.26 0.1 0.05 0.19 -0.18 -0.5 -0.52
-0.02 0.06 -0.05 0.04 -0.05 -0.18 -0.11 0.08 -0.19 -0.08 -0.11 -0.17 0.18 0.35 0.19 0.01 0.05 0.27 -0.08 -0.29 0.01 -0.12 0.07 0.04 -0.09 -0.04 0.03 0.11 -0.06 -0.02
-0.4 -0.15 -0.37 -0.33 0.15 -0.22 -0.33 -0.13 -0.2 0.07 0.01 -0.05 0.29 1.04 0.24 0.13 0.23 0.3 -0.21 -0.36 -0.02 -0.11 0.53 -0.03 -0.05 -0.13 -0.06 0.01 -0.33 -0.64
0.14 0.08 -0.12 -0.0 -0.03 -0.59 -0.42 -0.18 -0.15 -0.11 -0.1 -0.28 -0.06 0.68 0.11 -0.12 0.03 0.81 -0.25 -0.27 -0.07 -0.2 0.68 -0.23 -0.19 -0.12 -0.05 -0.08 0.04 0.07
-0.02 -0.03 -0.13 -0.06 -0.11 -0.28 -0.11 -0.04 -0.1 -0.02 -0.04 -0.11 0.22 0.2 -0.0 -0.04 0.04 0.22 0.01 -0.03 0.09 0.01 0.37 -0.03 -0.02 0.01 0.18 -0.06 -0.19 -0.11
-0.15 0.08 -0.09 -0.05 -0.17 0.11 -0.16 0.07 -0.22 -0.29 -0.28 -0.28 0.12 0.85 0.45 0.18 0.19 0.57 -0.21 -0.11 -0.08 -0.06 0.3 -0.16 -0.61 -0.16 -0.26 -0.58 -0.27 0.23
-0.01 0.01 -0.11 0.09 -0.18 -0.43 -0.25 0.1 -0.1 -0.02 -0.09 -0.07 0.26 0.39 0.03 0.03 0.04 0.43 -0.16 -0.26 -0.13 -0.12 0.29 0.01 -0.03 -0.09 0.04 0.14 -0.02 -0.13
-0.56 0.15 -0.94 -1.74 0.38 0.03 -0.71 -0.93 -1.0 -0.12 -1.88 -0.99 1.22 1.7 -1.47 -0.9 -1.11 1.98 -0.7 -0.72 -1.01 -0.39 1.78 -0.8 -1.31 -0.56 -0.07 -0.05 -0.38 -0.73
0.1 -0.08 -0.13 -0.13 -0.01 -0.21 -0.42 -0.2 -0.11 -0.09 -0.02 -0.26 0.02 0.68 0.2 0.12 0.2 0.6 -0.13 -0.25 0.15 0.12 0.05 -0.13 -0.35 -0.15 0.0 -0.23 -0.01 0.08
-0.23 -0.11 -0.18 -0.33 0.16 -0.28 -0.61 -0.55 0.09 0.24 0.06 0.04 -0.13 0.94 0.04 0.02 -0.05 0.51 -0.17 -0.09 -0.08 -0.15 0.71 -0.08 -0.14 -0.14 -0.08 0.1 -0.22 -0.43
Spov3_chr2.03697 (PLDDELTA)
 -0.01 0.0 -0.25 -0.21 -0.1 -0.22 -0.15 -0.01 -0.27 -0.27 -0.16 -0.1 0.18 0.66 0.29 0.14 0.16 0.6 -0.21 -0.19 -0.13 -0.03 0.46 -0.15 -0.09 -0.06 0.01 0.01 -0.24 -0.34
0.05 0.07 -0.28 -0.2 0.07 -0.35 -0.69 -0.11 -0.35 -0.2 -0.51 -0.29 0.22 0.8 -0.12 -0.01 -0.31 0.96 -0.1 -0.41 -0.15 -0.27 0.83 -0.05 -0.19 -0.08 -0.16 0.03 0.03 0.19
0.27 0.17 -0.08 -0.05 -0.25 -0.41 -0.33 -0.12 -0.39 -0.16 -0.21 -0.28 0.16 0.77 0.12 0.05 0.14 0.8 -0.36 -0.48 -0.2 -0.15 0.38 -0.18 -0.26 -0.19 -0.12 -0.02 -0.17 0.45
-0.33 -0.28 -0.4 -0.42 0.07 -0.21 -0.22 -0.07 -0.16 -0.03 -0.07 -0.18 0.28 0.5 0.25 0.25 0.14 0.57 -0.03 0.0 0.11 -0.1 0.22 -0.07 -0.07 0.03 0.14 -0.23 -0.26 -0.03
Spov3_chr3.00559 (ICME-LIKE1)
 0.19 -0.01 -0.03 -0.01 0.02 -0.08 -0.17 -0.06 -0.06 -0.0 -0.11 -0.1 0.04 0.65 0.01 -0.03 0.07 0.39 -0.11 -0.26 -0.14 -0.13 0.14 -0.06 -0.3 -0.09 0.03 0.06 -0.07 -0.11
0.13 0.28 -0.13 -0.11 0.09 -0.2 -0.3 -0.17 -0.08 -0.1 -0.22 -0.22 0.12 0.27 0.26 0.14 0.08 0.32 -0.37 -0.37 0.05 -0.03 0.3 -0.16 -0.3 -0.02 0.07 -0.2 0.03 0.36
0.19 0.03 -0.04 0.04 -0.05 -0.07 -0.08 0.01 -0.21 -0.22 -0.04 -0.15 0.18 0.4 0.19 0.25 0.16 0.35 -0.33 -0.33 -0.14 -0.19 0.44 -0.18 -0.11 -0.11 -0.13 -0.05 -0.16 -0.06
-0.24 -0.1 -0.28 -0.17 0.27 -0.19 -0.29 0.01 -0.23 0.12 0.01 -0.18 0.15 0.75 -0.01 0.06 0.04 0.88 -0.17 -0.12 0.07 -0.09 -0.42 -0.24 -0.1 0.17 0.04 -0.19 -0.24 -0.21
-0.07 -0.01 -0.15 0.04 0.04 -0.27 -0.14 0.11 -0.25 -0.08 -0.11 -0.08 0.09 0.53 0.24 0.07 0.28 0.31 -0.12 -0.18 -0.09 -0.15 0.19 -0.19 -0.13 -0.07 0.06 -0.18 -0.12 0.08
-0.02 -0.04 -0.09 0.15 0.03 -0.1 -0.1 0.27 -0.26 -0.09 -0.21 -0.13 0.11 0.18 0.11 0.11 0.09 0.34 -0.07 -0.14 -0.16 -0.09 0.27 -0.26 -0.18 0.03 0.21 -0.15 -0.12 0.04
-0.07 -0.04 -0.16 0.02 0.08 -0.04 0.11 0.41 -0.38 -0.25 -0.23 -0.13 0.06 0.24 -0.12 0.18 0.3 0.09 -0.23 -0.21 -0.16 -0.18 0.27 0.01 -0.03 -0.12 0.0 0.09 0.0 0.14
0.09 -0.01 -0.12 -0.04 0.03 -0.21 -0.2 0.16 -0.23 -0.11 -0.06 -0.21 0.1 0.34 0.11 -0.0 0.1 0.21 -0.04 -0.11 0.02 -0.03 0.32 -0.02 -0.04 -0.03 0.08 0.08 -0.2 -0.2
-0.06 -0.02 -0.1 -0.13 -0.14 -0.04 -0.15 0.4 -0.28 -0.3 -0.23 0.01 0.19 0.16 0.17 0.16 0.1 0.06 -0.14 -0.09 -0.18 0.04 0.28 0.03 -0.09 0.01 -0.01 0.1 -0.1 0.1
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0.1 0.01 -0.02 -0.01 -0.11 -0.24 -0.38 -0.01 -0.16 0.01 0.03 -0.04 0.04 0.39 -0.03 -0.1 0.16 0.54 -0.21 -0.41 -0.08 -0.15 0.55 -0.01 -0.03 -0.01 0.06 0.01 -0.15 -0.27
-0.09 -0.09 -0.17 -0.11 0.08 -0.14 0.07 0.21 -0.21 -0.04 -0.06 -0.08 0.06 0.19 0.11 -0.02 0.1 0.37 -0.14 0.03 -0.06 -0.19 0.32 -0.1 -0.11 0.11 0.13 -0.06 -0.28 -0.08
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0.16 0.06 -0.07 -0.11 0.01 -0.18 -0.14 -0.03 -0.21 -0.01 -0.08 -0.15 -0.0 0.25 0.27 0.07 -0.02 0.22 -0.1 -0.18 -0.05 -0.0 0.29 -0.12 -0.14 0.07 0.09 -0.08 -0.07 0.07
0.02 -0.21 -0.16 -0.05 0.02 -0.26 -0.22 0.27 -0.14 -0.16 -0.05 -0.13 0.21 0.51 0.35 0.29 0.1 0.47 -0.18 -0.13 -0.04 -0.19 0.17 -0.18 -0.06 -0.12 0.13 -0.37 -0.43 -0.02
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-0.13 -0.19 -0.13 -0.09 -0.01 -0.31 -0.14 0.06 -0.16 -0.07 0.01 -0.15 0.3 0.37 0.31 0.11 0.18 0.48 -0.13 -0.17 0.02 -0.15 0.31 -0.28 -0.03 -0.04 0.18 -0.22 -0.3 -0.09
0.03 -0.33 -0.48 -0.43 -0.23 -0.12 -0.22 -0.33 -0.11 0.1 0.03 -0.12 0.32 0.96 0.17 0.19 0.17 0.58 -0.18 -0.16 -0.14 -0.05 0.55 -0.03 -0.16 -0.13 -0.08 -0.27 -0.36 -0.28
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-0.01 -0.02 0.08 0.22 -0.02 -0.19 -0.17 0.25 -0.18 0.0 -0.19 -0.19 0.13 0.32 -0.01 0.03 0.09 0.34 -0.18 -0.23 -0.06 -0.13 0.31 -0.2 -0.14 -0.08 0.01 0.09 -0.04 -0.15
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-0.12 -0.11 -0.14 -0.04 0.04 -0.26 -0.33 -0.01 -0.16 0.04 -0.07 -0.11 0.53 0.59 0.17 -0.02 0.12 0.3 -0.17 -0.31 -0.08 -0.16 0.23 -0.08 -0.0 -0.1 0.08 0.04 -0.18 -0.17
-0.16 -0.14 -0.22 -0.02 -0.05 -0.6 -0.37 0.01 -0.46 -0.12 -0.13 -0.36 0.66 0.72 0.01 -0.14 -0.02 0.36 -0.12 -0.19 0.03 -0.01 0.53 -0.19 0.04 -0.03 0.19 -0.03 -0.25 0.13
0.16 0.24 0.01 0.07 -0.08 -0.29 -0.29 -0.01 -0.14 0.0 -0.2 -0.17 0.05 0.73 0.03 -0.13 0.03 0.85 -0.47 -0.39 -0.34 -0.27 0.36 -0.25 -0.32 -0.18 -0.22 0.13 0.02 0.08
-0.04 0.03 -0.15 -0.06 -0.02 -0.49 -0.36 -0.25 -0.19 -0.07 -0.08 -0.14 0.12 0.78 0.31 0.06 0.03 0.4 -0.3 -0.05 -0.12 -0.1 0.67 -0.32 -0.23 -0.12 -0.02 0.1 -0.16 -0.03
0.15 0.1 -0.32 0.01 0.33 -0.39 -0.35 -0.22 -0.37 -0.21 -0.26 -0.31 0.0 0.6 0.03 -0.29 -0.11 0.68 -0.18 -0.5 -0.09 0.06 0.69 -0.34 -0.09 0.07 0.39 0.06 -0.15 -0.06
-0.1 0.01 -0.13 -0.3 0.01 -0.57 -0.43 -0.25 -0.29 -0.03 -0.23 -0.33 0.15 0.67 -0.04 -0.06 -0.1 1.09 -0.17 -0.3 0.15 -0.1 0.56 -0.16 -0.18 0.05 0.06 -0.19 -0.15 0.12
0.46 0.02 0.05 0.24 -0.02 -0.05 -0.25 -0.33 -0.17 -0.15 -0.12 -0.25 0.06 1.08 0.3 0.08 0.14 0.22 -0.38 -0.34 -0.22 -0.3 0.15 -0.35 -0.23 -0.31 -0.25 0.05 -0.2 0.01
0.05 0.05 -0.14 0.07 0.05 -0.24 -0.17 0.18 -0.21 -0.03 -0.02 -0.22 0.1 0.23 0.2 0.07 0.32 0.39 -0.34 -0.21 0.02 -0.16 0.27 -0.39 -0.17 -0.06 0.06 0.06 -0.04 -0.07
0.14 0.24 -0.06 0.02 -0.21 -0.39 -0.44 -0.27 0.02 0.04 -0.13 -0.22 0.08 0.72 0.11 0.02 0.18 0.28 -0.19 -0.3 -0.06 -0.14 0.6 -0.19 -0.33 -0.2 -0.06 0.06 -0.01 -0.04
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-0.2 0.0 -0.03 0.04 -0.25 -0.14 -0.23 0.4 -0.17 -0.17 -0.26 -0.24 0.18 0.29 0.14 0.18 0.25 0.47 -0.1 -0.02 -0.15 -0.11 0.3 -0.3 -0.27 -0.07 0.05 -0.14 -0.32 0.32
-0.08 -0.06 -0.14 -0.18 -0.11 -0.33 -0.34 0.04 -0.07 0.03 -0.02 -0.16 0.2 0.78 0.19 0.06 0.2 0.69 -0.15 -0.16 -0.03 -0.12 0.06 -0.32 -0.12 -0.05 0.08 -0.12 -0.29 -0.18
-0.21 0.01 -0.42 -0.83 0.27 -0.28 -0.62 -0.55 -0.35 0.07 -0.19 -0.28 0.15 0.92 0.16 0.2 0.15 1.25 0.08 0.09 0.34 0.02 -0.35 -0.17 -0.06 0.12 0.06 -0.49 -0.52 -0.72
0.05 -0.08 -0.0 0.15 0.11 0.03 -0.06 0.16 -0.2 -0.29 -0.07 -0.16 0.07 0.49 0.19 0.01 0.02 0.44 -0.13 -0.18 -0.18 -0.18 0.22 -0.31 -0.2 -0.14 -0.06 -0.22 -0.05 0.17
0.13 -0.12 -0.09 0.06 -0.11 -0.28 -0.26 -0.06 -0.12 -0.12 -0.03 -0.22 0.26 0.83 0.11 0.02 0.13 0.5 -0.12 -0.2 -0.13 -0.15 -0.12 -0.18 -0.05 -0.04 0.06 0.11 -0.32 -0.09
Spov3_S01.00161 (CYP94D1)
 0.06 -0.01 -0.09 -0.33 -0.01 -0.49 -0.46 0.15 -0.12 -0.03 -0.03 -0.24 0.05 0.68 0.3 0.14 0.11 0.62 -0.1 -0.23 -0.07 -0.07 0.13 -0.27 -0.26 -0.18 -0.08 0.02 -0.17 0.26
0.16 0.21 -0.1 -0.15 0.11 -0.24 -0.12 -0.11 -0.09 -0.03 -0.04 -0.14 -0.06 0.4 0.06 0.0 0.06 0.65 -0.09 -0.27 0.09 0.05 -0.35 -0.09 0.03 0.03 0.12 -0.08 -0.2 -0.24

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.