1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_92 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
- - - - - - - - - 1.74 - - 1.8 - - - 1.89 - - - - - - - 3.18 - - - 1.91 2.73
- - - - - - 3.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.01 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.81 - - - - - - 4.0 - - - - -
- - - - 2.4 - - 2.18 - - - - - - 0.42 - 0.66 1.93 - - - - -0.45 - 3.14 - - - 0.46 1.34
- - - 2.57 - - - - - - - - - - 2.45 - - - - - - - 2.71 - 3.59 - - - - -
- - - - - 3.81 - - - - - - - - - - - 4.0 - - - - - - - - - - - -
- -1.64 0.11 0.29 -1.27 0.39 0.47 -0.35 1.38 0.32 -0.82 0.25 -0.37 -1.98 - -1.07 -2.17 0.94 0.19 0.58 -0.57 -0.67 0.31 -0.47 1.88 -0.73 0.78 -0.39 -0.12 -0.61
- - - - 2.19 - - - - - - - 2.29 - - - - - 1.36 - - - - - 4.02 - 0.87 - - -
- - - 3.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.29 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
- - - 2.77 - - 0.82 - - - - - 2.01 0.9 - - - 0.8 - - - - 1.85 - 3.35 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
- - - - - - - - 2.3 - - - - - - - - - - - - - - - 4.38 2.08 - - - -
-14.9 - - - - 2.18 - - 2.46 - -0.59 - - - -14.53 1.63 1.75 3.68 - - - - - - -29.06 - - - - -24.45
- - - - - - - - - - 3.4 - - - - - - - - - - - - - 4.28 - - - - -
- - - - - 2.2 0.16 - - - - - 1.4 - - - - - -0.68 0.31 0.75 - 2.08 - 3.79 - - - - -
Spov3_chr1.05119 (ROPGEF3)
 - - - - - 3.88 - - - - - - - - - - - 3.93 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
- - 3.26 - - 2.63 - - - - - - - - - - - 3.83 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
- - 2.44 1.1 0.91 - - - - - - - - - - - - 3.37 - - - - - - 2.57 - - - 2.09 -
- - -1.33 1.71 - - - - - 0.61 - - - - - - - - - 1.91 0.87 - 3.51 - 2.97 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
- - - - - - - - 2.98 - - - - - - - 2.69 - - - - 2.5 - 2.41 - - 2.23 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
- - - - 2.32 - - - - - - 0.22 - - - - - 3.85 - - - - - - 3.23 - - - - -
0.4 1.39 -1.33 -0.54 -2.0 -4.51 -1.49 -1.85 -0.44 0.58 -3.4 -0.13 -0.76 -3.16 - 1.5 -0.79 2.29 -2.06 -0.3 1.16 -5.05 - -0.33 1.98 -0.75 -2.72 -10.21 1.11 -0.24
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
- - 2.79 - - - 2.53 - 0.96 - - - - - - - - 3.37 - 0.83 - 1.71 - - - - - - - -
0.25 0.55 0.47 -1.27 -2.21 -0.88 -2.36 -2.14 0.42 0.0 -1.96 -2.19 -0.93 0.52 -1.23 -0.98 0.48 0.82 -1.04 0.52 1.18 1.27 -0.07 0.9 0.73 0.19 -0.81 -1.07 -0.3 0.5
3.02 - - 2.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.88 2.76 - - - -
0.0 -0.03 0.07 -27.59 0.51 -0.4 -1.02 - 0.58 0.12 - - 0.18 1.22 - 0.15 - 1.48 0.49 0.62 - - 1.68 - 2.23 - -3.64 -2.63 1.19 -0.01
- - - 0.61 - -0.67 1.25 - -0.19 - 0.72 - - - - - - 2.16 - - - 1.84 - 1.05 2.88 2.26 - - - -0.59
- - - - - - - - -15.91 - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
1.3 - 0.04 - - 0.98 - 1.16 0.42 - 0.35 0.05 - 1.76 - - 1.29 - - - - 2.1 - - 2.19 1.64 -0.18 - - -
-0.3 -1.34 - -0.67 - 1.6 - 0.78 -0.47 0.91 0.33 0.08 -0.41 -0.42 -1.57 - -1.3 2.3 - -0.55 1.4 -0.08 -1.28 -1.52 1.73 -1.69 -1.6 - -0.28 0.6
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
Spov3_chr4.04165 (UMAMIT41)
 - - - - - - - - - - - - 2.5 2.34 - - - 2.16 - - - - - - 3.35 - - - - 2.21
-1.01 0.76 - -1.36 - -0.27 -1.37 -1.01 1.07 0.52 - -0.25 -1.17 0.42 -1.31 - 0.92 -0.68 -0.47 - - 1.66 -1.04 1.1 2.17 0.76 1.0 -1.05 - 0.51
-0.16 - 0.8 -0.18 - 0.57 - 2.08 - 1.31 - 0.65 - - 0.57 0.79 0.79 0.5 - - -0.31 - - - 2.05 -0.25 -0.46 - -0.18 1.57
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
- - - - - 3.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.18 - - - - -
- - - - 1.26 - -0.34 - 2.16 - - - 2.43 2.85 - - 0.38 - - - 0.86 - 0.82 - 2.28 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
0.19 - - - 0.14 - 1.59 - - - - - 0.26 - - - 1.13 2.55 - - - - - - 3.4 -0.1 - - - 1.98
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.99 - 4.46 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - -
- 0.31 - 0.08 -0.63 - -0.65 - - 0.34 -0.49 -0.75 - - - - -0.5 3.28 0.42 - -0.68 -0.73 -0.57 - 2.89 - 0.64 -0.76 - -0.74

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.