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Heatmap: Cluster_168 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.03 0.04 -0.1 -0.11 0.46 -0.04 -0.2 -0.27 -0.09 -0.12 -0.18 -0.27 -0.07 0.68 0.24 -0.04 0.07 0.35 -0.2 -0.38 -0.28 -0.15 0.66 0.05 -0.21 -0.25 -0.24 0.09 0.08 -0.36
0.2 -0.03 -0.11 -0.09 0.4 -0.11 -0.25 0.0 -0.41 -0.4 -0.37 -0.4 -0.16 0.59 0.15 -0.1 -0.13 1.02 -0.32 -0.41 -0.38 -0.19 1.25 -0.41 -0.51 -0.12 -0.22 -0.34 -0.15 -0.01
0.02 0.0 -0.13 -0.19 0.12 0.07 -0.13 0.07 -0.27 -0.29 -0.22 -0.27 -0.27 0.92 0.06 0.09 0.11 0.74 -0.33 -0.21 -0.1 -0.25 0.98 -0.21 -0.46 -0.3 -0.21 -0.19 -0.25 -0.37
0.08 0.0 -0.1 -0.31 0.15 -0.02 -0.09 -0.32 0.01 0.01 -0.15 -0.08 -0.08 0.78 0.12 0.13 -0.13 0.18 -0.04 -0.0 -0.03 -0.09 0.42 -0.06 -0.18 -0.17 -0.03 -0.19 -0.06 -0.25
0.15 0.11 -0.05 -0.09 0.18 0.02 -0.17 -0.13 -0.17 -0.07 -0.2 -0.19 -0.13 0.6 0.15 0.11 0.21 0.04 -0.24 -0.2 -0.16 -0.07 0.27 -0.18 -0.18 0.03 -0.02 -0.1 0.02 0.12
Spov3_C0307.00001 (CYP705A3)
 0.11 0.21 -0.33 -0.65 0.6 0.28 -0.23 -1.05 -0.42 -0.22 -0.78 -0.5 -0.13 1.15 0.17 0.07 0.06 1.06 -0.32 -0.68 -0.14 -0.35 1.14 -0.26 -0.55 -0.13 -0.15 -0.29 -0.11 -0.88
0.01 0.1 -0.18 -0.15 0.3 -0.01 -0.17 0.2 -0.47 -0.33 -0.42 -0.37 0.09 1.03 0.25 0.11 0.06 0.7 -0.45 -0.43 -0.32 -0.32 0.84 -0.05 -0.37 -0.46 -0.39 -0.19 -0.08 -0.2
-0.03 -0.07 -0.15 -0.3 0.24 0.11 0.01 -0.1 -0.14 0.03 -0.15 -0.11 0.08 0.57 0.03 0.05 -0.09 0.45 -0.1 -0.11 -0.12 -0.15 0.44 0.02 -0.17 -0.13 -0.14 -0.17 -0.11 -0.14
-0.23 -0.19 -1.03 -1.41 0.14 0.49 0.21 -0.45 -0.83 -0.62 -0.79 -0.73 -0.19 2.19 0.52 0.37 0.09 0.69 -0.41 -0.56 -0.29 -0.42 1.0 0.26 -0.55 -0.35 -0.7 -0.57 -1.11 -1.43
0.08 0.2 -0.11 -0.53 -0.02 0.38 0.22 -0.15 -0.19 -0.14 -0.25 -0.16 -0.41 0.81 0.31 0.24 0.18 0.39 -0.17 -0.25 -0.13 -0.06 0.99 -0.29 -0.35 -0.46 -0.45 -0.27 -0.33 -0.62
0.47 0.44 -0.22 -0.57 0.27 0.39 -0.02 -0.64 -0.64 -0.71 -0.88 -0.63 -0.14 1.22 0.49 0.13 -0.0 1.0 -0.48 -0.21 -0.44 -0.2 1.37 -0.49 -0.87 -0.53 -0.67 -0.97 -0.4 -0.35
0.28 0.07 -0.24 -0.48 0.61 -0.06 -0.13 -0.48 -0.29 -0.24 -0.29 -0.28 -0.25 1.08 0.36 0.05 -0.03 0.83 -0.29 -0.37 -0.12 -0.2 0.85 -0.36 -0.28 -0.25 -0.22 -0.5 -0.15 -0.67
-0.15 -0.18 -0.23 -0.08 0.18 0.17 -0.06 -0.18 -0.27 -0.32 -0.25 -0.26 -0.0 0.8 0.28 0.12 0.13 0.83 -0.34 -0.4 -0.23 -0.31 0.9 -0.27 -0.28 -0.29 -0.24 -0.27 -0.15 -0.04
-0.04 -0.06 -0.13 -0.23 0.2 0.02 -0.06 -0.17 -0.18 -0.15 -0.13 -0.14 -0.04 0.76 0.04 0.15 0.01 0.51 -0.15 -0.18 -0.17 -0.09 0.62 0.01 -0.15 -0.17 -0.19 -0.13 -0.16 -0.31
0.14 0.1 -0.24 -0.42 0.13 -0.05 0.09 -0.07 0.08 -0.13 -0.23 -0.11 -0.05 1.19 0.19 -0.02 -0.12 0.09 -0.21 -0.16 -0.26 -0.14 0.31 -0.07 -0.23 -0.26 -0.22 0.02 -0.02 -0.28
0.44 0.65 -0.86 -2.47 0.42 0.63 -0.26 -1.49 -0.96 -0.35 -0.75 -0.53 -1.16 1.95 0.35 0.26 -0.04 0.71 -0.6 -0.68 -0.23 -0.11 1.02 -0.04 -0.64 -0.23 -0.58 -0.15 -0.52 -1.07
0.08 0.03 -0.41 -0.59 0.36 0.04 0.1 -0.4 -0.3 -0.03 -0.06 -0.12 0.12 1.09 0.02 -0.0 -0.19 0.2 -0.19 -0.15 -0.18 -0.17 0.45 0.17 0.02 -0.26 -0.32 -0.05 0.08 -0.45
-0.05 0.02 -0.2 -0.2 0.24 0.12 -0.02 -0.27 -0.01 -0.04 -0.11 -0.09 -0.13 0.67 0.1 0.04 0.03 0.37 -0.09 -0.16 -0.04 -0.11 0.58 -0.1 -0.3 -0.09 -0.14 -0.19 -0.12 -0.3
0.05 0.12 -0.22 -0.31 0.14 -0.13 -0.37 -0.58 -0.08 0.02 -0.14 -0.13 0.07 0.86 0.14 0.08 -0.03 0.59 -0.34 -0.25 0.0 -0.03 0.67 -0.12 -0.13 -0.12 -0.2 -0.14 -0.23 -0.18
0.23 0.12 -0.17 -0.37 0.45 0.16 -0.12 -0.8 -0.09 -0.03 -0.09 -0.07 -0.36 1.0 0.24 0.04 -0.05 0.47 -0.26 -0.25 -0.14 -0.16 0.57 -0.16 -0.24 -0.15 -0.14 -0.19 -0.14 -0.65
-0.14 -0.04 -0.37 -0.45 0.14 -0.23 -0.38 -0.42 -0.16 0.04 -0.02 -0.03 -0.11 0.86 0.05 0.08 0.1 0.7 -0.12 -0.15 -0.01 -0.08 0.76 0.2 -0.06 -0.14 -0.22 -0.28 -0.3 -0.4
0.25 0.06 -0.29 -0.53 0.26 -0.07 -0.13 -0.3 -0.3 -0.12 -0.16 -0.23 -0.11 0.91 0.16 -0.01 -0.02 0.51 0.04 -0.06 0.06 -0.04 0.66 -0.06 -0.22 -0.1 -0.17 -0.28 -0.32 -0.46
0.3 0.25 -0.18 -0.26 0.3 -0.18 -0.2 -0.09 -0.19 -0.09 -0.37 -0.35 -0.18 0.87 0.17 0.15 0.09 0.47 -0.16 -0.39 -0.07 -0.25 0.43 -0.25 -0.34 -0.08 -0.02 -0.23 -0.02 -0.05
Spov3_chr3.02863 (CYP89A5)
 0.15 0.2 -0.21 -0.4 0.56 -0.11 -0.34 -0.39 -0.23 -0.02 -0.19 -0.27 0.02 0.96 0.11 -0.14 -0.26 0.7 -0.36 -0.39 -0.32 -0.21 0.92 -0.04 -0.3 -0.25 -0.24 0.01 -0.06 -0.62
-0.01 0.03 -0.18 -0.35 0.25 0.14 0.01 -0.17 -0.12 -0.13 -0.32 -0.18 -0.38 0.87 0.24 0.11 0.02 0.44 -0.18 -0.21 -0.14 -0.13 0.65 -0.12 -0.22 -0.14 -0.09 -0.16 -0.17 -0.24
0.04 0.09 -0.36 -0.52 0.11 0.07 -0.12 -0.35 -0.15 -0.09 -0.15 -0.12 -0.18 1.15 0.19 0.14 0.08 0.26 -0.11 -0.1 -0.04 -0.08 0.46 0.1 -0.17 -0.1 -0.16 -0.18 -0.3 -0.5
-0.13 -0.06 -0.34 -0.58 0.25 0.1 -0.12 -0.2 -0.28 -0.11 -0.36 -0.23 -0.05 0.89 0.32 0.08 0.0 0.79 -0.33 -0.29 -0.12 -0.26 0.88 -0.04 -0.35 -0.17 -0.22 -0.26 -0.09 -0.18
0.38 0.06 -0.46 -0.22 0.08 -0.28 -0.3 -0.41 -0.27 -0.3 -0.42 -0.32 -0.09 1.16 -0.06 -0.13 0.01 1.16 -0.25 -0.58 -0.12 -0.36 1.07 -0.21 -0.26 -0.27 -0.19 -0.37 -0.18 -0.39
0.16 0.25 -0.1 -0.24 0.21 -0.04 -0.09 0.1 -0.2 -0.04 -0.26 -0.29 -0.18 0.73 0.19 -0.05 -0.06 0.4 -0.26 -0.29 -0.09 -0.3 0.55 -0.07 -0.24 -0.14 -0.22 -0.07 0.0 -0.08
0.03 -0.07 -0.47 -0.78 0.43 0.31 -0.11 -0.5 -0.02 0.04 -0.15 -0.09 -0.25 1.15 0.11 -0.02 -0.11 0.96 -0.5 -0.3 -0.46 -0.57 0.92 -0.25 -0.26 -0.14 -0.14 -0.3 -0.23 -0.58
0.15 -0.05 -0.2 -0.42 0.35 0.05 -0.19 -0.23 -0.3 -0.27 -0.47 -0.48 -0.04 1.14 0.27 0.01 -0.13 1.06 -0.42 -0.36 -0.34 -0.37 1.16 -0.21 -0.41 -0.27 -0.35 -0.56 -0.2 -0.54
Spov3_chr4.00937 (PRA1.A1)
 -0.18 -0.11 -0.37 -0.39 -0.04 -0.18 -0.31 -0.26 -0.14 0.17 -0.03 0.05 0.08 0.93 0.18 0.14 0.16 0.51 -0.15 -0.31 -0.01 -0.08 0.69 -0.09 -0.1 -0.09 -0.08 -0.23 -0.37 -0.46
-0.15 -0.12 -0.45 -0.34 -0.02 0.34 0.1 -0.13 -0.14 -0.11 -0.16 -0.13 0.03 1.13 0.13 0.2 0.06 0.56 -0.26 -0.39 -0.26 -0.2 0.41 -0.17 -0.25 -0.13 -0.1 -0.32 -0.22 -0.1
-0.01 0.05 -0.17 -0.04 0.18 -0.07 -0.15 -0.22 -0.15 -0.25 -0.24 -0.24 -0.31 0.66 0.16 0.04 -0.09 0.88 -0.19 -0.02 -0.07 -0.12 0.9 -0.09 -0.38 -0.23 -0.39 -0.13 -0.22 -0.3
0.15 0.08 -0.38 -0.66 0.08 0.34 0.11 -0.2 -0.1 -0.01 -0.19 0.08 -0.25 1.02 0.14 0.05 -0.18 0.51 -0.28 -0.24 -0.2 -0.18 0.75 -0.25 -0.49 -0.21 -0.26 -0.05 -0.27 -0.26
1.28 0.58 -1.21 -1.6 0.99 -0.75 -1.75 -1.15 -2.34 -1.77 -4.79 -2.3 -1.12 2.54 -0.06 -1.48 -4.28 2.43 -2.89 -2.47 -2.83 -3.21 2.43 -1.47 -1.87 -2.82 -4.01 -1.53 -0.15 -2.49
0.27 0.2 0.01 -0.09 0.15 -0.03 -0.22 0.04 -0.17 -0.05 -0.29 -0.02 -0.09 0.64 0.15 0.15 0.04 0.06 -0.41 -0.49 -0.1 -0.2 0.41 -0.25 -0.19 -0.18 -0.03 -0.02 0.09 0.05
0.35 0.21 -0.17 -0.41 0.39 0.06 -0.27 0.16 -0.68 -0.65 -0.69 -0.48 0.08 1.06 0.11 -0.32 -0.31 1.23 -0.82 -0.66 -0.67 -0.7 1.51 -0.45 -0.29 -0.68 -0.61 -0.5 0.03 -0.02
0.22 0.11 -0.13 -0.21 0.1 0.13 -0.04 -0.08 -0.09 -0.31 -0.23 -0.26 0.06 0.49 0.1 -0.03 -0.1 0.45 -0.22 -0.28 -0.25 -0.16 0.87 -0.12 -0.23 -0.16 -0.07 -0.12 -0.14 -0.05
-0.46 -0.32 -1.34 -1.98 -0.65 0.69 0.17 -0.36 -1.08 -0.76 -0.87 -0.5 -0.07 2.18 0.67 0.35 -0.19 1.07 -0.6 -0.54 -0.47 -0.37 1.37 -0.11 -0.89 -0.5 -0.93 -0.98 -0.74 -0.3
0.12 0.16 -0.08 -0.13 0.1 0.05 -0.06 0.04 -0.17 -0.11 -0.13 -0.21 -0.09 0.59 0.16 0.15 0.08 0.27 -0.16 -0.16 0.03 -0.08 0.15 -0.29 -0.24 -0.1 -0.08 -0.13 -0.12 0.09
0.08 -0.01 -0.25 -0.35 0.33 -0.12 -0.18 -0.23 -0.14 0.01 -0.01 -0.12 -0.08 0.58 0.1 -0.02 0.02 0.55 -0.06 -0.13 -0.04 -0.15 0.61 -0.09 -0.16 -0.16 -0.1 -0.06 -0.17 -0.26
Spov3_chr5.02463 (RabGAP22)
 0.48 -0.65 -0.65 -1.73 1.36 0.47 -1.22 -0.62 -0.71 0.04 -0.89 -1.44 -0.13 1.53 0.47 0.15 -0.5 1.29 -0.6 -0.69 -0.0 -0.56 1.23 -0.4 -0.24 -0.23 -0.5 -0.62 -0.94 -1.46
0.2 0.18 -0.11 -0.16 0.22 -0.11 -0.17 -0.09 -0.15 -0.05 -0.07 -0.25 -0.11 0.74 0.07 0.14 0.15 0.17 -0.04 -0.18 -0.02 -0.13 0.14 -0.33 -0.22 -0.03 -0.1 -0.31 -0.05 0.17
0.14 -0.13 -0.46 -0.92 0.42 -0.01 -0.22 -0.46 -0.31 0.2 -0.47 -0.23 -0.2 1.23 -0.04 -0.28 0.06 1.21 -0.6 -0.58 -0.39 -0.47 1.27 -0.31 -0.39 -0.07 -0.39 -0.25 -0.21 -0.55
0.36 0.05 -0.5 -0.67 0.14 0.11 0.1 -0.48 -0.23 -0.28 -0.4 -0.25 -0.58 1.68 0.2 -0.05 -0.29 -0.02 -0.36 -0.43 -0.39 -0.18 1.13 -0.1 -0.33 -0.34 -0.33 -0.14 0.1 -0.6
0.11 0.12 -0.18 -0.37 0.16 0.03 -0.05 -0.17 -0.3 -0.12 -0.21 -0.33 -0.13 0.89 0.05 0.04 0.01 0.25 -0.14 -0.3 0.0 -0.09 0.63 -0.05 -0.32 -0.03 -0.02 -0.04 -0.05 -0.19
-0.01 0.18 -0.01 -0.19 0.09 -0.1 -0.2 0.1 -0.25 -0.07 -0.39 -0.22 -0.12 0.97 0.08 -0.04 -0.03 0.56 -0.29 -0.22 -0.17 -0.2 0.65 -0.21 -0.37 -0.14 -0.12 -0.01 -0.08 -0.17
0.13 0.28 0.07 -0.05 -0.02 -0.24 -0.2 0.01 -0.21 -0.11 -0.15 -0.2 -0.04 0.8 0.05 0.17 0.08 0.45 -0.39 -0.38 -0.2 -0.24 0.7 -0.21 -0.29 -0.16 -0.24 -0.08 -0.18 -0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.