1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_150 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.52 0.52 0.39 0.3 0.58 0.41 0.31 0.32 0.41 0.48 0.34 0.38 0.27 0.98 0.31 0.3 0.29 0.72 0.36 0.33 0.36 0.32 1.0 0.39 0.34 0.41 0.4 0.48 0.49 0.36
Spov3_C0004.00150 (GlcAT14B)
 0.56 0.56 0.51 0.5 0.61 0.46 0.5 0.56 0.47 0.49 0.53 0.53 0.61 0.76 0.6 0.58 0.54 0.74 0.48 0.46 0.55 0.53 1.0 0.5 0.55 0.54 0.57 0.49 0.53 0.53
0.64 0.58 0.54 0.52 0.64 0.42 0.41 0.34 0.47 0.5 0.37 0.4 0.4 0.79 0.5 0.41 0.45 0.67 0.38 0.38 0.4 0.37 1.0 0.41 0.38 0.4 0.39 0.51 0.55 0.35
0.53 0.54 0.48 0.55 0.6 0.44 0.47 0.54 0.48 0.49 0.44 0.43 0.51 0.79 0.5 0.49 0.54 0.69 0.44 0.39 0.45 0.48 1.0 0.49 0.44 0.48 0.47 0.52 0.42 0.38
0.66 0.65 0.63 0.62 0.83 0.63 0.66 0.71 0.58 0.58 0.63 0.58 0.66 0.86 0.68 0.61 0.64 0.87 0.59 0.59 0.61 0.64 1.0 0.6 0.6 0.57 0.62 0.64 0.63 0.63
0.41 0.42 0.36 0.39 0.37 0.42 0.32 0.41 0.27 0.26 0.3 0.31 0.33 0.66 0.45 0.38 0.39 0.44 0.28 0.27 0.32 0.34 1.0 0.33 0.3 0.27 0.3 0.36 0.45 0.54
0.49 0.39 0.29 0.26 0.4 0.27 0.25 0.21 0.26 0.26 0.26 0.23 0.28 0.61 0.32 0.26 0.27 0.31 0.22 0.25 0.23 0.22 1.0 0.23 0.23 0.23 0.24 0.26 0.31 0.33
0.63 0.67 0.59 0.55 0.72 0.51 0.49 0.62 0.54 0.57 0.5 0.5 0.52 0.74 0.54 0.5 0.52 0.6 0.48 0.49 0.51 0.52 1.0 0.53 0.49 0.53 0.56 0.63 0.62 0.53
0.64 0.63 0.48 0.4 0.61 0.5 0.47 0.39 0.37 0.43 0.37 0.4 0.41 0.8 0.48 0.42 0.41 0.68 0.36 0.32 0.37 0.41 1.0 0.32 0.39 0.34 0.35 0.49 0.56 0.45
0.68 0.67 0.57 0.58 0.53 0.42 0.4 0.38 0.46 0.46 0.35 0.37 0.36 0.73 0.42 0.41 0.38 0.68 0.35 0.35 0.42 0.42 1.0 0.4 0.33 0.37 0.37 0.51 0.59 0.51
0.23 0.18 0.13 0.11 0.29 0.26 0.17 0.23 0.15 0.12 0.12 0.09 0.17 0.58 0.25 0.19 0.24 0.25 0.11 0.1 0.09 0.12 1.0 0.19 0.12 0.15 0.09 0.11 0.25 0.29
0.51 0.5 0.45 0.43 0.49 0.33 0.42 0.51 0.37 0.41 0.44 0.36 0.53 0.76 0.55 0.46 0.46 0.68 0.38 0.36 0.43 0.41 1.0 0.35 0.42 0.4 0.44 0.44 0.43 0.44
0.78 0.59 0.5 0.48 0.65 0.46 0.47 0.38 0.39 0.46 0.38 0.38 0.48 0.79 0.48 0.41 0.38 0.8 0.45 0.36 0.47 0.41 1.0 0.39 0.46 0.43 0.46 0.63 0.53 0.46
0.75 0.66 0.7 0.8 0.62 0.5 0.54 0.63 0.63 0.64 0.62 0.56 0.62 0.76 0.62 0.57 0.67 0.72 0.5 0.52 0.56 0.57 1.0 0.57 0.55 0.56 0.57 0.61 0.59 0.53
0.35 0.35 0.34 0.32 0.38 0.34 0.28 0.29 0.23 0.23 0.21 0.23 0.35 0.69 0.34 0.3 0.31 0.51 0.26 0.24 0.22 0.22 1.0 0.27 0.3 0.25 0.31 0.35 0.42 0.62
0.43 0.42 0.45 0.35 0.63 0.41 0.44 0.49 0.38 0.4 0.39 0.4 0.33 0.62 0.42 0.44 0.39 0.79 0.28 0.31 0.31 0.31 1.0 0.36 0.31 0.39 0.33 0.48 0.48 0.49
0.61 0.65 0.41 0.29 0.66 0.4 0.29 0.26 0.38 0.42 0.31 0.38 0.31 0.99 0.41 0.33 0.33 0.69 0.42 0.34 0.37 0.41 1.0 0.42 0.32 0.3 0.34 0.48 0.5 0.4
0.71 0.68 0.58 0.53 0.72 0.55 0.54 0.5 0.55 0.59 0.54 0.53 0.49 0.79 0.53 0.52 0.53 0.91 0.57 0.52 0.56 0.53 1.0 0.64 0.55 0.56 0.52 0.61 0.59 0.47
0.56 0.64 0.52 0.52 0.62 0.58 0.46 0.5 0.49 0.54 0.44 0.46 0.43 0.89 0.55 0.52 0.51 0.6 0.45 0.43 0.46 0.45 1.0 0.53 0.41 0.5 0.47 0.56 0.59 0.57
0.32 0.43 0.3 0.31 0.48 0.34 0.28 0.31 0.27 0.35 0.24 0.27 0.28 0.59 0.34 0.32 0.3 0.48 0.24 0.17 0.22 0.22 1.0 0.32 0.28 0.28 0.25 0.32 0.39 0.32
0.59 0.6 0.51 0.47 0.63 0.51 0.47 0.49 0.44 0.56 0.48 0.48 0.57 0.81 0.55 0.57 0.59 0.74 0.5 0.47 0.55 0.54 1.0 0.46 0.49 0.51 0.54 0.56 0.53 0.47
0.55 0.47 0.48 0.43 0.44 0.31 0.27 0.32 0.36 0.36 0.33 0.32 0.42 0.7 0.46 0.36 0.38 0.54 0.33 0.27 0.33 0.33 1.0 0.33 0.35 0.3 0.34 0.49 0.46 0.52
0.56 0.54 0.54 0.52 0.73 0.52 0.54 0.6 0.51 0.57 0.52 0.52 0.58 0.86 0.65 0.55 0.59 0.78 0.5 0.51 0.53 0.53 1.0 0.52 0.53 0.57 0.58 0.52 0.55 0.48
0.37 0.42 0.38 0.36 0.53 0.36 0.35 0.37 0.33 0.41 0.36 0.35 0.44 0.67 0.4 0.35 0.4 0.52 0.36 0.34 0.39 0.38 1.0 0.45 0.38 0.39 0.42 0.5 0.39 0.36
0.54 0.48 0.4 0.34 0.42 0.36 0.33 0.32 0.39 0.37 0.34 0.28 0.26 0.66 0.39 0.28 0.32 0.54 0.3 0.28 0.28 0.29 1.0 0.34 0.29 0.33 0.31 0.41 0.42 0.34
Spov3_chr3.04223 (AtHMP52)
 0.34 0.33 0.28 0.22 0.3 0.42 0.29 0.25 0.26 0.27 0.27 0.22 0.24 0.92 0.33 0.31 0.27 0.39 0.25 0.27 0.24 0.24 1.0 0.23 0.17 0.23 0.17 0.3 0.3 0.5
0.59 0.64 0.55 0.38 0.82 0.49 0.36 0.38 0.46 0.48 0.39 0.46 0.4 0.86 0.38 0.41 0.34 0.63 0.42 0.34 0.39 0.46 1.0 0.42 0.38 0.39 0.37 0.64 0.58 0.37
Spov3_chr3.04608 (ATERDJ2A)
 0.67 0.7 0.63 0.64 0.58 0.48 0.51 0.62 0.49 0.56 0.52 0.49 0.54 0.71 0.61 0.59 0.57 0.67 0.51 0.47 0.56 0.53 1.0 0.52 0.49 0.51 0.53 0.58 0.53 0.52
0.55 0.56 0.4 0.35 0.47 0.42 0.36 0.34 0.32 0.37 0.31 0.32 0.36 0.79 0.41 0.37 0.35 0.48 0.29 0.28 0.33 0.33 1.0 0.39 0.33 0.34 0.33 0.53 0.48 0.42
0.58 0.8 0.39 0.28 0.66 0.35 0.25 0.27 0.33 0.39 0.24 0.3 0.29 0.98 0.35 0.33 0.33 0.51 0.26 0.28 0.36 0.31 1.0 0.31 0.23 0.32 0.31 0.43 0.54 0.59
0.63 0.6 0.32 0.26 0.7 0.28 0.3 0.22 0.34 0.32 0.19 0.24 0.27 1.0 0.33 0.3 0.25 0.52 0.24 0.23 0.22 0.26 0.94 0.33 0.38 0.27 0.31 0.5 0.38 0.26
0.73 0.69 0.45 0.41 0.67 0.45 0.35 0.3 0.35 0.42 0.3 0.3 0.42 1.0 0.41 0.43 0.39 0.6 0.37 0.32 0.4 0.36 0.98 0.47 0.39 0.36 0.4 0.54 0.55 0.5
0.47 0.59 0.52 0.38 0.41 0.34 0.26 0.31 0.5 0.43 0.25 0.33 0.18 0.81 0.34 0.3 0.31 0.73 0.3 0.27 0.3 0.26 1.0 0.24 0.22 0.25 0.24 0.36 0.5 0.37
0.71 0.74 0.61 0.54 0.75 0.57 0.55 0.58 0.62 0.64 0.61 0.6 0.48 0.97 0.59 0.58 0.61 0.81 0.55 0.55 0.61 0.53 1.0 0.58 0.54 0.54 0.5 0.68 0.68 0.57
0.74 0.75 0.64 0.57 0.78 0.53 0.53 0.5 0.55 0.59 0.53 0.52 0.55 0.84 0.58 0.52 0.57 0.79 0.51 0.47 0.55 0.52 1.0 0.56 0.54 0.53 0.58 0.62 0.68 0.58
0.51 0.41 0.23 0.19 0.28 0.24 0.21 0.17 0.23 0.23 0.17 0.18 0.15 0.54 0.21 0.18 0.17 0.28 0.17 0.16 0.18 0.18 1.0 0.21 0.18 0.17 0.16 0.35 0.32 0.16
0.51 0.35 0.21 0.17 0.27 0.24 0.22 0.16 0.21 0.23 0.16 0.18 0.16 0.42 0.27 0.2 0.16 0.33 0.15 0.15 0.18 0.19 1.0 0.22 0.15 0.18 0.16 0.28 0.3 0.16
0.47 0.47 0.39 0.3 0.41 0.42 0.36 0.33 0.31 0.33 0.3 0.31 0.35 0.72 0.41 0.35 0.33 0.54 0.26 0.26 0.27 0.29 1.0 0.29 0.29 0.28 0.28 0.41 0.45 0.56
0.63 0.56 0.5 0.43 0.7 0.45 0.46 0.49 0.47 0.53 0.44 0.42 0.51 0.77 0.52 0.51 0.48 0.68 0.48 0.43 0.51 0.48 1.0 0.44 0.46 0.5 0.54 0.53 0.49 0.45
0.25 0.18 0.01 0.0 0.29 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.28 0.04 0.02 0.02 0.15 0.0 0.01 0.01 0.0 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.06 0.07
0.65 0.66 0.58 0.43 0.75 0.52 0.43 0.47 0.48 0.6 0.41 0.47 0.51 0.93 0.51 0.51 0.44 1.0 0.46 0.49 0.5 0.49 0.94 0.61 0.49 0.51 0.51 0.62 0.52 0.48
0.69 0.67 0.56 0.43 0.85 0.6 0.52 0.5 0.53 0.53 0.48 0.52 0.56 0.96 0.53 0.43 0.48 0.68 0.49 0.52 0.49 0.48 1.0 0.45 0.49 0.49 0.47 0.62 0.53 0.46
0.69 0.71 0.6 0.57 0.67 0.53 0.46 0.55 0.49 0.53 0.47 0.46 0.53 0.8 0.64 0.58 0.58 0.72 0.48 0.47 0.51 0.5 1.0 0.5 0.5 0.53 0.52 0.56 0.57 0.53
0.39 0.42 0.36 0.33 0.51 0.32 0.23 0.39 0.26 0.32 0.28 0.33 0.3 0.62 0.37 0.34 0.35 0.44 0.31 0.26 0.29 0.27 1.0 0.28 0.29 0.32 0.35 0.46 0.36 0.37
0.63 0.62 0.51 0.46 0.6 0.49 0.42 0.41 0.54 0.56 0.46 0.47 0.37 0.75 0.46 0.43 0.45 0.61 0.44 0.42 0.47 0.48 1.0 0.46 0.45 0.51 0.52 0.56 0.53 0.41
0.74 0.68 0.63 0.49 0.83 0.58 0.52 0.52 0.55 0.55 0.47 0.5 0.47 0.88 0.58 0.51 0.51 0.9 0.45 0.45 0.49 0.49 1.0 0.52 0.5 0.48 0.44 0.83 0.58 0.56
0.6 0.57 0.51 0.51 0.57 0.43 0.44 0.53 0.43 0.53 0.45 0.43 0.59 0.84 0.47 0.48 0.49 0.69 0.37 0.41 0.47 0.43 1.0 0.46 0.44 0.41 0.42 0.59 0.51 0.4
0.61 0.52 0.51 0.52 0.69 0.41 0.43 0.47 0.44 0.47 0.4 0.4 0.46 0.65 0.52 0.4 0.44 0.73 0.4 0.37 0.39 0.39 1.0 0.41 0.4 0.38 0.4 0.53 0.59 0.46
0.01 0.05 0.12 0.03 0.15 0.06 0.02 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.08 0.64 0.07 0.05 0.05 0.28 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.04 0.27 0.32
0.69 0.77 0.62 0.52 0.72 0.5 0.45 0.48 0.53 0.63 0.48 0.54 0.54 0.99 0.56 0.55 0.54 0.98 0.54 0.53 0.58 0.52 1.0 0.62 0.54 0.56 0.61 0.57 0.64 0.51
0.69 0.67 0.53 0.56 0.68 0.53 0.53 0.51 0.5 0.49 0.48 0.48 0.52 0.79 0.58 0.55 0.56 0.62 0.44 0.45 0.47 0.54 1.0 0.46 0.46 0.44 0.44 0.61 0.56 0.5
0.67 0.65 0.64 0.66 0.68 0.56 0.43 0.64 0.6 0.63 0.51 0.58 0.51 0.9 0.57 0.53 0.56 0.81 0.48 0.5 0.58 0.53 1.0 0.53 0.51 0.59 0.56 0.62 0.66 0.77

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)