Heatmap: Cluster_169 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0001.00179 (GPN3)	-0.07	-0.14	-0.14	0.11	-0.25	0.05	0.13	0.19	-0.1	-0.31	-0.12	0.01	0.4	0.76	0.12	0.14	0.21	0.02	-0.13	-0.11	-0.12	-0.23	0.41	-0.32	-0.3	-0.26	-0.09	-0.28	-0.3	0.04
Spov3_C0001.00226 (PCO5)	0.05	0.01	-0.35	-0.38	-0.0	0.08	0.0	-0.44	-0.13	-0.09	-0.15	0.1	-0.09	0.77	0.38	0.27	0.33	0.21	-0.04	-0.16	-0.04	-0.03	0.1	0.07	-0.07	-0.04	-0.12	-0.26	-0.31	-0.36
Spov3_C0004.00102 (VHA-d1)	0.01	-0.01	-0.14	-0.21	-0.01	0.08	0.18	-0.03	-0.06	-0.08	-0.07	-0.09	-0.16	0.41	0.3	0.22	0.11	-0.06	0.06	0.06	0.03	0.03	-0.12	-0.03	-0.0	0.09	0.06	-0.2	-0.29	-0.35
Spov3_C0014.00017	0.03	-0.13	-0.45	-0.27	0.1	0.3	0.07	-0.08	-0.14	-0.16	-0.24	-0.03	0.15	0.92	0.24	0.34	0.37	0.16	-0.39	-0.17	-0.21	-0.07	0.24	-0.09	-0.19	-0.06	-0.12	-0.27	-0.37	-0.37
Spov3_C0025.00051 (BGLU14)	0.23	0.31	0.15	-0.32	-0.06	-0.31	-0.13	-0.63	0.11	-0.27	-0.17	-0.01	-0.31	0.8	0.43	0.43	0.52	0.8	-0.12	-0.14	-0.06	0.16	-1.05	-0.42	-0.17	0.11	-0.03	-0.11	-0.55	-1.19
Spov3_C0026.00019 (EngA-2)	-0.14	-0.01	-0.33	-0.21	0.19	0.18	0.1	0.09	-0.18	-0.25	-0.09	-0.12	-0.11	0.92	0.3	0.21	0.28	0.17	-0.06	-0.02	0.11	-0.13	-0.07	-0.06	-0.25	-0.2	-0.14	-0.3	-0.41	-0.26
Spov3_C0036.00031	-0.17	-0.0	0.08	0.49	0.06	-0.04	-0.21	0.46	-0.14	-0.06	-0.22	-0.02	-0.18	0.14	0.04	0.31	0.22	-0.05	-0.2	-0.23	0.02	-0.11	0.14	0.09	-0.02	-0.08	0.01	-0.3	-0.25	-0.19
Spov3_chr1.00224 (RRP5)	-0.05	-0.05	-0.2	-0.42	0.14	0.06	0.08	-0.01	-0.15	-0.02	-0.06	-0.03	-0.04	0.75	0.26	0.22	0.26	-0.04	-0.03	-0.11	0.0	-0.05	-0.17	-0.09	-0.21	-0.1	-0.06	-0.05	-0.18	-0.11
Spov3_chr1.00525	0.19	0.04	-0.15	-0.17	0.03	-0.0	0.04	0.02	-0.16	-0.22	-0.09	-0.13	0.04	0.72	0.3	0.25	0.22	0.4	-0.22	-0.43	-0.12	-0.1	-0.17	-0.04	-0.26	-0.22	-0.19	-0.05	-0.05	-0.05
Spov3_chr1.02398 (AGLU1)	-0.32	-0.32	-0.42	-0.74	0.11	0.21	0.02	-0.01	-0.12	-0.33	-0.4	-0.23	-0.2	1.13	0.68	0.44	0.44	0.42	-0.22	-0.23	0.0	-0.13	0.31	-0.0	-0.19	0.04	-0.24	-0.56	-0.51	-0.38
Spov3_chr1.02896	-0.14	-0.12	-0.35	-0.49	0.05	0.18	0.05	0.2	-0.34	-0.26	-0.06	-0.04	0.23	0.66	0.38	0.24	0.27	0.15	-0.15	-0.13	-0.06	-0.02	-0.2	0.08	-0.04	0.01	-0.04	-0.11	-0.36	-0.21
Spov3_chr1.04240 (IES2C)	-0.2	-0.02	-0.41	-0.4	-0.03	-0.15	-0.12	0.12	-0.16	0.11	-0.09	0.01	0.24	0.91	0.45	0.21	0.15	0.1	-0.34	-0.22	-0.11	-0.09	0.21	0.13	-0.01	-0.04	-0.18	-0.34	-0.19	-0.35
Spov3_chr1.04244 (GB1)	-0.12	-0.07	-0.25	-0.29	0.22	0.06	-0.16	-0.17	-0.12	-0.16	-0.16	-0.13	-0.07	0.96	0.36	0.15	0.33	0.37	-0.1	0.04	0.01	-0.04	-0.23	-0.06	-0.07	-0.07	-0.14	-0.2	-0.32	-0.39
Spov3_chr1.04252 (MTV8)	-0.12	-0.23	-0.36	-0.16	0.06	0.02	0.18	0.25	-0.24	-0.06	-0.09	-0.05	0.3	0.64	0.25	0.24	0.2	0.08	-0.24	-0.11	-0.17	-0.06	0.07	-0.14	-0.11	-0.17	-0.05	-0.22	-0.11	-0.08
Spov3_chr1.04729	-0.04	-0.05	-0.16	-0.14	-0.11	-0.17	0.05	0.21	-0.17	-0.13	-0.04	-0.1	0.12	0.66	0.24	0.08	0.14	-0.0	-0.08	-0.14	-0.06	-0.03	0.2	-0.05	-0.09	-0.04	-0.02	-0.06	-0.17	-0.18
Spov3_chr1.04782 (MED2)	-0.1	-0.09	-0.27	-0.07	-0.05	0.06	-0.2	-0.03	-0.23	-0.05	-0.14	-0.13	0.05	0.78	0.21	0.35	0.37	0.2	-0.04	-0.04	0.06	0.0	-0.14	0.03	-0.04	-0.08	-0.04	-0.21	-0.35	-0.4
Spov3_chr1.04851 (ZIP2)	-0.19	-0.19	-0.24	-0.33	0.05	0.11	0.16	0.17	-0.25	-0.13	-0.03	-0.07	0.21	0.57	0.27	0.18	0.13	-0.05	-0.21	-0.03	-0.05	0.05	-0.06	-0.22	-0.12	0.02	0.08	-0.05	-0.23	0.07
Spov3_chr1.04896 (OCT1)	-0.59	-0.48	-1.23	-1.96	0.07	0.61	0.41	0.14	-0.39	-0.2	-0.37	0.27	0.2	1.39	0.6	0.68	0.47	0.27	-0.41	-0.19	-0.19	-0.2	-1.05	0.32	-0.38	0.16	-0.32	-0.58	-0.62	-0.47
Spov3_chr1.04908	-0.35	-0.13	-0.51	-0.6	0.05	0.14	0.35	0.34	-0.28	-0.1	-0.14	-0.16	-0.07	0.7	0.36	0.3	0.28	0.21	-0.14	-0.27	0.01	0.06	-0.19	0.04	-0.11	0.06	-0.02	-0.36	-0.23	-0.05
Spov3_chr2.00039 (Hop2)	-0.2	-0.27	-0.25	-0.06	-0.3	-0.26	0.19	0.56	-0.42	-0.43	-0.07	-0.13	0.68	0.81	0.23	0.07	0.21	-0.34	-0.12	-0.01	-0.14	-0.06	0.29	-0.21	-0.09	-0.19	-0.02	-0.05	-0.42	-0.01
Spov3_chr2.00550	0.02	-0.23	-0.6	-0.52	-0.35	0.09	0.33	0.3	-0.01	0.03	-0.08	0.06	0.29	0.89	0.25	0.35	0.2	0.03	-0.22	-0.03	-0.16	-0.06	-0.27	0.14	-0.01	-0.11	-0.23	-0.04	-0.46	-0.66
Spov3_chr2.00794 (PABN1)	0.11	0.08	0.11	0.17	-0.11	-0.14	-0.08	0.36	-0.06	-0.1	-0.12	-0.26	-0.05	0.18	0.17	0.16	0.1	0.05	-0.08	-0.23	0.01	0.06	-0.05	-0.04	-0.05	-0.01	0.06	-0.06	-0.17	-0.23
Spov3_chr2.00825 (AtACER)	-0.1	0.21	-0.32	-0.66	0.13	-0.17	-0.32	-0.18	-0.29	-0.06	-0.15	-0.04	0.25	1.31	0.32	0.28	0.03	0.61	-0.02	-0.39	-0.09	-0.18	0.19	-0.2	-0.52	-0.23	-0.25	-0.12	-0.43	-0.25
Spov3_chr2.01143 (ISTL2)	-0.12	0.0	-0.44	-0.23	-0.08	0.04	0.06	0.03	-0.12	-0.13	0.11	0.06	0.13	0.67	0.39	0.29	0.26	-0.15	-0.18	-0.1	-0.09	0.04	-0.06	-0.08	-0.06	0.04	-0.07	-0.16	-0.25	-0.32
Spov3_chr2.01884	-0.2	-0.01	-0.34	-0.48	0.26	0.41	0.09	-0.04	-0.42	-0.17	-0.23	-0.41	0.24	1.08	0.18	0.34	-0.07	0.44	-0.37	-0.35	-0.25	0.07	0.26	0.02	-0.09	0.04	-0.27	-0.29	-0.28	-0.47
Spov3_chr2.01974 (CPA)	0.08	0.13	-0.06	-0.04	-0.05	-0.02	-0.05	-0.18	-0.13	-0.13	-0.12	-0.12	-0.07	0.66	0.28	0.29	0.36	0.31	-0.11	-0.18	-0.09	-0.06	-0.25	-0.12	-0.19	-0.07	-0.16	-0.08	-0.18	-0.11
Spov3_chr2.02808	-0.45	-0.34	-0.49	-0.59	-0.27	0.31	0.12	0.11	-0.28	-0.36	-0.34	-0.29	-0.18	1.12	0.53	0.46	0.47	0.52	-0.16	-0.05	-0.01	-0.05	0.26	0.06	-0.35	-0.08	-0.07	-0.53	-0.69	-0.17
Spov3_chr2.02902 (DJC65)	-0.29	-0.28	-0.68	-0.84	-0.83	0.31	0.48	0.55	-0.62	-0.13	-0.11	-0.05	0.43	1.2	0.39	0.18	0.3	-0.17	-0.36	0.15	-0.13	-0.05	-0.09	0.18	0.03	-0.11	-0.25	-0.7	-0.09	-0.62
Spov3_chr2.03971 (ABCG27)	-0.28	-0.36	-0.72	-0.31	-0.6	0.35	0.11	0.34	-0.3	-0.5	-0.36	-0.55	0.47	1.78	0.84	0.89	1.02	0.25	-0.32	-0.42	-0.27	-0.15	-0.08	-0.61	-0.58	-0.82	-0.76	-0.84	-1.57	-1.18
Spov3_chr2.03989	0.17	0.0	-0.19	-0.14	-0.03	-0.04	0.09	0.1	-0.32	-0.26	-0.17	-0.22	0.08	0.78	0.18	0.13	0.11	0.06	-0.26	-0.34	-0.23	-0.13	0.15	-0.03	0.0	-0.09	-0.02	0.19	-0.04	-0.05
Spov3_chr2.04646	-0.05	-0.05	-0.4	-0.44	-0.03	0.3	0.26	0.07	-0.38	-0.38	-0.21	-0.05	0.16	0.52	0.34	0.37	0.28	0.06	-0.12	-0.08	0.02	0.04	-0.04	-0.19	-0.24	0.06	-0.05	-0.26	-0.3	0.16
Spov3_chr2.04681	-0.15	0.05	-0.25	-0.08	0.01	-0.2	-0.27	-0.06	-0.08	-0.01	-0.03	0.11	0.22	0.93	0.27	0.23	0.18	0.13	-0.38	-0.25	-0.14	-0.03	0.13	-0.06	-0.15	-0.13	-0.07	-0.36	-0.18	-0.03
Spov3_chr2.05055	-0.0	-0.15	-0.05	0.02	-0.04	0.15	0.03	0.21	-0.17	-0.25	-0.06	-0.09	0.15	0.45	0.16	0.06	0.05	0.01	-0.22	-0.18	-0.24	-0.08	0.07	-0.2	-0.15	-0.18	-0.08	0.01	-0.02	0.47
Spov3_chr3.01032	-0.15	-0.12	-0.13	-0.15	0.19	0.07	0.02	0.1	-0.25	-0.16	-0.07	-0.06	0.05	0.64	0.23	0.18	0.09	0.05	-0.13	-0.15	0.04	-0.05	-0.13	-0.14	-0.08	0.02	-0.07	-0.11	-0.12	0.06
Spov3_chr3.03208 (ARL8a)	0.17	0.01	0.13	0.36	-0.39	-0.02	-0.1	0.16	-0.06	-0.2	-0.03	-0.24	-0.09	0.46	0.4	0.32	0.3	0.58	-0.09	-0.14	-0.07	-0.15	-0.51	-0.14	-0.05	-0.06	-0.03	-0.3	-0.5	-0.52
Spov3_chr3.03503 (REM4.2)	-0.56	-0.08	-0.89	-1.09	-0.26	0.48	0.17	0.24	-0.57	-0.46	-0.41	-0.19	-0.06	1.44	0.41	0.23	0.25	0.27	0.09	0.0	-0.13	0.02	0.28	0.18	-0.52	0.07	-0.38	-0.36	-0.36	-0.29
Spov3_chr3.04722 (ACYB-2)	0.03	0.04	-0.39	-0.4	-0.24	0.02	0.2	0.16	-0.18	-0.05	-0.23	-0.13	0.31	0.96	0.1	0.11	-0.02	0.36	-0.14	-0.12	-0.13	-0.25	-0.19	-0.07	-0.2	-0.06	-0.06	-0.14	0.02	-0.05
Spov3_chr4.01287	-0.15	-0.05	-0.26	-0.26	-0.17	0.12	0.04	0.24	-0.01	-0.03	0.12	0.09	0.01	0.68	0.36	0.22	0.41	-0.35	-0.22	-0.2	-0.23	-0.14	-0.21	-0.06	-0.06	0.02	0.04	-0.21	-0.12	-0.17
Spov3_chr4.01844 (DiT1)	-0.5	-0.35	-0.64	-0.52	0.21	0.23	-0.02	0.32	-0.63	-0.46	-1.32	-0.74	0.42	1.54	0.72	0.51	0.49	0.27	-0.34	-0.43	0.02	-0.42	0.11	-0.29	-0.35	-0.12	0.0	-0.41	-0.21	-0.31
Spov3_chr4.02897 (TBP3)	-0.15	-0.01	-0.28	-0.3	0.08	0.23	0.2	0.23	-0.25	-0.25	-0.17	-0.14	0.06	0.47	0.24	0.2	0.1	0.02	-0.04	-0.09	0.07	0.01	-0.06	0.11	-0.01	0.0	0.05	-0.27	-0.16	-0.27
Spov3_chr4.02928	0.2	0.17	0.17	0.2	0.36	0.01	-0.3	-0.62	-0.15	-0.26	-0.12	-0.1	-0.22	0.01	0.3	0.21	0.19	0.56	-0.19	-0.19	0.06	-0.07	-0.28	0.04	-0.02	-0.0	-0.11	-0.34	-0.25	0.13
Spov3_chr4.03209 (WLIM2a)	-0.4	-0.1	-0.43	-0.4	0.37	0.21	0.04	0.18	-0.27	-0.2	-0.21	-0.24	0.18	1.01	0.47	0.5	0.54	-0.18	-0.21	-0.26	-0.04	-0.13	-0.12	-0.13	-0.24	-0.06	-0.09	-0.33	-0.53	-0.25
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Spov3_chr4.04025	-0.04	-0.04	-0.25	-0.24	0.03	0.15	0.1	-0.13	-0.25	-0.23	-0.09	-0.08	0.03	0.59	0.29	0.33	0.31	0.12	-0.08	-0.08	0.0	0.01	0.09	-0.0	-0.08	-0.02	-0.08	-0.2	-0.37	-0.26
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Spov3_chr5.00300	0.25	0.18	0.22	-0.23	0.26	0.09	0.13	-0.52	0.04	-0.41	0.05	-0.12	-0.46	0.34	0.49	0.41	0.4	0.69	0.01	0.34	0.22	0.3	-1.72	-0.4	-0.33	-0.33	-0.1	-0.74	-0.68	-0.45
Spov3_chr5.00450 (ACR3)	0.3	-0.09	-0.28	0.03	-0.37	-0.0	0.09	0.4	-0.24	-0.53	-0.17	-0.14	-0.02	1.27	0.34	0.17	0.1	-0.12	-0.41	-0.37	-0.49	-0.24	0.46	0.4	-0.1	-0.35	-0.43	-0.06	-0.08	-0.84
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Spov3_chr5.00990	-0.12	-0.13	-0.22	-0.26	0.27	0.06	-0.04	-0.08	-0.22	-0.12	-0.0	0.03	0.05	0.84	0.22	0.2	0.28	-0.04	-0.13	-0.13	0.0	-0.03	-0.55	0.06	-0.05	0.08	0.0	-0.14	-0.16	-0.27
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Spov3_chr5.03427 (PECT1)	0.01	-0.18	-0.14	0.18	-0.33	-0.12	0.07	0.54	-0.2	-0.27	-0.16	-0.11	0.33	0.73	0.41	0.17	0.14	-0.15	-0.35	-0.16	-0.37	-0.2	0.38	-0.23	-0.33	-0.38	-0.26	-0.23	0.01	0.29
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Spov3_chr6.02526 (PK5)	0.05	-0.05	-0.24	-0.25	-0.08	-0.04	0.12	-0.06	-0.12	0.03	-0.05	-0.12	0.25	0.78	0.27	0.2	0.23	0.17	-0.24	-0.18	-0.15	-0.09	-0.39	-0.09	-0.09	-0.05	-0.03	-0.04	-0.11	-0.19
Spov3_chr6.02996 (HB25)	-0.28	-0.24	-0.38	-0.52	-0.1	0.1	-0.16	0.17	-0.33	-0.19	-0.01	0.12	0.37	0.8	0.4	0.21	0.35	-0.01	-0.29	-0.1	-0.03	0.1	-0.17	0.14	0.06	-0.01	-0.02	-0.16	-0.45	-0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.