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Heatmap: Cluster_163 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.25 0.1 -0.57 0.06 0.76 0.29 -0.26 -0.12 -0.57 -0.38 -0.57 -0.43 -0.05 1.21 0.27 -0.01 0.03 0.45 -0.37 -0.51 -0.34 -0.4 0.1 -0.23 -0.57 -0.14 -0.25 0.45 0.14 0.18
0.42 0.02 0.24 -0.17 0.15 1.12 0.2 -0.41 0.47 -0.36 -0.21 -0.31 0.18 -0.59 -0.06 0.38 0.46 -0.42 0.09 0.4 -0.26 -0.18 -0.79 -1.1 -1.42 -0.79 -0.3 -0.09 0.15 0.49
-0.26 -0.31 0.15 0.08 0.26 0.68 0.28 0.2 0.43 -0.42 -0.12 -0.07 -0.15 0.29 0.16 0.37 0.06 -0.58 0.11 -0.23 0.06 -0.04 -1.27 -0.18 -0.11 0.03 -0.22 -0.52 -0.36 0.38
- 1.04 -0.71 - -0.06 0.7 -0.6 0.29 1.01 0.47 -0.5 - 0.6 - 1.29 0.7 -0.48 -0.69 1.3 - 0.35 0.36 -0.6 - 0.4 0.16 -0.49 - 0.82 0.3
-0.05 -0.16 -0.22 -0.34 1.13 0.6 0.6 -0.45 0.37 -0.03 -0.44 -0.11 -0.63 0.12 -0.0 -0.05 0.26 -2.0 -0.56 -0.34 -0.42 0.2 -0.57 0.13 -0.16 -0.3 -0.51 0.35 0.43 0.41
0.39 -0.07 -0.33 -3.4 1.61 1.6 1.1 -2.49 -0.78 -0.79 -0.23 -0.25 -1.2 -1.03 -0.57 -0.28 -0.77 -1.42 -0.69 -0.15 -1.34 0.94 -0.39 0.65 -0.35 -0.69 -1.49 0.58 1.04 -0.46
Spov3_chr1.00665 (EMB1865)
 0.29 0.04 - - - 2.02 1.02 0.72 0.71 - 0.0 - 1.32 -0.17 0.82 0.87 -0.05 - 1.35 -0.32 1.41 -0.25 - - -0.36 - - - -0.14 -0.2
-0.05 0.12 -0.03 0.01 0.31 0.08 0.07 -0.08 -0.37 -0.23 -0.04 -0.15 0.21 -0.3 0.03 0.32 -0.06 -0.27 -0.23 -0.16 -0.2 -0.05 -0.45 0.18 0.12 -0.14 -0.09 0.12 0.15 0.63
0.5 0.23 -0.54 -0.9 1.45 0.86 0.67 -1.98 -0.06 -0.12 -0.2 -0.28 -1.96 -1.7 -0.8 0.04 -0.74 -1.42 -0.38 -0.24 -0.7 0.53 -2.42 0.63 -0.13 -0.18 -0.34 0.72 0.94 0.61
0.26 0.29 0.24 0.07 0.3 0.28 0.21 -0.03 -0.0 -0.06 -0.14 -0.23 -0.4 0.36 -0.06 -0.11 -0.16 0.67 -0.33 -0.13 -0.11 -0.13 -0.83 -0.3 -0.57 -0.26 -0.55 0.09 0.12 0.47
0.14 -0.01 -0.12 -0.27 0.17 0.15 0.11 -0.3 0.03 -0.16 -0.05 -0.02 -0.56 0.5 -0.02 0.05 -0.22 0.71 -0.17 -0.01 -0.35 -0.16 0.57 0.04 -0.35 -0.31 -0.56 -0.12 0.09 0.29
0.04 0.06 -0.1 -0.33 0.57 0.33 -0.01 -0.51 0.12 0.01 -0.07 0.1 -0.47 0.49 -0.06 0.07 -0.2 0.35 -0.09 -0.03 -0.19 -0.13 0.37 0.03 -0.44 -0.31 -0.5 -0.34 -0.03 0.41
- - - - - 3.84 2.4 - - - - 2.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.48
-0.11 -0.33 -0.59 -0.63 0.35 0.5 0.44 -0.09 -0.54 -0.64 -0.12 -0.12 0.25 0.76 0.34 0.24 0.25 0.33 -0.23 -0.13 -0.19 -0.02 -0.2 0.11 0.0 -0.17 -0.17 -0.01 -0.25 -0.24
0.26 -1.04 - -2.42 1.38 1.41 1.22 - 0.08 -0.27 -0.54 0.22 - - -1.33 0.87 -0.52 -0.78 0.58 -2.32 -0.95 0.66 -2.34 1.04 1.2 -0.21 -0.41 0.31 0.19 -0.06
0.7 0.2 -0.36 - 1.89 0.85 -0.09 -0.14 1.3 0.29 -0.92 -1.09 0.32 -0.35 -0.09 -0.66 -0.08 -3.73 -2.41 -1.11 -3.58 -0.4 -1.08 -0.66 -0.46 -0.82 0.05 0.21 1.8 -2.02
-0.55 -0.51 -0.2 0.05 0.76 0.14 0.0 0.66 -0.11 -0.28 -0.02 -0.0 0.18 -0.44 0.11 0.19 0.28 -0.58 -0.35 -0.21 -0.11 -0.07 -0.12 -0.34 -0.14 -0.1 -0.2 0.3 0.2 0.35
-0.21 -0.17 -0.01 0.31 0.12 0.14 -0.24 0.21 0.07 -0.02 0.11 0.08 0.05 -0.32 0.1 0.04 0.2 -0.41 -0.13 -0.28 -0.17 -0.16 -0.22 -0.16 -0.06 -0.17 -0.08 0.3 0.35 0.29
0.04 0.1 0.01 -0.08 0.92 0.12 -0.34 0.01 0.05 -0.01 -0.35 -0.33 -0.48 0.89 0.19 0.23 0.2 0.28 -0.39 -0.58 -0.23 -0.42 -0.4 -0.28 -0.49 -0.24 -0.37 0.16 0.3 0.03
-0.1 -0.0 -0.35 -0.69 0.41 0.5 0.22 -0.51 -0.47 -0.23 -0.36 -0.22 -0.05 1.03 0.63 0.22 0.28 0.37 -0.33 -0.55 -0.23 -0.27 0.33 -0.36 -0.5 -0.2 -0.24 0.06 -0.06 -0.02
-0.31 -0.44 -0.0 0.14 0.96 -0.13 0.16 0.1 0.62 0.59 -0.03 0.11 -0.4 -2.26 -0.42 -0.22 -0.28 -1.61 -0.28 -0.56 -0.15 -0.26 0.11 0.23 0.03 0.12 -0.0 0.73 0.67 -0.62
-0.21 -0.1 -0.22 -0.2 0.73 0.45 0.27 0.13 0.19 0.11 0.09 0.24 -0.01 -0.2 0.21 0.31 -0.2 -0.47 -0.44 -0.36 -0.37 -0.26 -0.39 -0.04 -0.53 -0.29 -0.44 0.14 0.23 0.55
-0.4 -0.3 -0.62 -0.53 0.81 0.51 0.32 0.2 0.15 0.08 -0.29 0.14 -0.04 0.01 0.18 -0.04 0.28 -0.52 -0.26 -0.15 -0.22 -0.1 -0.08 -0.02 -0.41 -0.19 -0.24 -0.01 0.31 0.35
0.86 0.25 0.03 - 1.19 0.95 1.11 -2.0 0.44 -0.01 0.1 0.08 - - -0.66 0.73 -2.52 -1.27 0.14 0.81 0.46 0.89 -1.94 0.74 0.31 -3.29 -0.44 -1.13 -0.79 -0.23
0.02 0.15 -0.15 -0.32 -0.05 0.28 -0.01 -0.48 0.0 0.08 -0.06 0.02 -0.4 0.36 0.16 0.11 0.13 0.64 -0.01 0.0 -0.01 -0.03 0.06 -0.03 -0.37 -0.11 -0.17 -0.37 -0.23 0.2
0.07 -0.07 -0.02 -0.15 0.36 0.01 -0.06 -0.3 0.07 0.11 0.11 0.12 -0.01 0.28 0.14 0.05 0.04 -0.19 -0.15 -0.14 -0.12 -0.05 -0.24 -0.11 -0.22 -0.12 -0.09 0.11 0.28 0.04
-0.27 0.24 -0.4 -0.54 0.5 0.47 -0.11 -0.04 -0.18 0.33 -0.24 -0.19 -0.1 0.61 0.21 0.18 0.33 0.66 -0.33 -0.81 -0.14 -0.28 0.24 -0.46 -0.49 -0.19 -0.23 0.24 -0.13 -0.23
-0.44 -0.1 0.05 0.21 0.64 0.08 0.16 -0.29 0.19 -0.21 -0.16 -0.55 0.24 0.08 0.3 -0.15 -0.17 -0.19 -0.19 -0.33 -0.04 -0.01 0.72 -0.56 -0.17 -0.2 -0.41 0.14 -0.09 0.44
0.01 -0.03 -0.09 -0.36 0.34 0.23 0.28 -0.08 -0.16 -0.23 -0.04 -0.08 -0.12 0.26 0.23 0.13 0.12 -0.09 0.07 0.09 0.05 0.12 -0.24 -0.04 -0.07 -0.03 -0.0 -0.15 -0.24 -0.18
0.18 -0.13 -0.39 -0.43 0.2 0.12 0.27 0.04 -0.13 -0.15 0.03 -0.09 0.11 0.77 0.2 -0.09 0.03 0.17 -0.22 -0.27 -0.08 -0.04 0.03 -0.04 -0.0 -0.11 -0.08 0.02 -0.21 -0.25
0.37 0.26 0.08 0.02 0.47 0.04 -0.07 -0.32 0.11 0.05 -0.12 -0.22 -0.44 0.42 -0.3 -0.38 -0.22 0.55 -0.3 -0.43 -0.38 0.1 -0.61 -0.23 -0.52 -0.48 -0.17 0.17 0.55 0.67
-0.07 -0.15 -0.23 -0.53 0.95 0.6 0.15 -0.13 0.08 -0.06 -0.1 -0.01 -0.32 0.19 0.29 0.31 0.31 -0.29 -0.27 -0.29 -0.29 -0.18 -0.6 -0.13 -0.42 -0.32 -0.39 0.29 0.17 0.2
0.21 0.42 0.02 0.21 1.07 -0.0 -0.74 -0.56 -0.49 -0.46 -0.52 -0.46 -0.69 1.0 0.36 0.31 0.29 0.68 -0.6 -0.77 -0.35 -0.43 -0.24 0.1 -0.36 -0.24 -0.36 -0.2 0.09 0.15
-0.51 -0.08 -0.16 0.54 0.55 0.1 0.12 0.21 0.09 -0.4 -0.24 -0.24 0.39 0.27 0.01 0.12 0.32 -0.53 -0.3 -0.12 -0.29 -0.37 0.98 -1.18 -0.15 -0.08 -0.12 -0.18 -0.06 -0.31
0.82 0.44 -0.33 -0.78 1.92 0.97 -0.71 -0.77 -1.02 0.06 -0.91 -1.4 -0.75 0.48 -0.99 -0.12 -1.43 0.65 -1.11 -0.72 -1.69 -0.21 0.01 -0.52 -0.47 0.36 -0.41 0.11 0.84 0.21
-0.16 -0.03 -0.01 -0.24 0.72 0.12 -0.01 0.1 0.08 0.16 -0.1 -0.04 -0.41 0.46 -0.06 0.19 0.17 0.06 -0.33 -0.4 -0.26 -0.19 -0.37 -0.1 -0.43 -0.05 -0.17 -0.03 0.47 0.09
-0.16 -0.01 -0.21 -0.28 0.33 0.14 0.02 -0.03 0.0 -0.09 -0.1 -0.09 -0.06 0.37 0.21 0.32 0.25 -0.3 -0.0 -0.0 0.05 0.06 -0.25 0.11 0.06 0.02 0.03 -0.25 -0.27 -0.19
0.14 0.14 -0.04 -0.01 0.22 0.13 -0.1 -0.33 -0.02 0.09 -0.14 -0.19 -0.41 0.33 -0.37 -0.01 -0.25 0.4 0.0 -0.1 0.09 -0.07 0.08 -0.11 -0.32 -0.11 0.09 0.06 0.25 0.16
-0.2 0.13 -0.45 -0.64 0.6 0.53 -0.07 -0.26 -0.55 -0.22 -0.57 -0.3 -0.23 1.11 0.48 0.28 0.08 0.47 -0.54 -0.69 -0.22 -0.19 0.36 0.01 -0.52 -0.18 -0.33 0.17 0.06 -0.09
-0.09 -0.03 -0.38 -0.67 0.57 0.39 0.14 -0.05 -0.06 0.0 -0.08 -0.01 -0.02 0.42 0.33 0.29 0.27 -0.15 -0.16 -0.3 -0.07 -0.1 -0.69 0.1 -0.08 0.09 -0.09 -0.02 -0.05 -0.27
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-0.65 -0.49 -0.73 -0.76 0.4 0.9 0.43 -0.17 -0.76 -0.54 -0.14 -0.12 0.19 0.52 0.5 0.37 0.58 -0.21 0.02 -0.19 -0.19 0.15 -0.73 0.1 0.14 0.1 0.13 -0.22 -0.69 -0.01
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-0.5 -1.07 -0.54 -0.54 0.93 0.5 0.15 0.41 0.3 0.24 0.12 0.08 0.2 -1.51 0.05 0.14 0.16 -1.72 -0.33 -0.35 -0.38 -0.21 -0.06 0.12 0.08 0.16 -0.19 0.57 0.44 -0.14
0.06 0.23 -0.09 -0.21 0.49 -0.04 -0.12 0.06 0.01 0.01 -0.33 -0.16 -0.24 0.89 0.06 -0.02 -0.1 0.45 -0.12 -0.16 -0.08 -0.33 -0.05 -0.21 -0.45 -0.16 -0.45 0.14 0.09 -0.02
-0.14 -0.2 -0.12 0.07 0.85 -0.12 -0.39 -0.02 -0.07 -0.14 -0.32 -0.29 -0.19 0.84 0.18 0.07 0.1 0.59 -0.41 -0.54 -0.2 -0.36 0.26 -0.21 -0.25 -0.25 -0.2 -0.03 0.2 0.04
0.36 -0.01 0.0 0.13 0.48 0.48 0.08 -0.24 -0.08 -0.24 -0.05 -0.12 0.1 -0.05 0.13 0.09 0.11 -0.56 -0.26 -0.31 -0.23 -0.2 -0.26 -0.13 -0.13 -0.1 -0.11 -0.04 0.16 0.4
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0.33 0.1 -0.14 -0.28 0.2 0.16 0.13 -0.13 -0.12 0.0 -0.08 -0.08 -0.2 0.3 0.1 0.18 0.02 -0.01 -0.18 -0.23 -0.01 -0.11 -0.24 -0.08 0.03 0.06 0.05 0.02 0.04 -0.08
-0.25 -0.41 -0.78 -0.89 0.67 0.48 0.29 -0.22 -0.62 -0.37 -0.2 -0.21 0.38 0.6 0.59 0.51 0.48 -0.39 -0.16 -0.16 -0.08 0.01 -0.08 0.19 0.12 -0.01 -0.09 -0.25 -0.34 -0.52
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-0.02 0.01 0.02 0.15 0.16 0.28 0.19 0.55 0.16 0.14 -0.08 0.15 -0.43 0.32 -0.39 -0.59 -0.44 -0.77 0.07 0.04 0.08 -0.17 -1.44 -0.03 -0.3 -0.09 -0.15 0.24 0.35 0.53
Spov3_chr6.02555 (CYP82C4)
 0.41 0.14 -0.0 -0.38 0.71 0.55 -0.04 0.06 0.2 -0.33 -0.06 -0.05 -0.56 0.19 0.18 -0.02 -0.06 -0.73 -0.23 -0.07 -0.17 -0.36 -0.98 -0.24 -0.42 -0.31 -0.44 0.25 0.48 0.68
-0.79 -0.55 -0.56 -0.33 0.73 0.44 0.37 0.31 -0.05 0.15 0.06 0.33 0.35 -0.17 0.18 0.65 -0.0 -0.47 -0.55 -0.26 0.02 -0.14 -0.06 -0.18 -0.75 -0.27 -0.32 -0.42 0.33 0.34
Spov3_S06.00045 (CP12-3)
 0.08 0.12 -0.07 -0.3 0.81 0.69 0.28 -0.32 -0.17 0.1 -0.28 -0.14 -0.27 0.3 0.03 -0.13 -0.16 0.34 -0.1 -0.16 -0.24 -0.18 -0.44 -0.21 -0.45 -0.17 -0.39 -0.2 0.24 0.33
-0.13 -0.16 -0.06 -0.02 0.4 0.37 0.23 -0.16 0.07 -0.03 0.0 -0.01 -0.0 0.1 -0.02 -0.24 -0.16 -0.31 -0.15 -0.15 -0.17 -0.18 0.26 -0.05 -0.18 0.04 -0.07 0.09 0.08 0.25
0.04 0.03 0.03 -0.23 0.71 0.26 -0.1 -0.2 -0.12 -0.23 -0.09 -0.06 -0.18 0.31 0.25 0.15 0.13 -0.21 -0.4 -0.38 -0.2 -0.34 0.07 -0.01 -0.27 -0.18 0.02 0.15 0.27 0.16

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.