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Heatmap: Cluster_150 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.26 0.27 -0.17 -0.56 0.41 -0.1 -0.51 -0.46 -0.1 0.15 -0.36 -0.21 -0.7 1.18 -0.5 -0.54 -0.56 0.72 -0.29 -0.39 -0.26 -0.42 1.2 -0.16 -0.35 -0.07 -0.14 0.15 0.17 -0.29
Spov3_C0004.00150 (GlcAT14B)
 -0.02 -0.01 -0.14 -0.16 0.11 -0.27 -0.17 -0.01 -0.24 -0.21 -0.08 -0.08 0.13 0.43 0.1 0.04 -0.05 0.4 -0.22 -0.29 -0.04 -0.09 0.83 -0.15 -0.03 -0.06 0.02 -0.19 -0.08 -0.08
0.4 0.25 0.15 0.11 0.4 -0.22 -0.25 -0.53 -0.05 0.04 -0.38 -0.29 -0.3 0.71 0.04 -0.24 -0.1 0.46 -0.36 -0.35 -0.27 -0.37 1.04 -0.25 -0.36 -0.29 -0.31 0.07 0.18 -0.47
0.04 0.06 -0.1 0.09 0.21 -0.24 -0.15 0.06 -0.12 -0.08 -0.24 -0.27 -0.01 0.61 -0.06 -0.07 0.08 0.42 -0.22 -0.4 -0.2 -0.11 0.95 -0.07 -0.22 -0.1 -0.12 0.02 -0.28 -0.42
0.01 -0.03 -0.07 -0.08 0.33 -0.07 -0.0 0.11 -0.18 -0.18 -0.07 -0.18 -0.01 0.38 0.04 -0.11 -0.04 0.4 -0.16 -0.16 -0.12 -0.04 0.6 -0.14 -0.13 -0.21 -0.09 -0.05 -0.07 -0.07
0.09 0.13 -0.13 0.02 -0.08 0.1 -0.26 0.07 -0.5 -0.56 -0.35 -0.34 -0.23 0.77 0.21 -0.04 0.01 0.18 -0.5 -0.51 -0.29 -0.21 1.36 -0.25 -0.4 -0.54 -0.35 -0.12 0.21 0.49
0.64 0.32 -0.11 -0.27 0.36 -0.19 -0.34 -0.55 -0.29 -0.27 -0.28 -0.41 -0.16 0.97 0.05 -0.25 -0.23 -0.01 -0.48 -0.35 -0.41 -0.53 1.68 -0.46 -0.45 -0.41 -0.36 -0.25 -0.01 0.06
0.13 0.22 0.04 -0.05 0.32 -0.17 -0.23 0.1 -0.08 -0.01 -0.19 -0.21 -0.14 0.37 -0.07 -0.21 -0.14 0.08 -0.25 -0.24 -0.17 -0.13 0.8 -0.11 -0.23 -0.11 -0.04 0.15 0.11 -0.12
0.42 0.41 0.02 -0.25 0.35 0.06 -0.02 -0.27 -0.36 -0.14 -0.35 -0.25 -0.2 0.76 0.03 -0.18 -0.2 0.51 -0.39 -0.59 -0.37 -0.22 1.07 -0.56 -0.29 -0.47 -0.42 0.04 0.23 -0.07
0.49 0.48 0.25 0.28 0.13 -0.19 -0.27 -0.36 -0.08 -0.07 -0.45 -0.38 -0.42 0.6 -0.2 -0.25 -0.34 0.5 -0.47 -0.48 -0.2 -0.19 1.05 -0.28 -0.54 -0.4 -0.38 0.09 0.3 0.08
0.13 -0.2 -0.77 -0.9 0.46 0.3 -0.3 0.14 -0.55 -0.87 -0.79 -1.22 -0.34 1.45 0.21 -0.14 0.16 0.26 -0.96 -1.13 -1.24 -0.84 2.23 -0.17 -0.88 -0.47 -1.22 -0.96 0.22 0.43
0.11 0.09 -0.08 -0.12 0.05 -0.52 -0.18 0.13 -0.37 -0.19 -0.1 -0.39 0.17 0.69 0.23 -0.04 -0.04 0.52 -0.3 -0.38 -0.14 -0.21 1.09 -0.44 -0.17 -0.24 -0.11 -0.11 -0.13 -0.09
0.61 0.22 -0.02 -0.09 0.35 -0.16 -0.11 -0.43 -0.38 -0.15 -0.42 -0.42 -0.07 0.63 -0.09 -0.31 -0.42 0.64 -0.19 -0.52 -0.12 -0.33 0.97 -0.37 -0.15 -0.24 -0.14 0.3 0.05 -0.16
0.27 0.08 0.16 0.36 -0.02 -0.33 -0.2 0.02 0.02 0.03 -0.0 -0.16 -0.02 0.28 -0.01 -0.14 0.1 0.21 -0.31 -0.26 -0.15 -0.14 0.68 -0.12 -0.19 -0.16 -0.13 -0.03 -0.09 -0.24
0.0 0.02 -0.06 -0.13 0.12 -0.06 -0.33 -0.28 -0.61 -0.59 -0.71 -0.61 0.01 0.97 -0.06 -0.23 -0.18 0.53 -0.45 -0.55 -0.67 -0.66 1.51 -0.35 -0.2 -0.47 -0.18 0.01 0.27 0.81
-0.05 -0.09 0.03 -0.34 0.52 -0.1 -0.02 0.16 -0.22 -0.15 -0.19 -0.15 -0.4 0.5 -0.07 -0.02 -0.17 0.84 -0.65 -0.52 -0.52 -0.53 1.18 -0.28 -0.5 -0.16 -0.42 0.12 0.14 0.15
0.45 0.53 -0.14 -0.63 0.56 -0.15 -0.63 -0.76 -0.23 -0.1 -0.51 -0.22 -0.53 1.15 -0.13 -0.44 -0.45 0.63 -0.1 -0.39 -0.27 -0.14 1.16 -0.1 -0.46 -0.56 -0.39 0.09 0.15 -0.18
0.25 0.2 -0.03 -0.18 0.27 -0.12 -0.15 -0.27 -0.13 -0.02 -0.14 -0.17 -0.28 0.41 -0.16 -0.2 -0.18 0.61 -0.06 -0.19 -0.1 -0.17 0.74 0.1 -0.11 -0.08 -0.2 0.02 -0.01 -0.36
0.05 0.24 -0.05 -0.06 0.19 0.11 -0.25 -0.11 -0.16 -0.01 -0.3 -0.24 -0.33 0.72 0.02 -0.06 -0.08 0.16 -0.27 -0.34 -0.25 -0.28 0.89 -0.04 -0.4 -0.11 -0.21 0.04 0.13 0.09
-0.11 0.35 -0.18 -0.14 0.5 -0.02 -0.27 -0.16 -0.36 0.03 -0.48 -0.34 -0.27 0.79 -0.01 -0.1 -0.17 0.49 -0.52 -0.97 -0.64 -0.64 1.56 -0.11 -0.3 -0.26 -0.42 -0.1 0.21 -0.08
0.09 0.12 -0.13 -0.25 0.18 -0.13 -0.25 -0.17 -0.34 0.01 -0.22 -0.21 0.03 0.54 -0.02 0.05 0.09 0.41 -0.16 -0.26 -0.01 -0.04 0.85 -0.27 -0.19 -0.13 -0.04 0.01 -0.07 -0.23
0.4 0.15 0.18 0.03 0.08 -0.45 -0.61 -0.4 -0.2 -0.24 -0.32 -0.37 -0.0 0.75 0.13 -0.22 -0.12 0.37 -0.33 -0.62 -0.34 -0.35 1.26 -0.35 -0.26 -0.49 -0.29 0.24 0.14 0.31
-0.06 -0.12 -0.11 -0.16 0.33 -0.16 -0.12 0.05 -0.21 -0.04 -0.16 -0.16 -0.0 0.56 0.15 -0.09 0.01 0.41 -0.22 -0.18 -0.15 -0.15 0.78 -0.15 -0.14 -0.02 -0.01 -0.16 -0.09 -0.27
-0.18 -0.03 -0.18 -0.25 0.31 -0.24 -0.28 -0.2 -0.38 -0.05 -0.23 -0.28 0.04 0.67 -0.09 -0.26 -0.07 0.28 -0.22 -0.33 -0.13 -0.16 1.24 0.1 -0.14 -0.11 -0.03 0.24 -0.12 -0.23
0.49 0.32 0.06 -0.2 0.11 -0.1 -0.22 -0.27 0.02 -0.05 -0.19 -0.48 -0.59 0.77 -0.0 -0.47 -0.28 0.48 -0.34 -0.46 -0.48 -0.43 1.37 -0.17 -0.43 -0.23 -0.34 0.09 0.11 -0.18
Spov3_chr3.04223 (AtHMP52)
 0.06 0.02 -0.24 -0.6 -0.13 0.35 -0.16 -0.38 -0.34 -0.27 -0.28 -0.55 -0.45 1.49 -0.0 -0.09 -0.3 0.25 -0.37 -0.25 -0.44 -0.44 1.61 -0.49 -0.91 -0.53 -0.9 -0.11 -0.14 0.62
0.26 0.38 0.16 -0.38 0.73 -0.02 -0.45 -0.37 -0.11 -0.05 -0.34 -0.11 -0.29 0.81 -0.37 -0.26 -0.51 0.35 -0.23 -0.52 -0.32 -0.11 1.02 -0.24 -0.38 -0.34 -0.42 0.38 0.24 -0.4
Spov3_chr3.04608 (ATERDJ2A)
 0.21 0.27 0.13 0.16 -0.01 -0.27 -0.19 0.1 -0.22 -0.05 -0.14 -0.22 -0.11 0.3 0.09 0.03 -0.03 0.22 -0.18 -0.29 -0.06 -0.12 0.79 -0.16 -0.24 -0.17 -0.11 -0.0 -0.13 -0.15
0.4 0.42 -0.08 -0.26 0.16 0.01 -0.21 -0.32 -0.39 -0.19 -0.45 -0.38 -0.24 0.92 -0.02 -0.18 -0.26 0.19 -0.51 -0.58 -0.34 -0.33 1.25 -0.1 -0.35 -0.3 -0.36 0.33 0.18 0.0
0.46 0.94 -0.1 -0.61 0.66 -0.26 -0.74 -0.63 -0.34 -0.09 -0.78 -0.48 -0.56 1.22 -0.26 -0.36 -0.34 0.28 -0.67 -0.58 -0.2 -0.42 1.25 -0.46 -0.87 -0.39 -0.44 0.04 0.37 0.49
0.74 0.65 -0.23 -0.57 0.88 -0.42 -0.36 -0.78 -0.16 -0.25 -0.98 -0.66 -0.49 1.4 -0.21 -0.36 -0.6 0.47 -0.67 -0.74 -0.77 -0.55 1.3 -0.19 -0.0 -0.47 -0.28 0.39 0.02 -0.57
0.61 0.53 -0.08 -0.23 0.48 -0.09 -0.47 -0.67 -0.46 -0.17 -0.67 -0.65 -0.18 1.07 -0.21 -0.15 -0.29 0.34 -0.36 -0.59 -0.24 -0.39 1.04 -0.02 -0.3 -0.4 -0.27 0.19 0.2 0.07
0.27 0.58 0.4 -0.06 0.07 -0.21 -0.58 -0.33 0.36 0.14 -0.63 -0.23 -1.15 1.04 -0.2 -0.37 -0.34 0.9 -0.4 -0.56 -0.39 -0.61 1.35 -0.72 -0.85 -0.65 -0.68 -0.14 0.35 -0.09
0.17 0.23 -0.05 -0.23 0.24 -0.14 -0.2 -0.11 -0.02 0.03 -0.05 -0.07 -0.38 0.62 -0.08 -0.13 -0.03 0.36 -0.19 -0.2 -0.06 -0.24 0.67 -0.12 -0.23 -0.23 -0.34 0.11 0.12 -0.14
0.28 0.3 0.08 -0.09 0.37 -0.21 -0.2 -0.28 -0.14 -0.03 -0.21 -0.22 -0.13 0.47 -0.06 -0.22 -0.1 0.38 -0.26 -0.38 -0.15 -0.22 0.72 -0.11 -0.16 -0.2 -0.06 0.03 0.15 -0.06
0.98 0.66 -0.16 -0.48 0.1 -0.14 -0.34 -0.64 -0.15 -0.19 -0.64 -0.51 -0.77 1.05 -0.28 -0.55 -0.62 0.08 -0.63 -0.69 -0.54 -0.5 1.94 -0.3 -0.55 -0.63 -0.73 0.42 0.29 -0.69
1.03 0.48 -0.24 -0.54 0.08 -0.07 -0.21 -0.62 -0.28 -0.16 -0.66 -0.5 -0.63 0.74 0.1 -0.3 -0.7 0.38 -0.73 -0.79 -0.5 -0.42 1.99 -0.21 -0.79 -0.5 -0.63 0.15 0.25 -0.68
0.27 0.27 0.02 -0.39 0.05 0.09 -0.13 -0.26 -0.35 -0.25 -0.36 -0.34 -0.16 0.88 0.07 -0.17 -0.26 0.46 -0.6 -0.58 -0.51 -0.45 1.36 -0.43 -0.43 -0.48 -0.47 0.07 0.22 0.51
0.25 0.09 -0.08 -0.3 0.4 -0.23 -0.21 -0.11 -0.18 0.01 -0.27 -0.32 -0.05 0.54 -0.03 -0.05 -0.14 0.36 -0.15 -0.3 -0.05 -0.15 0.92 -0.26 -0.19 -0.07 0.04 -0.0 -0.1 -0.24
1.56 1.14 -3.87 -4.88 1.79 -1.69 -4.21 -7.18 -4.04 -3.6 -6.09 -5.29 -2.03 1.74 -1.05 -1.85 -2.27 0.87 -4.55 -3.88 -3.04 -4.5 3.57 -2.52 -4.27 -2.49 -3.39 -2.47 -0.51 -0.36
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0.28 0.24 -0.01 -0.41 0.59 0.09 -0.12 -0.19 -0.1 -0.1 -0.25 -0.13 -0.02 0.75 -0.09 -0.4 -0.24 0.26 -0.2 -0.12 -0.23 -0.24 0.82 -0.32 -0.22 -0.21 -0.26 0.13 -0.09 -0.3
0.27 0.3 0.07 -0.01 0.22 -0.12 -0.31 -0.08 -0.22 -0.13 -0.28 -0.33 -0.12 0.47 0.16 0.02 0.01 0.33 -0.25 -0.3 -0.17 -0.19 0.8 -0.21 -0.21 -0.11 -0.16 -0.04 -0.01 -0.13
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0.33 0.2 0.11 -0.27 0.49 -0.03 -0.19 -0.18 -0.09 -0.11 -0.34 -0.24 -0.32 0.57 -0.01 -0.2 -0.2 0.61 -0.4 -0.4 -0.28 -0.28 0.76 -0.17 -0.23 -0.3 -0.41 0.49 -0.02 -0.07
0.22 0.14 -0.02 -0.02 0.15 -0.28 -0.24 0.03 -0.26 0.05 -0.19 -0.26 0.2 0.71 -0.13 -0.1 -0.07 0.42 -0.48 -0.32 -0.14 -0.25 0.96 -0.16 -0.22 -0.35 -0.31 0.19 -0.02 -0.35
0.31 0.07 0.04 0.07 0.48 -0.26 -0.2 -0.08 -0.17 -0.06 -0.31 -0.32 -0.1 0.41 0.08 -0.31 -0.15 0.57 -0.31 -0.42 -0.33 -0.33 1.02 -0.26 -0.3 -0.37 -0.29 0.1 0.26 -0.11
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0.19 0.34 0.02 -0.22 0.24 -0.29 -0.43 -0.36 -0.21 0.04 -0.36 -0.17 -0.18 0.69 -0.13 -0.14 -0.17 0.68 -0.18 -0.21 -0.08 -0.24 0.71 0.02 -0.17 -0.12 -0.01 -0.09 0.06 -0.26
0.32 0.27 -0.06 0.01 0.3 -0.06 -0.07 -0.12 -0.15 -0.18 -0.21 -0.21 -0.09 0.51 0.06 -0.01 0.01 0.16 -0.34 -0.3 -0.24 -0.05 0.85 -0.28 -0.26 -0.33 -0.33 0.13 0.0 -0.15
0.11 0.08 0.05 0.11 0.14 -0.12 -0.52 0.06 -0.03 0.03 -0.27 -0.08 -0.28 0.55 -0.1 -0.22 -0.13 0.41 -0.36 -0.3 -0.09 -0.22 0.7 -0.22 -0.27 -0.07 -0.14 0.0 0.11 0.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.