Heatmap: Cluster_80 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0002.00244	-0.14	0.01	-0.16	-0.06	-0.1	-0.11	-0.35	-0.18	-0.11	-0.03	0.0	-0.13	-0.02	0.6	0.28	0.36	0.45	0.1	-0.07	-0.07	0.06	0.07	-0.04	-0.16	-0.14	0.0	-0.09	-0.28	-0.26	0.11
Spov3_C0003.00080 (CPL2)	-0.12	0.01	0.01	0.07	-0.04	0.01	0.08	0.2	-0.05	-0.1	0.05	-0.05	-0.02	0.36	0.27	0.16	0.18	-0.45	-0.13	-0.23	-0.07	-0.03	-0.04	-0.1	-0.06	-0.05	0.02	-0.16	-0.1	0.14
Spov3_C0056.00004 (PAB2)	-0.02	0.06	-0.04	0.04	-0.15	-0.04	-0.1	-0.02	-0.14	-0.15	-0.12	-0.06	0.12	0.51	0.27	0.14	0.15	-0.09	-0.09	-0.14	-0.07	-0.03	0.14	0.05	-0.09	-0.1	-0.05	-0.09	-0.05	-0.07
Spov3_C0135.00002	0.11	0.17	0.11	0.16	-0.03	0.06	-0.18	0.22	-0.28	-0.27	-0.07	-0.09	-0.01	0.24	0.38	0.25	0.32	-0.06	-0.32	-0.33	-0.08	-0.03	-0.22	-0.17	-0.2	-0.13	0.07	-0.03	-0.08	0.12
Spov3_chr1.00107 (RBP45d)	0.11	0.25	-0.06	0.19	-0.1	-0.33	-0.37	-0.01	-0.19	-0.16	-0.16	-0.23	0.01	0.74	0.45	0.39	0.47	-0.21	-0.23	-0.32	0.06	-0.11	0.02	-0.09	-0.05	-0.03	-0.13	-0.3	-0.29	-0.08
Spov3_chr1.00270	0.04	-0.05	-0.1	0.05	-0.29	-0.1	-0.07	0.16	-0.13	-0.16	-0.06	-0.1	0.09	0.78	0.19	0.06	0.09	-0.28	-0.21	-0.17	-0.11	0.02	0.59	-0.09	-0.14	-0.18	-0.17	0.04	-0.14	-0.11
Spov3_chr1.00278 (CDKC;1)	0.39	0.45	-0.02	0.15	-0.12	-0.11	-0.21	-0.04	-0.31	-0.38	-0.28	-0.39	-0.08	1.04	0.44	0.38	0.35	-0.24	-0.22	-0.18	-0.11	-0.09	-0.29	-0.08	-0.24	-0.21	-0.22	-0.3	-0.27	0.03
Spov3_chr1.00589 (ARF1)	-0.06	0.12	-0.07	-0.09	-0.03	0.1	-0.11	0.03	-0.29	-0.28	-0.15	-0.12	-0.05	0.71	0.42	0.41	0.41	-0.01	-0.12	-0.06	0.1	-0.02	-0.11	-0.05	-0.2	-0.06	-0.14	-0.53	-0.56	0.1
Spov3_chr1.01008 (IQD26)	0.2	0.1	0.01	0.0	0.13	-0.22	-0.3	-0.16	0.02	0.02	-0.07	-0.15	0.03	0.55	0.19	0.29	0.25	0.19	-0.12	-0.2	-0.13	-0.23	0.19	-0.15	-0.18	-0.18	-0.12	-0.14	-0.1	-0.12
Spov3_chr1.02018 (IRP6)	0.19	0.29	0.04	0.14	-0.1	0.04	-0.15	-0.14	-0.33	-0.28	-0.2	-0.28	0.06	0.5	0.4	0.32	0.34	0.11	-0.27	-0.34	-0.11	-0.1	-0.06	-0.07	-0.2	-0.14	-0.16	-0.12	-0.14	0.2
Spov3_chr1.02027 (TOT3)	-0.08	0.05	-0.03	0.01	0.03	0.04	-0.05	0.13	-0.12	-0.11	0.01	-0.12	0.01	0.46	0.42	0.21	0.26	-0.18	-0.17	-0.13	-0.03	-0.04	-0.16	-0.0	-0.17	-0.04	-0.0	-0.04	-0.16	-0.29
Spov3_chr1.02299 (CuAO-zeta)	0.02	0.24	-0.05	-0.07	0.17	0.0	-0.18	-0.17	-0.04	-0.01	-0.22	-0.36	-0.11	0.94	0.6	0.36	0.46	0.15	-0.2	-0.53	-0.15	-0.2	0.27	-0.43	-0.38	-0.33	-0.33	-0.27	-0.22	-0.1
Spov3_chr1.02417 (NEV)	0.12	0.34	-0.07	-0.14	0.05	0.23	-0.14	-0.2	-0.28	-0.31	-0.25	-0.28	-0.24	1.12	0.54	0.34	0.37	0.05	-0.31	-0.33	-0.09	-0.17	0.15	-0.11	-0.3	-0.11	-0.18	-0.42	-0.47	-0.22
Spov3_chr1.03711 (RER1B)	-0.11	0.01	-0.13	-0.07	-0.12	-0.16	-0.26	-0.06	-0.04	-0.08	-0.0	-0.11	-0.06	0.66	0.35	0.36	0.32	0.2	-0.15	-0.16	0.05	-0.08	0.27	-0.06	-0.14	-0.03	-0.03	-0.41	-0.36	-0.13
Spov3_chr1.03958 (IBM1)	-0.25	0.07	-0.2	-0.04	0.18	-0.03	-0.18	-0.09	-0.08	-0.01	-0.17	-0.24	-0.06	0.75	0.18	0.32	0.17	0.03	-0.09	-0.06	0.14	0.01	-0.1	-0.06	-0.08	-0.08	-0.06	-0.28	-0.13	-0.0
Spov3_chr1.04275	0.31	0.35	-0.04	-0.1	0.03	0.21	-0.17	-0.08	-0.23	-0.24	-0.23	-0.27	-0.22	0.97	0.41	0.36	0.3	-0.09	-0.34	-0.38	-0.11	-0.15	-0.49	-0.09	-0.26	-0.21	-0.16	-0.23	-0.13	0.25
Spov3_chr1.04897 (UBC22)	0.14	0.38	-0.2	0.09	0.03	0.0	-0.31	-0.51	-0.39	-0.2	-0.41	-0.33	-0.17	1.45	0.34	0.3	0.35	0.06	-0.36	-0.34	-0.1	-0.21	-0.33	0.11	-0.02	-0.1	-0.32	-0.36	-0.26	-0.1
Spov3_chr2.00299 (TOM2A)	-0.06	-0.05	-0.18	-0.08	0.21	-0.04	-0.11	-0.1	-0.02	-0.04	0.03	-0.09	-0.03	0.41	0.28	0.17	0.21	0.42	-0.03	-0.21	-0.19	-0.05	0.15	-0.09	-0.19	-0.14	-0.02	-0.31	-0.16	-0.03
Spov3_chr2.00622 (KELP)	0.02	0.12	-0.09	-0.08	0.06	0.09	0.11	-0.19	-0.05	-0.16	-0.04	-0.07	-0.22	0.57	0.31	0.48	0.36	-0.09	-0.07	-0.16	0.03	0.0	-0.32	-0.01	-0.13	-0.06	-0.13	-0.22	-0.26	-0.32
Spov3_chr2.00646 (UCH2)	0.14	0.09	-0.11	0.0	0.14	-0.2	-0.19	0.22	-0.26	-0.08	-0.1	-0.22	0.04	0.67	0.06	-0.04	0.08	0.36	-0.25	-0.25	-0.15	-0.18	0.29	-0.12	-0.06	-0.09	-0.07	0.08	-0.03	-0.22
Spov3_chr2.00796	0.35	0.21	-0.18	-0.15	0.12	-0.1	-0.3	-0.32	-0.27	-0.06	-0.17	-0.15	-0.5	1.15	0.45	0.45	0.33	0.16	-0.22	-0.36	-0.12	-0.19	-0.35	-0.01	-0.15	0.01	-0.18	-0.16	-0.31	-0.26
Spov3_chr2.00877 (GLXI-like;10)	-0.03	0.37	-0.22	0.01	0.02	0.08	-0.42	-1.0	-0.13	-0.29	-0.11	-0.23	0.14	0.83	0.4	0.63	0.66	0.05	-0.14	-0.47	0.22	0.1	-0.18	-0.12	-0.23	-0.02	-0.4	-0.5	-0.45	-0.05
Spov3_chr2.00905	0.33	0.29	0.23	0.39	0.13	0.05	-0.16	0.08	-0.3	-0.3	-0.25	-0.41	-0.04	-0.35	0.4	0.35	0.34	-0.25	-0.24	-0.22	0.05	-0.01	0.09	-0.14	-0.05	-0.02	-0.07	-0.29	-0.22	0.0
Spov3_chr2.01062	0.11	0.11	0.01	-0.04	0.04	-0.22	-0.28	-0.05	-0.11	0.01	-0.07	-0.12	-0.1	0.81	0.15	0.22	0.18	0.12	-0.14	-0.15	-0.09	-0.12	0.13	-0.16	-0.15	-0.05	-0.01	-0.13	-0.22	-0.13
Spov3_chr2.01287 (HCR1)	0.09	-0.11	-0.22	-0.24	0.18	0.25	0.21	-0.4	-0.07	-0.2	-0.05	-0.09	0.15	0.62	0.5	0.21	0.2	-0.06	-0.2	-0.23	-0.16	0.04	-0.17	-0.3	-0.14	-0.09	-0.02	-0.18	-0.25	0.14
Spov3_chr2.01473	0.01	0.15	-0.0	0.22	0.05	-0.18	-0.13	0.4	-0.56	-0.35	-0.06	-0.19	0.19	-0.15	0.15	0.23	0.37	-0.01	-0.02	-0.04	-0.06	-0.01	0.1	-0.11	-0.02	-0.0	-0.02	-0.21	-0.37	0.22
Spov3_chr2.01844 (AGD14)	0.22	0.27	-0.14	-0.14	-0.04	0.08	-0.12	-0.19	-0.17	-0.25	-0.16	-0.16	-0.07	0.96	0.3	0.26	0.25	-0.31	-0.3	-0.18	-0.05	-0.05	0.0	0.04	-0.2	0.02	-0.11	-0.02	-0.24	-0.22
Spov3_chr2.02211 (ORP3B)	0.01	0.08	-0.03	0.08	-0.01	-0.06	-0.02	0.21	-0.08	-0.06	-0.04	-0.04	-0.01	0.35	0.26	0.23	0.18	-0.31	-0.17	-0.2	-0.08	-0.04	-0.17	-0.08	-0.02	-0.11	0.04	0.09	-0.02	-0.2
Spov3_chr2.02329 (ALY2)	-0.03	0.01	-0.11	0.08	0.02	-0.05	0.07	0.35	-0.28	-0.15	-0.12	-0.18	0.17	0.35	0.26	0.2	0.26	-0.02	-0.15	-0.2	-0.03	-0.08	-0.14	0.07	0.02	-0.11	-0.07	-0.02	-0.21	-0.19
Spov3_chr2.02467 (PUR2)	0.14	0.26	0.1	0.32	0.11	0.05	-0.25	0.08	-0.2	-0.08	-0.07	-0.02	-0.04	0.25	0.15	0.15	0.22	0.01	-0.08	-0.35	0.01	-0.09	-0.45	-0.17	-0.14	-0.0	0.08	0.1	-0.02	-0.45
Spov3_chr2.02493 (RHF1A)	0.29	0.25	-0.04	0.04	0.05	0.0	-0.16	-0.01	-0.14	-0.06	-0.22	-0.17	-0.05	0.83	0.23	0.26	0.12	0.09	-0.27	-0.34	-0.22	-0.2	0.0	-0.15	-0.3	-0.26	-0.14	-0.16	-0.03	0.14
Spov3_chr2.02875 (XF1)	0.22	0.09	-0.01	0.36	0.11	-0.24	-0.26	-0.06	-0.07	-0.21	-0.07	-0.21	0.03	0.6	0.36	0.2	0.34	-0.02	-0.18	-0.24	-0.11	-0.22	0.3	-0.27	-0.26	-0.18	0.03	-0.24	-0.25	-0.13
Spov3_chr2.02959	0.05	-0.02	0.04	0.02	0.05	-0.01	-0.08	0.07	-0.35	-0.27	-0.2	-0.07	-0.11	0.38	0.32	0.3	0.28	0.32	0.01	-0.14	-0.05	-0.06	0.22	-0.12	-0.12	-0.09	-0.04	-0.27	-0.35	-0.08
Spov3_chr2.03437	-0.03	0.17	-0.12	-0.24	0.38	0.06	-0.09	-0.19	-0.33	-0.23	-0.25	-0.25	-0.21	1.34	0.72	0.38	0.42	-0.16	-0.09	-0.19	0.09	-0.01	-0.88	-0.26	-0.19	-0.29	-0.24	-0.36	-0.39	-0.5
Spov3_chr2.03530	-0.08	-0.1	-0.2	0.11	-0.21	-0.09	-0.21	-0.03	-0.13	-0.23	-0.1	-0.2	0.07	0.59	0.41	0.44	0.45	-0.05	-0.27	-0.09	-0.08	0.07	0.38	0.03	-0.13	-0.07	-0.15	-0.33	-0.26	-0.14
Spov3_chr2.03839 (VPS26B)	0.04	-0.21	-1.1	-0.84	0.04	-0.15	-0.1	-0.18	-0.01	0.23	-0.24	-0.29	-0.11	0.97	0.52	0.24	0.24	1.03	-0.22	-0.3	-0.04	-0.12	0.23	-0.33	-0.17	0.03	0.13	-0.82	-0.17	-0.34
Spov3_chr2.03946 (CHY1)	0.05	0.15	-0.15	-0.21	0.02	0.02	0.14	-0.06	-0.12	-0.08	-0.12	-0.2	-0.21	0.63	0.31	0.32	0.28	-0.21	-0.07	-0.1	-0.1	-0.13	-0.18	-0.09	-0.18	-0.06	0.02	-0.13	-0.08	0.13
Spov3_chr2.05338 (PTB2)	-0.0	0.07	0.06	0.05	0.11	-0.02	-0.33	-0.05	-0.36	-0.19	-0.27	-0.29	0.12	0.91	0.36	0.16	0.21	0.6	-0.21	-0.32	-0.16	-0.41	-0.0	-0.15	-0.02	-0.13	-0.29	-0.21	-0.09	-0.04
Spov3_chr3.00371	-0.09	0.1	-0.25	0.07	0.0	-0.12	-0.72	-0.45	-0.45	-0.43	-0.24	-0.27	0.14	0.76	0.43	0.1	0.46	0.67	-0.43	-0.17	0.15	-0.06	0.19	-0.11	-0.14	-0.13	-0.05	-0.16	-0.29	0.31
Spov3_chr3.00501 (FAB1C)	0.07	0.06	0.07	0.0	0.06	0.07	-0.04	-0.07	-0.13	-0.17	-0.11	-0.13	-0.02	0.61	0.41	0.23	0.19	-0.17	-0.27	-0.28	-0.09	-0.08	0.05	-0.18	-0.2	-0.09	0.01	-0.14	-0.01	-0.05
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Spov3_chr3.00909	0.01	-0.06	-0.17	-0.25	0.09	0.11	-0.08	-0.1	-0.21	-0.06	-0.08	-0.13	0.05	0.45	0.34	0.24	0.23	0.36	-0.11	-0.19	0.06	-0.08	-0.08	-0.12	-0.09	-0.01	0.07	-0.13	-0.24	-0.18
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Spov3_chr6.02429	-0.28	-0.15	-0.11	0.17	-0.2	-0.1	-0.1	0.28	-0.09	-0.11	-0.05	-0.07	0.16	0.58	0.42	0.5	0.47	-0.18	-0.17	-0.14	-0.06	-0.17	0.25	-0.22	-0.23	-0.2	-0.18	-0.17	-0.34	-0.17
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Spov3_S03.00025 (AL7)	0.05	0.05	-0.01	0.09	0.13	-0.01	-0.09	0.06	-0.14	-0.06	-0.14	-0.22	0.02	0.71	0.38	0.32	0.26	-0.03	-0.18	-0.26	-0.08	-0.16	0.07	-0.09	-0.14	-0.15	-0.2	-0.1	-0.23	-0.36
Spov3_S15.00001 (ROL5)	0.03	0.09	-0.14	0.07	-0.19	0.13	-0.12	-0.0	-0.31	-0.19	-0.18	-0.14	0.05	0.65	0.29	0.35	0.28	0.0	-0.15	-0.42	-0.07	-0.12	0.31	-0.14	-0.11	-0.15	-0.2	0.06	-0.14	-0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.