1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_104 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.15 -0.18 0.14 0.06 0.1 -0.2 -0.04 0.13 0.12 0.17 0.12 0.06 0.21 -1.03 -0.24 -0.2 -0.11 -0.58 0.19 0.2 0.11 0.13 -0.16 -0.15 0.25 0.15 0.21 0.08 0.01 -0.0
-0.01 0.01 0.16 0.27 0.11 -0.4 0.13 0.4 0.1 0.15 0.15 0.04 0.31 -1.92 -0.6 -0.53 -0.37 -1.2 0.13 0.01 -0.11 -0.06 -0.18 0.23 0.41 0.03 0.22 0.59 0.27 -0.38
-0.14 -0.11 0.38 0.42 -0.25 -0.74 -0.13 0.08 0.23 0.24 0.22 0.08 0.52 -2.79 -0.44 -0.37 -0.18 -1.3 0.16 0.14 0.12 0.09 -0.06 -0.09 0.52 0.13 0.34 0.42 -0.04 -0.33
-0.1 -0.06 0.11 0.11 0.09 -0.4 0.03 0.09 0.16 0.33 0.3 0.2 0.39 -1.53 -0.45 -0.31 -0.19 -1.17 0.19 0.05 -0.02 0.04 -0.21 0.2 0.41 0.08 0.18 0.47 0.02 -0.61
-0.14 -0.11 0.13 0.07 -0.04 -0.34 0.13 0.29 0.17 0.24 0.24 0.13 0.45 -2.04 -0.36 -0.33 -0.3 -0.96 0.18 0.11 -0.03 0.05 -0.15 0.03 0.41 0.06 0.28 0.54 -0.02 -0.55
-0.05 -0.03 0.11 0.16 0.04 -0.27 0.14 0.27 0.05 0.14 0.13 0.03 0.28 -1.12 -0.38 -0.24 -0.23 -1.1 0.2 0.15 0.04 0.02 -0.22 0.13 0.36 0.08 0.25 0.39 0.03 -0.45
0.13 0.17 0.17 0.32 -0.04 -0.28 -0.23 0.0 -0.1 -0.02 -0.01 0.0 0.17 -0.64 -0.04 -0.09 0.01 -0.48 -0.08 -0.12 -0.01 -0.05 0.27 0.07 0.13 0.05 0.14 0.25 0.08 -0.19
-0.01 -0.13 0.17 0.2 0.02 -0.22 0.19 0.23 0.2 0.19 0.2 0.15 0.18 -2.44 -0.4 -0.31 -0.25 -1.62 0.13 0.09 0.0 0.09 -0.06 0.19 0.4 0.06 0.21 0.62 0.03 -0.63
-0.18 -0.19 0.1 0.27 -0.34 -0.4 0.16 0.31 0.14 0.12 0.28 0.16 0.43 -1.62 -0.13 -0.15 0.02 -1.68 0.18 0.13 -0.0 0.06 -0.12 0.17 0.41 0.12 0.22 0.38 -0.14 -0.7
Spov3_chr1.05254 (emb1473)
 -0.11 -0.03 0.18 0.21 -0.11 -0.48 0.0 0.15 0.18 0.29 0.3 0.17 0.4 -1.77 -0.48 -0.4 -0.18 -1.16 0.15 0.04 -0.01 0.04 0.04 0.17 0.46 0.07 0.19 0.51 0.02 -0.74
0.01 -0.01 0.16 0.3 -0.26 -0.19 0.06 0.22 0.08 0.06 0.13 0.09 0.34 -1.13 -0.24 -0.31 -0.21 -0.81 -0.0 0.07 -0.06 -0.02 0.15 0.12 0.26 -0.04 0.07 0.43 0.12 -0.29
-0.1 -0.07 0.12 0.17 -0.13 -0.44 -0.01 0.16 0.15 0.18 0.24 0.14 0.46 -1.95 -0.35 -0.25 -0.15 -1.16 0.18 0.14 0.03 0.08 0.03 0.14 0.45 0.1 0.22 0.39 -0.05 -0.52
-0.02 0.03 0.21 0.2 -0.05 -0.35 -0.02 0.16 0.16 0.21 0.22 0.16 0.42 -1.88 -0.48 -0.41 -0.29 -0.98 0.14 0.05 -0.03 0.03 -0.11 0.09 0.39 0.05 0.16 0.47 0.13 -0.33
-0.02 -0.03 0.2 0.24 -0.18 -0.47 -0.09 0.03 0.17 0.29 0.23 0.17 0.33 -1.5 -0.43 -0.32 -0.22 -1.04 0.12 0.09 -0.01 0.07 -0.25 0.25 0.44 0.02 0.15 0.58 0.13 -0.48
0.0 -0.05 0.2 0.31 -0.03 -0.28 0.07 0.25 0.17 0.16 0.16 0.05 0.34 -1.87 -0.34 -0.25 -0.14 -1.21 0.19 0.11 -0.03 0.0 -0.21 0.05 0.34 0.05 0.2 0.37 0.1 -0.32
0.03 -0.03 0.18 0.19 -0.06 -0.17 0.03 0.09 0.11 0.06 0.16 0.12 0.39 -0.93 -0.13 -0.13 -0.09 -0.82 -0.01 0.04 -0.05 -0.02 0.02 -0.01 0.19 0.0 0.09 0.29 0.03 -0.2
-0.05 0.02 0.07 0.03 -0.06 -0.21 -0.02 -0.04 0.05 0.09 0.11 0.11 0.37 -0.76 -0.13 -0.09 -0.06 -0.58 0.06 0.05 0.01 0.03 0.23 0.07 0.28 0.04 0.14 0.29 -0.08 -0.49
-0.14 -0.09 0.18 0.23 -0.09 -0.27 0.1 0.14 0.15 0.06 0.21 0.16 0.42 -1.98 -0.17 -0.23 -0.09 -1.56 0.19 0.13 0.03 0.16 -0.04 0.21 0.41 -0.0 0.24 0.48 -0.17 -0.84
-0.07 -0.09 0.17 0.22 -0.02 -0.34 0.02 0.21 0.1 0.12 0.17 0.1 0.41 -1.7 -0.41 -0.38 -0.24 -1.0 0.18 0.08 0.02 0.05 -0.13 0.14 0.39 0.05 0.25 0.39 0.15 -0.32
0.02 0.0 0.16 0.17 -0.07 -0.47 -0.08 0.09 0.12 0.22 0.25 0.09 0.49 -1.07 -0.34 -0.21 -0.22 -0.78 0.09 0.07 -0.07 -0.01 -0.07 -0.08 0.24 0.03 0.27 0.32 0.15 -0.22
-0.08 -0.1 0.12 0.12 -0.15 -0.27 0.12 0.12 0.15 0.16 0.2 0.07 0.25 -1.82 -0.14 -0.13 0.06 -1.37 0.22 0.15 0.09 0.08 -0.23 0.12 0.39 0.15 0.2 0.23 -0.01 -0.29
-0.04 -0.07 0.16 0.22 -0.21 -0.38 0.06 0.19 0.11 0.14 0.16 0.12 0.39 -1.33 -0.26 -0.23 -0.12 -1.22 0.12 0.13 0.0 0.11 -0.18 0.23 0.4 0.02 0.13 0.44 -0.01 -0.41
-0.04 -0.03 0.11 0.08 0.19 -0.23 0.09 0.13 0.11 0.16 0.17 0.08 0.17 -1.46 -0.43 -0.29 -0.24 -1.25 0.17 0.14 0.07 0.13 -0.11 0.28 0.48 0.12 0.22 0.37 -0.06 -0.58
0.08 0.12 0.06 -0.05 0.01 -0.16 0.25 0.07 0.04 0.02 0.15 0.13 0.41 -1.34 -0.35 -0.28 -0.35 -0.48 0.08 0.06 -0.1 0.06 -0.01 0.29 0.37 0.03 0.14 0.48 -0.14 -0.66
-0.02 -0.05 0.09 0.25 -0.19 -0.53 -0.17 -0.11 0.03 0.06 0.08 0.07 0.31 -1.34 -0.37 -0.18 -0.21 -0.55 0.06 0.14 0.06 0.07 0.31 0.15 0.45 0.22 0.35 0.34 0.03 -0.47
-0.16 -0.09 0.08 0.16 0.22 -0.3 -0.05 0.23 0.06 0.12 0.14 0.05 0.34 -1.38 -0.11 -0.2 -0.05 -0.94 0.11 0.15 0.03 -0.03 -0.15 -0.04 0.35 0.13 0.22 0.25 0.12 -0.31
0.05 0.05 0.2 0.21 0.03 -0.2 0.07 0.19 0.1 0.12 0.11 0.04 0.09 -1.26 -0.32 -0.21 -0.14 -1.17 0.12 0.03 0.06 0.05 -0.09 0.12 0.3 0.11 0.22 0.44 -0.0 -0.41
-0.11 -0.04 0.21 0.36 -0.01 -0.66 -0.1 0.19 0.09 0.25 0.16 0.01 0.6 -2.5 -0.78 -0.67 -0.52 -1.02 0.46 0.15 -0.01 0.05 -0.16 0.06 0.45 0.08 0.33 0.57 0.17 -0.44
0.23 0.28 0.23 0.46 0.02 -0.33 -0.19 -0.04 -0.13 -0.07 -0.09 -0.02 -0.16 -1.15 0.03 0.05 0.04 -0.74 -0.09 -0.41 0.06 -0.18 0.33 0.21 0.2 0.06 0.16 0.44 0.13 -0.33
Spov3_chr4.03263 (PSRP3/1)
 -0.12 -0.03 0.1 0.05 -0.03 -0.23 0.22 0.32 0.12 0.25 0.14 0.07 0.36 -1.41 -0.33 -0.18 -0.15 -1.36 0.18 0.13 -0.03 -0.0 -0.43 0.06 0.41 0.19 0.26 0.32 0.07 -0.45
Spov3_chr4.03300 (AtBBE24)
 0.05 0.01 0.09 0.19 -0.03 -0.08 0.16 0.21 -0.16 -0.15 0.0 -0.05 0.02 -0.86 -0.21 -0.14 -0.12 -0.73 0.21 0.06 0.08 0.14 -0.02 0.17 0.34 0.04 0.19 0.14 -0.02 -0.14
0.13 0.05 0.17 0.25 0.07 -0.42 -0.04 0.23 0.13 0.23 0.18 0.11 0.14 -1.8 -0.87 -0.52 -0.41 -0.95 0.13 0.04 0.02 0.01 0.09 0.33 0.47 0.07 0.19 0.57 0.1 -0.68
-0.08 -0.08 0.22 0.34 -0.43 -0.48 -0.02 0.11 0.14 0.08 0.23 0.1 0.32 -2.06 -0.16 -0.15 -0.04 -1.22 0.14 0.11 0.06 0.07 0.15 0.13 0.4 0.13 0.23 0.37 -0.06 -0.43
0.02 0.07 -0.01 0.1 -0.01 -0.1 0.18 0.28 0.01 0.14 0.1 0.07 0.4 -0.95 -0.14 -0.33 -0.26 -0.85 0.18 0.18 -0.2 0.02 0.02 0.04 0.27 0.1 0.06 0.33 -0.07 -0.45
Spov3_chr5.00047 (EMB3137)
 -0.06 0.02 0.1 0.14 0.15 -0.25 0.09 0.26 0.04 0.13 0.05 -0.03 0.29 -1.06 -0.3 -0.19 -0.14 -1.3 0.16 0.08 0.0 0.03 -0.2 0.22 0.35 0.04 0.17 0.37 0.12 -0.39
-0.27 -0.11 0.14 0.47 -0.52 -0.51 -0.32 0.22 -0.03 -0.03 0.22 0.03 0.3 -0.74 -0.04 -0.08 0.19 -0.42 -0.05 -0.07 0.01 -0.02 0.15 -0.13 0.17 0.1 0.2 0.22 0.06 0.17
-0.03 -0.04 0.29 0.56 -0.45 -0.39 -0.28 -0.0 -0.0 -0.19 0.12 0.12 0.37 -1.41 0.05 0.03 0.16 -0.63 -0.07 0.0 0.11 0.01 0.37 -0.13 0.25 0.04 0.15 0.18 -0.1 -0.2
0.0 -0.0 0.3 0.37 -0.18 -0.64 -0.21 -0.06 0.18 0.22 0.15 0.12 0.37 -2.56 -0.53 -0.41 -0.21 -1.23 0.15 0.03 0.05 0.04 -0.01 0.14 0.52 0.19 0.28 0.52 0.17 -0.35
-0.09 -0.06 0.01 0.02 -0.01 -0.33 0.14 0.22 0.06 0.07 0.16 0.03 0.45 -1.34 -0.31 -0.25 -0.12 -1.06 0.21 0.1 -0.03 0.08 -0.18 0.27 0.4 0.01 0.17 0.49 0.06 -0.48
0.24 0.11 0.22 0.34 -0.12 -0.33 -0.04 0.09 -0.01 0.06 0.02 0.04 -0.08 -0.56 -0.09 -0.19 0.03 -0.36 0.05 -0.22 -0.08 -0.08 0.16 -0.07 0.14 -0.06 0.08 0.27 0.14 -0.07
0.06 0.1 0.19 0.25 0.06 -0.44 -0.13 0.03 0.23 0.33 0.17 0.12 0.37 -1.68 -0.55 -0.43 -0.3 -1.15 0.09 0.02 -0.07 -0.03 -0.08 0.14 0.37 0.04 0.19 0.54 0.23 -0.36
-0.13 -0.11 0.1 0.13 -0.06 -0.37 0.1 0.25 0.06 0.07 0.23 0.11 0.5 -1.9 -0.27 -0.25 -0.09 -1.2 0.23 0.16 0.01 0.1 0.12 0.13 0.43 0.07 0.19 0.41 -0.15 -0.7
-0.14 -0.08 0.04 0.04 0.05 -0.34 0.1 0.21 0.2 0.22 0.22 0.14 0.34 -1.47 -0.3 -0.23 -0.14 -1.38 0.21 0.2 0.05 0.1 -0.06 0.23 0.48 0.14 0.21 0.35 -0.17 -0.97
-0.11 -0.0 0.06 0.12 -0.24 -0.25 0.14 0.2 0.07 -0.03 0.13 0.13 0.33 -0.63 -0.08 -0.21 -0.1 -0.48 -0.04 -0.01 -0.06 0.05 0.3 0.08 0.2 0.03 0.07 0.33 -0.14 -0.32
0.03 0.05 0.28 0.52 -0.3 -0.31 -0.27 -0.03 -0.1 -0.15 0.08 0.02 0.3 -1.31 -0.08 0.16 0.3 -0.52 0.01 -0.04 0.11 -0.02 -0.14 -0.05 0.2 0.19 0.21 0.13 -0.12 -0.05
-0.1 -0.06 0.19 0.24 -0.13 -0.32 0.06 0.21 0.14 0.12 0.14 0.07 0.16 -1.65 -0.32 -0.23 -0.12 -1.4 0.22 0.19 0.11 0.13 -0.23 0.19 0.43 0.14 0.25 0.35 -0.03 -0.36
-0.01 0.01 0.22 0.18 -0.26 -0.62 -0.29 -0.35 0.04 0.03 0.2 0.05 0.5 -1.35 -0.0 -0.14 -0.04 -0.62 0.18 0.11 0.16 0.22 0.08 -0.08 0.34 0.13 0.23 0.27 -0.15 -0.15
-0.03 -0.1 0.21 0.34 -0.02 -0.25 0.15 0.24 0.03 -0.03 0.1 -0.01 0.1 -2.07 -0.41 -0.24 -0.2 -1.18 0.2 0.08 0.03 0.08 0.07 0.29 0.45 0.12 0.23 0.4 0.03 -0.44

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.