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Heatmap: Cluster_171 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.19 0.12 0.28 0.41 0.18 -0.23 -0.32 0.27 0.1 0.06 -0.03 -0.01 -0.24 -0.39 -0.16 0.05 -0.0 -0.48 -0.24 -0.25 -0.1 -0.1 -0.22 -0.23 -0.03 0.06 0.1 0.22 0.26 0.24
0.31 0.32 0.61 0.64 -0.28 -0.48 -0.28 0.16 -0.08 -0.08 -0.37 -0.57 -0.06 0.17 -0.37 -0.65 -0.4 -0.58 -0.04 -0.1 0.23 0.19 -0.18 -0.23 -0.24 0.11 0.18 0.09 0.44 0.31
-0.67 0.26 0.34 1.08 0.21 -0.57 -1.12 0.78 0.42 0.32 -0.95 -0.7 -0.32 0.04 -0.12 -0.1 -0.71 -0.29 -0.05 -0.81 -0.62 -0.38 -0.47 -0.66 -0.02 0.07 0.22 0.23 0.88 0.51
0.22 0.22 0.17 0.27 0.2 -0.12 -0.25 0.07 -0.06 -0.03 -0.03 -0.09 -0.14 -0.2 -0.13 -0.13 -0.08 -0.11 -0.26 -0.12 -0.04 -0.11 -0.19 -0.02 -0.07 -0.02 0.12 0.12 0.27 0.25
-0.28 -0.17 0.27 0.93 0.65 -0.18 -0.44 0.43 0.14 -0.32 -0.24 -0.21 -0.24 -0.23 -0.11 -0.15 -0.15 -0.29 -0.17 -0.47 -0.24 -0.06 -0.33 -0.62 -0.45 -0.09 0.31 0.14 0.38 0.68
0.13 0.11 0.1 0.01 0.04 -0.18 -0.28 0.17 0.07 0.2 -0.03 0.07 0.01 0.56 -0.21 -0.25 -0.18 -0.3 -0.16 -0.18 -0.14 -0.27 0.28 -0.21 -0.15 -0.03 -0.07 0.27 0.16 0.03
-0.53 0.01 0.47 1.13 0.17 0.09 -1.52 0.6 0.25 0.31 -0.12 0.36 -0.87 -0.8 -0.6 -0.62 0.17 -0.21 -1.09 -0.69 -0.34 -0.73 -0.77 -0.22 -0.18 -0.12 0.4 -0.06 0.6 1.06
0.23 0.14 0.51 0.73 0.33 -0.26 -0.79 0.36 -0.03 0.16 -0.1 -0.24 -0.35 -0.58 -0.39 -0.41 -0.35 -0.86 -0.72 -0.83 -0.2 -0.47 0.18 0.06 -0.07 -0.22 0.01 0.66 0.7 0.64
-0.02 0.15 0.23 0.28 0.17 -0.1 -0.27 0.71 0.17 0.07 -0.12 0.07 -0.01 -0.32 -0.17 -0.38 -0.21 -0.21 -0.17 -0.25 -0.16 -0.21 -0.24 -0.05 -0.13 -0.18 -0.16 0.22 0.48 0.17
-0.07 -0.05 0.09 -0.06 0.31 -0.3 -0.09 0.68 0.25 0.31 -0.03 0.04 -0.19 0.4 -0.29 -0.43 -0.47 -0.17 -0.38 -0.23 -0.23 -0.22 0.39 -0.04 -0.32 -0.2 -0.26 0.42 0.34 -0.1
0.17 0.11 0.26 0.37 0.0 -0.18 -0.1 0.25 0.16 0.19 0.03 0.04 -0.27 -0.06 -0.16 -0.23 -0.12 -0.15 -0.31 -0.2 -0.09 -0.11 -0.2 -0.16 0.02 0.03 0.09 0.2 0.14 -0.04
-0.0 -0.48 0.42 1.27 -0.04 -0.61 -0.87 0.62 -0.3 0.41 -0.81 0.11 -0.41 -1.2 -0.38 0.02 0.02 0.05 -0.93 -1.13 0.17 -0.64 -0.99 -0.24 -0.19 0.26 0.31 0.5 0.43 0.85
-0.29 0.32 0.58 1.13 -0.43 -0.55 -1.9 0.45 -0.18 0.11 0.13 -0.49 -0.24 0.23 -0.16 -0.42 0.17 -0.3 -1.04 -0.7 -0.08 -0.68 -0.76 -0.58 0.32 -0.2 -0.03 0.09 0.33 1.31
-0.5 0.05 0.32 1.0 0.29 -0.24 -1.42 0.45 0.06 0.14 0.09 0.0 -0.13 -0.78 -0.13 -0.17 -0.46 -0.2 -0.85 -0.48 0.04 -0.22 -0.53 -0.28 -0.17 0.29 0.07 0.1 0.51 0.81
-0.2 0.29 0.34 1.01 0.23 -0.23 -1.25 0.88 -0.25 0.16 -0.2 -0.24 -0.37 -0.26 -0.46 -0.49 -0.21 -0.26 -0.64 -0.74 -0.18 -0.4 -0.39 -0.74 -0.29 -0.1 0.12 0.41 0.77 0.85
-0.15 -0.12 0.08 -0.21 0.75 -0.3 -0.06 1.2 0.39 0.09 -0.34 -0.1 -0.51 -0.76 -0.65 -0.83 -0.54 -0.96 -0.29 -0.06 -0.46 -0.45 0.29 -0.11 -0.35 -0.27 -0.31 0.6 0.99 0.48
-0.24 0.17 0.38 0.87 0.01 -0.32 -0.25 0.78 -0.11 0.14 -0.34 -0.23 -0.3 -0.37 -0.2 0.14 -0.35 0.39 -0.35 -0.55 -0.31 -0.2 -0.75 -0.58 -0.18 0.08 0.43 0.01 0.41 0.23
-0.12 -0.26 0.62 1.2 0.3 -0.75 -2.24 0.57 -0.18 -0.44 -0.21 0.14 -0.95 -0.48 -0.47 -0.3 -0.8 -0.28 -0.7 -0.59 -0.54 -0.17 -1.01 -0.45 0.11 0.35 0.13 0.62 0.84 1.18
-0.16 -0.16 0.33 1.11 0.48 -1.12 -0.84 0.97 -0.34 -0.65 -0.19 0.15 0.27 -1.59 -0.73 -0.7 0.1 0.43 -0.61 -0.56 -0.3 -2.08 -0.78 -0.63 0.01 0.26 0.19 0.39 0.32 1.21
0.41 0.41 0.36 0.94 0.1 -0.6 -1.14 0.33 0.31 0.19 -0.12 -0.15 -0.62 0.14 -0.3 -0.47 -0.1 -0.11 -0.42 -0.51 -0.15 -0.35 -0.63 -0.41 -0.37 -0.09 -0.12 0.28 0.8 0.3
Spov3_chr2.02252 (Obg A-1)
 0.23 0.29 0.41 0.57 0.21 -0.41 -0.46 0.35 -0.04 0.24 -0.34 -0.11 -0.29 -0.42 -0.21 -0.36 -0.17 -0.3 -0.18 -0.55 -0.15 -0.22 -0.54 -0.3 -0.11 -0.07 0.02 0.56 0.59 0.5
-0.49 0.04 0.22 1.2 -0.18 -0.09 -1.23 0.7 0.11 -0.12 -0.01 0.03 -0.51 -0.54 -0.81 -0.4 0.17 -0.31 -0.24 -0.31 -0.2 -0.2 -0.74 -0.61 -0.03 -0.41 -0.05 0.41 0.78 0.9
-0.47 -0.41 0.49 0.95 -0.03 -0.39 -0.18 0.96 0.7 0.47 -0.35 -0.08 -0.3 -0.67 -0.46 -0.56 -0.3 -1.31 -0.72 -0.42 -0.59 -0.44 -1.72 -1.14 -0.71 -0.3 -0.43 0.45 1.25 1.25
-0.46 -0.03 0.25 0.86 -0.08 -0.37 -0.44 0.78 0.07 0.1 0.11 -0.17 0.14 -0.6 -0.05 -0.21 0.07 -0.72 -0.23 -0.55 -0.25 -0.5 -0.79 -0.69 0.1 0.21 0.27 0.04 0.53 0.67
-0.15 0.17 0.16 0.82 -0.01 -0.23 -1.03 0.67 -0.09 -0.06 -0.2 -0.05 -0.32 0.07 -0.23 -0.06 -0.22 0.22 -0.51 -0.66 -0.02 -0.54 -0.54 -0.09 -0.25 0.02 0.04 0.07 0.58 0.76
-0.03 0.12 0.17 0.53 0.24 -0.63 -0.87 0.3 0.4 0.34 0.18 -0.14 -0.25 -0.57 -0.04 0.25 0.16 0.09 -0.38 -0.22 -0.7 -0.53 -0.29 -0.69 -0.16 -0.12 -0.07 0.28 0.17 0.85
0.12 0.18 0.37 0.35 0.06 -0.36 0.1 0.3 0.13 0.18 0.05 -0.16 0.04 -0.41 -0.31 -0.08 -0.2 -0.41 -0.18 -0.27 -0.2 -0.21 -0.46 -0.44 -0.11 -0.09 0.08 0.25 0.54 0.36
-0.44 -0.03 0.1 1.19 0.16 0.03 -1.23 0.64 -0.03 0.31 -0.33 -0.32 -0.21 -0.28 -0.02 -0.53 -0.77 -0.56 -0.29 -1.12 -1.04 -0.32 -0.14 -0.68 -0.21 0.33 -0.25 0.26 0.69 1.3
0.05 -0.09 0.33 1.15 -0.08 0.05 -1.25 0.58 -0.04 0.23 -0.02 -0.27 -0.34 -1.0 -0.3 -0.11 -0.06 -0.1 -0.95 -1.09 -0.33 -0.43 -1.01 -0.84 0.05 0.04 0.38 0.44 0.69 0.9
0.46 0.4 0.62 0.58 -0.25 -0.37 -0.48 -0.16 0.17 0.15 0.16 -0.11 -0.39 -0.22 -0.08 -0.3 -0.17 -0.29 -0.0 -0.02 0.0 -0.14 -0.36 -0.14 -0.14 -0.11 -0.11 -0.38 0.52 0.18
0.24 0.35 0.25 0.64 -0.03 -0.09 -0.39 0.23 -0.02 0.07 -0.16 0.04 0.12 0.02 -0.26 -0.25 -0.02 -0.42 -0.45 -0.26 -0.13 -0.15 -0.53 -0.31 0.0 -0.08 0.09 0.45 0.27 0.02
-0.35 -0.12 0.33 0.91 0.35 -0.75 -1.49 0.36 -0.13 0.24 -0.11 -0.05 -0.76 -1.38 0.02 -0.11 0.05 -0.05 -0.88 -0.87 -0.12 -0.65 -0.16 -0.52 0.23 0.13 0.14 0.95 0.76 0.61
0.07 -0.3 0.45 0.82 0.05 -0.46 -0.87 0.71 -0.06 0.03 0.09 0.06 -0.39 0.08 -0.12 -0.39 -0.39 -0.15 -0.56 -0.34 -0.37 -0.52 -0.14 -0.25 0.02 -0.3 -0.11 0.06 0.61 0.85
0.15 0.21 0.3 0.47 0.15 -0.24 -0.22 0.06 0.0 0.1 -0.04 0.1 -0.15 0.04 -0.37 -0.27 -0.22 -0.09 -0.18 -0.21 -0.06 -0.18 -0.43 -0.08 -0.02 -0.1 0.11 0.25 0.32 0.13
-0.26 0.15 0.27 0.98 0.21 -0.02 -0.93 0.47 0.02 0.1 -0.1 0.04 -0.37 0.02 -0.78 -0.63 0.01 -0.32 -0.95 -0.26 -0.17 -0.32 -0.57 -0.28 -0.06 0.26 0.28 0.08 0.39 0.75
0.27 0.23 0.4 0.39 0.13 -0.17 -0.23 0.23 0.11 0.05 -0.2 -0.06 -0.24 -0.32 -0.01 -0.19 -0.08 -0.19 -0.24 -0.25 -0.02 -0.12 -0.06 -0.32 -0.24 -0.06 0.01 0.16 0.29 0.26
0.0 0.15 -0.03 -0.51 0.19 -0.01 -0.08 0.59 0.3 0.28 -0.2 0.08 -1.06 0.17 -0.35 -0.36 -0.43 -0.2 -0.18 -0.25 -0.1 -0.27 0.23 -0.14 -0.17 0.06 0.04 0.5 0.53 0.12
0.27 0.35 0.44 0.57 0.07 -0.44 -0.65 0.61 0.46 0.04 -0.17 0.08 -0.86 -0.19 -0.56 -0.7 -0.16 -0.03 -0.39 -0.36 -0.25 -0.32 -0.64 -0.2 -0.42 -0.09 -0.0 0.63 0.67 0.33
-0.18 -0.32 0.51 0.8 0.04 -0.54 -1.4 0.66 0.23 -0.04 -0.3 -0.18 -0.05 -1.07 -0.54 -0.29 -0.2 -0.35 -0.73 -0.86 -0.33 -0.7 -0.34 -0.2 0.37 0.39 0.28 0.57 0.66 0.95
-0.13 0.13 0.53 0.97 0.13 -0.51 -0.93 0.28 -0.08 0.29 -0.21 -0.24 -0.24 -0.34 -0.2 -0.38 -0.25 0.23 -0.44 -0.17 -0.14 -0.55 -0.37 -0.73 -0.11 -0.08 0.26 0.19 0.54 0.7
0.41 0.57 0.9 0.83 -0.16 -0.55 -0.37 0.53 0.71 0.46 -0.27 -0.21 -0.86 -0.12 -0.36 -0.5 -0.55 -1.16 -0.52 -0.54 -0.48 -0.44 -0.98 -0.52 -0.53 -0.37 -0.18 0.22 1.05 0.42
0.06 -0.02 0.13 0.22 0.04 -0.17 -0.13 0.36 0.07 0.04 0.07 0.01 0.13 -0.13 -0.24 -0.04 -0.03 -0.39 -0.17 -0.18 -0.02 -0.16 -0.03 -0.27 0.02 -0.04 0.04 0.13 0.25 0.2
0.04 -0.19 -0.2 0.91 0.02 -0.86 -1.92 0.8 0.19 0.04 -0.87 -0.15 -0.31 -0.95 -0.67 -0.07 0.01 0.52 0.07 -0.39 -0.71 -0.3 -0.26 -0.52 0.06 -0.25 -0.03 0.68 0.09 1.34
-0.35 -0.73 0.18 0.89 0.04 -0.02 -1.71 0.79 0.02 0.28 0.07 -0.19 -0.2 -0.23 0.19 -0.32 -0.87 0.02 -0.88 -1.31 0.3 -0.89 -1.39 -0.22 0.01 0.08 0.02 0.54 0.34 1.29
-0.43 0.36 0.54 0.88 -0.21 -0.37 -0.71 0.51 0.19 0.24 -0.05 -0.47 -0.17 -0.08 -0.84 -0.16 -0.57 -0.23 -0.56 -0.33 -0.12 -0.71 -0.94 -0.28 -0.06 0.06 0.36 0.23 0.77 0.75
-0.35 -0.12 0.03 0.88 0.07 -0.48 -1.09 0.7 0.19 0.52 -0.12 -0.17 -0.67 -0.49 -0.14 -0.35 -0.48 -0.05 -0.98 -0.67 -0.54 -0.47 -0.6 -0.03 0.18 0.03 0.35 -0.03 0.76 1.12
Spov3_S11.00040 (NPF5.5)
 0.55 1.08 0.3 -0.34 -0.45 0.16 -0.97 0.2 0.02 0.88 -0.49 -0.03 -0.03 1.29 -0.84 -0.87 -1.29 -0.19 -0.96 -0.62 -0.18 -0.71 0.38 -0.71 -0.8 -0.21 -0.72 0.05 0.8 0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.