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Heatmap: Cluster_139 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
Spov3_C0044.00005 (SULT202E1)
 -1.07 -0.92 0.32 0.3 -1.07 -1.12 -0.57 0.8 1.22 0.82 0.24 0.71 -1.66 -1.84 -1.14 -0.96 -0.79 -0.74 -0.23 -0.03 0.09 -0.6 -0.97 0.24 0.22 0.41 0.38 1.35 0.26 -0.45
0.24 -0.06 0.37 0.54 0.0 0.26 -0.37 0.33 0.4 -0.23 -0.51 -0.05 -0.5 0.19 0.08 0.19 0.12 -0.04 -0.37 -0.99 -0.07 -0.36 -0.85 -0.55 -0.09 0.19 -0.31 0.23 0.45 0.34
0.26 0.16 -0.01 -0.38 0.68 0.38 0.32 0.2 0.07 -0.06 0.15 0.07 -0.1 -0.67 -0.09 -0.26 -0.2 0.1 -0.47 -0.35 -0.28 -0.17 -0.69 0.13 0.11 -0.17 -0.2 0.68 0.24 -0.69
-0.03 0.01 0.03 -0.41 0.73 0.18 0.25 0.32 0.18 -0.01 -0.14 0.06 -0.17 -0.31 -0.15 -0.23 -0.26 0.51 -0.27 -0.24 -0.3 -0.24 -0.75 0.08 0.07 -0.1 -0.23 0.56 0.3 -0.55
-0.16 -0.14 0.17 0.37 0.16 0.21 0.1 0.37 0.4 0.08 -0.0 -0.04 -0.48 -0.25 0.08 0.05 0.1 0.23 -0.16 -0.27 -0.06 -0.12 -0.82 -0.34 -0.11 -0.02 -0.06 0.06 0.13 -0.14
0.15 0.25 0.12 0.18 0.26 -0.24 -0.06 -0.05 0.19 0.15 -0.12 0.03 -0.47 0.22 -0.12 0.0 -0.4 0.3 -0.27 -0.63 -0.2 -0.11 -0.38 -0.16 -0.15 -0.1 0.01 0.5 0.37 0.04
0.07 1.24 -0.46 0.06 0.18 -0.34 -1.42 -0.05 1.25 0.87 0.5 0.11 -3.11 -0.82 -2.43 -1.06 -0.24 -1.93 -0.69 -0.22 0.82 0.42 -1.23 0.47 1.32 -0.21 0.32 -0.61 -1.73 -1.14
-0.29 -0.54 0.75 1.25 -1.65 -2.34 -0.33 0.52 1.39 1.38 0.12 0.33 -0.54 -5.44 -1.38 -1.14 -1.21 -1.45 -0.04 0.2 -0.35 -0.06 -2.93 -0.79 -0.33 0.16 0.28 0.74 0.76 -0.55
0.02 0.01 0.11 0.24 0.08 -0.12 -0.18 0.21 0.14 0.13 0.06 0.07 -0.02 -0.09 0.01 -0.08 0.0 0.16 -0.13 -0.2 0.0 -0.12 -0.2 -0.21 -0.08 0.08 0.08 0.06 -0.04 -0.17
0.38 0.45 0.19 0.1 0.04 -0.03 -0.1 -0.31 0.41 0.29 -0.02 0.03 -0.72 -0.19 0.04 -0.07 -0.06 0.24 -0.22 -0.35 -0.08 -0.17 -0.33 -0.05 -0.29 -0.08 -0.09 0.21 0.4 -0.35
-0.15 0.06 -0.16 -1.64 0.3 0.29 0.23 -0.08 0.23 0.39 0.26 0.19 0.29 0.4 -0.04 -0.54 -0.48 0.66 -0.19 0.31 -0.08 -0.06 -1.24 -0.03 -0.18 -0.04 -0.17 0.32 0.18 -1.31
0.29 0.47 0.31 0.3 0.23 0.1 -0.44 -0.06 -0.03 0.14 -0.49 -0.11 -0.28 -0.43 -0.31 -0.13 -0.25 0.5 -0.23 -0.57 -0.14 -0.15 -0.14 -0.44 -0.29 -0.06 0.03 0.36 0.35 0.48
0.23 0.27 0.22 0.06 -0.24 -0.43 -0.21 -0.13 0.57 0.4 0.08 0.0 -0.57 -0.47 -0.17 -0.07 -0.07 0.18 -0.03 -0.11 -0.05 -0.11 -0.37 -0.12 -0.04 0.09 0.08 0.26 0.24 -0.18
0.26 0.33 0.12 0.32 0.1 -0.11 -0.31 -0.16 0.0 0.03 -0.14 0.02 -0.19 -0.03 -0.33 -0.4 0.0 0.18 -0.37 -0.25 -0.09 -0.03 0.15 -0.09 -0.19 -0.06 -0.01 0.11 0.36 0.32
0.31 0.27 0.31 -0.01 0.17 0.16 0.23 0.44 0.36 0.43 0.13 0.04 -0.14 -1.23 -0.44 -0.34 -0.19 -0.26 -0.35 -0.27 -0.44 -0.47 -0.83 0.16 -0.11 -0.27 0.15 0.44 0.29 0.04
Spov3_chr2.02042 (MAPKKK6)
 0.61 0.49 0.34 0.42 0.46 -0.26 -0.16 -0.64 0.06 -0.54 -0.05 -0.21 -1.07 0.23 -0.41 -0.15 -0.37 1.02 -0.11 -0.34 -0.2 -0.72 -0.22 -0.31 -0.32 0.01 -0.04 0.18 0.31 0.05
-0.1 0.13 0.34 -0.14 -0.27 -0.55 0.04 0.61 0.74 0.7 0.36 0.25 -0.76 -0.26 -0.87 -1.26 -0.73 0.84 0.13 0.23 -0.34 0.06 -1.44 0.1 -0.27 0.16 -0.25 0.15 0.06 -0.52
-0.29 0.98 0.03 0.18 -0.55 -1.68 -0.64 -0.41 0.91 1.74 0.59 0.03 -0.4 -0.1 -1.0 -0.89 -1.41 -0.13 -0.19 0.35 -0.19 -0.57 -0.74 -0.07 -0.17 0.55 -0.21 -0.3 -0.1 -0.56
-0.93 1.57 0.65 0.81 -3.55 - -0.72 -0.43 0.73 1.9 0.25 0.18 -1.99 -1.89 -4.31 -1.83 -1.05 -0.05 0.35 0.34 -0.14 -0.35 -0.92 -0.03 -0.06 -0.28 0.32 -0.24 0.15 0.02
0.03 1.02 0.33 0.62 -1.94 -5.26 -0.66 -0.64 1.53 1.86 0.46 -0.31 -2.21 -1.27 -2.44 -1.95 -1.51 -1.22 0.68 0.17 0.53 -0.89 -0.76 -0.23 0.01 0.39 0.26 -0.25 -0.07 -0.78
-0.58 1.01 0.23 0.49 -2.21 -2.45 -1.26 -0.37 0.7 1.97 -0.33 -0.19 -1.59 -2.1 -3.81 -2.46 -1.57 0.53 0.93 -0.06 0.35 -0.38 -0.39 -0.09 0.12 0.49 0.54 -0.05 0.14 -0.51
0.53 0.77 0.67 0.35 -1.04 -4.13 -0.44 -0.42 1.36 1.76 -1.16 -0.16 -2.2 -2.1 -3.13 -1.04 -2.75 -0.43 0.23 0.13 0.46 -0.2 -0.79 -0.58 0.29 0.38 0.35 0.07 0.5 -0.54
-0.67 -1.96 0.04 0.27 0.74 -0.61 -0.38 0.81 1.8 1.27 0.45 0.23 -1.58 -4.04 -1.43 -0.89 -0.88 -5.66 0.01 -0.71 -0.26 -0.63 -0.12 -0.46 -0.17 -0.17 -0.51 0.93 1.01 -0.76
-0.21 0.27 0.17 -0.38 0.03 -0.13 -0.2 -0.41 0.53 0.68 0.02 0.45 -0.46 -0.76 -0.4 -0.47 -0.49 0.71 0.04 0.04 0.19 0.07 -0.3 0.17 -0.21 0.01 0.1 -0.13 0.21 -0.47
-0.61 0.15 -0.17 0.84 0.14 -0.44 0.2 0.48 0.79 0.61 0.38 -0.27 -2.25 -4.36 -1.28 -1.17 -1.48 -0.28 -0.14 0.06 -0.37 -0.51 -0.94 -0.05 -0.0 0.39 0.12 0.88 1.25 -0.02
Spov3_chr2.04628 (AtHMP08)
 -0.71 0.75 0.55 0.11 -3.96 -2.38 -1.15 -0.87 0.67 1.31 0.61 0.14 -3.71 -1.95 -0.29 -0.68 -0.67 -3.04 0.77 -0.53 0.33 -0.29 -0.72 -0.08 1.4 0.45 1.63 -0.59 -1.2 -1.19
-0.94 -0.07 0.45 -1.63 -0.76 -1.26 -0.42 -2.98 0.35 0.84 1.54 0.03 - - -1.21 0.84 0.28 - -1.38 - -0.33 -1.22 -0.76 1.13 2.0 1.24 0.79 0.04 -0.14 -3.07
Spov3_chr2.05720 (VPS20.2)
 0.43 0.72 0.1 0.11 -1.07 -0.87 0.05 -0.8 0.79 0.89 0.26 -0.09 -1.06 -2.32 -1.37 -0.62 -0.91 -1.17 0.32 0.22 0.48 0.31 -0.98 0.08 0.11 0.65 0.45 -0.1 0.2 0.12
0.29 0.25 0.01 0.13 -0.04 -0.4 -0.06 0.26 0.12 0.1 0.06 -0.14 -0.15 -0.26 -0.4 -0.16 -0.32 0.69 -0.16 -0.36 -0.19 -0.22 -0.38 0.04 -0.08 -0.13 -0.05 0.17 0.47 0.2
0.16 0.42 0.13 0.04 0.29 -0.16 -0.47 -0.04 0.14 0.17 -0.01 -0.23 -0.55 -0.06 -0.85 -0.31 -0.04 0.07 -0.44 -0.49 -0.41 -0.35 0.61 -0.32 -0.05 0.03 -0.15 0.44 0.74 0.37
0.27 0.12 0.64 0.96 0.28 -0.42 -1.07 -3.07 0.4 0.62 -0.58 -1.0 -0.53 1.35 - 0.51 -3.13 2.12 -0.19 -0.64 -1.66 -0.31 -3.41 -3.07 -0.58 -0.06 -0.01 0.62 0.1 -1.23
1.12 1.71 -0.69 -0.67 1.28 -0.27 -2.35 -0.49 0.68 0.61 -1.16 -0.64 - 0.06 - -1.05 - 2.12 - -0.7 -0.27 - 0.07 -2.25 0.77 -0.19 0.43 -0.07 0.56 -
0.26 0.25 0.19 0.28 0.17 -0.04 -0.07 0.04 0.04 0.07 0.02 0.1 -0.05 -0.4 -0.33 -0.29 -0.15 0.46 -0.2 -0.28 -0.04 -0.15 -0.4 -0.18 -0.16 -0.06 -0.08 0.18 0.18 0.17
0.85 1.0 0.53 0.2 -1.06 -1.19 -0.04 -0.87 0.19 0.35 -0.29 -0.04 -1.92 -2.64 -1.65 -1.41 -0.99 -1.19 0.61 -0.07 0.33 0.03 -1.22 0.03 0.2 0.73 0.76 0.44 0.68 0.29
0.81 0.93 0.51 0.28 0.38 -0.44 -0.28 -1.17 0.93 0.1 -0.16 -0.21 -1.38 -0.07 -0.68 0.01 -0.58 1.22 -0.58 -0.06 -0.76 -0.28 -1.07 -0.17 -0.43 -0.27 -0.44 -0.14 0.16 -0.09
Spov3_chr3.04609 (emb1417)
 -0.05 0.03 0.19 0.12 0.05 0.01 0.01 0.4 0.36 0.19 0.07 0.19 -0.61 -0.53 -0.27 -0.23 -0.25 0.1 -0.07 -0.1 -0.02 -0.12 -0.48 -0.08 -0.05 0.1 0.07 0.3 0.19 -0.1
0.1 0.19 0.28 -0.12 0.12 -0.09 -0.06 0.25 0.54 0.32 0.02 0.17 -1.15 -0.79 -0.34 -0.37 -0.27 0.82 -0.26 -0.29 -0.16 -0.15 -0.85 -0.02 -0.07 -0.0 -0.0 0.66 0.34 -0.64
-0.08 -0.19 0.15 0.07 0.27 -0.1 -0.47 0.34 0.57 0.2 0.24 0.19 -0.76 -0.64 -0.01 -0.05 0.02 -0.82 -0.08 -0.29 -0.12 -0.27 -0.39 -0.14 -0.07 0.06 0.1 0.75 0.5 -0.25
0.35 0.21 0.26 0.32 0.3 -0.33 -0.28 -0.21 -0.23 -0.05 -0.28 -0.26 0.0 0.08 -0.17 -0.06 -0.18 0.19 -0.23 -0.15 -0.23 -0.12 -0.15 -0.06 0.0 -0.08 0.12 0.26 0.25 0.22
-0.25 -0.19 -0.1 -0.19 0.43 0.05 0.18 0.49 0.2 0.21 -0.01 0.01 -0.22 -0.1 0.08 0.32 0.13 -0.15 -0.16 -0.34 -0.12 -0.07 -0.44 -0.24 -0.34 0.07 0.2 -0.03 0.1 -0.05
0.1 0.21 0.24 0.07 0.21 -0.32 0.19 0.58 0.45 0.52 -0.08 -0.02 -0.79 -1.14 -0.91 -0.63 -0.78 -0.06 0.11 0.05 0.09 0.0 -0.98 -0.02 0.06 0.12 0.26 0.51 0.38 -0.42
-0.47 -0.37 -0.2 -0.2 -0.09 0.02 -0.36 -0.14 0.37 0.37 0.22 0.24 -0.4 -1.36 0.06 0.07 0.13 0.97 -0.06 -0.07 0.4 0.19 -0.13 -0.24 0.02 0.14 0.04 -0.28 -0.08 -0.24
-0.79 -0.36 0.21 -0.56 -0.95 -1.11 0.46 0.05 0.64 1.59 1.1 -0.08 -0.41 -1.83 -0.95 -1.3 -0.5 -1.88 0.09 0.51 0.13 0.08 -0.91 -1.0 -0.49 0.77 0.67 -0.43 0.13 0.37
0.24 0.16 0.31 0.34 -0.03 0.01 0.13 0.34 0.26 0.07 0.03 0.13 -0.14 -0.77 -0.37 -0.46 -0.41 0.47 -0.25 -0.22 -0.28 -0.12 -0.42 -0.18 -0.06 -0.16 -0.08 0.38 0.38 -0.2
0.09 0.23 0.24 0.18 -0.47 -0.49 -0.32 -0.02 0.65 0.55 0.25 0.26 -0.71 -0.36 -0.53 -0.42 -0.15 -0.35 -0.02 0.01 0.06 -0.11 -0.29 0.09 0.1 0.41 0.16 0.27 -0.02 -0.47
-0.33 -0.09 0.23 -0.22 0.26 -0.12 -0.06 0.19 0.45 0.19 0.05 0.12 -1.14 -1.82 -0.1 -0.13 0.04 0.69 -0.06 -0.13 0.11 -0.0 -0.55 -0.27 -0.13 0.25 0.24 0.38 0.26 -0.16
0.26 0.49 0.35 -0.03 -0.45 -0.7 -0.48 0.01 0.99 0.75 -0.13 -0.14 -0.32 -0.66 -0.25 0.12 -0.64 -0.45 -0.37 0.14 0.13 -0.49 -0.31 0.25 0.36 -0.49 0.75 -0.38 -0.0 -0.44
-0.43 0.3 0.55 -1.31 -1.32 -0.37 0.17 -0.8 1.0 0.82 0.93 0.7 -2.81 -2.32 -0.67 -0.06 -0.18 -5.49 0.46 -0.02 0.47 0.66 -3.6 -0.09 -0.45 0.36 0.69 0.04 -0.51 0.52
-0.12 0.08 0.3 0.03 0.27 -0.58 -0.25 0.49 0.67 0.48 0.05 0.08 -0.8 0.01 -0.49 -0.54 -0.42 0.52 -0.07 -0.12 -0.13 -0.27 -0.54 -0.12 -0.12 0.21 0.13 0.32 0.13 -0.56
-0.21 -0.23 0.48 0.64 -0.16 -0.86 -0.3 1.3 1.25 0.9 0.34 0.39 -1.66 -2.25 -1.2 -1.53 -0.78 -1.83 -0.15 0.01 -0.42 -0.56 -0.14 -0.45 -0.45 -0.01 -0.04 0.63 0.73 -0.46
-0.13 1.01 -0.11 0.64 -2.77 -1.8 -3.8 -1.96 0.83 1.49 -0.23 0.48 -1.97 -0.66 -0.73 -1.21 -3.5 1.66 -0.42 -0.34 0.72 0.41 -1.65 -1.08 0.11 0.84 -0.53 0.52 0.16 -1.31
0.24 0.19 0.13 0.33 0.02 -0.17 -0.21 -0.05 0.07 0.15 0.09 0.02 -0.24 -0.05 -0.25 -0.06 -0.1 0.07 -0.21 -0.17 -0.13 -0.13 0.01 -0.1 -0.09 -0.24 -0.05 0.24 0.23 0.21
0.23 0.36 0.15 0.22 0.08 -0.19 -0.11 -0.14 -0.05 -0.04 -0.12 -0.11 -0.14 -0.07 -0.12 -0.17 -0.08 0.42 -0.29 -0.23 -0.11 -0.02 -0.02 -0.2 -0.06 -0.12 0.1 0.15 0.21 0.17
0.13 0.23 0.2 0.2 0.25 -0.19 -0.28 -0.16 0.31 0.3 -0.05 -0.02 -0.61 -0.07 -0.16 -0.27 -0.27 0.38 -0.14 -0.05 -0.13 0.03 -0.19 -0.32 -0.35 0.14 0.07 0.22 0.34 -0.11
0.05 0.28 0.07 -0.03 0.02 0.08 -0.12 -0.23 0.23 0.14 0.03 0.06 -0.46 0.01 0.17 -0.09 0.06 0.14 -0.11 0.01 0.09 0.13 -0.53 -0.16 -0.09 0.01 0.04 0.27 -0.08 -0.36
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-0.27 0.26 -0.05 0.13 -0.38 -0.41 -0.6 -0.3 -0.43 0.51 0.48 0.42 0.18 -1.07 -0.16 0.51 0.06 -0.84 -0.48 -1.5 0.27 0.49 -0.3 -0.09 0.8 0.18 0.3 0.24 -0.04 -0.33
-0.91 -0.43 0.98 0.78 1.12 -2.08 -0.35 1.4 1.01 1.0 0.07 -0.07 -0.89 -2.36 -2.19 -1.46 -1.42 -2.37 -1.07 -0.21 -0.28 -0.07 -1.54 -0.51 -0.18 -1.09 0.22 0.94 1.11 -0.81
1.07 0.51 0.43 0.26 0.16 -0.23 -0.51 -0.17 0.19 0.35 -0.38 -0.25 -0.55 -0.85 -1.22 -0.97 -0.55 0.81 -0.14 -0.2 -0.17 -0.82 -0.18 -0.32 -0.21 -0.26 -0.32 0.76 0.46 0.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.