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Heatmap: Cluster_21 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
- 1.12 2.29 0.72 0.74 - - 1.08 0.16 - - -5.89 - - 1.44 0.99 - 1.31 - 0.76 - - - -0.17 - - 0.67 0.19 0.05 1.52
-1.05 0.46 1.08 -0.24 0.65 -0.92 0.53 -1.36 1.67 1.44 -0.68 -2.05 -1.93 -2.13 1.03 -0.76 0.34 -0.75 - 0.5 - -0.22 1.14 -1.06 -1.06 -2.58 0.65 -0.48 -0.75 0.06
1.51 0.46 -0.78 0.12 -0.82 0.54 -0.26 0.7 0.26 0.7 0.2 - -0.48 -1.53 -0.79 - -0.55 - -1.71 -1.79 - - -0.14 - - 1.49 0.45 2.31 1.08 -0.82
-0.42 -0.6 0.08 0.56 -0.15 0.24 -0.22 0.47 0.05 -0.46 0.1 -0.45 -0.67 0.21 0.13 0.65 0.23 -0.16 -0.3 0.23 0.36 -0.62 -0.34 -0.02 0.11 0.43 0.02 -0.44 -0.44 0.07
0.23 -0.45 0.1 0.39 -0.02 0.18 -0.57 -0.46 0.27 0.26 -0.14 -0.03 -0.13 0.58 0.24 -0.07 -0.37 0.53 0.18 -1.93 0.18 0.29 0.19 0.25 -1.75 0.39 0.18 -0.61 -0.87 0.17
- - - - - -1.48 1.27 - 1.35 1.07 -1.3 0.22 1.64 - -1.39 0.78 - 0.49 - 0.45 1.46 -0.54 0.14 -0.46 -1.49 1.28 1.28 -0.12 -0.28 -0.33
0.58 0.58 0.23 0.42 -0.4 -0.14 -0.56 -0.61 -0.17 -0.06 -0.04 -0.55 -0.02 0.32 0.18 -0.09 -0.22 0.1 -0.29 -0.16 -0.55 -0.22 0.39 -0.3 -0.08 -0.17 -0.58 0.5 0.14 0.44
-0.33 -0.67 -0.55 0.09 0.08 0.04 -0.09 -0.16 -0.23 -0.23 0.35 -0.03 0.43 -0.58 -0.24 -0.22 0.27 0.54 0.51 0.6 -0.22 0.01 -0.41 0.7 0.01 0.1 -0.38 0.36 -0.58 -0.78
-0.3 -0.33 -0.58 -0.15 -0.31 -0.23 0.07 -0.11 0.07 0.19 0.11 0.18 0.14 -0.54 -0.14 0.34 -0.22 0.18 0.46 0.73 -0.0 -0.03 0.09 0.33 -0.09 0.36 0.19 -0.16 -0.61 -0.81
0.04 -0.39 -0.17 0.01 0.02 0.2 0.36 0.04 0.98 0.61 0.27 0.22 0.35 0.16 0.59 0.05 0.06 -0.66 0.08 -0.79 -0.54 -1.07 -0.09 -1.01 -0.44 -0.45 -0.05 -0.17 -0.32 0.01
- -0.22 -0.22 -0.55 - 0.56 -0.47 -0.21 1.81 1.35 0.87 1.18 0.8 0.83 -0.4 -0.21 -0.17 0.52 -0.58 - - - - -0.46 -0.34 - -0.47 - - 2.0
-1.15 -1.29 0.23 0.25 -1.51 -0.35 0.0 -0.32 1.73 1.72 0.65 0.77 0.23 0.52 1.22 0.23 -0.36 -0.06 -1.32 - - - -0.46 -1.62 -1.5 -1.42 -0.5 0.34 0.31 -0.48
-0.55 -1.3 -0.56 -0.23 -0.21 -0.01 -0.04 -0.55 1.19 1.0 0.51 0.34 0.44 0.43 0.52 0.57 0.4 -0.15 -0.08 -0.05 -0.36 -0.76 -0.27 0.07 -0.29 -0.09 -0.66 -1.1 -0.92 -0.98
- - - - 0.77 0.62 - -0.34 1.73 2.11 1.87 - 1.79 - -0.23 -0.06 1.79 -0.46 -0.03 - - - 0.78 - -0.3 -0.4 - - -0.08 -
- 2.3 0.45 1.83 - - - 0.61 - 0.59 - 0.34 0.15 - 0.17 1.84 1.69 - - - - - - 0.37 - 0.21 - - 2.13 -
- 0.67 - 0.58 0.94 1.32 - 1.7 - 1.51 - - 0.58 - - 0.62 - - - - - - 0.41 2.72 - 1.29 0.2 -1.21 0.49 -
-0.18 -0.53 -0.18 0.16 -0.53 -0.29 -0.06 -0.57 0.46 0.51 0.35 0.05 0.02 0.52 0.14 0.29 0.08 -0.49 0.33 0.26 0.12 -0.11 -0.12 0.04 -0.11 0.05 -0.28 0.03 -0.42 -0.56
-0.03 -0.42 -0.05 0.3 -0.53 -0.24 0.07 -0.42 0.37 0.38 0.28 -0.01 0.04 0.32 -0.0 0.18 0.01 -0.64 0.3 0.29 0.07 -0.11 -0.29 -0.01 -0.04 0.1 -0.11 0.02 -0.16 -0.41
- 1.9 2.21 1.78 - - 1.51 - 1.95 1.81 - - - - - 1.11 - 0.94 - - - - - - - - 0.77 - 1.14 -
- -1.74 0.21 0.98 -2.1 -0.39 -0.41 -0.69 2.23 0.26 1.31 1.31 -0.69 -0.85 0.66 0.94 -0.15 0.01 -0.35 0.4 -1.81 -2.02 -0.32 -1.9 -0.35 -1.91 - -0.11 -1.64 -0.36
-0.87 0.22 0.24 0.26 -1.22 0.19 -0.52 -0.55 -0.78 0.65 -0.04 -0.86 0.63 0.54 -0.77 -2.92 0.88 -0.14 -1.66 -0.27 0.91 0.11 -1.26 0.8 -0.47 0.9 -0.76 0.4 -0.44 0.38
0.09 -0.71 -0.23 -0.14 -0.24 -0.42 -0.64 -0.27 -0.02 0.22 -0.09 -0.28 0.37 0.48 0.28 0.2 -0.22 1.37 -0.01 0.12 -0.01 -0.31 0.07 0.18 0.19 -0.05 -0.43 -0.41 -0.18 -0.9
0.04 -0.15 -0.13 -0.21 0.14 -0.01 0.15 -0.01 0.05 0.15 0.03 -0.06 0.09 -0.08 -0.06 -0.08 -0.08 -0.08 0.08 -0.01 0.07 -0.06 -0.02 0.01 0.13 0.11 0.15 -0.08 0.01 -0.18
-0.36 -0.98 -0.51 -0.15 0.27 -0.78 0.24 0.22 0.75 -0.53 0.23 -0.34 -0.87 0.24 0.03 -0.64 0.03 0.56 0.21 1.14 0.43 0.19 0.59 -0.03 -0.62 0.36 -0.28 -0.69 -0.96 -0.91
0.25 -0.28 -0.2 -0.13 -0.66 -0.5 -0.06 0.09 -0.1 0.23 0.41 -0.24 0.09 -0.27 -0.49 0.11 0.02 -0.58 0.29 0.58 0.12 0.19 -0.32 0.57 0.41 -0.12 0.05 0.26 -0.4 -0.48
-0.03 -0.11 0.15 -0.05 -0.07 0.31 0.19 0.01 0.19 0.2 -0.01 0.04 0.09 0.33 -0.07 -0.1 -0.21 -0.27 0.16 0.31 -0.13 -0.35 -0.56 0.16 -0.12 -0.19 -0.39 0.62 -0.15 -0.68
0.05 -0.37 0.11 -0.1 -0.13 0.13 0.17 -0.25 0.28 0.46 0.34 0.11 0.08 0.33 0.12 0.22 -0.06 -0.64 0.15 0.35 -0.02 -0.41 -0.36 -0.01 -0.23 -0.07 -0.39 0.28 -0.4 -0.55
0.28 -0.15 -0.03 0.21 -0.14 -0.39 -0.04 -0.02 -0.17 0.48 -0.07 -0.29 0.21 0.1 -0.7 -0.25 -0.69 -0.38 0.61 0.84 -0.14 -0.2 -0.29 0.62 -0.03 -0.07 0.03 0.06 -0.55 -0.19
0.15 0.13 -0.34 0.03 0.06 -0.24 0.2 0.14 0.17 -0.25 0.16 0.01 -0.37 -0.28 -0.01 -0.45 -0.8 0.65 0.31 0.31 -0.18 -0.46 -0.03 0.63 -0.28 0.54 -0.19 0.5 -0.63 -1.14
-0.3 -0.33 -0.58 -0.15 -0.31 -0.23 0.07 -0.11 0.07 0.19 0.11 0.18 0.14 -0.54 -0.14 0.34 -0.22 0.18 0.46 0.73 -0.0 -0.03 0.09 0.33 -0.09 0.36 0.19 -0.16 -0.61 -0.81
-0.33 -0.98 -0.55 -0.06 -0.52 -1.81 0.32 -0.58 -0.18 0.67 0.47 -0.29 -0.49 -1.13 -0.97 0.15 0.29 0.94 0.78 1.06 -0.35 -2.44 0.62 0.51 0.89 0.43 -0.57 -0.23 -0.27 -2.0
0.06 -0.3 -0.26 -0.07 -0.37 -0.26 0.04 -0.17 0.41 0.2 0.26 -0.01 0.14 -0.2 -0.01 0.06 -0.09 -0.24 0.29 0.61 0.2 -0.21 -0.39 0.12 0.07 0.24 0.12 0.15 -0.44 -0.75
-0.08 -0.44 -0.14 0.17 -0.4 0.04 0.22 -0.64 0.34 0.3 0.1 -0.01 -0.21 0.45 0.3 0.27 -0.01 0.74 0.18 0.57 -0.12 -0.39 0.27 -0.19 -0.58 -0.18 -0.47 -0.32 -0.4 -0.78
-0.16 0.13 -0.27 0.25 -0.02 -0.07 0.11 -0.24 -0.17 -0.23 0.04 -0.18 -0.36 0.37 -0.18 -0.33 -0.29 0.61 0.36 0.7 -0.05 -0.41 0.11 -0.0 0.27 -0.13 0.06 0.17 -0.37 -0.71
-0.74 -1.92 -0.4 0.17 -2.49 -0.77 0.47 0.43 -0.46 0.49 0.03 0.1 -0.01 -0.16 -0.05 -1.06 -0.3 -0.43 0.41 1.01 0.77 -0.74 0.05 0.9 0.35 0.27 0.73 -0.19 -0.66 -1.17
-0.62 -0.82 -1.2 -0.2 -1.01 -0.31 -0.45 -0.28 0.72 -0.5 -0.09 0.09 0.5 0.54 -1.72 -0.1 0.38 -0.02 0.26 0.55 0.31 -0.86 0.26 0.69 0.05 0.73 0.77 -0.42 -0.27 -0.66
-0.62 -0.82 -1.2 -0.2 -1.01 -0.31 -0.45 -0.28 0.72 -0.5 -0.09 0.09 0.5 0.54 -1.72 -0.1 0.38 -0.02 0.26 0.55 0.31 -0.86 0.26 0.69 0.05 0.73 0.77 -0.42 -0.27 -0.66
0.07 -0.48 0.06 0.48 -0.39 -0.09 -0.03 -0.55 0.34 0.4 0.13 -0.09 -0.27 0.35 -0.05 0.1 -0.03 -0.43 0.35 0.08 0.08 -0.18 0.01 0.12 -0.14 -0.18 -0.3 0.26 -0.13 -0.18
-0.06 -2.47 -0.12 0.13 -0.4 0.2 0.25 0.02 0.1 -0.49 0.16 -0.62 -0.1 -0.4 -0.35 -0.23 -0.84 -0.21 0.66 1.11 -0.41 0.02 -0.04 0.73 -0.06 0.77 0.35 0.19 -0.24 -1.44
-0.06 -2.47 -0.12 0.13 -0.4 0.2 0.25 0.02 0.1 -0.49 0.16 -0.62 -0.1 -0.4 -0.35 -0.23 -0.84 -0.21 0.66 1.11 -0.41 0.02 -0.04 0.73 -0.06 0.77 0.35 0.19 -0.24 -1.44
-0.55 -0.92 -0.52 0.08 -0.25 0.16 0.32 -0.14 0.04 0.14 -0.19 0.07 -0.1 0.07 0.1 -0.64 -0.49 -0.14 0.87 0.77 -0.06 -0.27 0.21 0.34 0.36 0.4 -0.04 -0.01 -0.51 -0.93
-0.01 -0.85 -0.0 0.28 -0.99 -0.59 -0.55 -0.96 0.45 0.42 0.16 0.03 -0.23 0.36 0.03 0.36 -0.09 -0.29 0.21 0.34 0.24 -0.29 0.01 0.12 -0.05 0.63 0.29 -0.07 -0.32 -0.29
-0.62 -0.82 -1.2 -0.2 -1.01 -0.31 -0.45 -0.28 0.72 -0.5 -0.09 0.09 0.5 0.54 -1.72 -0.1 0.38 -0.02 0.26 0.55 0.31 -0.86 0.26 0.69 0.05 0.73 0.77 -0.42 -0.27 -0.66
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-0.74 -1.92 -0.4 0.17 -2.49 -0.77 0.47 0.43 -0.46 0.49 0.03 0.1 -0.01 -0.16 -0.05 -1.06 -0.3 -0.43 0.41 1.01 0.77 -0.74 0.05 0.9 0.35 0.27 0.73 -0.19 -0.66 -1.17
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-0.32 0.02 -0.29 -0.21 -0.77 0.21 0.41 -0.28 0.14 0.39 0.07 0.44 -0.5 -0.79 0.23 -0.03 -0.2 0.34 0.3 0.5 0.01 0.28 -1.12 0.62 0.14 0.19 -0.08 -0.39 -0.23 -0.9
-0.31 -0.69 -0.35 -0.02 -0.44 -0.34 0.12 -0.55 0.28 0.24 0.19 -0.05 0.12 -0.19 0.01 0.14 -0.1 -0.16 0.58 1.04 0.14 -0.12 -0.05 0.26 0.14 0.2 0.01 0.01 -0.58 -1.17
-0.05 -0.13 -0.27 0.02 -0.14 0.08 0.36 -0.27 0.15 0.17 0.15 0.24 -0.06 0.01 -0.15 0.05 -0.13 -0.21 0.26 0.46 -0.0 -0.06 -0.4 0.12 -0.08 0.0 -0.09 0.13 -0.11 -0.5
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-0.94 -0.71 -0.6 0.11 -0.56 -0.88 0.1 -0.06 0.05 -0.37 -0.01 0.1 0.35 0.2 -0.79 -0.54 0.18 1.14 0.49 1.11 0.14 -0.29 0.07 0.29 0.34 -0.18 0.06 -0.37 -0.49 -0.88
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Spov3_chr6.02970 (ORF77.2)
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.