Heatmap: Cluster_140 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.27 0.29 -0.39 -0.4 0.3 -0.04 -0.49 -0.11 -0.34 0.39 -0.13 -0.27 -0.06 0.11 -0.51 -0.27 -0.61 0.27 -0.27 -0.72 -0.28 -0.21 0.33 -0.25 0.03 -0.05 0.17 0.33 1.22 0.47
-0.5 0.73 0.42 -0.76 0.14 -0.79 -1.31 -0.17 -0.52 -0.75 -0.23 -0.02 -0.17 0.75 -0.67 -0.62 -0.45 1.35 -0.11 -1.21 0.2 -0.51 -0.01 0.15 -1.15 0.22 0.37 0.14 0.45 0.85
- - - - - - - 3.23 - - - - - - - 3.39 - - - - - - - - - - - - - 3.34
-0.35 0.15 -0.24 0.11 -0.59 0.03 -0.23 0.15 -0.37 -0.26 -0.28 -0.37 0.13 0.39 0.25 0.43 0.42 0.34 -0.05 -0.29 -0.11 -0.3 0.64 -0.07 -0.04 -0.44 -0.25 -0.5 -0.12 0.64
1.06 -0.68 0.15 -1.76 2.57 - -0.4 0.09 - - -1.64 - - -0.74 - -1.73 - 1.19 -1.55 - 0.59 -1.44 - - -0.42 - 0.4 0.29 2.74 1.28
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.98 - - - - - 4.47
-0.46 0.42 -0.26 -0.52 -1.98 -0.87 -1.09 -0.6 -0.68 -0.2 -0.82 -0.78 -0.37 1.19 0.08 -0.17 0.19 0.81 0.2 0.07 0.18 -0.45 1.23 -0.26 -0.54 -0.09 -0.1 -1.1 -0.58 1.59
0.14 -0.33 0.26 0.39 -0.45 -0.3 -0.37 -0.24 -0.22 -0.06 -0.06 -0.48 0.57 -0.12 -0.3 -0.37 -0.23 0.42 -0.1 -0.2 -0.09 -0.17 0.66 -0.27 0.18 -0.3 0.25 -0.13 -0.72 1.04
-0.22 0.18 -0.53 -0.32 -0.04 -0.33 -0.4 0.61 -0.8 -0.13 -0.54 -0.2 0.42 -0.01 -0.81 -0.24 -0.06 1.08 -0.06 0.2 0.27 -0.15 0.17 -0.19 0.01 -0.17 0.11 -0.41 0.02 0.71
0.26 0.44 -0.06 -0.39 0.29 -0.08 -0.25 -0.13 -0.48 -0.01 -0.23 0.12 -0.29 0.16 -0.22 -0.35 0.07 0.68 -0.12 -0.12 -0.1 -0.35 0.14 0.06 0.08 -0.23 -0.33 -0.18 0.15 0.6
- - - - - - - - - - - - - - - 3.96 - - - - - - - - - - - - - 3.86
0.81 0.81 0.56 1.12 0.18 - - 1.25 - - -0.57 - - - -0.56 - - - - -1.05 - - - - - - 0.58 0.28 2.51 3.19
0.38 0.48 -0.04 -0.36 -0.07 -0.1 -0.12 -0.33 -0.22 0.3 -0.24 -0.19 -0.45 0.65 -0.27 -0.2 -0.03 0.31 -0.15 -0.28 0.08 -0.09 -0.58 -0.06 -0.09 0.31 0.09 -0.0 -0.01 0.42
0.56 0.94 0.45 0.28 0.64 0.46 -0.88 -1.04 -0.46 - -2.37 0.71 -0.66 1.14 -0.51 -2.19 - 1.42 -1.03 -0.59 -1.31 -0.73 0.47 -1.31 -1.28 -1.32 -0.1 -1.21 1.17 1.44
2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.23 - - - 2.29 - - -
0.37 0.11 0.09 0.23 0.42 -0.08 -0.22 -0.17 -0.37 -0.13 -0.49 -0.17 -0.13 0.75 -0.15 -0.29 -0.25 0.69 -0.41 -0.38 -0.4 -0.06 0.16 -0.59 -0.26 -0.13 0.06 -0.08 0.19 0.48
-0.88 0.16 -0.18 -2.9 -0.5 1.38 -0.79 0.06 -0.75 -0.7 -0.11 -0.95 -1.38 -0.21 -0.2 0.6 0.01 -0.79 0.3 0.03 -0.75 -1.17 1.88 -0.6 -0.43 -0.8 0.24 -1.14 -0.08 1.58
0.53 -0.87 -0.43 0.33 0.46 -3.17 -0.35 -1.32 -0.75 0.0 -2.03 -0.14 0.91 - -2.16 -2.83 0.23 1.02 -1.99 -2.24 -1.33 -0.57 1.71 -1.14 -0.4 0.66 0.1 -0.8 0.07 2.28
0.1 -0.04 -0.15 0.14 0.29 0.03 -0.24 0.16 0.12 -0.02 -0.08 -0.2 0.05 -0.36 -0.29 -0.24 -0.03 0.1 -0.47 -0.34 -0.22 -0.09 0.23 0.15 0.02 -0.12 -0.0 0.4 0.35 0.27
-0.14 -0.1 -0.14 -0.12 0.23 0.09 -0.02 0.14 -0.09 -0.1 -0.2 -0.08 0.12 -0.03 0.09 -0.02 0.05 0.3 -0.16 -0.04 -0.03 -0.11 0.29 -0.09 -0.01 -0.04 -0.05 -0.16 0.05 0.18
-0.31 -0.3 -0.1 0.16 -0.04 -0.07 -0.04 0.27 -0.2 -0.46 -0.1 -0.48 0.36 -0.71 0.09 0.14 0.07 0.3 0.1 0.12 0.02 -0.08 0.25 -0.02 0.09 0.2 -0.03 -0.42 -0.33 0.71
0.15 0.1 -0.21 -0.29 0.36 -0.06 -0.46 -0.14 -0.24 0.06 -0.19 -0.35 0.25 0.6 -0.21 -0.19 0.02 0.36 -0.05 -0.28 -0.09 -0.27 -0.06 -0.13 -0.07 -0.08 -0.02 0.13 0.16 0.54
-0.18 -0.16 -0.3 0.34 -0.21 -0.45 -0.27 -0.09 -0.11 -0.12 -0.1 -0.19 0.37 0.44 0.38 0.02 0.03 0.89 -0.1 -0.46 -0.06 -0.23 0.97 -0.87 -0.5 0.15 -0.55 -0.46 -0.76 0.59
-2.43 -2.6 -2.61 -0.08 -0.37 -0.22 -1.19 -1.0 -1.37 -1.43 -0.9 -0.37 1.79 0.05 -2.77 -1.0 -1.11 2.43 - -1.75 -0.66 -1.09 2.55 -1.47 - -1.82 -1.91 -1.52 -0.36 1.86
Spov3_chr2.01665 (ATGSTF13)
-0.67 -0.35 -0.22 0.17 -0.41 -0.25 -0.45 0.03 -0.08 -0.42 -0.71 -0.61 1.37 -1.13 -0.37 -0.84 -0.3 0.92 -0.47 0.55 0.24 0.19 0.79 -0.78 -0.35 -0.07 0.2 -0.38 -0.11 0.86
-1.89 1.4 0.15 -1.1 1.37 -0.6 - - -2.12 0.43 -0.93 -1.08 0.31 -1.13 - -1.94 -0.11 1.49 - - 0.3 -0.51 0.22 -1.12 0.23 0.35 1.13 0.1 0.4 1.77
-0.53 -0.03 -0.79 -0.65 -0.32 -0.12 -0.03 0.57 -0.49 0.24 0.09 -0.2 -0.13 -1.36 -0.7 -0.37 -0.98 0.4 0.05 -0.37 -0.13 -0.35 -0.13 0.34 -0.09 0.22 0.04 0.58 0.9 1.27
- - - - - - - - - - - - - - - 2.44 - - - - - - - - - - - 2.43 - 4.26
0.02 0.13 -0.21 -0.44 0.36 -0.09 -0.05 -0.37 -0.16 0.05 -0.04 -0.02 -0.01 0.47 -0.0 -0.09 0.03 0.21 -0.08 -0.24 -0.11 -0.21 -0.02 0.07 -0.13 0.07 -0.07 0.05 0.15 0.32
-0.1 -0.74 -0.08 -1.73 -2.79 0.61 -0.99 -1.47 -2.52 0.11 1.29 - 0.15 - -0.29 - 0.5 - - 0.63 -1.06 -0.4 0.94 -1.09 0.48 0.83 -1.27 -0.06 1.21 2.49
-1.02 -1.04 -1.21 -0.01 -3.28 0.84 -0.24 -0.79 -1.55 -0.42 -1.19 -0.49 0.55 -0.79 -1.31 -0.43 -0.62 1.88 -0.23 -0.83 1.03 -0.98 0.24 -1.19 -0.54 -0.87 -0.65 -0.92 1.28 2.04
Spov3_chr3.01402 (UGT74D1)
-0.29 0.43 -1.58 -0.95 0.83 0.42 -1.67 -1.28 -1.43 -1.73 -0.87 -2.38 -0.22 2.29 0.37 -0.72 -1.32 1.53 -1.37 -0.87 -0.73 -3.55 1.48 -1.03 - - -1.55 -0.15 0.46 1.71
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.87 - - - - - 3.94
-0.06 0.03 -0.87 -0.82 -0.03 0.2 -1.43 -0.01 -1.66 -1.23 -0.88 -0.97 1.03 0.93 -0.88 -0.78 0.09 1.28 -0.9 -1.34 -1.2 -2.04 1.5 -1.27 -1.36 -0.88 -1.13 -0.38 0.19 2.29
Spov3_chr3.03179 (Hsp89.1)
0.11 0.19 -1.1 -0.09 -0.48 0.05 -0.67 -0.36 -0.29 -0.66 0.07 -0.76 0.16 0.98 0.38 -0.12 -0.13 1.0 -0.57 -0.09 -0.19 0.01 0.69 -0.15 -1.48 -0.28 -0.21 -0.58 -0.49 1.29
0.49 0.47 -0.24 0.22 0.09 0.03 -0.2 -0.07 -0.61 0.16 -0.12 -0.41 -0.32 0.1 0.15 -0.09 -0.01 0.6 -0.48 -0.3 -0.16 -0.44 0.29 -0.12 0.06 -0.58 -0.5 0.1 0.23 0.54
Spov3_chr3.03718 (HSP70T-2)
0.13 0.34 -0.78 -0.59 0.3 -0.39 -0.9 -1.02 -0.53 0.32 -0.3 -0.5 0.18 0.98 -0.56 0.08 0.03 0.64 -0.08 -0.44 -0.11 -0.27 -0.13 -0.27 -0.18 0.12 0.39 -0.01 -0.08 1.07
-0.72 -0.84 -1.69 0.01 0.97 -0.28 -0.15 0.41 -0.4 -0.76 -0.03 -0.26 -0.16 -0.78 -1.06 -0.45 -1.1 -0.3 -0.38 -0.04 -1.2 -0.72 0.06 -0.04 -0.12 0.2 -0.04 0.9 1.66 1.32
-0.17 -0.0 -0.14 0.16 0.06 -0.14 -0.2 0.34 -0.15 -0.21 -0.01 -0.06 -0.18 1.07 -0.2 -0.13 -0.01 -0.08 -0.44 -0.29 -0.1 -0.13 0.5 -0.06 -0.09 -0.03 -0.01 0.09 -0.06 -0.17
-0.47 0.65 - -1.78 - -0.44 -1.68 -0.18 0.63 - - 1.07 -0.06 0.12 0.61 2.03 -0.77 - -1.94 -2.02 - -0.43 0.22 0.84 - -1.14 0.95 -0.67 -0.65 2.52
0.95 0.72 -1.94 -1.82 1.23 -0.19 -2.28 -1.27 -2.08 -1.48 -2.09 -2.12 0.08 1.42 -0.62 -1.46 -1.34 2.13 -1.79 -1.4 -1.65 -1.62 2.0 -1.55 -1.73 -1.45 -1.57 -0.67 -0.0 1.67
-0.8 -0.21 -0.48 0.07 -0.28 -0.43 -1.0 0.59 -1.35 -0.58 -0.31 -0.79 0.57 0.68 -0.3 0.07 0.05 1.34 -0.07 -0.18 -0.81 -1.06 1.58 -0.64 -0.94 -0.33 -0.26 -0.73 -0.27 1.11
0.17 0.07 0.08 0.04 0.09 -0.07 -0.0 0.1 -0.01 0.02 -0.02 -0.05 -0.12 0.22 0.04 0.03 -0.04 0.33 -0.15 -0.28 -0.2 -0.11 -0.0 -0.17 -0.06 -0.13 0.0 -0.1 0.06 0.08
0.76 0.39 -1.07 -0.41 0.53 0.04 -0.13 -0.71 -0.83 -1.41 -0.9 -0.9 0.15 0.5 -0.11 -0.31 -0.35 1.06 -0.67 -0.94 -1.12 -1.25 1.57 -0.66 -0.8 -1.19 -1.23 -0.16 0.53 1.69
-0.03 -0.11 -0.6 -0.49 0.32 -0.15 0.11 0.4 -0.3 -0.26 -0.19 -0.18 0.09 0.06 0.1 0.02 -0.12 0.6 -0.03 -0.12 -0.16 -0.18 0.71 -0.32 -0.36 -0.01 0.02 -0.33 0.1 0.46
Spov3_chr4.03501 (CYP735A2)
- -0.4 0.15 -1.42 -0.0 - 0.84 -0.79 -1.59 -0.89 - -1.63 2.42 - -0.06 -2.34 -0.51 1.52 -0.34 -0.23 0.41 -2.6 0.79 -2.69 0.03 0.52 1.95 -1.24 - 0.44
0.11 0.19 0.01 0.6 0.05 0.12 -0.46 -0.14 -1.13 -0.53 -0.37 -0.22 1.1 -0.11 -0.19 -0.47 -0.3 1.0 -1.52 -0.91 -0.85 -0.6 0.5 -0.02 -0.87 -0.43 -0.39 0.81 0.14 0.86
Spov3_chr4.03951 (OSCA1.7)
-0.03 0.12 0.04 -0.28 0.3 0.11 -0.28 -0.27 -0.52 -0.21 -0.48 -0.25 0.07 0.55 0.06 -0.21 -0.17 0.49 -0.48 -0.62 -0.32 -0.19 0.67 -0.19 -0.16 -0.27 -0.24 -0.1 0.31 1.03
1.24 1.68 -1.29 -2.25 0.05 -0.56 -1.49 -1.58 -1.36 0.18 -0.72 -1.39 -1.8 1.15 -1.73 -1.73 -1.14 0.58 -0.66 -1.64 -0.5 -2.07 0.61 -0.75 -2.0 -1.03 -1.08 0.96 1.05 2.21
0.76 1.44 0.47 0.38 -1.79 -1.81 -2.71 -1.65 -1.72 -0.82 -1.85 -1.75 -0.34 1.87 -0.22 -0.75 -0.6 0.74 -0.34 -0.64 -0.42 -1.1 1.33 -1.62 -1.87 -0.75 -1.51 -0.63 0.53 1.77
0.26 -0.71 -1.63 0.17 -1.24 -0.69 -1.45 -0.72 -1.88 -0.81 -0.91 -2.1 1.05 -1.82 -0.17 -0.88 -0.85 1.52 -2.06 -1.14 -2.67 -0.95 1.71 0.39 -0.01 -0.89 -0.65 -1.88 1.35 2.31
-0.55 -0.09 -0.14 -0.56 0.66 -0.23 -1.49 -0.22 -0.34 0.32 -0.12 -0.29 -0.01 0.79 -0.37 -0.41 -0.08 0.61 -0.24 -0.25 0.02 -0.08 0.03 -0.36 -0.02 0.06 0.44 0.26 0.34 0.43
1.29 0.64 -2.04 -1.82 0.3 -2.03 -0.42 -1.29 -2.98 -2.44 -3.46 -3.19 0.31 1.0 -2.29 -1.56 -2.3 1.32 -2.66 -2.66 -4.13 -2.12 2.53 -3.43 -3.04 -1.45 -1.95 -1.15 -1.33 2.96
-1.15 0.17 -1.29 0.24 -0.59 -1.44 -2.23 -0.36 -0.55 0.38 -0.22 -1.4 -0.03 2.17 -1.4 -0.34 -2.79 1.45 -0.68 -0.88 -1.42 -0.49 1.89 -1.91 -0.77 -1.01 1.01 -0.89 0.21 0.07
-0.55 0.31 - - 1.26 -2.78 -0.1 -0.32 - -1.1 - -2.73 0.43 2.57 0.59 -1.49 -0.58 1.18 - 0.55 -0.72 -2.86 3.15 - - - - - - -
-1.9 0.96 -1.17 - 1.03 - - - - - - - 1.52 3.11 - -1.65 - 2.81 - -2.08 - - 1.61 - -0.53 - - 0.17 -1.95 0.12
-2.76 -1.72 -1.92 -3.13 -1.59 -3.1 -0.79 -0.52 -2.86 -0.81 - -1.98 0.69 0.51 -0.14 -1.74 -0.48 -1.08 -2.94 - - -0.68 2.62 -0.18 0.15 -0.66 -0.87 -1.65 -0.52 3.32
0.15 0.34 -0.81 -0.07 0.55 -0.23 -0.45 -0.62 -0.9 0.36 -0.97 -1.33 -0.17 1.31 -0.58 -0.47 -0.62 1.03 -0.51 -1.29 -0.81 -0.59 0.45 -0.03 0.11 0.0 -0.05 0.15 0.34 1.07
-0.07 0.01 -0.38 -0.6 -0.32 -0.01 0.1 -0.39 -0.7 -0.6 -0.32 -0.35 0.9 0.96 0.06 -0.12 0.07 0.37 -0.39 -0.42 -0.43 -0.49 1.12 -0.4 -0.36 -0.32 -0.16 -0.39 -0.34 1.06
-0.24 -0.47 -1.47 -1.1 1.42 0.16 -0.36 0.29 -1.36 -0.75 -1.24 -1.66 0.47 -2.2 -1.78 -1.13 -1.76 1.05 -1.64 -1.45 -1.8 -1.55 0.48 -1.69 -1.92 -1.38 -1.81 0.6 2.12 2.47
1.08 1.02 0.27 -0.42 -0.09 -0.74 -1.62 -2.69 -1.31 -0.43 -0.49 -0.68 0.37 1.66 -1.06 -0.79 -0.83 0.61 -1.17 -0.85 -0.24 -1.19 1.06 -1.61 -1.0 -0.76 -0.87 -0.78 0.6 1.75
- - - - - - - - - - - - - 3.1 - - - - - - - - 4.14 - - - - - - 1.95
0.07 0.05 0.08 0.19 0.4 -0.28 -0.29 -0.08 0.13 -0.17 0.01 -0.15 -0.02 -0.07 -0.08 -0.09 -0.2 0.27 -0.24 -0.17 -0.35 -0.27 0.54 -0.43 -0.22 -0.17 -0.16 0.2 0.33 0.51
2.92 - - - - - - - - - - - - 1.89 - - - - - - - - 4.23 - - - - - - -
-0.22 -0.24 -0.48 0.4 0.4 -0.61 -0.06 -0.2 -0.28 -0.28 -0.34 -0.22 1.11 -0.42 -1.48 -0.33 -0.77 1.17 -0.15 -0.51 -0.35 -0.62 0.04 -0.54 -0.86 -0.41 -0.28 0.48 0.21 1.5
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-0.21 -0.16 -0.1 -0.13 -0.14 -0.32 -0.09 -0.14 -0.07 -0.1 0.06 -0.09 0.25 -0.18 0.19 0.06 0.14 0.16 0.08 -0.01 0.13 -0.01 0.34 -0.06 -0.1 0.05 0.06 -0.31 -0.16 0.49
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0.49 0.31 -0.74 -1.7 0.85 -0.95 -1.47 -1.83 -1.54 -0.44 -0.83 -0.8 0.54 1.1 -1.6 -1.06 -1.12 0.36 -0.51 -1.23 -0.67 -0.26 0.83 0.27 0.01 -0.42 -0.08 -0.1 0.16 2.26
- - - - - - - - - - - - - 3.65 - - - 2.19 - - - - 3.69 - - - - - - -
0.06 0.13 0.03 0.42 0.02 -0.24 -0.03 0.12 -0.16 -0.38 -0.08 -0.18 -0.0 -0.05 -0.03 -0.22 -0.19 -0.43 -0.26 -0.34 0.0 -0.08 0.49 -0.25 -0.17 -0.02 0.12 -0.03 0.28 0.76
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-0.44 -0.43 0.3 0.78 -0.31 -0.36 -1.88 -1.65 -0.45 -0.3 -0.99 -0.42 0.13 0.27 -0.43 -0.65 0.32 1.7 -1.3 -4.33 -1.11 -0.49 1.84 -2.19 -0.97 -1.15 -1.06 -0.27 -0.02 1.9
- 1.5 0.44 - 0.39 - - - - - - - 0.5 0.4 - - - 2.22 - - - - 0.32 - - 0.29 - 2.02 2.04 2.69
0.06 0.08 0.11 0.3 0.0 -0.5 -0.32 0.29 -0.21 0.03 -0.12 -0.15 0.12 0.44 -0.28 -0.24 -0.47 -0.61 -0.08 -0.16 -0.14 0.07 0.48 -0.32 -0.02 -0.08 0.19 0.12 0.12 0.51

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.