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Heatmap: Cluster_137 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.34 0.38 0.19 0.08 0.13 -0.13 -0.01 -0.03 -0.11 -0.12 -0.12 -0.06 0.24 -0.29 -0.02 -0.06 -0.11 -0.47 -0.04 -0.04 -0.08 -0.05 -0.27 0.11 0.14 -0.04 0.0 0.1 0.09 -0.08
-0.18 -0.08 0.22 0.33 -0.05 -0.43 -0.31 0.93 0.14 0.1 0.03 0.1 0.1 -0.91 -0.13 -0.06 0.02 -0.69 -0.15 -0.11 -0.05 -0.14 0.26 -0.42 -0.07 -0.01 0.11 0.25 0.09 0.02
-0.08 -0.01 0.25 0.42 0.08 -0.08 -0.07 0.47 0.14 -0.09 -0.1 -0.05 0.52 -1.22 -0.31 -0.3 -0.2 -0.29 -0.34 -0.2 -0.34 -0.19 0.72 0.01 -0.09 -0.11 -0.22 0.26 0.07 0.17
0.07 0.24 0.05 0.1 0.06 -0.11 -0.04 0.19 0.05 0.05 -0.01 0.03 0.18 -0.13 -0.32 -0.22 -0.24 -0.46 -0.21 -0.13 -0.02 -0.1 -0.26 0.12 0.05 -0.07 -0.07 0.4 0.35 0.06
-0.02 0.05 0.06 0.14 0.09 -0.13 0.04 0.25 -0.05 0.03 0.03 0.03 0.36 -0.3 -0.25 -0.25 -0.07 -0.61 -0.06 -0.03 -0.05 -0.04 -0.02 -0.06 0.09 -0.05 -0.0 0.34 0.13 -0.0
0.08 0.2 0.09 0.03 0.17 -0.27 0.05 0.42 0.04 0.18 0.03 0.02 0.29 -0.48 -0.36 -0.32 -0.19 -0.67 -0.02 -0.12 -0.13 -0.05 -0.14 0.05 0.08 -0.01 -0.02 0.56 0.18 -0.33
0.09 0.01 0.15 0.39 0.03 -0.3 -0.29 0.21 0.13 0.08 0.07 -0.1 0.05 -0.41 -0.14 -0.1 -0.08 -0.08 -0.18 -0.21 -0.05 -0.22 0.17 -0.09 0.08 -0.03 0.13 0.33 0.08 -0.05
-0.02 -0.06 0.15 0.31 0.11 -0.23 0.04 0.66 -0.02 -0.41 -0.09 -0.31 0.35 -1.37 0.03 0.0 0.06 -0.94 -0.14 -0.01 -0.24 -0.13 0.57 -0.35 -0.17 -0.26 -0.11 0.43 0.18 0.46
0.2 0.08 0.22 0.36 -0.05 -0.18 0.13 0.22 -0.09 -0.18 -0.02 -0.02 0.21 -0.55 -0.03 -0.08 -0.04 -0.77 -0.07 -0.07 -0.01 0.03 -0.17 0.03 0.1 -0.2 0.01 0.29 0.2 -0.03
-0.01 0.09 0.2 0.33 0.18 -0.17 -0.28 0.27 0.27 0.13 -0.05 -0.15 -0.38 -0.2 -0.15 -0.11 -0.02 -0.3 -0.17 -0.16 -0.13 -0.22 0.47 -0.1 -0.13 -0.03 -0.05 0.17 0.23 0.04
-0.1 -0.02 0.11 0.13 0.28 -0.13 -0.23 0.11 0.11 0.06 -0.05 -0.08 0.03 -0.5 0.1 -0.01 0.09 0.01 -0.09 -0.19 -0.09 -0.14 0.55 -0.26 -0.21 0.02 -0.07 0.09 0.02 0.09
0.26 0.08 0.09 0.07 0.36 -0.37 0.01 0.01 0.11 0.08 0.06 0.08 0.25 -0.7 -0.43 -0.39 -0.22 -1.17 -0.14 -0.08 -0.15 -0.09 0.28 0.05 0.22 -0.03 0.06 0.35 0.38 0.0
0.19 0.21 0.03 0.16 -0.03 -0.48 -0.34 0.21 -0.02 0.08 -0.12 -0.04 -0.05 0.11 -0.1 -0.33 -0.09 -0.31 -0.15 -0.22 -0.04 -0.03 0.17 0.01 -0.01 0.06 0.02 0.38 0.3 0.04
0.06 -0.01 -0.04 -0.14 0.31 -0.19 0.12 0.14 -0.04 0.08 0.07 -0.0 0.39 -0.53 -0.27 -0.3 -0.24 -0.46 -0.04 0.07 -0.12 -0.08 0.38 0.1 0.18 -0.19 -0.06 0.4 0.17 -0.32
0.11 0.14 0.38 0.39 0.18 -0.21 -0.28 0.57 0.11 0.01 -0.12 -0.12 -0.4 -1.04 -0.18 -0.14 -0.02 -0.07 -0.23 -0.21 -0.1 -0.17 0.68 -0.35 -0.33 -0.11 -0.07 0.21 0.23 0.11
0.28 -0.18 0.14 -0.3 0.86 -1.36 -0.39 -0.58 -0.15 -0.1 -0.13 -0.25 -0.51 -0.41 -1.13 -0.27 -0.6 -0.15 -0.88 -1.02 -0.1 -0.16 1.65 0.13 0.3 0.06 0.53 0.1 0.33 0.39
1.21 0.45 1.69 0.91 -0.71 -1.98 -1.5 0.23 0.3 0.84 0.56 -0.2 -1.13 -2.55 -0.11 -1.25 -1.67 -0.34 -0.85 0.19 0.12 -0.56 0.79 -0.45 -0.57 -0.38 -0.59 0.36 -0.37 -1.72
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Spov3_chr3.03452 (EMB2654)
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0.24 0.28 0.12 0.07 0.15 -0.17 0.02 0.25 0.05 0.02 -0.01 -0.04 0.11 -0.52 -0.1 -0.1 -0.12 -0.61 -0.04 0.0 -0.07 -0.17 -0.01 0.08 0.08 -0.02 0.02 0.21 0.17 -0.24
0.21 -0.3 0.48 0.65 -0.2 -1.03 -0.07 -0.01 0.33 0.23 0.4 0.07 0.14 -1.29 -0.52 -0.23 -0.49 -0.16 -0.14 0.04 -0.3 0.16 0.62 -0.0 0.46 -0.13 0.19 -0.04 -0.14 -0.76
0.2 0.36 0.16 0.28 0.15 -0.22 -0.22 0.15 0.03 0.07 -0.02 -0.1 0.49 -1.28 -0.39 -0.3 -0.02 -1.17 -0.27 0.01 -0.22 -0.13 -0.3 -0.18 0.15 0.21 0.18 0.56 0.32 0.08
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0.65 0.29 0.57 0.63 0.04 -0.48 0.03 0.07 0.02 0.0 -0.03 -0.26 0.28 -1.97 -0.3 -0.35 -0.25 -0.91 0.06 0.03 -0.15 -0.01 0.7 -0.39 -0.01 -0.17 0.01 0.09 0.0 -0.34
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-2.19 -1.55 -0.29 1.72 0.45 -2.35 -1.2 -0.26 -0.39 0.3 0.81 -0.54 0.44 - -1.85 -1.75 -2.3 -0.9 0.02 0.02 -0.26 -0.13 1.95 -0.36 0.61 -0.17 0.82 1.03 -0.57 -3.58
0.18 0.3 0.12 0.12 -0.16 -0.39 -0.3 0.18 0.03 0.06 -0.06 0.01 0.01 0.35 -0.05 -0.18 -0.18 -0.02 -0.33 -0.36 -0.05 -0.15 0.12 -0.11 -0.1 0.0 0.1 0.22 0.18 0.09
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0.14 0.11 0.13 0.19 0.2 -0.13 -0.05 0.1 -0.07 -0.03 -0.15 -0.2 0.05 -0.68 -0.11 -0.11 -0.18 -0.1 0.04 -0.04 0.04 -0.01 0.34 -0.13 0.03 0.13 0.18 0.12 0.0 -0.15
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-0.24 0.29 0.5 0.37 0.34 -1.39 -0.31 0.43 0.6 0.48 0.2 -0.07 -0.23 -2.25 -1.16 -0.81 -0.95 -0.92 -0.35 -0.23 -0.28 -0.14 0.41 0.37 0.06 -0.16 0.11 0.52 0.73 0.24
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.