Heatmap: Cluster_169 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0001.00179 (GPN3)	0.56	0.54	0.53	0.64	0.5	0.61	0.65	0.68	0.55	0.48	0.54	0.6	0.78	1.0	0.64	0.65	0.69	0.6	0.54	0.55	0.54	0.5	0.79	0.47	0.48	0.49	0.55	0.49	0.48	0.61
Spov3_C0001.00226 (PCO5)	0.61	0.59	0.46	0.45	0.58	0.62	0.59	0.43	0.53	0.55	0.53	0.63	0.55	1.0	0.76	0.71	0.74	0.68	0.57	0.52	0.57	0.57	0.63	0.62	0.56	0.57	0.54	0.49	0.47	0.46
Spov3_C0004.00102 (VHA-d1)	0.76	0.75	0.68	0.65	0.75	0.79	0.85	0.73	0.72	0.71	0.72	0.71	0.67	1.0	0.93	0.88	0.81	0.72	0.78	0.78	0.77	0.77	0.69	0.74	0.75	0.8	0.78	0.66	0.61	0.59
Spov3_C0014.00017	0.54	0.48	0.39	0.44	0.57	0.65	0.55	0.5	0.48	0.47	0.45	0.52	0.59	1.0	0.62	0.67	0.68	0.59	0.4	0.47	0.45	0.5	0.63	0.5	0.46	0.51	0.49	0.44	0.41	0.41
Spov3_C0025.00051 (BGLU14)	0.67	0.71	0.64	0.46	0.55	0.46	0.52	0.37	0.62	0.47	0.51	0.57	0.46	1.0	0.77	0.77	0.82	1.0	0.53	0.52	0.55	0.64	0.28	0.43	0.51	0.62	0.56	0.53	0.39	0.25
Spov3_C0026.00019 (EngA-2)	0.48	0.52	0.42	0.46	0.6	0.6	0.57	0.56	0.47	0.44	0.49	0.48	0.49	1.0	0.65	0.61	0.64	0.59	0.5	0.52	0.57	0.48	0.5	0.51	0.44	0.46	0.48	0.43	0.4	0.44
Spov3_C0036.00031	0.64	0.71	0.75	1.0	0.74	0.7	0.62	0.98	0.65	0.68	0.61	0.7	0.63	0.79	0.73	0.88	0.83	0.69	0.62	0.61	0.73	0.66	0.78	0.76	0.7	0.67	0.72	0.58	0.6	0.63
Spov3_chr1.00224 (RRP5)	0.58	0.58	0.52	0.44	0.66	0.62	0.63	0.59	0.54	0.59	0.57	0.58	0.58	1.0	0.71	0.69	0.71	0.58	0.58	0.55	0.6	0.57	0.53	0.56	0.52	0.55	0.57	0.58	0.52	0.55
Spov3_chr1.00525	0.69	0.62	0.55	0.54	0.62	0.61	0.62	0.62	0.54	0.52	0.57	0.56	0.62	1.0	0.75	0.72	0.71	0.8	0.52	0.45	0.56	0.57	0.54	0.59	0.51	0.52	0.53	0.59	0.59	0.58
Spov3_chr1.02398 (AGLU1)	0.37	0.37	0.34	0.27	0.5	0.53	0.46	0.46	0.42	0.37	0.35	0.39	0.4	1.0	0.73	0.62	0.62	0.61	0.39	0.39	0.46	0.42	0.57	0.46	0.4	0.47	0.39	0.31	0.32	0.35
Spov3_chr1.02896	0.57	0.58	0.5	0.45	0.65	0.72	0.65	0.72	0.5	0.53	0.6	0.61	0.74	1.0	0.82	0.75	0.76	0.7	0.57	0.58	0.61	0.62	0.55	0.67	0.61	0.63	0.62	0.59	0.49	0.54
Spov3_chr1.04240 (IES2C)	0.46	0.52	0.4	0.4	0.52	0.48	0.49	0.58	0.48	0.57	0.5	0.53	0.63	1.0	0.72	0.62	0.59	0.57	0.42	0.46	0.49	0.5	0.62	0.58	0.53	0.52	0.47	0.42	0.47	0.42
Spov3_chr1.04244 (GB1)	0.47	0.49	0.43	0.42	0.6	0.54	0.46	0.46	0.47	0.46	0.46	0.47	0.49	1.0	0.66	0.57	0.65	0.66	0.48	0.53	0.52	0.5	0.44	0.49	0.49	0.49	0.47	0.45	0.41	0.39
Spov3_chr1.04252 (MTV8)	0.59	0.55	0.5	0.58	0.67	0.65	0.73	0.77	0.55	0.62	0.6	0.62	0.79	1.0	0.76	0.76	0.74	0.68	0.55	0.6	0.57	0.62	0.67	0.58	0.6	0.57	0.62	0.55	0.6	0.61
Spov3_chr1.04729	0.61	0.61	0.57	0.57	0.58	0.56	0.65	0.73	0.56	0.57	0.61	0.59	0.69	1.0	0.74	0.67	0.7	0.63	0.6	0.57	0.61	0.62	0.72	0.61	0.59	0.61	0.62	0.61	0.56	0.56
Spov3_chr1.04782 (MED2)	0.54	0.55	0.48	0.55	0.56	0.61	0.51	0.57	0.5	0.56	0.53	0.53	0.6	1.0	0.67	0.74	0.75	0.67	0.56	0.56	0.6	0.58	0.53	0.59	0.56	0.55	0.57	0.5	0.46	0.44
Spov3_chr1.04851 (ZIP2)	0.59	0.59	0.57	0.54	0.7	0.73	0.76	0.76	0.57	0.62	0.66	0.64	0.78	1.0	0.81	0.77	0.74	0.65	0.58	0.66	0.65	0.7	0.65	0.58	0.62	0.68	0.72	0.65	0.58	0.71
Spov3_chr1.04896 (OCT1)	0.25	0.27	0.16	0.1	0.4	0.58	0.51	0.42	0.29	0.33	0.3	0.46	0.44	1.0	0.58	0.61	0.53	0.46	0.29	0.33	0.33	0.33	0.18	0.48	0.29	0.43	0.31	0.25	0.25	0.28
Spov3_chr1.04908	0.48	0.56	0.43	0.41	0.64	0.67	0.78	0.78	0.51	0.57	0.56	0.55	0.59	1.0	0.79	0.76	0.75	0.71	0.56	0.51	0.62	0.64	0.54	0.63	0.57	0.64	0.6	0.48	0.52	0.59
Spov3_chr2.00039 (Hop2)	0.5	0.47	0.48	0.55	0.46	0.48	0.65	0.84	0.43	0.42	0.54	0.52	0.91	1.0	0.67	0.6	0.66	0.45	0.52	0.57	0.52	0.55	0.7	0.49	0.54	0.5	0.56	0.55	0.43	0.57
Spov3_chr2.00550	0.55	0.46	0.36	0.38	0.42	0.58	0.68	0.67	0.54	0.55	0.51	0.56	0.66	1.0	0.64	0.69	0.62	0.55	0.46	0.53	0.48	0.52	0.45	0.6	0.53	0.5	0.46	0.52	0.39	0.34
Spov3_chr2.00794 (PABN1)	0.84	0.83	0.84	0.88	0.72	0.71	0.74	1.0	0.75	0.73	0.72	0.65	0.75	0.88	0.88	0.87	0.83	0.81	0.74	0.67	0.79	0.81	0.75	0.76	0.75	0.78	0.82	0.75	0.69	0.67
Spov3_chr2.00825 (AtACER)	0.38	0.47	0.32	0.26	0.44	0.36	0.32	0.36	0.33	0.39	0.36	0.39	0.48	1.0	0.51	0.49	0.41	0.62	0.4	0.31	0.38	0.36	0.46	0.35	0.28	0.35	0.34	0.37	0.3	0.34
Spov3_chr2.01143 (ISTL2)	0.58	0.63	0.46	0.53	0.59	0.65	0.65	0.64	0.58	0.57	0.68	0.65	0.69	1.0	0.82	0.77	0.75	0.57	0.55	0.59	0.59	0.65	0.6	0.59	0.6	0.65	0.6	0.56	0.53	0.5
Spov3_chr2.01884	0.41	0.47	0.37	0.34	0.57	0.63	0.5	0.46	0.35	0.42	0.4	0.36	0.56	1.0	0.54	0.6	0.45	0.64	0.37	0.37	0.4	0.5	0.57	0.48	0.44	0.49	0.39	0.39	0.39	0.34
Spov3_chr2.01974 (CPA)	0.67	0.69	0.61	0.61	0.61	0.62	0.61	0.56	0.58	0.58	0.58	0.58	0.6	1.0	0.77	0.77	0.81	0.78	0.59	0.56	0.59	0.61	0.53	0.58	0.55	0.6	0.57	0.6	0.56	0.59
Spov3_chr2.02808	0.34	0.36	0.33	0.3	0.38	0.57	0.5	0.5	0.38	0.36	0.36	0.38	0.41	1.0	0.66	0.63	0.64	0.66	0.41	0.44	0.46	0.44	0.55	0.48	0.36	0.44	0.44	0.32	0.28	0.41
Spov3_chr2.02902 (DJC65)	0.36	0.36	0.27	0.24	0.25	0.54	0.6	0.64	0.28	0.4	0.4	0.42	0.59	1.0	0.57	0.49	0.54	0.39	0.34	0.48	0.4	0.42	0.41	0.49	0.44	0.4	0.37	0.27	0.41	0.28
Spov3_chr2.03971 (ABCG27)	0.24	0.23	0.18	0.23	0.19	0.37	0.31	0.37	0.24	0.21	0.23	0.2	0.4	1.0	0.52	0.54	0.59	0.35	0.23	0.22	0.24	0.26	0.27	0.19	0.19	0.16	0.17	0.16	0.1	0.13
Spov3_chr2.03989	0.66	0.58	0.51	0.53	0.57	0.57	0.62	0.63	0.47	0.49	0.52	0.5	0.62	1.0	0.66	0.64	0.63	0.61	0.49	0.46	0.5	0.53	0.65	0.57	0.59	0.55	0.58	0.67	0.57	0.56
Spov3_chr2.04646	0.67	0.68	0.53	0.52	0.68	0.86	0.84	0.74	0.54	0.54	0.6	0.68	0.78	1.0	0.88	0.91	0.85	0.73	0.64	0.66	0.71	0.72	0.68	0.61	0.59	0.73	0.67	0.58	0.57	0.78
Spov3_chr2.04681	0.47	0.54	0.44	0.5	0.53	0.46	0.44	0.5	0.5	0.52	0.52	0.57	0.61	1.0	0.63	0.62	0.6	0.57	0.4	0.44	0.48	0.51	0.57	0.5	0.47	0.48	0.5	0.41	0.46	0.51
Spov3_chr2.05055	0.72	0.65	0.7	0.73	0.71	0.8	0.74	0.84	0.64	0.61	0.69	0.68	0.8	0.99	0.81	0.76	0.75	0.73	0.62	0.64	0.61	0.69	0.76	0.63	0.65	0.64	0.69	0.73	0.71	1.0
Spov3_chr3.01032	0.58	0.59	0.58	0.58	0.73	0.67	0.65	0.69	0.54	0.57	0.61	0.61	0.66	1.0	0.75	0.72	0.68	0.66	0.59	0.58	0.66	0.62	0.59	0.58	0.6	0.65	0.61	0.59	0.59	0.67
Spov3_chr3.03208 (ARL8a)	0.75	0.67	0.73	0.86	0.51	0.66	0.62	0.75	0.64	0.58	0.65	0.56	0.63	0.92	0.88	0.84	0.82	1.0	0.63	0.61	0.63	0.6	0.47	0.61	0.65	0.64	0.65	0.54	0.47	0.46
Spov3_chr3.03503 (REM4.2)	0.25	0.35	0.2	0.17	0.31	0.51	0.41	0.43	0.25	0.27	0.28	0.32	0.35	1.0	0.49	0.43	0.44	0.44	0.39	0.37	0.34	0.37	0.45	0.42	0.26	0.39	0.28	0.29	0.29	0.3
Spov3_chr3.04722 (ACYB-2)	0.53	0.53	0.39	0.39	0.44	0.52	0.59	0.57	0.46	0.5	0.44	0.47	0.64	1.0	0.55	0.56	0.51	0.66	0.47	0.48	0.47	0.43	0.45	0.49	0.45	0.5	0.49	0.47	0.52	0.5
Spov3_chr4.01287	0.56	0.6	0.52	0.52	0.56	0.68	0.64	0.74	0.62	0.61	0.68	0.67	0.63	1.0	0.8	0.73	0.83	0.49	0.54	0.54	0.53	0.57	0.54	0.6	0.6	0.63	0.65	0.54	0.58	0.56
Spov3_chr4.01844 (DiT1)	0.24	0.27	0.22	0.24	0.4	0.4	0.34	0.43	0.22	0.25	0.14	0.21	0.46	1.0	0.57	0.49	0.49	0.42	0.27	0.26	0.35	0.26	0.37	0.28	0.27	0.32	0.35	0.26	0.3	0.28
Spov3_chr4.02897 (TBP3)	0.65	0.72	0.59	0.59	0.77	0.85	0.83	0.85	0.61	0.61	0.64	0.66	0.75	1.0	0.86	0.83	0.78	0.73	0.71	0.68	0.76	0.73	0.7	0.78	0.72	0.73	0.75	0.6	0.65	0.6
Spov3_chr4.02928	0.78	0.76	0.76	0.78	0.87	0.68	0.55	0.44	0.61	0.57	0.62	0.63	0.58	0.68	0.83	0.79	0.77	1.0	0.59	0.59	0.71	0.65	0.56	0.7	0.67	0.68	0.63	0.54	0.57	0.74
Spov3_chr4.03209 (WLIM2a)	0.38	0.46	0.37	0.38	0.64	0.57	0.51	0.56	0.41	0.43	0.43	0.42	0.56	1.0	0.69	0.7	0.72	0.44	0.43	0.42	0.48	0.45	0.46	0.45	0.42	0.48	0.47	0.4	0.34	0.42
Spov3_chr4.03917 (ADCL)	0.16	0.3	0.16	0.11	0.3	0.25	0.2	0.16	0.2	0.26	0.21	0.24	0.3	1.0	0.33	0.3	0.34	0.48	0.16	0.2	0.32	0.27	0.32	0.21	0.19	0.28	0.2	0.27	0.14	0.14
Spov3_chr4.04018 (UBC2)	0.68	0.67	0.57	0.54	0.62	0.64	0.55	0.46	0.54	0.54	0.57	0.56	0.64	1.0	0.79	0.68	0.66	0.7	0.56	0.54	0.57	0.56	0.65	0.61	0.52	0.58	0.55	0.52	0.54	0.51
Spov3_chr4.04025	0.65	0.65	0.56	0.56	0.68	0.74	0.71	0.61	0.56	0.57	0.62	0.63	0.68	1.0	0.81	0.84	0.83	0.72	0.63	0.63	0.67	0.67	0.71	0.66	0.63	0.66	0.63	0.58	0.51	0.56
Spov3_chr4.04494	0.57	0.66	0.64	0.75	0.63	0.55	0.55	1.0	0.54	0.53	0.53	0.52	0.59	0.65	0.68	0.69	0.74	0.66	0.61	0.56	0.76	0.61	0.51	0.52	0.52	0.57	0.66	0.54	0.53	0.57
Spov3_chr4.04501 (ERD2B)	0.52	0.48	0.47	0.45	0.54	0.49	0.56	0.69	0.48	0.5	0.56	0.54	0.72	1.0	0.73	0.65	0.71	0.7	0.54	0.55	0.56	0.55	0.75	0.58	0.62	0.56	0.59	0.45	0.47	0.54
Spov3_chr5.00300	0.74	0.7	0.72	0.53	0.74	0.66	0.68	0.43	0.63	0.47	0.64	0.57	0.45	0.78	0.87	0.82	0.82	1.0	0.62	0.78	0.72	0.76	0.19	0.47	0.49	0.49	0.58	0.37	0.39	0.45
Spov3_chr5.00450 (ACR3)	0.51	0.39	0.34	0.42	0.32	0.41	0.44	0.55	0.35	0.29	0.37	0.38	0.41	1.0	0.52	0.46	0.45	0.38	0.31	0.32	0.29	0.35	0.57	0.55	0.39	0.33	0.31	0.4	0.39	0.23
Spov3_chr5.00578 (FYPP1)	0.67	0.64	0.63	0.71	0.7	0.78	0.83	0.86	0.61	0.6	0.66	0.65	0.8	1.0	0.84	0.84	0.85	0.66	0.67	0.71	0.69	0.7	0.77	0.63	0.69	0.69	0.73	0.68	0.59	0.59
Spov3_chr5.00990	0.51	0.51	0.48	0.47	0.67	0.58	0.54	0.53	0.48	0.51	0.56	0.57	0.58	1.0	0.65	0.64	0.68	0.54	0.51	0.51	0.56	0.55	0.38	0.58	0.54	0.59	0.56	0.51	0.5	0.46
Spov3_chr5.01033 (EMB3127)	0.69	0.62	0.67	0.71	0.71	0.79	0.54	0.68	0.51	0.56	0.57	0.57	0.72	1.0	0.76	0.77	0.79	0.82	0.52	0.58	0.53	0.54	0.85	0.53	0.56	0.62	0.6	0.69	0.74	1.0
Spov3_chr5.01315 (CPY)	0.44	0.46	0.44	0.36	0.64	0.62	0.64	0.59	0.48	0.49	0.53	0.52	0.54	1.0	0.69	0.59	0.62	0.48	0.52	0.52	0.55	0.52	0.53	0.49	0.51	0.58	0.6	0.5	0.47	0.55
Spov3_chr5.01872 (CKB3)	0.63	0.69	0.64	0.67	0.76	0.76	0.74	0.84	0.68	0.73	0.73	0.68	0.73	1.0	0.84	0.85	0.77	0.72	0.68	0.66	0.7	0.66	0.74	0.76	0.73	0.74	0.76	0.66	0.59	0.59
Spov3_chr5.02506 (FATB)	0.52	0.49	0.54	0.62	0.58	0.77	0.61	0.63	0.56	0.55	0.59	0.56	0.71	1.0	0.78	0.71	0.76	0.5	0.46	0.52	0.5	0.47	0.81	0.45	0.48	0.49	0.5	0.54	0.43	0.47
Spov3_chr5.02701	0.56	0.51	0.44	0.37	0.6	0.73	0.68	0.73	0.48	0.53	0.51	0.61	0.59	1.0	0.76	0.7	0.7	0.67	0.59	0.59	0.56	0.49	0.48	0.62	0.57	0.6	0.54	0.56	0.56	0.5
Spov3_chr5.03427 (PECT1)	0.61	0.53	0.55	0.68	0.48	0.56	0.63	0.88	0.53	0.5	0.54	0.56	0.76	1.0	0.8	0.68	0.67	0.54	0.47	0.54	0.47	0.52	0.78	0.51	0.48	0.46	0.51	0.51	0.61	0.74
Spov3_chr6.00268 (PUX1)	0.72	0.6	0.64	0.6	0.57	0.57	0.67	0.81	0.62	0.65	0.6	0.59	0.84	1.0	0.72	0.67	0.7	0.58	0.69	0.68	0.72	0.59	0.64	0.62	0.61	0.57	0.66	0.64	0.58	0.63
Spov3_chr6.00552 (ATN1)	0.66	0.66	0.5	0.44	0.59	0.62	0.5	0.43	0.52	0.49	0.48	0.46	0.49	1.0	0.68	0.7	0.72	0.67	0.48	0.47	0.57	0.51	0.41	0.5	0.48	0.52	0.46	0.57	0.5	0.48
Spov3_chr6.00647 (BOR2)	0.73	0.61	0.57	0.69	0.55	0.59	0.53	0.5	0.6	0.54	0.62	0.54	0.59	1.0	0.84	0.74	0.89	0.78	0.58	0.55	0.54	0.52	0.43	0.52	0.6	0.53	0.58	0.43	0.39	0.58
Spov3_chr6.00982 (DDL)	0.64	0.67	0.52	0.52	0.63	0.67	0.56	0.6	0.46	0.42	0.53	0.51	0.61	1.0	0.7	0.76	0.63	0.67	0.43	0.44	0.63	0.5	0.47	0.5	0.53	0.51	0.53	0.55	0.51	0.61
Spov3_chr6.01257 (UBC27)	0.57	0.54	0.5	0.42	0.64	0.56	0.54	0.58	0.5	0.55	0.58	0.58	0.63	1.0	0.72	0.69	0.66	0.62	0.53	0.55	0.53	0.55	0.56	0.54	0.51	0.54	0.55	0.55	0.51	0.5
Spov3_chr6.01332 (CRL)	0.55	0.59	0.53	0.5	0.57	0.66	0.75	0.8	0.61	0.57	0.62	0.65	0.65	1.0	0.77	0.74	0.73	0.63	0.58	0.58	0.59	0.63	0.59	0.68	0.63	0.62	0.63	0.58	0.59	0.57
Spov3_chr6.01961	0.29	0.36	0.25	0.28	0.46	0.36	0.32	0.31	0.33	0.39	0.38	0.4	0.4	1.0	0.54	0.46	0.53	0.56	0.35	0.33	0.42	0.35	0.4	0.33	0.3	0.42	0.41	0.28	0.23	0.28
Spov3_chr6.02280 (DRM2)	0.78	0.74	0.64	0.6	0.72	0.73	0.68	0.67	0.59	0.61	0.62	0.58	0.7	1.0	0.85	0.78	0.77	0.73	0.56	0.61	0.64	0.62	0.67	0.66	0.63	0.67	0.63	0.68	0.62	0.61
Spov3_chr6.02526 (PK5)	0.6	0.56	0.49	0.49	0.55	0.57	0.63	0.56	0.54	0.59	0.56	0.54	0.69	1.0	0.7	0.67	0.68	0.65	0.49	0.51	0.53	0.55	0.45	0.55	0.54	0.56	0.57	0.57	0.54	0.51
Spov3_chr6.02996 (HB25)	0.47	0.49	0.44	0.4	0.53	0.62	0.52	0.65	0.46	0.5	0.57	0.62	0.74	1.0	0.76	0.66	0.73	0.57	0.47	0.54	0.56	0.61	0.51	0.63	0.6	0.57	0.57	0.51	0.42	0.51

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)