1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_139 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
Spov3_C0044.00005 (SULT202E1)
 0.19 0.21 0.49 0.48 0.19 0.18 0.26 0.68 0.91 0.69 0.46 0.64 0.12 0.11 0.18 0.2 0.23 0.24 0.33 0.39 0.42 0.26 0.2 0.46 0.46 0.52 0.51 1.0 0.47 0.29
0.81 0.66 0.89 1.0 0.69 0.82 0.53 0.86 0.91 0.59 0.48 0.66 0.48 0.78 0.73 0.79 0.75 0.67 0.53 0.35 0.66 0.53 0.38 0.47 0.64 0.78 0.55 0.8 0.94 0.87
0.75 0.69 0.62 0.48 1.0 0.81 0.78 0.72 0.65 0.6 0.69 0.65 0.58 0.39 0.59 0.52 0.54 0.67 0.45 0.49 0.51 0.55 0.39 0.68 0.68 0.55 0.54 1.0 0.74 0.39
0.59 0.61 0.62 0.46 1.0 0.69 0.72 0.76 0.68 0.6 0.55 0.63 0.54 0.49 0.55 0.52 0.5 0.86 0.5 0.51 0.49 0.51 0.36 0.64 0.63 0.57 0.52 0.89 0.74 0.41
0.68 0.69 0.85 0.98 0.85 0.87 0.81 0.98 1.0 0.8 0.75 0.73 0.54 0.64 0.8 0.78 0.81 0.89 0.68 0.63 0.73 0.69 0.43 0.6 0.7 0.75 0.73 0.79 0.82 0.69
0.79 0.84 0.77 0.8 0.84 0.6 0.68 0.68 0.81 0.78 0.65 0.72 0.51 0.82 0.65 0.71 0.54 0.87 0.59 0.46 0.62 0.66 0.54 0.63 0.64 0.66 0.71 1.0 0.92 0.73
0.42 0.94 0.29 0.42 0.45 0.32 0.15 0.39 0.95 0.73 0.56 0.43 0.05 0.23 0.07 0.19 0.34 0.11 0.25 0.34 0.71 0.54 0.17 0.56 1.0 0.35 0.5 0.26 0.12 0.18
0.31 0.26 0.64 0.91 0.12 0.08 0.3 0.55 1.0 0.99 0.41 0.48 0.26 0.01 0.15 0.17 0.16 0.14 0.37 0.44 0.3 0.37 0.05 0.22 0.3 0.43 0.46 0.64 0.64 0.26
0.86 0.86 0.92 1.0 0.89 0.78 0.75 0.98 0.93 0.93 0.88 0.89 0.84 0.8 0.85 0.8 0.85 0.95 0.78 0.74 0.85 0.78 0.74 0.73 0.8 0.9 0.9 0.88 0.82 0.75
0.95 1.0 0.83 0.78 0.75 0.71 0.68 0.59 0.97 0.89 0.72 0.75 0.44 0.64 0.75 0.7 0.7 0.86 0.63 0.57 0.69 0.65 0.58 0.71 0.6 0.69 0.69 0.85 0.96 0.57
0.57 0.66 0.57 0.2 0.78 0.78 0.74 0.6 0.75 0.83 0.76 0.73 0.78 0.84 0.62 0.44 0.46 1.0 0.56 0.79 0.6 0.61 0.27 0.62 0.56 0.62 0.57 0.79 0.72 0.26
0.87 0.98 0.88 0.87 0.83 0.76 0.52 0.68 0.69 0.78 0.51 0.66 0.58 0.53 0.57 0.65 0.6 1.0 0.6 0.48 0.64 0.64 0.64 0.52 0.58 0.68 0.72 0.91 0.9 0.99
0.79 0.81 0.79 0.71 0.57 0.5 0.58 0.62 1.0 0.89 0.71 0.68 0.45 0.49 0.6 0.64 0.64 0.77 0.66 0.63 0.65 0.63 0.52 0.62 0.66 0.72 0.71 0.81 0.8 0.6
0.93 0.98 0.84 0.97 0.83 0.72 0.63 0.7 0.78 0.79 0.71 0.79 0.68 0.76 0.62 0.59 0.78 0.88 0.6 0.65 0.73 0.76 0.86 0.73 0.68 0.75 0.77 0.84 1.0 0.97
0.91 0.89 0.91 0.73 0.82 0.82 0.86 1.0 0.94 0.99 0.81 0.76 0.67 0.31 0.54 0.58 0.65 0.61 0.58 0.61 0.54 0.53 0.41 0.82 0.68 0.61 0.82 1.0 0.9 0.76
Spov3_chr2.02042 (MAPKKK6)
 0.75 0.69 0.62 0.66 0.68 0.41 0.44 0.32 0.51 0.34 0.47 0.42 0.23 0.58 0.37 0.44 0.38 1.0 0.45 0.39 0.43 0.3 0.42 0.4 0.39 0.49 0.48 0.56 0.61 0.51
0.52 0.61 0.71 0.51 0.46 0.38 0.58 0.85 0.93 0.91 0.72 0.66 0.33 0.47 0.31 0.23 0.34 1.0 0.61 0.66 0.44 0.58 0.21 0.6 0.46 0.62 0.47 0.62 0.58 0.39
0.24 0.59 0.3 0.34 0.2 0.09 0.19 0.23 0.56 1.0 0.45 0.31 0.23 0.28 0.15 0.16 0.11 0.27 0.26 0.38 0.26 0.2 0.18 0.28 0.27 0.44 0.26 0.24 0.28 0.2
0.14 0.79 0.42 0.47 0.02 0.0 0.16 0.2 0.44 1.0 0.32 0.3 0.07 0.07 0.01 0.08 0.13 0.26 0.34 0.34 0.24 0.21 0.14 0.26 0.26 0.22 0.33 0.23 0.3 0.27
0.28 0.56 0.35 0.42 0.07 0.01 0.17 0.18 0.79 1.0 0.38 0.22 0.06 0.11 0.05 0.07 0.1 0.12 0.44 0.31 0.4 0.15 0.16 0.23 0.28 0.36 0.33 0.23 0.26 0.16
0.17 0.51 0.3 0.36 0.06 0.05 0.11 0.2 0.41 1.0 0.2 0.22 0.08 0.06 0.02 0.05 0.09 0.37 0.49 0.25 0.33 0.2 0.2 0.24 0.28 0.36 0.37 0.25 0.28 0.18
0.43 0.5 0.47 0.38 0.14 0.02 0.22 0.22 0.76 1.0 0.13 0.26 0.06 0.07 0.03 0.14 0.04 0.22 0.35 0.32 0.41 0.26 0.17 0.2 0.36 0.38 0.38 0.31 0.42 0.2
0.18 0.07 0.29 0.35 0.48 0.19 0.22 0.5 1.0 0.69 0.39 0.34 0.1 0.02 0.11 0.16 0.16 0.01 0.29 0.18 0.24 0.19 0.26 0.21 0.26 0.26 0.2 0.55 0.58 0.17
0.53 0.74 0.69 0.47 0.63 0.56 0.53 0.46 0.89 0.98 0.62 0.84 0.45 0.36 0.47 0.44 0.44 1.0 0.63 0.63 0.7 0.64 0.5 0.69 0.53 0.62 0.66 0.56 0.71 0.44
0.28 0.47 0.37 0.75 0.46 0.31 0.48 0.59 0.73 0.64 0.55 0.35 0.09 0.02 0.17 0.19 0.15 0.35 0.38 0.44 0.32 0.3 0.22 0.41 0.42 0.55 0.46 0.77 1.0 0.41
Spov3_chr2.04628 (AtHMP08)
 0.2 0.54 0.47 0.35 0.02 0.06 0.15 0.18 0.51 0.8 0.49 0.36 0.02 0.08 0.26 0.2 0.2 0.04 0.55 0.22 0.41 0.26 0.2 0.31 0.85 0.44 1.0 0.21 0.14 0.14
0.13 0.24 0.34 0.08 0.15 0.1 0.19 0.03 0.32 0.45 0.73 0.26 0.0 0.0 0.11 0.45 0.3 0.0 0.1 0.0 0.2 0.11 0.15 0.55 1.0 0.59 0.43 0.26 0.23 0.03
Spov3_chr2.05720 (VPS20.2)
 0.73 0.89 0.58 0.58 0.26 0.29 0.56 0.31 0.94 1.0 0.65 0.51 0.26 0.11 0.21 0.35 0.29 0.24 0.67 0.63 0.76 0.67 0.27 0.57 0.58 0.85 0.74 0.5 0.62 0.59
0.76 0.74 0.62 0.68 0.6 0.47 0.59 0.74 0.68 0.67 0.65 0.56 0.56 0.52 0.47 0.56 0.5 1.0 0.56 0.48 0.55 0.53 0.48 0.64 0.59 0.57 0.6 0.7 0.86 0.72
0.67 0.8 0.66 0.61 0.73 0.53 0.43 0.58 0.66 0.67 0.59 0.51 0.41 0.58 0.33 0.48 0.58 0.63 0.44 0.43 0.45 0.47 0.91 0.48 0.58 0.61 0.54 0.81 1.0 0.78
0.28 0.25 0.36 0.45 0.28 0.17 0.11 0.03 0.3 0.35 0.15 0.12 0.16 0.59 0.0 0.33 0.03 1.0 0.2 0.15 0.07 0.19 0.02 0.03 0.15 0.22 0.23 0.35 0.25 0.1
0.5 0.75 0.14 0.14 0.56 0.19 0.05 0.16 0.37 0.35 0.1 0.15 0.0 0.24 0.0 0.11 0.0 1.0 0.0 0.14 0.19 0.0 0.24 0.05 0.39 0.2 0.31 0.22 0.34 0.0
0.87 0.87 0.83 0.88 0.82 0.71 0.7 0.75 0.75 0.76 0.74 0.78 0.7 0.55 0.58 0.6 0.66 1.0 0.63 0.6 0.71 0.66 0.55 0.65 0.65 0.7 0.69 0.83 0.83 0.82
0.9 1.0 0.72 0.58 0.24 0.22 0.49 0.27 0.57 0.64 0.41 0.49 0.13 0.08 0.16 0.19 0.25 0.22 0.76 0.47 0.63 0.51 0.21 0.51 0.58 0.83 0.84 0.68 0.8 0.61
0.75 0.82 0.61 0.52 0.56 0.32 0.35 0.19 0.82 0.46 0.38 0.37 0.16 0.41 0.27 0.43 0.29 1.0 0.29 0.41 0.25 0.35 0.2 0.38 0.32 0.36 0.32 0.39 0.48 0.4
Spov3_chr3.04609 (emb1417)
 0.73 0.77 0.87 0.83 0.79 0.76 0.76 1.0 0.97 0.87 0.8 0.87 0.5 0.53 0.63 0.65 0.64 0.81 0.72 0.71 0.75 0.7 0.55 0.72 0.73 0.81 0.8 0.93 0.87 0.71
0.61 0.65 0.69 0.52 0.62 0.53 0.54 0.67 0.82 0.71 0.57 0.64 0.26 0.33 0.45 0.44 0.47 1.0 0.47 0.46 0.51 0.51 0.31 0.56 0.54 0.57 0.56 0.9 0.72 0.36
0.56 0.52 0.66 0.62 0.72 0.56 0.43 0.76 0.88 0.68 0.7 0.68 0.35 0.38 0.59 0.58 0.6 0.34 0.56 0.49 0.55 0.49 0.46 0.54 0.57 0.62 0.64 1.0 0.84 0.5
1.0 0.91 0.94 0.98 0.97 0.63 0.65 0.68 0.67 0.76 0.65 0.66 0.79 0.83 0.7 0.75 0.7 0.9 0.67 0.71 0.67 0.72 0.71 0.76 0.79 0.74 0.86 0.94 0.94 0.92
0.6 0.63 0.66 0.62 0.97 0.74 0.81 1.0 0.82 0.83 0.71 0.72 0.61 0.67 0.75 0.89 0.78 0.64 0.64 0.56 0.66 0.68 0.53 0.61 0.56 0.75 0.82 0.7 0.77 0.69
0.72 0.78 0.79 0.7 0.78 0.54 0.77 1.0 0.92 0.96 0.64 0.66 0.39 0.3 0.36 0.43 0.39 0.65 0.72 0.69 0.71 0.67 0.34 0.66 0.7 0.73 0.8 0.96 0.87 0.5
0.37 0.39 0.44 0.44 0.48 0.52 0.4 0.46 0.66 0.66 0.59 0.6 0.38 0.2 0.53 0.53 0.56 1.0 0.49 0.48 0.67 0.58 0.47 0.43 0.52 0.56 0.52 0.42 0.48 0.43
0.19 0.26 0.38 0.23 0.17 0.15 0.46 0.34 0.52 1.0 0.71 0.31 0.25 0.09 0.17 0.14 0.23 0.09 0.35 0.47 0.36 0.35 0.18 0.17 0.24 0.57 0.53 0.25 0.36 0.43
0.85 0.81 0.89 0.92 0.7 0.73 0.79 0.91 0.86 0.76 0.74 0.79 0.66 0.42 0.56 0.52 0.54 1.0 0.6 0.62 0.59 0.66 0.54 0.63 0.69 0.64 0.68 0.94 0.94 0.63
0.68 0.75 0.76 0.73 0.46 0.45 0.51 0.63 1.0 0.94 0.76 0.76 0.39 0.5 0.44 0.48 0.58 0.5 0.63 0.64 0.67 0.59 0.52 0.68 0.68 0.85 0.71 0.77 0.63 0.46
0.49 0.58 0.73 0.53 0.74 0.57 0.59 0.71 0.85 0.7 0.64 0.67 0.28 0.18 0.58 0.57 0.64 1.0 0.59 0.57 0.67 0.62 0.42 0.51 0.57 0.73 0.73 0.81 0.74 0.56
0.6 0.71 0.64 0.49 0.37 0.31 0.36 0.51 1.0 0.84 0.46 0.46 0.4 0.32 0.42 0.55 0.32 0.37 0.39 0.55 0.55 0.36 0.41 0.6 0.64 0.36 0.85 0.39 0.5 0.37
0.37 0.61 0.73 0.2 0.2 0.39 0.56 0.29 1.0 0.88 0.95 0.81 0.07 0.1 0.31 0.48 0.44 0.01 0.69 0.49 0.69 0.79 0.04 0.47 0.37 0.64 0.8 0.51 0.35 0.71
0.58 0.67 0.77 0.64 0.76 0.42 0.53 0.88 1.0 0.88 0.65 0.66 0.36 0.63 0.45 0.43 0.47 0.9 0.6 0.58 0.58 0.52 0.43 0.58 0.58 0.73 0.69 0.79 0.69 0.43
0.35 0.34 0.57 0.63 0.36 0.22 0.33 1.0 0.96 0.76 0.51 0.53 0.13 0.09 0.18 0.14 0.24 0.11 0.37 0.41 0.3 0.28 0.37 0.3 0.3 0.4 0.39 0.63 0.67 0.29
0.29 0.64 0.29 0.49 0.05 0.09 0.02 0.08 0.56 0.89 0.27 0.44 0.08 0.2 0.19 0.14 0.03 1.0 0.24 0.25 0.52 0.42 0.1 0.15 0.34 0.57 0.22 0.45 0.35 0.13
0.94 0.91 0.87 1.0 0.81 0.71 0.69 0.77 0.83 0.88 0.85 0.81 0.67 0.77 0.67 0.76 0.75 0.83 0.69 0.71 0.73 0.73 0.8 0.74 0.75 0.67 0.77 0.94 0.93 0.92
0.88 0.96 0.83 0.87 0.79 0.66 0.69 0.68 0.72 0.73 0.69 0.69 0.68 0.71 0.69 0.67 0.71 1.0 0.61 0.64 0.7 0.74 0.74 0.65 0.72 0.69 0.8 0.83 0.86 0.84
0.84 0.9 0.88 0.88 0.92 0.67 0.63 0.69 0.95 0.95 0.74 0.76 0.5 0.73 0.69 0.64 0.64 1.0 0.7 0.74 0.7 0.79 0.67 0.61 0.6 0.85 0.81 0.89 0.97 0.71
0.85 1.0 0.86 0.81 0.84 0.87 0.76 0.7 0.96 0.91 0.84 0.86 0.6 0.83 0.93 0.77 0.86 0.91 0.76 0.83 0.88 0.9 0.57 0.74 0.78 0.83 0.84 0.99 0.78 0.64
0.96 0.86 0.73 0.63 0.84 0.56 0.54 0.41 0.8 0.87 0.57 0.59 0.35 0.65 0.46 0.52 0.55 1.0 0.58 0.46 0.63 0.6 0.61 0.67 0.61 0.64 0.65 0.94 0.92 0.54
0.47 0.68 0.56 0.62 0.44 0.43 0.38 0.46 0.42 0.82 0.8 0.76 0.65 0.27 0.51 0.82 0.6 0.32 0.41 0.2 0.69 0.8 0.47 0.54 1.0 0.65 0.71 0.68 0.56 0.45
0.2 0.28 0.75 0.65 0.82 0.09 0.3 1.0 0.76 0.75 0.4 0.36 0.2 0.07 0.08 0.14 0.14 0.07 0.18 0.33 0.31 0.36 0.13 0.27 0.33 0.18 0.44 0.72 0.81 0.21
1.0 0.68 0.65 0.57 0.53 0.41 0.34 0.43 0.55 0.61 0.37 0.4 0.33 0.27 0.2 0.24 0.33 0.84 0.43 0.41 0.42 0.27 0.42 0.38 0.41 0.4 0.38 0.81 0.66 0.59

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)