1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_204 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000439 (PMEIL)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.16 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.74 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.73 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0
Bra001138 (RBK2)
 1.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0
1.0 0.56 0.53 0.26 0.1 0.05 0.17 0.09 0.14 0.08 0.23 0.27 0.17 0.1 0.15 0.08 0.15 0.23 0.01 0.09 0.09 0.03 0.45 0.11 0.28 0.07 0.0 0.07 0.13 0.34 0.47
Bra001308 (PLL3)
 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
Bra001311 (MYB3R-3)
 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.25 0.55 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra001795 (COBL10)
 1.0 0.0 0.16 0.0 0.29 0.19 0.55 0.37 0.77 0.0 0.11 0.25 0.28 0.08 0.31 0.0 0.26 0.47 0.16 0.2 0.06 0.54 0.0 0.23 0.35 0.25 0.0 0.15 0.07 0.42 0.16
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.45 0.3 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.39 0.13 0.0 0.13 0.0 0.13 0.0 0.3 0.0 0.0
Bra002750 (PICALM2a)
 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87
Bra002901 (XYLT)
 0.72 0.0 1.0 0.62 0.43 0.0 0.13 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.38 0.12 0.08 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.12 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra002902 (XYLT)
 0.8 0.0 1.0 0.82 0.43 0.0 0.2 0.0 0.58 0.18 0.0 0.0 0.69 0.37 0.08 0.0 0.16 0.0 0.28 0.0 0.03 0.17 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.17 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.16 0.19 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra003316 (MTP8)
 1.0 0.29 0.35 0.88 0.0 0.58 0.13 0.0 0.25 0.14 0.32 0.0 0.0 0.54 0.09 0.0 0.08 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.14 0.07 0.0 0.17 0.0 0.38 0.08
Bra003795 (CYP98A8)
 0.0 0.0 1.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57
1.0 0.53 0.93 0.58 0.76 0.08 0.36 0.04 0.01 0.0 0.02 0.0 0.12 0.0 0.06 0.0 0.11 0.0 0.25 0.04 0.07 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.61 0.24 0.09 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93
1.0 0.0 0.14 0.35 0.04 0.0 0.1 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.15 0.04 0.06 0.24 0.18 0.18 0.04 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.21 0.05 0.21 0.08 0.04
Bra010873 (PG45)
 1.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.21 0.37 0.0 0.0 0.0 0.08 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.11 0.05
1.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15
0.89 0.12 1.0 0.99 0.11 0.25 0.11 0.05 0.13 0.05 0.13 0.0 0.16 0.17 0.14 0.11 0.03 0.0 0.34 0.07 0.09 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.37 0.0 1.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra017775 (HAM4)
 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra017790 (OEE1)
 0.0 0.0 0.64 1.0 0.0 0.07 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.42 0.08 0.0 0.07 0.0 0.22 0.06 0.14 0.0 0.0 0.0 0.14 0.07 0.17 0.0 0.0 0.0
Bra018279 (CLE5)
 1.0 0.0 0.34 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.4 0.87 0.41 0.79 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47
0.9 0.0 1.0 0.75 0.48 0.91 0.04 0.19 0.0 0.0 0.18 0.1 0.05 0.0 0.25 0.21 0.17 0.13 0.17 0.0 0.15 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra020545 (PRK4)
 0.74 1.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.27 0.04 0.43 0.43 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra020815 (COG5)
 0.85 1.0 0.69 0.87 0.54 0.35 0.12 0.1 0.04 0.09 0.07 0.16 0.04 0.18 0.1 0.06 0.06 0.23 0.16 0.07 0.22 0.07 0.43 0.36 0.22 0.14 0.13 0.16 0.3 0.24 0.13
0.66 0.61 1.0 0.41 0.97 0.59 0.34 0.34 0.38 0.42 0.46 0.38 0.32 0.24 0.27 0.21 0.25 0.33 0.4 0.45 0.37 0.41 0.35 0.41 0.48 0.3 0.6 0.4 0.41 0.29 0.27
0.44 0.4 0.07 0.11 0.15 0.65 0.19 0.02 0.65 0.26 0.37 0.11 0.26 0.19 0.26 0.19 0.3 0.07 0.32 0.16 0.25 0.24 0.08 0.27 0.44 0.52 0.2 0.04 0.22 0.22 1.0
0.38 0.13 1.0 0.41 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.1 0.09 0.0 0.11 0.0 0.0 0.47 0.0 0.09 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.29 0.12 0.33 0.0 0.0
0.63 0.41 1.0 0.54 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.61 0.04 0.0 0.27 0.05 0.16 0.13 0.1 0.09 0.45 0.21 0.03 0.2 0.02 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.04 0.06
0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.44 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.71 0.57 0.34 0.03 0.12 0.26 0.23 0.06 0.04 0.04 0.11 0.23 0.01 0.05 0.11 0.22 0.0 0.01 0.04 0.03 0.11 0.08 0.14 0.15 0.32 0.2 0.16 0.26 0.12 0.27
Bra024844 (CYCJ18)
 0.33 0.09 0.0 0.17 0.51 0.14 0.12 0.0 0.06 0.0 0.12 0.0 0.0 0.26 0.85 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0 0.0 0.55 0.21 0.0 0.27 0.0 0.13 0.23 0.08 0.07 0.08
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0
Bra025199 (CYP71B34)
 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.42 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0
0.78 0.0 0.0 0.24 0.0 0.15 0.33 0.21 0.0 0.0 0.32 0.13 0.27 0.0 0.75 0.0 0.07 0.94 0.19 0.06 0.0 0.78 0.1 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.15 0.23 0.31
1.0 0.27 0.0 0.3 0.24 0.08 0.0 0.54 0.28 0.11 0.11 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.03 0.41 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.18 0.01 0.27 0.13 0.19
0.52 0.0 1.0 0.49 0.0 0.05 0.54 0.0 0.09 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra027634 (MAN7)
 0.64 1.0 0.69 0.67 0.0 0.07 0.46 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.26 0.0 0.0 0.25 0.0 0.04 0.0 0.08 0.15 0.18 0.18 0.09
Bra028080 (PUB50)
 0.2 0.54 0.13 0.1 0.27 0.7 0.36 0.11 0.96 0.37 1.0 0.39 0.76 0.41 0.35 0.2 0.45 0.15 0.35 0.48 0.4 0.43 0.04 0.12 0.22 0.26 0.3 0.06 0.21 0.2 0.7
Bra028081 (MORC4)
 0.83 0.0 1.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra028216 (LPPepsilon1)
 0.98 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra029395 (PRLIP6)
 1.0 0.74 0.86 0.29 0.34 0.26 0.22 0.24 0.14 0.32 0.33 0.21 0.22 0.28 0.23 0.35 0.47 0.32 0.34 0.57 0.31 0.55 0.91 0.35 0.26 0.29 0.31 0.22 0.22 0.14 0.19
0.91 0.56 0.8 1.0 0.65 0.16 0.29 0.0 0.0 0.08 0.14 0.09 0.09 0.0 0.0 0.09 0.09 0.0 0.37 0.17 0.32 0.0 0.25 0.0 0.0 0.47 0.0 0.09 0.25 0.55 0.24
Bra029454 (MEKK4)
 0.19 0.0 1.0 0.62 0.8 0.14 0.0 0.0 0.0 0.24 0.65 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra030545 (GRXS13)
 1.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.75
1.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.16 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.3 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra031150 (MBD9)
 0.06 0.24 1.0 0.68 0.21 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.21 0.0 0.3 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.11 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.23 0.1 0.0 0.11 0.03 0.05 0.1 0.46 0.17 0.28 0.03 0.13 0.03 0.04 0.16 0.03 0.22 0.0 0.32 0.06 0.04 0.03 0.0 0.1 0.0 0.08 0.0 0.19 0.13 0.07
Bra032302 (UNE1)
 1.0 0.43 0.88 0.57 0.67 0.53 0.3 0.32 0.6 0.28 0.28 0.45 0.93 0.62 0.83 0.22 0.46 0.63 0.68 0.27 0.3 0.15 0.22 0.68 0.26 0.53 0.04 0.15 0.15 0.07 0.29
Bra032438 (ADS1.2)
 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra033188 (REF6)
 1.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra034194 (SKIP19)
 0.67 0.24 0.0 0.0 0.68 0.22 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.1 1.0 0.05 0.0 0.0 0.33 0.12 0.04 0.18 0.08 0.08 0.48 0.0 0.0 0.46 0.0 0.21 0.0 0.05 0.1
0.96 0.03 1.0 0.5 0.02 0.0 0.08 0.18 0.05 0.0 0.35 0.21 0.2 0.06 0.25 0.03 0.29 0.09 0.0 0.1 0.19 0.02 0.16 0.35 0.58 0.55 0.54 0.24 0.38 0.37 0.37
1.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.11 0.5 0.46 0.26 0.77 0.55 0.06 0.77 0.11 0.8 0.13 0.71 0.27 0.35 0.18 0.36 0.09 0.33 1.0 0.41 0.19 0.0 0.13 0.33 0.0 0.2 0.46 0.07 0.15 0.64
0.83 0.69 0.0 0.73 0.38 0.46 0.3 0.0 1.0 0.07 0.07 0.14 0.0 0.0 0.18 0.23 0.0 0.19 0.4 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra037373 (NOP56)
 1.0 0.0 0.2 0.0 0.19 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0
0.34 0.14 0.34 0.0 0.48 0.71 0.37 0.11 0.96 0.1 0.5 0.73 0.39 0.31 0.19 0.11 0.36 0.31 0.36 0.36 0.63 0.1 0.0 0.3 0.36 0.41 0.11 0.19 0.06 0.0 1.0
Bra037693 (THAL)
 0.0 0.26 1.0 0.0 0.24 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12
Bra038770 (PUMPKIN)
 1.0 0.19 0.5 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra039389 (SKS13)
 0.27 0.23 0.8 1.0 0.0 0.29 0.2 0.08 0.26 0.0 0.08 0.61 0.33 0.0 0.05 0.25 0.28 0.0 0.0 0.04 0.3 0.42 0.0 0.0 0.08 0.42 0.18 0.0 0.05 0.05 0.05
0.57 0.45 0.45 0.47 0.47 0.73 0.34 0.09 1.0 0.22 0.63 0.14 0.25 0.52 0.12 0.41 0.4 0.28 0.27 0.57 0.58 0.37 0.09 0.12 0.13 0.16 0.25 0.09 0.24 0.08 0.72
Bra039820 (MEL3)
 1.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.45
0.94 0.22 0.09 0.14 0.19 0.47 0.1 0.04 0.61 0.0 0.45 0.39 1.0 0.0 0.25 0.2 0.2 0.11 0.38 0.0 0.22 0.34 0.11 0.14 0.13 0.34 0.0 0.17 0.19 0.04 0.16
Bra040876 (SPA3)
 0.5 0.0 1.0 0.28 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.13 0.0 0.0 0.27 0.25 0.63 0.38 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.13 0.0
Bra040944 (BSK7)
 1.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra041135 (ARS1)
 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)