1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_89 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
8.0 7.45 6.38 8.22 7.93 7.73 7.25 8.58 6.17 7.08 6.79 6.52 9.68 12.64 8.5 8.4 7.98 12.73 7.4 7.91 7.29 7.31 12.15 7.91 6.94 6.95 7.2 7.44 6.3 7.59
28.95 27.21 24.97 26.65 29.04 21.69 22.25 25.24 26.69 30.78 28.91 26.29 32.49 52.67 34.23 30.87 33.47 38.89 25.66 28.55 28.45 28.3 40.46 29.13 27.36 28.2 28.96 30.55 25.31 27.32
9.28 11.4 8.99 11.23 9.35 7.99 6.68 9.47 9.14 9.83 9.5 8.66 13.55 15.1 13.61 11.35 10.29 18.37 10.74 8.88 12.29 10.58 17.67 9.07 9.63 10.25 11.92 10.09 6.82 8.25
17.1 21.27 12.85 9.7 25.09 12.1 11.71 12.38 13.17 20.06 16.43 15.11 19.07 37.8 11.38 14.1 11.07 41.77 15.38 16.0 18.58 21.52 11.47 13.37 15.42 17.43 21.44 16.08 11.06 16.86
31.3 31.69 25.92 30.33 32.14 24.68 26.05 33.24 29.29 35.92 30.22 28.57 39.31 48.73 35.26 36.45 38.8 53.12 32.83 29.4 34.66 30.85 36.15 28.97 30.75 32.75 37.66 29.48 26.68 29.07
28.16 29.19 26.39 26.83 28.81 23.56 24.04 29.23 23.17 25.55 26.6 25.33 32.49 35.45 31.29 28.22 30.31 35.78 25.85 25.16 27.47 25.95 34.94 24.85 26.26 27.49 27.84 26.37 24.56 28.16
45.84 48.81 42.52 41.06 69.7 50.49 51.65 63.72 56.01 67.86 61.56 56.21 73.52 176.77 64.61 67.44 69.57 112.1 56.85 53.64 65.9 57.89 44.16 52.82 67.86 65.64 72.52 55.79 44.75 44.14
14.1 14.94 13.87 14.74 13.82 12.63 13.3 15.12 12.58 13.57 13.33 12.71 16.2 18.27 16.32 14.45 14.82 17.26 13.53 11.75 14.42 13.18 15.09 14.72 13.45 13.93 14.61 15.52 13.74 14.16
29.09 34.56 29.59 30.57 42.46 32.87 30.39 34.97 33.25 40.17 38.53 36.96 46.7 78.83 45.26 41.93 44.82 47.3 33.1 29.8 37.88 35.42 55.17 37.46 37.12 34.89 36.8 38.57 30.41 24.55
24.99 23.85 20.79 22.59 22.1 15.0 16.93 19.9 20.37 20.96 21.1 18.55 21.65 36.1 24.44 20.82 23.13 39.5 18.94 18.73 21.48 19.68 36.31 19.31 19.85 20.85 21.76 21.37 23.23 23.68
13.05 12.92 12.05 12.66 12.29 10.88 12.23 12.83 12.37 13.07 12.88 12.25 15.36 15.17 13.22 12.9 13.57 15.37 13.28 12.97 14.13 13.35 17.12 12.99 13.01 13.33 14.99 12.7 11.63 12.26
6.46 7.54 6.73 6.92 6.37 7.72 6.4 7.5 6.16 5.84 5.88 5.88 7.79 12.86 9.76 8.12 8.17 10.61 6.2 6.64 6.75 6.86 8.77 6.38 4.69 6.39 5.98 4.77 5.95 8.36
11.84 11.96 11.05 12.73 10.52 8.86 10.0 12.81 11.11 11.78 11.24 11.34 14.29 15.57 12.15 12.14 12.23 16.09 10.65 9.94 10.89 10.96 14.56 11.98 11.64 11.22 12.3 13.09 11.76 10.9
0.61 0.99 0.46 0.27 1.16 0.91 0.55 0.47 0.45 0.82 0.24 0.45 2.08 2.91 0.32 0.48 0.41 3.51 0.55 0.54 0.44 0.68 3.06 0.51 0.36 0.61 0.85 0.86 0.69 0.54
6.92 6.13 5.9 5.89 6.42 5.58 4.82 5.64 6.0 6.08 6.37 5.4 6.53 10.35 7.42 7.04 7.44 9.78 5.89 5.45 7.17 7.05 6.71 5.9 5.07 5.82 6.49 5.5 6.41 6.82
63.92 69.76 66.39 59.93 84.02 61.83 49.23 51.25 80.15 88.54 78.12 77.12 68.68 144.55 77.36 76.16 72.62 107.1 66.64 70.48 70.98 67.61 123.05 71.33 68.45 68.22 71.22 80.54 64.36 55.98
Spov3_chr2.03697 (PLDDELTA)
 9.25 9.36 7.82 8.05 8.69 8.0 8.43 9.24 7.72 7.76 8.36 8.72 10.56 14.77 11.41 10.26 10.41 14.11 8.05 8.18 8.5 9.11 12.85 8.41 8.77 8.97 9.42 9.37 7.92 7.35
20.64 20.93 16.42 17.32 20.84 15.61 12.28 18.44 15.62 17.36 13.93 16.22 23.16 34.68 18.29 19.8 16.02 38.62 18.55 14.97 17.97 16.48 35.44 19.23 17.49 18.82 17.84 20.36 20.29 22.75
6.74 6.27 5.3 5.41 4.69 4.2 4.43 5.13 4.25 5.01 4.83 4.6 6.23 9.54 6.05 5.78 6.15 9.72 4.36 4.01 4.86 5.03 7.26 4.93 4.66 4.88 5.13 5.49 4.97 7.65
102.65 106.13 97.92 96.61 135.6 111.77 110.98 122.78 115.19 126.02 122.55 113.52 156.5 182.69 153.44 153.04 142.05 191.19 126.45 129.1 139.23 120.71 150.24 122.72 122.92 131.65 141.71 110.27 107.47 126.53
Spov3_chr3.00559 (ICME-LIKE1)
 7.58 6.57 6.49 6.56 6.71 6.25 5.87 6.36 6.35 6.62 6.16 6.19 6.81 10.4 6.68 6.5 6.95 8.69 6.14 5.55 6.03 6.08 7.31 6.34 5.38 6.21 6.75 6.93 6.33 6.14
12.41 13.74 10.38 10.51 12.04 9.9 9.22 10.07 10.76 10.6 9.72 9.76 12.32 13.71 13.62 12.48 11.94 14.11 8.79 8.79 11.75 11.1 13.93 10.14 9.2 11.17 11.91 9.85 11.58 14.53
8.63 7.7 7.34 7.79 7.28 7.17 7.13 7.6 6.55 6.49 7.35 6.81 8.54 9.98 8.65 8.96 8.46 9.61 5.99 6.0 6.88 6.64 10.23 6.69 7.0 7.02 6.89 7.32 6.75 7.24
3.59 3.94 3.48 3.75 5.08 3.72 3.45 4.27 3.6 4.58 4.27 3.74 4.7 7.14 4.21 4.42 4.34 7.77 3.76 3.89 4.45 3.98 3.15 3.58 3.95 4.76 4.36 3.72 3.58 3.66
10.96 11.49 10.42 11.87 11.84 9.54 10.47 12.47 9.71 10.88 10.7 10.92 12.31 16.65 13.62 12.1 14.02 14.33 10.6 10.22 10.83 10.38 13.15 10.13 10.53 10.97 12.06 10.22 10.62 12.2
6.49 6.43 6.18 7.32 6.72 6.18 6.14 7.95 5.49 6.18 5.69 6.03 7.13 7.47 7.13 7.13 7.04 8.37 6.29 5.99 5.91 6.18 7.95 5.52 5.84 6.73 7.65 5.96 6.06 6.79
11.42 11.66 10.76 12.16 12.7 11.71 12.96 15.91 9.26 10.1 10.24 11.0 12.51 14.15 11.07 13.59 14.75 12.82 10.24 10.42 10.79 10.64 14.51 12.06 11.77 11.08 12.05 12.81 12.05 13.24
28.36 26.47 24.54 25.9 27.14 22.95 23.08 29.74 22.6 24.58 25.55 22.92 28.46 33.76 28.65 26.51 28.46 30.68 25.84 24.58 26.88 26.01 33.3 26.29 25.82 26.06 28.06 28.08 23.22 23.14
9.32 9.62 9.12 8.92 8.86 9.45 8.77 12.86 8.05 7.93 8.28 9.8 11.14 10.86 10.97 10.92 10.47 10.15 8.83 9.19 8.61 10.0 11.8 9.93 9.16 9.8 9.66 10.43 9.07 10.41
3.4 4.08 3.25 2.76 3.5 2.65 2.75 2.78 2.9 2.4 2.53 2.49 2.6 5.62 2.74 3.5 2.85 5.31 2.38 2.35 2.38 2.6 3.11 2.88 2.6 2.69 3.11 2.85 3.35 3.81
6.77 6.9 5.74 5.75 6.84 6.32 5.88 6.47 5.1 6.07 6.13 6.51 8.0 11.07 8.08 8.02 7.64 9.48 5.58 6.2 6.67 6.1 11.05 6.91 5.84 5.97 6.01 6.94 5.67 5.53
12.59 11.81 11.6 11.69 10.89 9.97 9.05 11.68 10.53 11.85 12.02 11.43 12.1 15.39 11.52 10.95 13.13 17.12 10.18 8.82 11.09 10.62 17.2 11.64 11.54 11.7 12.24 11.82 10.58 9.73
5.51 5.53 5.23 5.45 6.23 5.32 6.15 6.8 5.08 5.7 5.62 5.57 6.14 6.72 6.34 5.78 6.31 7.61 5.34 6.01 5.63 5.16 7.36 5.47 5.43 6.35 6.44 5.62 4.85 5.56
8.04 8.16 4.43 5.24 7.26 5.57 5.16 10.69 3.48 4.31 4.17 4.37 10.48 16.13 7.37 6.94 6.45 21.19 4.07 3.47 3.47 4.78 16.81 6.72 5.0 4.32 4.71 6.67 5.13 6.82
9.43 9.58 9.31 9.53 10.16 10.15 8.78 10.8 8.73 8.28 8.47 8.4 8.53 13.09 10.75 8.99 9.3 12.74 8.21 8.93 9.39 8.87 12.73 8.14 8.42 8.48 8.08 8.96 8.9 10.59
19.99 19.74 17.04 19.02 18.67 16.54 16.98 16.85 16.77 19.0 17.87 18.02 20.36 24.98 21.24 19.15 20.32 26.48 17.13 16.83 19.02 18.52 22.44 18.37 17.37 18.76 20.19 19.43 18.78 17.9
4.27 4.45 3.99 3.98 4.07 4.49 4.51 5.69 3.73 3.89 3.8 3.71 4.78 6.97 6.14 4.88 5.01 6.22 3.42 3.79 3.6 3.84 4.86 3.67 3.5 3.67 4.1 4.23 3.91 5.04
6.18 5.77 5.76 6.91 5.1 5.05 5.23 6.4 5.82 5.69 5.89 5.72 6.82 6.83 6.33 6.19 6.62 7.78 5.61 5.37 5.47 5.45 7.19 5.97 6.1 5.54 5.97 5.9 5.49 5.62
13.66 12.8 11.68 11.35 12.36 10.83 11.12 12.02 10.58 12.16 11.61 11.03 12.24 14.59 14.74 12.82 12.1 14.27 11.43 10.85 11.8 12.23 14.97 11.25 11.12 12.85 13.02 11.6 11.65 12.9
11.76 10.03 10.43 11.22 11.82 9.73 9.99 14.0 10.56 10.43 11.25 10.59 13.44 16.51 14.8 14.16 12.48 16.13 10.25 10.64 11.31 10.22 13.06 10.25 11.13 10.68 12.68 8.96 8.65 11.44
3.42 2.74 2.71 3.92 5.47 2.37 2.28 2.88 2.64 4.76 3.07 2.38 5.39 5.46 4.16 4.9 5.09 10.01 3.23 1.92 3.37 2.74 8.58 2.68 3.14 4.28 4.89 3.08 1.95 1.68
6.45 5.5 5.78 6.0 5.72 5.28 5.15 5.87 5.62 5.65 5.83 5.72 5.36 10.2 5.9 5.87 6.16 7.71 4.62 4.59 4.63 4.65 6.06 4.88 5.06 5.41 5.53 5.58 5.19 5.13
19.8 19.05 19.74 20.42 21.56 17.47 19.62 22.57 19.45 20.65 21.83 19.51 26.7 27.92 26.78 23.33 24.55 30.16 19.75 19.22 22.0 19.57 26.87 17.87 21.2 21.14 24.46 18.64 17.62 20.33
46.13 35.96 32.53 33.5 38.65 41.65 38.79 35.94 41.91 48.39 46.22 41.62 56.41 87.92 50.8 51.51 50.96 67.79 39.84 40.38 40.95 43.77 66.25 44.19 40.57 41.44 42.85 37.48 35.34 37.24
13.14 11.58 9.16 9.8 8.63 6.31 6.66 7.35 8.44 9.61 9.1 7.9 10.7 16.19 10.6 9.5 10.18 17.33 8.08 7.58 8.68 8.78 15.55 8.88 8.71 8.79 9.8 10.84 9.5 9.46
3.51 3.27 2.86 3.26 3.43 2.29 2.19 2.84 2.62 2.78 2.59 2.41 3.13 4.54 3.14 2.96 2.75 4.83 2.52 2.4 2.65 2.63 4.58 2.32 2.89 2.83 3.09 3.07 2.68 3.03
32.6 32.44 34.82 38.28 32.31 28.9 29.31 39.11 29.1 32.94 28.81 28.85 35.96 41.08 32.73 33.5 35.04 41.53 29.0 27.93 31.57 30.11 40.6 28.56 29.84 31.12 33.19 34.87 32.0 29.71
8.06 8.28 6.29 8.17 8.4 6.79 6.99 8.19 7.19 8.26 8.66 7.97 9.94 15.43 8.69 8.77 8.88 12.65 6.74 7.27 8.15 6.01 13.44 8.07 7.1 7.37 7.99 7.58 7.95 7.92
3.13 3.12 2.97 3.92 3.42 2.92 2.92 3.44 2.95 3.06 3.16 2.94 3.92 4.47 3.52 3.71 3.42 4.25 3.22 2.65 3.25 3.72 4.34 3.23 3.33 3.56 3.85 3.89 3.36 3.5
7.63 7.69 7.54 8.11 8.57 6.95 6.61 8.26 7.45 8.53 7.94 7.7 12.0 12.52 9.38 8.22 9.03 10.23 7.39 6.71 7.89 7.42 9.77 7.86 8.31 7.76 8.78 8.55 7.36 7.37
34.61 35.21 33.31 38.04 37.35 25.52 29.84 39.07 28.09 35.52 35.42 30.19 61.03 63.55 38.91 35.23 38.19 49.59 35.56 33.95 39.62 38.39 55.96 33.94 39.76 37.81 44.23 38.03 32.54 42.3
2.39 2.53 2.15 2.25 2.03 1.75 1.75 2.13 1.95 2.15 1.87 1.91 2.22 3.55 2.18 1.96 2.19 3.87 1.55 1.64 1.7 1.78 2.74 1.81 1.72 1.88 1.84 2.34 2.17 2.26
5.76 6.03 5.35 5.68 5.83 4.2 4.6 4.98 5.17 5.65 5.61 5.38 6.44 10.16 7.31 6.15 6.04 7.8 4.79 5.71 5.44 5.52 9.4 4.75 5.04 5.45 5.85 6.32 5.28 5.8
2.57 2.48 1.85 2.33 2.9 1.76 1.81 1.99 1.79 2.0 1.92 1.86 2.31 3.51 2.35 1.89 2.14 3.7 2.04 1.64 2.17 2.41 3.73 1.83 2.17 2.43 3.03 2.42 2.08 2.22
19.97 21.54 19.5 17.3 21.43 14.33 15.8 17.89 17.47 20.9 18.18 16.98 23.72 33.9 20.82 20.42 19.89 45.29 18.9 17.38 23.64 19.86 31.39 19.16 18.83 22.13 22.23 18.69 19.24 23.21
18.69 13.75 14.05 16.07 13.38 13.11 11.42 10.83 12.06 12.22 12.47 11.4 14.11 28.69 16.74 14.32 14.99 15.87 10.43 10.76 11.68 11.02 15.05 10.63 11.6 10.96 11.38 14.06 11.86 13.7
5.32 5.34 4.67 5.39 5.32 4.35 4.57 5.84 4.43 5.02 5.08 4.4 5.5 6.01 5.9 5.38 6.4 6.73 4.07 4.43 5.2 4.59 6.21 3.91 4.55 4.92 5.37 5.37 4.98 4.91
10.71 11.44 9.3 9.85 8.39 7.39 7.13 8.06 9.8 10.0 8.85 8.33 10.27 15.97 10.46 9.84 11.0 11.8 8.48 7.85 9.28 8.79 14.73 8.5 7.71 8.42 9.3 10.08 9.63 9.43
2.9 3.28 2.7 2.65 2.89 2.62 2.4 2.8 2.38 2.23 2.14 2.23 3.02 4.59 2.72 2.74 3.05 4.09 2.57 1.98 2.39 2.45 2.91 2.56 2.03 2.26 2.53 2.36 2.51 3.17
5.0 5.74 5.61 5.91 4.84 5.22 4.89 7.58 5.1 5.09 4.81 4.86 6.52 7.01 6.31 6.48 6.84 7.95 5.36 5.68 5.17 5.31 7.09 4.67 4.78 5.47 5.95 5.21 4.6 7.18
43.36 43.8 41.42 40.38 42.34 36.48 36.02 47.06 43.67 46.54 45.0 40.79 52.38 78.41 52.28 47.79 52.39 73.68 41.11 41.0 44.86 42.11 47.5 36.5 41.97 44.29 48.2 41.97 37.41 40.28
4230.36 4923.77 3656.21 2750.43 5915.28 4039.32 3183.4 3332.38 3833.14 5134.75 4282.08 4020.79 5418.92 9224.61 5462.52 5617.87 5427.4 11604.96 5176.26 5200.99 6198.89 4965.81 3845.04 4339.93 4692.78 5320.37 5089.21 3479.14 3403.39 2965.08
18.31 16.77 17.65 19.71 19.14 18.1 16.97 19.77 15.36 14.5 16.87 15.82 18.6 24.86 20.25 17.79 17.93 24.04 16.16 15.64 15.61 15.58 20.59 14.24 15.41 16.07 17.03 15.23 17.07 19.96
22.18 18.69 18.98 21.18 18.79 16.64 16.98 19.38 18.7 18.64 19.86 17.42 24.31 35.92 21.82 20.49 22.21 28.73 18.65 17.66 18.46 18.2 18.61 17.86 19.56 19.66 21.1 21.84 16.2 19.09
Spov3_S01.00161 (CYP94D1)
 20.32 19.27 18.28 15.49 19.35 13.84 14.11 21.52 17.85 19.11 19.1 16.45 20.11 31.21 23.94 21.48 20.95 29.97 18.19 16.54 18.57 18.56 21.31 16.18 16.2 17.2 18.45 19.75 17.27 23.23
9.49 9.89 7.94 7.66 9.21 7.22 7.83 7.92 8.02 8.37 8.3 7.74 8.16 11.24 8.89 8.53 8.91 13.34 8.03 7.07 9.08 8.83 6.67 8.01 8.73 8.67 9.23 8.04 7.4 7.21

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)