1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_168 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.64 0.64 0.58 0.58 0.86 0.61 0.54 0.52 0.59 0.58 0.55 0.52 0.6 1.0 0.74 0.61 0.65 0.8 0.55 0.48 0.52 0.56 0.99 0.65 0.54 0.52 0.53 0.66 0.66 0.49
0.48 0.41 0.39 0.39 0.56 0.39 0.36 0.42 0.32 0.32 0.33 0.32 0.38 0.63 0.47 0.39 0.38 0.86 0.34 0.32 0.32 0.37 1.0 0.32 0.3 0.39 0.36 0.33 0.38 0.42
0.51 0.51 0.46 0.44 0.55 0.53 0.46 0.53 0.42 0.41 0.43 0.42 0.42 0.96 0.53 0.54 0.55 0.85 0.4 0.44 0.47 0.42 1.0 0.44 0.37 0.41 0.44 0.44 0.42 0.39
0.62 0.58 0.54 0.47 0.65 0.57 0.55 0.47 0.59 0.59 0.52 0.55 0.55 1.0 0.63 0.64 0.53 0.66 0.57 0.58 0.57 0.55 0.78 0.56 0.52 0.52 0.57 0.51 0.56 0.49
0.73 0.71 0.64 0.62 0.75 0.67 0.59 0.6 0.59 0.63 0.58 0.58 0.6 1.0 0.73 0.71 0.76 0.68 0.56 0.57 0.59 0.63 0.79 0.58 0.58 0.68 0.65 0.62 0.67 0.72
Spov3_C0307.00001 (CYP705A3)
 0.48 0.52 0.36 0.29 0.68 0.55 0.38 0.22 0.34 0.39 0.26 0.32 0.41 1.0 0.51 0.47 0.47 0.94 0.36 0.28 0.41 0.35 0.99 0.37 0.31 0.41 0.41 0.37 0.42 0.24
0.5 0.53 0.43 0.44 0.6 0.49 0.44 0.56 0.36 0.39 0.37 0.38 0.52 1.0 0.58 0.53 0.51 0.8 0.36 0.36 0.39 0.39 0.88 0.47 0.38 0.36 0.37 0.43 0.46 0.43
0.66 0.64 0.6 0.55 0.8 0.73 0.68 0.63 0.61 0.69 0.6 0.62 0.71 1.0 0.68 0.69 0.63 0.92 0.63 0.62 0.62 0.6 0.91 0.68 0.6 0.61 0.61 0.6 0.62 0.61
0.19 0.19 0.11 0.08 0.24 0.31 0.25 0.16 0.12 0.14 0.13 0.13 0.19 1.0 0.31 0.28 0.23 0.35 0.16 0.15 0.18 0.16 0.44 0.26 0.15 0.17 0.14 0.15 0.1 0.08
0.53 0.58 0.47 0.35 0.5 0.66 0.59 0.45 0.44 0.46 0.42 0.45 0.38 0.89 0.62 0.59 0.57 0.66 0.45 0.42 0.46 0.48 1.0 0.41 0.39 0.37 0.37 0.42 0.4 0.33
0.54 0.52 0.33 0.26 0.47 0.51 0.38 0.25 0.25 0.24 0.21 0.25 0.35 0.9 0.54 0.42 0.39 0.77 0.28 0.33 0.29 0.34 1.0 0.28 0.21 0.27 0.24 0.2 0.29 0.3
0.57 0.5 0.4 0.34 0.72 0.45 0.43 0.34 0.39 0.4 0.39 0.39 0.4 1.0 0.61 0.49 0.46 0.84 0.39 0.36 0.43 0.41 0.85 0.37 0.39 0.4 0.41 0.33 0.43 0.3
0.48 0.47 0.46 0.51 0.61 0.6 0.52 0.47 0.44 0.43 0.45 0.45 0.53 0.93 0.65 0.58 0.58 0.95 0.42 0.41 0.46 0.43 1.0 0.44 0.44 0.44 0.45 0.44 0.48 0.52
0.57 0.56 0.54 0.5 0.68 0.6 0.56 0.52 0.52 0.53 0.54 0.53 0.57 1.0 0.61 0.65 0.59 0.84 0.53 0.52 0.52 0.55 0.9 0.59 0.53 0.52 0.51 0.54 0.53 0.47
0.48 0.47 0.37 0.33 0.48 0.42 0.47 0.42 0.46 0.4 0.37 0.41 0.42 1.0 0.5 0.43 0.4 0.47 0.38 0.39 0.37 0.4 0.54 0.42 0.37 0.37 0.38 0.44 0.43 0.36
0.35 0.41 0.14 0.05 0.35 0.4 0.22 0.09 0.13 0.2 0.15 0.18 0.12 1.0 0.33 0.31 0.25 0.42 0.17 0.16 0.22 0.24 0.53 0.25 0.17 0.22 0.17 0.23 0.18 0.12
0.5 0.48 0.35 0.31 0.6 0.48 0.5 0.36 0.38 0.46 0.45 0.43 0.51 1.0 0.48 0.47 0.41 0.54 0.41 0.42 0.41 0.42 0.64 0.53 0.48 0.39 0.38 0.45 0.5 0.34
0.61 0.64 0.55 0.55 0.74 0.68 0.62 0.52 0.62 0.61 0.58 0.59 0.58 1.0 0.67 0.65 0.64 0.81 0.59 0.56 0.61 0.58 0.94 0.59 0.51 0.59 0.57 0.55 0.58 0.51
0.57 0.6 0.47 0.45 0.61 0.51 0.43 0.37 0.52 0.56 0.5 0.5 0.58 1.0 0.61 0.58 0.54 0.83 0.44 0.47 0.55 0.54 0.88 0.51 0.51 0.51 0.48 0.5 0.47 0.49
0.59 0.54 0.44 0.39 0.68 0.56 0.46 0.29 0.47 0.49 0.47 0.48 0.39 1.0 0.59 0.51 0.48 0.69 0.42 0.42 0.45 0.45 0.74 0.45 0.42 0.45 0.45 0.44 0.45 0.32
0.5 0.54 0.43 0.4 0.61 0.47 0.42 0.41 0.49 0.56 0.54 0.54 0.51 1.0 0.57 0.58 0.59 0.89 0.51 0.49 0.55 0.52 0.93 0.63 0.53 0.5 0.47 0.45 0.45 0.42
0.63 0.56 0.43 0.37 0.64 0.51 0.49 0.43 0.43 0.49 0.48 0.45 0.49 1.0 0.59 0.53 0.53 0.76 0.55 0.51 0.56 0.52 0.84 0.51 0.46 0.5 0.47 0.44 0.43 0.39
0.67 0.65 0.48 0.46 0.67 0.48 0.48 0.52 0.48 0.51 0.42 0.43 0.48 1.0 0.62 0.61 0.58 0.76 0.49 0.42 0.52 0.46 0.74 0.46 0.43 0.52 0.54 0.47 0.54 0.53
Spov3_chr3.02863 (CYP89A5)
 0.57 0.59 0.44 0.39 0.76 0.48 0.4 0.39 0.44 0.5 0.45 0.43 0.52 1.0 0.55 0.47 0.43 0.83 0.4 0.39 0.41 0.44 0.97 0.5 0.42 0.43 0.43 0.52 0.49 0.33
0.54 0.56 0.48 0.43 0.65 0.6 0.55 0.49 0.51 0.5 0.44 0.48 0.42 1.0 0.65 0.59 0.56 0.74 0.48 0.47 0.5 0.5 0.86 0.5 0.47 0.5 0.51 0.49 0.49 0.46
0.46 0.48 0.35 0.31 0.49 0.47 0.42 0.35 0.41 0.43 0.41 0.42 0.4 1.0 0.51 0.5 0.48 0.54 0.42 0.42 0.44 0.43 0.62 0.48 0.4 0.42 0.4 0.4 0.37 0.32
0.49 0.52 0.43 0.36 0.64 0.58 0.5 0.47 0.45 0.5 0.42 0.46 0.52 1.0 0.67 0.57 0.54 0.93 0.43 0.44 0.5 0.45 1.0 0.52 0.42 0.48 0.47 0.45 0.51 0.48
0.58 0.47 0.33 0.38 0.47 0.37 0.36 0.34 0.37 0.36 0.34 0.36 0.42 1.0 0.43 0.41 0.45 1.0 0.38 0.3 0.41 0.35 0.94 0.39 0.37 0.37 0.39 0.34 0.4 0.34
0.68 0.72 0.57 0.51 0.7 0.59 0.57 0.65 0.53 0.59 0.5 0.49 0.53 1.0 0.69 0.58 0.58 0.8 0.51 0.49 0.57 0.49 0.89 0.58 0.51 0.55 0.52 0.58 0.61 0.57
0.46 0.43 0.32 0.26 0.61 0.56 0.42 0.32 0.44 0.46 0.41 0.42 0.38 1.0 0.49 0.44 0.42 0.88 0.32 0.37 0.33 0.3 0.85 0.38 0.37 0.41 0.41 0.36 0.38 0.3
0.5 0.43 0.39 0.34 0.57 0.47 0.39 0.38 0.36 0.37 0.32 0.32 0.44 0.99 0.54 0.45 0.41 0.94 0.34 0.35 0.35 0.35 1.0 0.39 0.34 0.37 0.35 0.3 0.39 0.31
Spov3_chr4.00937 (PRA1.A1)
 0.46 0.49 0.41 0.4 0.51 0.46 0.42 0.44 0.48 0.59 0.51 0.55 0.56 1.0 0.59 0.58 0.59 0.75 0.47 0.43 0.52 0.5 0.85 0.49 0.49 0.49 0.5 0.45 0.41 0.38
0.41 0.42 0.33 0.36 0.45 0.58 0.49 0.42 0.42 0.43 0.41 0.42 0.47 1.0 0.5 0.52 0.48 0.67 0.38 0.35 0.38 0.4 0.61 0.41 0.39 0.42 0.43 0.37 0.39 0.43
0.53 0.55 0.48 0.52 0.6 0.51 0.48 0.46 0.48 0.45 0.45 0.45 0.43 0.85 0.6 0.55 0.5 0.99 0.47 0.53 0.51 0.49 1.0 0.5 0.41 0.46 0.41 0.49 0.46 0.43
0.55 0.52 0.38 0.31 0.52 0.62 0.53 0.43 0.46 0.49 0.43 0.52 0.41 1.0 0.54 0.51 0.44 0.7 0.41 0.42 0.43 0.44 0.83 0.42 0.35 0.43 0.41 0.48 0.41 0.41
0.42 0.26 0.07 0.06 0.34 0.1 0.05 0.08 0.03 0.05 0.01 0.03 0.08 1.0 0.16 0.06 0.01 0.93 0.02 0.03 0.02 0.02 0.92 0.06 0.05 0.02 0.01 0.06 0.15 0.03
0.77 0.73 0.64 0.6 0.71 0.63 0.55 0.66 0.57 0.62 0.52 0.63 0.6 1.0 0.71 0.71 0.66 0.67 0.48 0.46 0.6 0.56 0.85 0.54 0.56 0.57 0.63 0.63 0.68 0.66
0.45 0.41 0.31 0.26 0.46 0.37 0.29 0.39 0.22 0.22 0.22 0.25 0.37 0.73 0.38 0.28 0.28 0.82 0.2 0.22 0.22 0.22 1.0 0.26 0.29 0.22 0.23 0.25 0.36 0.35
0.64 0.59 0.5 0.47 0.59 0.6 0.54 0.52 0.51 0.44 0.47 0.46 0.57 0.77 0.59 0.54 0.51 0.75 0.47 0.45 0.46 0.49 1.0 0.51 0.47 0.49 0.52 0.5 0.5 0.53
0.16 0.18 0.09 0.06 0.14 0.36 0.25 0.17 0.1 0.13 0.12 0.16 0.21 1.0 0.35 0.28 0.19 0.47 0.15 0.15 0.16 0.17 0.57 0.2 0.12 0.16 0.12 0.11 0.13 0.18
0.72 0.74 0.63 0.61 0.71 0.69 0.64 0.68 0.59 0.61 0.61 0.58 0.62 1.0 0.74 0.74 0.7 0.8 0.59 0.59 0.68 0.63 0.74 0.54 0.56 0.62 0.63 0.61 0.61 0.7
0.7 0.65 0.55 0.52 0.83 0.6 0.58 0.56 0.6 0.66 0.65 0.61 0.62 0.98 0.7 0.65 0.66 0.96 0.63 0.6 0.64 0.59 1.0 0.62 0.59 0.59 0.61 0.63 0.58 0.55
Spov3_chr5.02463 (RabGAP22)
 0.49 0.22 0.22 0.1 0.89 0.48 0.15 0.23 0.21 0.36 0.19 0.13 0.32 1.0 0.48 0.39 0.25 0.85 0.23 0.22 0.35 0.24 0.82 0.26 0.29 0.3 0.25 0.23 0.18 0.13
0.69 0.68 0.56 0.53 0.7 0.55 0.53 0.56 0.54 0.58 0.57 0.5 0.55 1.0 0.63 0.66 0.66 0.67 0.58 0.53 0.59 0.55 0.66 0.48 0.51 0.59 0.56 0.48 0.58 0.67
0.45 0.38 0.3 0.22 0.55 0.41 0.36 0.3 0.33 0.48 0.3 0.35 0.36 0.97 0.4 0.34 0.43 0.96 0.27 0.28 0.32 0.3 1.0 0.33 0.32 0.39 0.32 0.35 0.36 0.28
0.4 0.32 0.22 0.2 0.34 0.34 0.33 0.22 0.27 0.26 0.24 0.26 0.21 1.0 0.36 0.3 0.26 0.31 0.24 0.23 0.24 0.28 0.68 0.29 0.25 0.25 0.25 0.28 0.33 0.21
0.58 0.59 0.48 0.42 0.6 0.55 0.52 0.48 0.44 0.5 0.47 0.43 0.49 1.0 0.56 0.56 0.54 0.64 0.49 0.44 0.54 0.51 0.84 0.52 0.43 0.53 0.53 0.52 0.52 0.47
0.51 0.58 0.51 0.45 0.54 0.48 0.44 0.55 0.43 0.49 0.39 0.44 0.47 1.0 0.54 0.5 0.5 0.75 0.42 0.44 0.45 0.44 0.8 0.44 0.39 0.46 0.47 0.51 0.48 0.45
0.63 0.7 0.6 0.55 0.57 0.48 0.5 0.58 0.5 0.53 0.52 0.5 0.56 1.0 0.59 0.64 0.61 0.79 0.44 0.44 0.5 0.49 0.93 0.5 0.47 0.51 0.49 0.55 0.51 0.56

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)