1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_163 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.36 0.46 0.29 0.45 0.74 0.53 0.36 0.4 0.29 0.33 0.29 0.32 0.42 1.0 0.52 0.43 0.44 0.59 0.34 0.31 0.34 0.33 0.47 0.37 0.29 0.39 0.36 0.59 0.48 0.49
0.61 0.46 0.54 0.41 0.51 1.0 0.53 0.35 0.64 0.36 0.4 0.37 0.52 0.3 0.44 0.6 0.63 0.34 0.49 0.61 0.38 0.41 0.27 0.21 0.17 0.27 0.37 0.43 0.51 0.64
0.52 0.5 0.69 0.66 0.75 1.0 0.76 0.72 0.84 0.47 0.57 0.59 0.56 0.76 0.7 0.81 0.65 0.42 0.67 0.53 0.65 0.61 0.26 0.55 0.58 0.64 0.54 0.43 0.49 0.81
0.0 0.83 0.25 0.0 0.39 0.66 0.27 0.49 0.82 0.56 0.29 0.0 0.61 0.0 0.99 0.66 0.29 0.25 1.0 0.0 0.51 0.52 0.27 0.0 0.54 0.45 0.29 0.0 0.71 0.5
0.44 0.41 0.39 0.36 1.0 0.69 0.69 0.33 0.59 0.45 0.34 0.42 0.3 0.49 0.46 0.44 0.55 0.11 0.31 0.36 0.34 0.52 0.31 0.5 0.41 0.37 0.32 0.58 0.61 0.61
0.43 0.31 0.26 0.03 1.0 1.0 0.7 0.06 0.19 0.19 0.28 0.28 0.14 0.16 0.22 0.27 0.19 0.12 0.2 0.3 0.13 0.63 0.25 0.52 0.26 0.2 0.12 0.49 0.67 0.24
Spov3_chr1.00665 (EMB1865)
 0.3 0.25 0.0 0.0 0.0 1.0 0.5 0.41 0.4 0.0 0.25 0.0 0.61 0.22 0.43 0.45 0.24 0.0 0.63 0.2 0.65 0.21 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.22 0.21
0.62 0.7 0.63 0.65 0.8 0.68 0.68 0.61 0.5 0.55 0.63 0.58 0.75 0.52 0.66 0.8 0.62 0.53 0.55 0.58 0.56 0.62 0.47 0.73 0.7 0.59 0.61 0.7 0.72 1.0
0.52 0.43 0.25 0.2 1.0 0.66 0.58 0.09 0.35 0.34 0.32 0.3 0.09 0.11 0.21 0.38 0.22 0.14 0.28 0.31 0.23 0.53 0.07 0.57 0.33 0.32 0.29 0.6 0.7 0.56
0.75 0.77 0.75 0.66 0.78 0.77 0.73 0.61 0.63 0.6 0.57 0.54 0.48 0.81 0.6 0.58 0.56 1.0 0.5 0.58 0.58 0.57 0.35 0.51 0.43 0.53 0.43 0.67 0.68 0.87
0.67 0.6 0.56 0.51 0.69 0.68 0.66 0.49 0.62 0.54 0.59 0.6 0.41 0.86 0.6 0.63 0.52 1.0 0.54 0.61 0.48 0.54 0.9 0.63 0.48 0.49 0.41 0.56 0.65 0.75
0.69 0.7 0.63 0.53 1.0 0.85 0.67 0.47 0.73 0.68 0.64 0.72 0.49 0.95 0.65 0.71 0.59 0.86 0.63 0.66 0.59 0.61 0.87 0.69 0.5 0.54 0.48 0.53 0.66 0.9
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39
0.55 0.47 0.39 0.38 0.75 0.84 0.8 0.55 0.41 0.38 0.55 0.54 0.7 1.0 0.75 0.7 0.71 0.75 0.5 0.54 0.52 0.58 0.52 0.64 0.59 0.53 0.53 0.59 0.5 0.5
0.45 0.18 0.0 0.07 0.98 1.0 0.88 0.0 0.4 0.31 0.26 0.44 0.0 0.0 0.15 0.69 0.26 0.22 0.56 0.08 0.2 0.6 0.07 0.77 0.87 0.33 0.28 0.47 0.43 0.36
0.44 0.31 0.21 0.0 1.0 0.49 0.25 0.25 0.67 0.33 0.14 0.13 0.34 0.21 0.25 0.17 0.26 0.02 0.05 0.13 0.02 0.2 0.13 0.17 0.2 0.15 0.28 0.31 0.94 0.07
0.4 0.41 0.51 0.61 1.0 0.65 0.59 0.93 0.54 0.48 0.58 0.59 0.67 0.43 0.63 0.67 0.72 0.39 0.46 0.51 0.55 0.56 0.54 0.46 0.53 0.55 0.51 0.73 0.67 0.75
0.68 0.7 0.78 0.97 0.85 0.86 0.66 0.91 0.82 0.77 0.85 0.83 0.81 0.63 0.84 0.81 0.9 0.59 0.71 0.65 0.7 0.7 0.67 0.7 0.75 0.69 0.74 0.97 1.0 0.96
0.54 0.57 0.54 0.5 1.0 0.58 0.42 0.53 0.55 0.53 0.42 0.42 0.38 0.98 0.61 0.62 0.61 0.64 0.4 0.36 0.45 0.4 0.4 0.44 0.38 0.45 0.41 0.59 0.65 0.54
0.46 0.49 0.38 0.3 0.65 0.69 0.57 0.34 0.35 0.42 0.38 0.42 0.47 1.0 0.76 0.57 0.59 0.63 0.39 0.34 0.42 0.41 0.62 0.38 0.35 0.43 0.41 0.51 0.47 0.48
0.41 0.38 0.52 0.57 1.0 0.47 0.58 0.55 0.79 0.77 0.5 0.56 0.39 0.11 0.39 0.44 0.42 0.17 0.42 0.35 0.46 0.43 0.56 0.6 0.53 0.56 0.52 0.85 0.82 0.34
0.52 0.56 0.52 0.52 1.0 0.82 0.73 0.66 0.68 0.65 0.64 0.71 0.6 0.52 0.7 0.74 0.52 0.43 0.44 0.47 0.47 0.5 0.46 0.59 0.42 0.49 0.44 0.66 0.71 0.88
0.43 0.46 0.37 0.4 1.0 0.81 0.71 0.65 0.63 0.6 0.46 0.63 0.55 0.58 0.64 0.56 0.69 0.4 0.47 0.51 0.49 0.53 0.54 0.56 0.43 0.5 0.48 0.56 0.71 0.72
0.8 0.52 0.45 0.0 1.0 0.85 0.95 0.11 0.59 0.43 0.47 0.46 0.0 0.0 0.28 0.73 0.08 0.18 0.48 0.77 0.6 0.81 0.11 0.73 0.54 0.04 0.32 0.2 0.25 0.37
0.65 0.71 0.58 0.52 0.62 0.78 0.64 0.46 0.64 0.68 0.62 0.65 0.49 0.83 0.72 0.69 0.71 1.0 0.64 0.64 0.64 0.63 0.67 0.63 0.5 0.6 0.57 0.5 0.55 0.74
0.82 0.74 0.77 0.7 1.0 0.78 0.75 0.63 0.82 0.84 0.84 0.85 0.77 0.95 0.86 0.81 0.8 0.68 0.7 0.7 0.72 0.75 0.66 0.72 0.67 0.72 0.73 0.84 0.94 0.8
0.53 0.75 0.48 0.44 0.89 0.88 0.59 0.62 0.56 0.8 0.54 0.56 0.59 0.97 0.74 0.72 0.8 1.0 0.5 0.36 0.58 0.52 0.75 0.46 0.45 0.55 0.54 0.75 0.58 0.54
0.45 0.57 0.63 0.7 0.94 0.64 0.68 0.5 0.69 0.53 0.54 0.41 0.72 0.64 0.75 0.55 0.54 0.53 0.53 0.48 0.59 0.6 1.0 0.41 0.54 0.53 0.46 0.67 0.57 0.82
0.8 0.78 0.75 0.62 1.0 0.93 0.96 0.75 0.71 0.68 0.77 0.75 0.73 0.95 0.93 0.87 0.86 0.74 0.83 0.84 0.82 0.86 0.67 0.77 0.75 0.78 0.79 0.72 0.67 0.7
0.67 0.54 0.45 0.44 0.67 0.64 0.71 0.6 0.54 0.53 0.6 0.55 0.64 1.0 0.68 0.55 0.6 0.66 0.5 0.49 0.56 0.57 0.6 0.57 0.59 0.55 0.56 0.59 0.51 0.49
0.81 0.75 0.66 0.64 0.87 0.65 0.6 0.5 0.68 0.65 0.58 0.54 0.46 0.84 0.51 0.48 0.54 0.92 0.51 0.47 0.48 0.67 0.41 0.54 0.44 0.45 0.56 0.71 0.92 1.0
0.49 0.47 0.44 0.36 1.0 0.79 0.57 0.47 0.55 0.5 0.48 0.52 0.42 0.59 0.63 0.64 0.64 0.42 0.43 0.42 0.43 0.46 0.34 0.47 0.39 0.41 0.4 0.64 0.58 0.6
0.55 0.64 0.48 0.55 1.0 0.48 0.29 0.32 0.34 0.35 0.33 0.35 0.3 0.95 0.61 0.59 0.58 0.76 0.32 0.28 0.38 0.35 0.4 0.51 0.37 0.4 0.37 0.42 0.51 0.53
0.36 0.48 0.45 0.74 0.74 0.54 0.55 0.59 0.54 0.38 0.43 0.43 0.67 0.61 0.51 0.55 0.63 0.35 0.41 0.47 0.41 0.39 1.0 0.22 0.46 0.48 0.47 0.45 0.49 0.41
0.47 0.36 0.21 0.15 1.0 0.52 0.16 0.15 0.13 0.28 0.14 0.1 0.16 0.37 0.13 0.24 0.1 0.41 0.12 0.16 0.08 0.23 0.27 0.18 0.19 0.34 0.2 0.28 0.47 0.31
0.54 0.6 0.61 0.52 1.0 0.66 0.61 0.65 0.64 0.68 0.57 0.59 0.46 0.84 0.59 0.7 0.68 0.64 0.48 0.46 0.51 0.53 0.47 0.57 0.45 0.59 0.54 0.6 0.84 0.65
0.7 0.77 0.67 0.64 0.97 0.86 0.78 0.76 0.78 0.73 0.72 0.73 0.74 1.0 0.9 0.97 0.92 0.63 0.77 0.77 0.8 0.81 0.65 0.84 0.81 0.78 0.8 0.65 0.64 0.68
0.84 0.84 0.74 0.75 0.88 0.83 0.71 0.6 0.75 0.81 0.69 0.67 0.57 0.95 0.59 0.75 0.64 1.0 0.76 0.71 0.81 0.72 0.8 0.7 0.61 0.7 0.81 0.79 0.9 0.85
0.41 0.51 0.34 0.3 0.71 0.67 0.44 0.39 0.32 0.4 0.31 0.38 0.4 1.0 0.65 0.56 0.49 0.64 0.32 0.29 0.4 0.41 0.6 0.47 0.32 0.41 0.37 0.52 0.49 0.44
0.63 0.66 0.52 0.42 1.0 0.89 0.75 0.65 0.65 0.68 0.64 0.67 0.67 0.9 0.85 0.82 0.82 0.61 0.6 0.55 0.65 0.63 0.42 0.72 0.64 0.72 0.63 0.67 0.65 0.56
0.24 0.49 0.14 0.02 1.0 0.46 0.13 0.19 0.29 0.26 0.15 0.18 0.04 0.33 0.14 0.18 0.22 0.01 0.21 0.14 0.19 0.11 0.0 0.12 0.07 0.26 0.14 0.26 0.43 0.58
0.34 0.38 0.32 0.32 0.71 1.0 0.72 0.48 0.32 0.37 0.49 0.49 0.61 0.77 0.76 0.7 0.8 0.46 0.54 0.47 0.47 0.59 0.32 0.57 0.59 0.57 0.59 0.46 0.33 0.53
0.82 0.85 0.73 0.57 1.0 0.95 0.82 0.75 0.68 0.79 0.71 0.78 0.75 0.97 0.77 0.84 0.83 0.79 0.64 0.7 0.76 0.73 0.52 0.74 0.69 0.79 0.7 0.74 0.78 0.69
0.37 0.25 0.36 0.36 1.0 0.74 0.58 0.7 0.65 0.62 0.57 0.56 0.6 0.18 0.54 0.58 0.59 0.16 0.42 0.41 0.4 0.45 0.5 0.57 0.56 0.59 0.46 0.78 0.71 0.48
0.56 0.63 0.51 0.47 0.76 0.53 0.5 0.56 0.55 0.54 0.43 0.48 0.46 1.0 0.56 0.54 0.5 0.74 0.5 0.49 0.51 0.43 0.52 0.47 0.4 0.48 0.4 0.59 0.58 0.53
0.5 0.48 0.51 0.58 1.0 0.51 0.42 0.55 0.53 0.5 0.45 0.45 0.49 0.99 0.63 0.58 0.59 0.83 0.42 0.38 0.48 0.43 0.66 0.48 0.47 0.47 0.48 0.54 0.64 0.57
0.92 0.71 0.72 0.78 1.0 1.0 0.76 0.61 0.68 0.61 0.69 0.66 0.77 0.69 0.79 0.76 0.77 0.49 0.6 0.58 0.61 0.62 0.6 0.66 0.66 0.67 0.66 0.7 0.8 0.95
0.62 0.65 0.51 0.43 1.0 0.82 0.68 0.49 0.6 0.66 0.54 0.6 0.53 0.86 0.71 0.7 0.71 0.76 0.49 0.48 0.66 0.56 0.52 0.54 0.52 0.63 0.55 0.6 0.67 0.62
1.0 0.86 0.72 0.66 0.91 0.89 0.87 0.73 0.73 0.8 0.75 0.75 0.69 0.98 0.85 0.9 0.8 0.79 0.7 0.68 0.79 0.73 0.67 0.75 0.81 0.83 0.82 0.8 0.82 0.75
0.53 0.47 0.37 0.34 1.0 0.88 0.77 0.54 0.41 0.49 0.55 0.55 0.82 0.95 0.95 0.9 0.88 0.48 0.56 0.56 0.59 0.63 0.6 0.72 0.69 0.63 0.59 0.53 0.5 0.44
0.78 0.93 0.81 0.6 1.0 0.9 0.66 0.75 0.74 0.85 0.72 0.84 0.59 0.96 0.8 0.73 0.81 0.94 0.72 0.78 0.84 0.76 0.71 0.73 0.64 0.82 0.74 0.81 0.83 0.93
0.68 0.69 0.69 0.76 0.76 0.83 0.78 1.0 0.76 0.75 0.64 0.76 0.51 0.85 0.52 0.45 0.5 0.4 0.72 0.7 0.72 0.61 0.25 0.67 0.55 0.64 0.61 0.8 0.87 0.99
Spov3_chr6.02555 (CYP82C4)
 0.81 0.67 0.61 0.47 1.0 0.89 0.59 0.63 0.7 0.49 0.58 0.59 0.41 0.7 0.69 0.6 0.59 0.37 0.52 0.58 0.54 0.47 0.31 0.52 0.45 0.49 0.45 0.72 0.85 0.98
0.35 0.41 0.41 0.48 1.0 0.81 0.78 0.74 0.58 0.67 0.63 0.76 0.77 0.54 0.68 0.94 0.6 0.44 0.41 0.5 0.61 0.54 0.58 0.53 0.36 0.5 0.48 0.45 0.75 0.76
Spov3_S06.00045 (CP12-3)
 0.6 0.62 0.54 0.46 1.0 0.92 0.7 0.46 0.51 0.61 0.47 0.52 0.48 0.7 0.58 0.52 0.51 0.72 0.53 0.51 0.49 0.5 0.42 0.5 0.42 0.51 0.44 0.5 0.67 0.72
0.69 0.68 0.73 0.75 1.0 0.98 0.89 0.68 0.8 0.74 0.76 0.75 0.76 0.81 0.75 0.64 0.68 0.61 0.68 0.68 0.67 0.67 0.9 0.73 0.67 0.78 0.72 0.8 0.8 0.9
0.63 0.62 0.62 0.52 1.0 0.73 0.57 0.53 0.56 0.52 0.58 0.59 0.54 0.76 0.73 0.68 0.67 0.53 0.46 0.47 0.53 0.48 0.64 0.61 0.51 0.54 0.62 0.68 0.74 0.69

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)