1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_92 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.73
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.18 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.29
0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 0.29 0.33 0.11 0.36 0.38 0.21 0.71 0.34 0.15 0.32 0.21 0.07 0.0 0.13 0.06 0.52 0.31 0.4 0.18 0.17 0.34 0.2 1.0 0.16 0.46 0.21 0.25 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.18 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.43 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.26 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.12 0.0 0.31 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spov3_chr1.05119 (ROPGEF3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.52 0.21 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0
0.0 0.0 0.03 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.16 0.0 1.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.68 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.54 0.08 0.14 0.05 0.01 0.07 0.06 0.15 0.31 0.02 0.19 0.12 0.02 0.0 0.58 0.12 1.0 0.05 0.17 0.46 0.01 0.0 0.16 0.81 0.12 0.03 0.0 0.44 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.17 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.49 0.61 0.57 0.17 0.09 0.23 0.08 0.09 0.55 0.42 0.11 0.09 0.22 0.59 0.18 0.21 0.58 0.73 0.2 0.6 0.94 1.0 0.4 0.77 0.69 0.47 0.24 0.2 0.34 0.59
1.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.21 0.22 0.0 0.3 0.16 0.11 0.0 0.32 0.23 0.0 0.0 0.24 0.5 0.0 0.24 0.0 0.59 0.3 0.33 0.0 0.0 0.69 0.0 1.0 0.0 0.02 0.03 0.49 0.21
0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.09 0.32 0.0 0.12 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.28 1.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.54 0.0 0.23 0.0 0.0 0.43 0.0 0.49 0.29 0.0 0.28 0.23 0.0 0.74 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 1.0 0.69 0.19 0.0 0.0 0.0
0.16 0.08 0.0 0.13 0.0 0.61 0.0 0.35 0.15 0.38 0.26 0.21 0.15 0.15 0.07 0.0 0.08 1.0 0.0 0.14 0.53 0.19 0.08 0.07 0.67 0.06 0.07 0.0 0.17 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spov3_chr4.04165 (UMAMIT41)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.5 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45
0.11 0.38 0.0 0.09 0.0 0.18 0.09 0.11 0.46 0.32 0.0 0.19 0.1 0.3 0.09 0.0 0.42 0.14 0.16 0.0 0.0 0.7 0.11 0.47 1.0 0.38 0.45 0.11 0.0 0.32
0.21 0.0 0.41 0.21 0.0 0.35 0.0 1.0 0.0 0.58 0.0 0.37 0.0 0.0 0.35 0.41 0.41 0.33 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.98 0.2 0.17 0.0 0.21 0.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.11 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.75 1.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.25 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.21 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.13 0.0 0.11 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.13 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 1.0 0.14 0.0 0.06 0.06 0.07 0.0 0.76 0.0 0.16 0.06 0.0 0.06

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)