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Heatmap: Cluster_61 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.1 0.18 -0.09 -0.14 0.28 0.08 -0.1 -0.34 -0.17 -0.08 -0.08 -0.14 -0.15 0.43 0.19 0.08 0.07 0.32 -0.26 -0.22 -0.09 -0.06 0.28 -0.03 -0.17 -0.09 -0.05 0.13 -0.09 -0.16
1.72 0.82 -0.32 -2.53 2.24 -2.18 -1.87 -2.67 -2.85 -2.6 -4.15 -2.65 -2.95 1.94 -1.09 -2.21 -2.67 3.24 -2.02 -2.6 -1.63 -2.51 -0.55 -2.24 -2.61 -1.98 -2.27 -1.28 -0.02 -5.18
0.5 0.29 0.18 0.01 0.32 -0.25 -0.59 -0.5 -0.05 -0.09 -0.45 -0.62 -0.31 0.9 -0.22 -0.18 -0.29 0.91 -0.39 -0.48 -0.21 -0.24 0.79 -0.32 -0.46 -0.31 -0.26 0.35 -0.1 0.12
0.28 0.25 0.05 0.03 0.29 -0.02 -0.19 -0.15 -0.24 -0.05 -0.27 -0.18 -0.13 0.45 0.16 0.01 -0.02 0.38 -0.27 -0.32 -0.05 -0.15 0.27 -0.01 -0.19 -0.13 -0.11 0.07 0.02 -0.21
0.7 0.06 -0.75 -2.25 1.34 1.04 -0.03 -1.32 -0.3 0.16 -0.82 -1.06 -1.02 -0.32 -0.07 -0.1 -0.96 2.37 -0.33 -0.17 -0.05 -0.7 0.56 -0.95 -1.06 -0.67 -0.48 -1.6 -0.35 -0.89
0.62 0.7 -0.3 -0.25 0.59 -0.02 -0.1 0.05 -0.21 -0.35 -0.75 -0.4 0.06 1.22 0.09 -0.41 -0.44 1.22 -0.58 -0.69 -0.67 -0.66 0.86 -0.59 -0.63 -0.69 -0.68 -0.44 -0.06 -0.25
0.66 0.23 -0.7 -1.7 0.62 -0.14 -0.13 -0.81 -1.26 -1.16 -1.29 -0.51 -0.06 1.2 0.24 -0.22 -0.29 1.77 -0.82 -1.29 -0.73 -0.57 2.22 -0.59 -1.17 -0.84 -1.48 -0.8 -0.22 -0.91
0.49 0.31 0.06 -0.03 0.32 -0.07 -0.2 -0.19 -0.34 -0.13 -0.4 -0.25 -0.08 0.85 -0.05 -0.12 -0.27 0.54 -0.36 -0.46 -0.31 -0.35 0.49 -0.23 -0.2 -0.29 -0.16 0.15 0.12 0.04
0.87 1.21 0.03 -3.07 -0.07 -0.25 -0.96 -0.73 -0.99 -0.62 -1.79 -0.5 -1.84 2.76 -0.69 -1.08 -2.86 0.49 -1.13 -3.15 -1.04 -0.9 0.8 - -0.01 0.48 - -0.13 0.95 0.51
1.26 1.52 -1.63 -0.02 0.74 -1.63 -1.3 -1.94 -1.11 -0.57 -1.87 -1.35 0.09 2.36 -1.37 -1.88 -1.54 1.57 -1.69 -1.21 -3.07 -1.85 1.76 -4.23 -2.18 -1.31 -0.77 -0.62 0.35 0.12
0.87 1.21 0.03 -3.07 -0.07 -0.25 -0.96 -0.73 -0.99 -0.62 -1.79 -0.5 -1.84 2.76 -0.69 -1.08 -2.86 0.49 -1.13 -3.15 -1.04 -0.9 0.8 - -0.01 0.48 - -0.13 0.95 0.51
0.59 0.46 0.05 -0.1 0.17 -0.12 -0.16 -0.32 -0.36 -0.23 -0.31 -0.47 -0.2 0.86 0.17 -0.05 -0.05 0.6 -0.49 -0.49 -0.43 -0.32 0.54 -0.16 -0.24 -0.33 -0.26 0.26 0.14 -0.16
0.38 0.25 0.04 -0.1 0.33 -0.23 -0.41 -0.42 -0.29 -0.3 -0.33 -0.32 -0.08 0.35 0.08 -0.08 -0.12 0.85 -0.23 -0.27 -0.19 -0.17 1.2 -0.48 -0.49 -0.44 -0.24 0.12 0.08 -0.19
1.36 0.54 0.19 -0.27 1.16 -1.24 -0.33 -0.82 -0.32 -0.49 -0.68 -0.79 -0.14 0.97 -0.02 -1.04 -1.1 1.32 -0.86 -0.77 -1.01 -1.08 1.42 -1.0 -0.27 -0.98 -0.59 -0.59 0.51 -0.69
0.61 0.19 -0.18 -1.75 1.27 -0.17 -2.15 -0.84 -0.48 0.12 -2.5 -1.65 -0.08 2.67 0.15 -0.88 -1.79 1.98 -1.03 -1.11 -0.76 -0.89 0.22 -0.25 -1.99 -4.14 -2.6 -1.82 0.06 -0.54
1.89 0.66 -0.39 -2.11 2.04 -1.0 -1.33 -2.1 -1.63 -0.9 -2.02 -1.63 -1.12 1.7 -0.43 -1.35 -2.11 2.66 -2.53 -1.89 -2.16 -1.84 0.83 -2.17 -1.58 -2.01 -1.51 -1.17 0.28 -3.41
1.12 0.94 0.25 -0.71 0.57 -0.2 -1.07 -0.21 -0.97 -0.54 -0.5 -0.14 -0.83 1.76 -0.25 -0.46 -0.5 1.62 -1.3 -1.18 -1.41 -1.05 0.43 -0.7 -0.65 -0.09 -0.94 -1.59 0.44 -0.26
1.4 0.94 0.07 -0.55 1.2 -0.91 -1.05 -1.1 -0.66 -0.51 -1.23 -1.57 -0.44 1.02 -0.38 -0.81 -1.09 2.27 -1.59 -1.38 -1.11 -1.58 1.05 -0.91 -1.58 -1.32 -0.86 -0.43 0.54 -0.28
1.4 0.84 -0.09 -1.14 1.3 -0.81 -0.95 -1.2 -0.94 -1.01 -1.3 -1.29 -0.33 0.81 -0.53 -0.94 -0.96 1.88 -1.52 -1.11 -1.01 -1.06 2.15 -1.12 -1.16 -1.36 -1.19 -0.69 0.29 -0.76
1.4 0.84 -0.09 -1.14 1.3 -0.81 -0.95 -1.2 -0.94 -1.01 -1.3 -1.29 -0.33 0.81 -0.53 -0.94 -0.96 1.88 -1.52 -1.11 -1.01 -1.06 2.15 -1.12 -1.16 -1.36 -1.19 -0.69 0.29 -0.76
1.08 0.89 -0.03 -0.54 0.44 0.17 -0.6 -1.38 -1.26 -0.8 -1.0 -0.77 -0.43 1.11 -0.22 -0.03 -0.26 0.94 -0.37 -0.35 -0.39 -0.34 1.19 0.4 -0.3 -0.59 -1.08 -0.63 -0.29 0.17
0.16 0.38 -0.15 -0.14 0.25 -0.25 -0.8 -0.17 -0.28 -0.11 -0.43 -0.5 0.02 0.75 0.11 0.03 -0.04 0.82 -0.47 -0.44 -0.09 -0.33 0.89 -0.38 -0.39 -0.25 -0.32 0.28 -0.01 0.16
1.49 0.44 -0.47 -2.12 1.32 -0.93 -0.43 -1.25 -1.0 -0.11 -1.31 -2.13 -0.54 1.35 0.4 -1.1 -0.14 2.57 -1.95 -1.88 -0.98 -1.36 0.53 -2.3 -0.67 -1.36 -0.71 -0.35 0.18 -2.52
0.63 0.62 0.25 0.03 0.62 -0.05 -0.5 -0.05 -0.61 -0.47 -0.64 -0.89 -0.68 1.06 -0.3 -0.32 -0.32 1.37 -0.76 -0.18 -0.33 -0.77 0.78 -0.53 -0.55 -0.4 -0.81 -0.17 0.08 0.05
0.84 -0.24 -0.72 -2.4 2.17 -1.74 -2.73 -2.82 -1.9 -0.44 -2.87 -1.64 -0.17 1.85 -1.04 -1.47 -2.16 2.56 -3.65 -2.11 -2.3 -2.41 2.56 -3.46 -2.21 -2.29 -2.52 -2.15 -0.01 -4.98
1.39 0.99 -0.27 -1.59 1.81 -0.88 -1.24 -1.42 -1.95 -1.49 -2.32 -1.96 -1.2 1.52 -1.27 -2.07 -2.22 1.94 -1.84 -1.96 -1.54 -2.07 2.6 -2.4 -1.61 -2.11 -2.08 -0.41 0.22 -2.31
0.57 0.47 0.16 -0.4 0.96 -0.08 -0.43 -0.65 -0.44 -0.05 -0.67 -0.6 -0.35 0.88 -0.55 -0.35 -0.14 1.61 -0.78 -1.32 -0.52 -0.2 1.38 -0.98 -0.45 -0.72 -0.45 -0.54 -0.12 -0.73
1.14 1.24 -0.35 -1.1 0.62 -0.64 -1.0 -1.04 -1.52 -1.23 -1.63 -1.44 -0.75 2.04 -0.63 -1.2 -1.67 1.23 -1.74 -1.74 -1.72 -1.51 2.47 -1.75 -1.42 -1.65 -1.42 0.6 -0.23 -0.72
Spov3_chr1.04238 (LRK10L4)
 0.95 0.73 -0.35 -0.73 0.9 -0.34 -0.87 -1.37 -0.7 -0.25 -1.0 -0.76 -0.61 1.8 -0.22 -0.56 -0.4 1.24 -1.0 -1.2 -0.77 -0.8 1.85 -0.74 -1.04 -0.94 -0.98 -0.59 0.03 -0.77
0.45 0.39 0.06 -0.15 0.3 -0.2 -0.4 -0.41 -0.06 0.05 -0.39 -0.25 -0.47 1.18 -0.2 -0.35 -0.48 0.48 -0.57 -0.65 -0.31 -0.39 0.98 -0.23 -0.48 -0.31 -0.36 0.4 0.29 -0.19
1.93 1.75 0.08 -1.41 1.69 -1.94 -1.56 -2.1 -2.14 -2.0 -2.46 -2.23 -1.1 2.57 -0.73 -2.09 -2.82 1.04 -2.5 -2.33 -2.52 -2.27 1.13 -2.23 -1.45 -2.1 -2.41 0.74 0.01 -1.4
0.84 0.8 0.34 0.13 0.26 -0.53 -0.37 -0.38 -0.37 -0.61 -0.57 -0.65 -0.28 1.3 -0.38 -0.63 -0.8 0.64 -0.79 -0.84 -0.72 -0.77 1.24 -0.55 -0.3 -0.66 -0.4 0.75 -0.07 -0.2
1.43 0.42 0.1 -0.41 0.71 -0.36 -0.38 -0.99 0.02 -0.12 -0.97 -1.06 -0.49 1.45 0.2 -0.82 -1.12 1.81 -1.58 -1.2 -1.36 -1.24 1.3 -1.17 -0.82 -1.28 -1.15 -0.46 0.49 -1.45
0.02 0.3 0.04 -0.29 0.49 -0.23 -0.85 -0.76 -0.05 -0.03 -0.61 -0.54 -0.1 0.83 -0.19 -0.42 -0.27 1.35 -0.34 -0.74 0.07 -0.35 1.44 -0.66 -0.5 -0.32 -0.34 0.03 -0.08 -0.59
0.36 -0.12 0.06 -1.48 1.52 0.26 -1.28 -0.81 -0.02 0.1 -1.5 -1.63 -0.28 1.93 0.21 -0.78 -1.55 2.23 -1.17 -1.86 -1.76 -1.63 1.27 -2.1 -1.45 -1.52 -2.13 -0.14 -0.02 -1.39
0.41 0.28 -0.09 -0.58 1.08 0.25 -0.07 -0.64 -0.41 -0.41 -0.68 -0.68 -0.27 1.2 0.11 -0.57 -0.61 0.87 -0.64 -0.45 -0.4 -0.62 1.35 -0.78 -0.63 -0.62 -0.58 -0.35 0.23 -0.0
Spov3_chr2.00652 (AtNCER2)
 1.08 1.26 -0.8 -1.28 0.83 -0.06 -0.55 -1.24 -1.38 -1.19 -1.45 -1.65 -0.86 1.47 0.23 -0.43 -0.75 1.57 -0.67 -0.8 -0.63 -0.72 1.84 -1.29 -1.65 -1.33 -1.49 -0.02 -0.2 -0.01
Spov3_chr2.00757 (UGT76C2)
 0.83 0.58 -0.21 -0.17 0.43 -0.23 -0.37 -0.31 -0.89 -0.9 -0.48 -0.49 -0.15 1.32 0.04 -0.19 -0.51 1.21 -0.48 -0.25 -0.36 -0.59 1.2 -0.65 -0.81 -0.9 -0.7 -0.35 -0.11 -0.02
0.2 0.24 0.01 -0.06 0.2 -0.05 -0.17 -0.22 -0.19 -0.1 -0.15 -0.22 -0.25 0.57 0.23 0.05 0.14 0.43 -0.37 -0.49 -0.1 -0.14 0.46 -0.09 -0.17 -0.19 -0.07 0.1 -0.06 -0.13
0.53 0.54 -0.32 -0.21 0.15 -0.35 -0.68 -0.48 -0.6 -0.22 -0.44 -0.45 -0.17 1.32 -0.14 -0.31 -0.15 0.82 -0.36 -0.59 -0.28 -0.45 1.25 -0.21 -0.41 -0.39 -0.28 0.19 -0.16 -0.27
1.08 1.49 -0.62 -1.15 1.53 -0.76 -0.56 -0.21 -1.48 -0.76 -1.74 -1.16 -0.46 2.11 -0.14 -1.31 -0.73 1.1 -0.69 -0.67 -0.75 -1.0 -0.13 -1.25 -0.99 -1.72 -1.29 0.88 -0.25 -0.8
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0.39 0.21 0.07 -0.09 0.46 -0.48 -0.56 -0.6 -0.05 -0.14 -0.32 -0.7 0.21 1.24 -0.02 -1.08 -0.66 1.43 -0.4 -0.28 -0.6 -1.1 1.53 -0.59 -0.38 -0.58 -0.09 -0.38 -0.33 -1.72
0.32 0.3 0.04 -0.05 0.18 -0.1 -0.21 -0.28 -0.25 -0.06 -0.35 -0.22 -0.2 0.94 -0.02 -0.06 -0.15 0.53 -0.54 -0.57 -0.27 -0.27 0.76 -0.22 -0.45 -0.16 -0.22 0.11 0.12 0.03
1.08 1.55 0.35 -0.32 0.28 -1.16 -1.52 -0.58 -0.61 0.08 -0.7 -1.34 0.36 1.74 -0.78 -0.46 -1.69 0.86 -0.94 -0.79 -0.22 -0.67 0.63 -1.17 -0.83 -0.47 -0.26 0.51 -0.71 -0.49
1.09 0.95 0.16 -0.29 0.49 -0.66 -0.86 -0.86 -0.67 -0.29 -0.76 -0.91 -0.61 1.26 -0.34 -0.59 -0.56 1.19 -0.81 -0.81 -0.55 -0.83 1.26 -0.67 -0.84 -0.57 -0.75 0.63 0.19 -0.13
1.03 0.53 -0.04 0.09 1.14 -0.72 -2.02 -2.21 -0.65 -0.26 -0.87 -0.89 -0.62 1.65 -0.46 -0.23 -0.93 2.13 -2.91 -1.58 -2.07 -0.07 0.96 -0.87 -0.79 -1.56 -0.59 -0.6 0.69 -1.38
0.63 0.48 0.03 -0.26 0.43 -0.21 -0.27 -0.4 -0.23 -0.1 -0.2 -0.28 -0.45 0.91 -0.15 -0.29 -0.28 0.73 -0.41 -0.46 -0.3 -0.44 0.74 -0.18 -0.36 -0.23 -0.3 0.16 0.15 -0.22
0.95 1.02 -0.02 -0.59 1.18 -0.07 -0.77 -0.48 -1.17 -0.19 -0.83 -0.74 -0.35 1.71 0.14 -0.71 -0.07 1.06 -1.23 -1.25 -1.45 -1.34 0.21 -1.64 -0.43 -0.5 -0.67 -0.59 0.52 0.4
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Spov3_chr3.02061 (LRK10L4)
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Spov3_chr3.04617 (AtHMP01)
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Spov3_chr4.01142 (UMAMIT9)
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Spov3_chr4.03398 (ELONGATION FACTOR-TU FAMILY)
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Spov3_chr5.00101 (CYP71B3)
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1.39 1.21 0.37 -0.49 0.71 -1.15 -1.11 -1.13 -1.29 -1.55 -1.56 -1.6 -0.67 2.04 -0.29 -1.32 -1.73 1.95 -1.71 -1.7 -1.44 -1.7 1.39 -1.74 -1.09 -1.69 -1.48 0.76 -0.35 -0.56
0.48 0.58 -0.41 -1.38 0.51 0.47 0.22 0.36 -0.56 -0.46 -0.38 -0.21 -0.32 1.4 0.19 -0.07 -0.27 -0.5 -0.25 -0.25 -0.32 -0.21 -0.14 0.02 -0.17 -0.36 -0.44 0.54 -0.35 -0.55
0.51 0.2 0.06 0.14 0.01 -0.09 -0.3 -0.6 -0.12 -0.38 -0.28 -0.34 -0.01 0.76 0.17 -0.11 -0.15 0.91 -0.39 -0.34 -0.45 -0.29 1.06 -0.35 -0.4 -0.38 -0.31 -0.15 -0.1 -0.16
0.95 0.71 0.02 -1.18 0.87 -0.26 -0.91 -0.29 -0.85 -0.56 -1.7 -1.02 -0.84 0.64 -0.06 -0.68 -0.86 1.99 -0.79 -0.94 -1.41 -0.73 1.77 -0.51 -0.41 -0.62 -0.32 -0.11 -0.52 -0.53
0.41 0.26 0.17 -0.03 0.28 -0.21 -0.21 -0.46 -0.27 -0.25 -0.44 -0.31 -0.04 1.05 0.01 -0.27 -0.26 0.97 -0.5 -0.33 -0.43 -0.33 0.86 -0.59 -0.44 -0.5 -0.38 -0.16 0.15 0.12
0.52 0.44 -0.12 -0.24 0.24 -0.08 -0.25 -0.44 -0.18 -0.23 -0.35 -0.3 -0.32 1.17 0.03 -0.35 -0.24 0.83 -0.4 -0.5 -0.3 -0.42 1.15 -0.61 -0.48 -0.39 -0.36 -0.01 -0.15 -0.2
Spov3_chr5.03724 (CCoAOMT7)
 0.84 -2.89 -2.85 - 2.03 -2.12 -1.89 -1.03 -1.29 0.7 -1.83 - 0.66 0.67 0.07 -1.93 - 1.74 - - - - 3.51 -3.14 - -3.24 -2.32 - -0.15 -
0.57 0.4 -0.13 -0.18 0.21 -0.24 -0.24 -0.38 -0.24 -0.09 -0.25 -0.32 -0.18 0.77 -0.04 -0.08 0.04 0.29 -0.23 -0.48 -0.27 -0.27 0.77 -0.08 -0.29 -0.16 -0.13 0.2 -0.0 -0.09
-0.81 -0.43 -0.4 -1.74 0.92 -0.01 -1.13 -1.19 -1.34 -0.85 -1.36 -0.88 0.28 0.86 0.84 -0.61 -0.69 1.83 -1.14 -1.36 -0.55 -0.69 2.47 -2.38 -1.42 -1.05 -0.4 -1.52 0.04 0.52
0.07 0.09 -0.16 -0.14 1.25 -0.12 -0.41 -0.25 -0.83 -0.35 -0.47 -0.81 0.09 0.26 -0.36 -0.18 -0.22 1.41 -0.43 -0.44 -0.32 -0.45 0.82 -0.44 -0.45 -0.11 0.01 0.16 -0.0 -0.27
0.77 0.55 0.05 -0.27 0.16 -0.06 -0.25 -0.37 -0.35 -0.28 -0.47 -0.48 -0.4 1.08 -0.18 -0.33 -0.27 0.84 -0.59 -0.52 -0.33 -0.18 0.53 -0.39 -0.55 -0.55 -0.56 0.37 0.21 0.39
0.89 1.27 -1.07 -1.69 1.28 -1.07 -0.6 -1.21 -0.92 -0.78 -1.91 -1.88 -2.77 1.43 -1.26 -2.63 -2.39 2.19 -1.66 -0.99 -1.24 -1.19 2.3 -2.1 -1.97 -1.8 -1.67 0.57 0.74 -1.85
Spov3_chr6.02326 (CYP71A24)
 1.32 -0.8 0.56 -1.4 1.42 -2.3 -1.78 -0.62 -0.79 -0.55 -2.79 -3.28 0.38 1.48 0.25 -1.45 -3.12 2.12 -5.0 -3.74 -4.84 -6.15 2.79 -3.16 -3.46 -4.05 -3.27 -2.67 0.91 -2.61
0.71 0.61 -2.87 -3.94 2.21 -3.21 -0.88 - -2.57 -1.7 -2.29 -3.15 -1.14 1.36 -2.16 - -2.03 3.39 -0.79 -1.85 -3.06 - 1.02 -2.59 - -1.53 -1.49 -1.83 1.15 -2.12
2.28 0.93 -1.68 -1.3 1.75 -1.38 -0.62 -1.5 -0.77 -1.61 -0.92 -2.59 -1.02 -1.36 -0.1 -3.36 -2.45 3.03 -2.26 -4.5 -2.55 -2.1 0.33 -1.68 -2.38 -1.88 -1.25 -1.52 1.04 -1.52
2.09 0.77 -1.82 -1.7 1.99 -1.94 -0.19 -2.15 -0.71 -1.28 -2.17 -1.63 -1.09 -0.72 -0.79 -2.46 -2.52 2.64 -2.4 -2.0 -3.11 -2.0 2.36 -1.86 -3.07 -3.65 -1.82 -2.81 0.53 -4.85
0.5 0.39 0.27 0.09 0.5 -0.66 -0.8 -0.19 -0.4 -0.54 -0.56 -0.65 -0.02 1.49 0.33 -0.5 -0.88 1.08 -0.78 -0.53 -0.44 -0.61 1.61 -1.09 -0.38 -0.8 -0.64 -0.21 -0.29 -1.13
0.97 0.52 0.35 -0.42 0.05 -0.11 -0.19 0.69 -0.58 -0.18 -1.1 -0.9 0.12 1.45 -0.06 -0.56 -1.25 0.91 -0.71 -0.36 -0.73 -0.73 1.92 -0.93 -0.94 -1.39 -1.34 -0.71 -0.43 -2.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.