1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_140 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.36 0.52 0.33 0.32 0.53 0.42 0.31 0.4 0.34 0.56 0.39 0.36 0.41 0.46 0.3 0.35 0.28 0.52 0.35 0.26 0.35 0.37 0.54 0.36 0.44 0.41 0.48 0.54 1.0 0.59
0.28 0.65 0.53 0.23 0.43 0.23 0.16 0.35 0.27 0.23 0.34 0.39 0.35 0.66 0.25 0.26 0.29 1.0 0.36 0.17 0.45 0.28 0.39 0.44 0.18 0.46 0.51 0.43 0.54 0.71
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96
0.5 0.71 0.54 0.69 0.43 0.66 0.55 0.71 0.5 0.54 0.53 0.5 0.7 0.84 0.77 0.87 0.86 0.81 0.62 0.53 0.59 0.52 1.0 0.61 0.62 0.47 0.54 0.46 0.59 1.0
0.31 0.09 0.17 0.04 0.89 0.0 0.11 0.16 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.09 0.0 0.05 0.0 0.34 0.05 0.0 0.23 0.06 0.0 0.0 0.11 0.0 0.2 0.18 1.0 0.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.24 0.44 0.28 0.23 0.08 0.18 0.16 0.22 0.21 0.29 0.19 0.19 0.26 0.76 0.35 0.3 0.38 0.58 0.38 0.35 0.38 0.24 0.78 0.28 0.23 0.31 0.31 0.16 0.22 1.0
0.54 0.39 0.58 0.63 0.35 0.4 0.38 0.41 0.42 0.46 0.46 0.35 0.72 0.45 0.39 0.37 0.41 0.65 0.45 0.42 0.46 0.43 0.77 0.4 0.55 0.39 0.58 0.44 0.29 1.0
0.41 0.54 0.33 0.38 0.46 0.38 0.36 0.72 0.27 0.43 0.33 0.41 0.63 0.47 0.27 0.4 0.45 1.0 0.45 0.55 0.57 0.43 0.53 0.41 0.48 0.42 0.51 0.36 0.48 0.77
0.75 0.84 0.6 0.48 0.76 0.59 0.53 0.57 0.45 0.62 0.53 0.68 0.51 0.7 0.54 0.49 0.65 1.0 0.57 0.57 0.58 0.49 0.68 0.65 0.66 0.53 0.5 0.55 0.69 0.94
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93
0.19 0.19 0.16 0.24 0.12 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.13 0.62 1.0
0.83 0.89 0.62 0.5 0.61 0.59 0.59 0.51 0.55 0.78 0.54 0.56 0.47 1.0 0.53 0.55 0.62 0.79 0.57 0.53 0.67 0.6 0.43 0.61 0.6 0.79 0.68 0.64 0.63 0.85
0.54 0.71 0.5 0.45 0.57 0.51 0.2 0.18 0.27 0.0 0.07 0.6 0.23 0.81 0.26 0.08 0.0 0.99 0.18 0.24 0.15 0.22 0.51 0.15 0.15 0.15 0.34 0.16 0.83 1.0
0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0
0.77 0.64 0.63 0.7 0.8 0.56 0.51 0.53 0.46 0.54 0.42 0.53 0.54 1.0 0.54 0.48 0.5 0.96 0.45 0.46 0.45 0.57 0.66 0.39 0.5 0.54 0.62 0.56 0.68 0.83
0.15 0.3 0.24 0.04 0.19 0.71 0.16 0.28 0.16 0.17 0.25 0.14 0.1 0.23 0.24 0.41 0.27 0.16 0.33 0.28 0.16 0.12 1.0 0.18 0.2 0.16 0.32 0.12 0.26 0.81
0.3 0.11 0.15 0.26 0.28 0.02 0.16 0.08 0.12 0.21 0.05 0.19 0.39 0.0 0.05 0.03 0.24 0.42 0.05 0.04 0.08 0.14 0.67 0.09 0.16 0.33 0.22 0.12 0.22 1.0
0.81 0.74 0.68 0.84 0.93 0.78 0.64 0.85 0.82 0.75 0.72 0.66 0.79 0.59 0.62 0.64 0.75 0.81 0.55 0.6 0.65 0.71 0.89 0.84 0.77 0.7 0.76 1.0 0.97 0.92
0.74 0.76 0.74 0.75 0.95 0.87 0.8 0.9 0.76 0.76 0.71 0.77 0.88 0.8 0.86 0.8 0.84 1.0 0.73 0.79 0.8 0.75 0.99 0.76 0.81 0.79 0.78 0.73 0.84 0.92
0.49 0.5 0.57 0.68 0.6 0.58 0.59 0.74 0.53 0.45 0.57 0.44 0.78 0.37 0.65 0.67 0.64 0.75 0.65 0.66 0.62 0.58 0.73 0.61 0.65 0.7 0.6 0.46 0.49 1.0
0.73 0.71 0.57 0.54 0.85 0.63 0.48 0.6 0.56 0.69 0.58 0.52 0.78 1.0 0.57 0.58 0.67 0.85 0.64 0.54 0.62 0.55 0.63 0.6 0.63 0.62 0.65 0.72 0.73 0.96
0.45 0.46 0.41 0.65 0.44 0.37 0.43 0.48 0.47 0.47 0.48 0.45 0.66 0.7 0.67 0.52 0.52 0.95 0.48 0.37 0.49 0.44 1.0 0.28 0.36 0.57 0.35 0.37 0.3 0.77
0.03 0.03 0.03 0.16 0.13 0.15 0.07 0.09 0.07 0.06 0.09 0.13 0.59 0.18 0.03 0.09 0.08 0.92 0.0 0.05 0.11 0.08 1.0 0.06 0.0 0.05 0.05 0.06 0.13 0.62
Spov3_chr2.01665 (ATGSTF13)
 0.24 0.3 0.33 0.44 0.29 0.33 0.28 0.39 0.37 0.29 0.24 0.25 1.0 0.18 0.3 0.22 0.31 0.73 0.28 0.57 0.46 0.44 0.67 0.22 0.3 0.37 0.44 0.3 0.36 0.7
0.08 0.77 0.33 0.14 0.76 0.19 0.0 0.0 0.07 0.4 0.15 0.14 0.36 0.13 0.0 0.08 0.27 0.83 0.0 0.0 0.36 0.21 0.34 0.14 0.34 0.37 0.64 0.32 0.39 1.0
0.29 0.41 0.24 0.26 0.33 0.38 0.41 0.62 0.3 0.49 0.44 0.36 0.38 0.16 0.26 0.32 0.21 0.55 0.43 0.32 0.38 0.33 0.38 0.53 0.39 0.48 0.43 0.62 0.78 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 1.0
0.73 0.79 0.62 0.53 0.92 0.68 0.7 0.56 0.65 0.75 0.7 0.71 0.72 1.0 0.72 0.68 0.74 0.84 0.68 0.61 0.67 0.62 0.71 0.76 0.66 0.76 0.69 0.75 0.8 0.9
0.17 0.11 0.17 0.05 0.03 0.27 0.09 0.06 0.03 0.19 0.44 0.0 0.2 0.0 0.15 0.0 0.25 0.0 0.0 0.28 0.09 0.13 0.34 0.08 0.25 0.32 0.07 0.17 0.41 1.0
0.12 0.12 0.1 0.24 0.02 0.43 0.21 0.14 0.08 0.18 0.11 0.17 0.35 0.14 0.1 0.18 0.16 0.89 0.21 0.14 0.49 0.12 0.29 0.11 0.17 0.13 0.15 0.13 0.59 1.0
Spov3_chr3.01402 (UGT74D1)
 0.17 0.28 0.07 0.11 0.36 0.27 0.06 0.08 0.08 0.06 0.11 0.04 0.18 1.0 0.26 0.12 0.08 0.59 0.08 0.11 0.12 0.02 0.57 0.1 0.0 0.0 0.07 0.18 0.28 0.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.2 0.21 0.11 0.12 0.2 0.23 0.08 0.2 0.06 0.09 0.11 0.1 0.42 0.39 0.11 0.12 0.22 0.5 0.11 0.08 0.09 0.05 0.58 0.08 0.08 0.11 0.09 0.16 0.23 1.0
Spov3_chr3.03179 (Hsp89.1)
 0.44 0.47 0.19 0.38 0.29 0.42 0.26 0.32 0.33 0.26 0.43 0.24 0.46 0.8 0.53 0.38 0.37 0.82 0.27 0.38 0.36 0.41 0.66 0.37 0.15 0.34 0.35 0.27 0.29 1.0
0.92 0.91 0.56 0.76 0.7 0.67 0.57 0.63 0.43 0.74 0.61 0.5 0.53 0.71 0.73 0.62 0.65 1.0 0.47 0.54 0.59 0.48 0.8 0.6 0.68 0.44 0.47 0.71 0.77 0.96
Spov3_chr3.03718 (HSP70T-2)
 0.52 0.6 0.28 0.32 0.59 0.36 0.25 0.23 0.33 0.59 0.39 0.34 0.54 0.93 0.32 0.5 0.49 0.74 0.45 0.35 0.44 0.39 0.43 0.39 0.42 0.52 0.62 0.47 0.45 1.0
0.19 0.18 0.1 0.32 0.62 0.26 0.28 0.42 0.24 0.19 0.31 0.26 0.28 0.18 0.15 0.23 0.15 0.26 0.24 0.31 0.14 0.19 0.33 0.31 0.29 0.36 0.31 0.59 1.0 0.79
0.42 0.47 0.43 0.53 0.5 0.43 0.41 0.6 0.43 0.41 0.47 0.45 0.42 1.0 0.41 0.44 0.47 0.45 0.35 0.39 0.44 0.43 0.67 0.46 0.45 0.46 0.47 0.5 0.46 0.42
0.13 0.27 0.0 0.05 0.0 0.13 0.05 0.15 0.27 0.0 0.0 0.37 0.17 0.19 0.27 0.72 0.1 0.0 0.05 0.04 0.0 0.13 0.2 0.31 0.0 0.08 0.34 0.11 0.11 1.0
0.44 0.38 0.06 0.06 0.54 0.2 0.05 0.09 0.05 0.08 0.05 0.05 0.24 0.61 0.15 0.08 0.09 1.0 0.07 0.09 0.07 0.07 0.91 0.08 0.07 0.08 0.08 0.14 0.23 0.73
0.19 0.29 0.24 0.35 0.27 0.25 0.17 0.5 0.13 0.22 0.27 0.19 0.5 0.53 0.27 0.35 0.35 0.85 0.32 0.29 0.19 0.16 1.0 0.21 0.17 0.27 0.28 0.2 0.28 0.72
0.9 0.84 0.84 0.82 0.85 0.76 0.79 0.85 0.79 0.81 0.78 0.77 0.73 0.92 0.82 0.81 0.77 1.0 0.72 0.65 0.69 0.74 0.79 0.71 0.76 0.73 0.8 0.74 0.83 0.84
0.52 0.41 0.15 0.23 0.45 0.32 0.28 0.19 0.17 0.12 0.17 0.17 0.35 0.44 0.29 0.25 0.24 0.65 0.19 0.16 0.14 0.13 0.92 0.2 0.18 0.14 0.13 0.28 0.45 1.0
0.6 0.57 0.4 0.44 0.76 0.55 0.66 0.81 0.5 0.51 0.54 0.54 0.65 0.64 0.66 0.62 0.57 0.93 0.6 0.56 0.55 0.54 1.0 0.49 0.48 0.61 0.62 0.49 0.65 0.84
Spov3_chr4.03501 (CYP735A2)
 0.0 0.14 0.21 0.07 0.19 0.0 0.33 0.11 0.06 0.1 0.0 0.06 1.0 0.0 0.18 0.04 0.13 0.54 0.15 0.16 0.25 0.03 0.32 0.03 0.19 0.27 0.72 0.08 0.0 0.25
0.5 0.53 0.47 0.7 0.48 0.51 0.34 0.42 0.21 0.32 0.36 0.4 1.0 0.43 0.41 0.34 0.38 0.93 0.16 0.25 0.26 0.31 0.66 0.46 0.25 0.35 0.36 0.82 0.52 0.85
Spov3_chr4.03951 (OSCA1.7)
 0.48 0.53 0.5 0.4 0.61 0.53 0.4 0.41 0.34 0.43 0.35 0.41 0.52 0.72 0.51 0.43 0.44 0.69 0.35 0.32 0.39 0.43 0.78 0.43 0.44 0.41 0.42 0.46 0.61 1.0
0.51 0.7 0.09 0.05 0.22 0.15 0.08 0.07 0.08 0.25 0.13 0.08 0.06 0.48 0.07 0.07 0.1 0.32 0.14 0.07 0.15 0.05 0.33 0.13 0.05 0.11 0.1 0.42 0.45 1.0
0.46 0.74 0.38 0.36 0.08 0.08 0.04 0.09 0.08 0.15 0.08 0.08 0.22 1.0 0.24 0.16 0.18 0.46 0.22 0.17 0.2 0.13 0.69 0.09 0.07 0.16 0.1 0.18 0.39 0.93
0.24 0.12 0.07 0.23 0.09 0.13 0.07 0.12 0.06 0.12 0.11 0.05 0.42 0.06 0.18 0.11 0.11 0.58 0.05 0.09 0.03 0.1 0.66 0.26 0.2 0.11 0.13 0.05 0.52 1.0
0.39 0.54 0.52 0.39 0.91 0.49 0.21 0.5 0.46 0.72 0.53 0.47 0.57 1.0 0.45 0.43 0.55 0.88 0.49 0.48 0.58 0.55 0.59 0.45 0.57 0.6 0.78 0.69 0.73 0.78
0.31 0.2 0.03 0.04 0.16 0.03 0.1 0.05 0.02 0.02 0.01 0.01 0.16 0.26 0.03 0.04 0.03 0.32 0.02 0.02 0.01 0.03 0.74 0.01 0.02 0.05 0.03 0.06 0.05 1.0
0.1 0.25 0.09 0.26 0.15 0.08 0.05 0.17 0.15 0.29 0.19 0.08 0.22 1.0 0.08 0.18 0.03 0.61 0.14 0.12 0.08 0.16 0.83 0.06 0.13 0.11 0.45 0.12 0.26 0.23
0.08 0.14 0.0 0.0 0.27 0.02 0.11 0.09 0.0 0.05 0.0 0.02 0.15 0.67 0.17 0.04 0.08 0.25 0.0 0.17 0.07 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.22 0.05 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 1.0 0.0 0.04 0.0 0.81 0.0 0.03 0.0 0.0 0.35 0.0 0.08 0.0 0.0 0.13 0.03 0.13
0.01 0.03 0.03 0.01 0.03 0.01 0.06 0.07 0.01 0.06 0.0 0.03 0.16 0.14 0.09 0.03 0.07 0.05 0.01 0.0 0.0 0.06 0.62 0.09 0.11 0.06 0.05 0.03 0.07 1.0
0.45 0.51 0.23 0.38 0.59 0.34 0.29 0.26 0.22 0.52 0.21 0.16 0.36 1.0 0.27 0.29 0.26 0.82 0.28 0.16 0.23 0.27 0.55 0.39 0.43 0.4 0.39 0.45 0.51 0.85
0.44 0.47 0.36 0.3 0.37 0.46 0.49 0.35 0.28 0.3 0.37 0.36 0.86 0.9 0.48 0.42 0.48 0.6 0.35 0.35 0.34 0.33 1.0 0.35 0.36 0.37 0.41 0.35 0.36 0.96
0.15 0.13 0.07 0.08 0.48 0.2 0.14 0.22 0.07 0.11 0.08 0.06 0.25 0.04 0.05 0.08 0.05 0.37 0.06 0.07 0.05 0.06 0.25 0.06 0.05 0.07 0.05 0.27 0.78 1.0
0.63 0.6 0.36 0.22 0.28 0.18 0.1 0.05 0.12 0.22 0.21 0.19 0.38 0.94 0.14 0.17 0.17 0.45 0.13 0.16 0.25 0.13 0.62 0.1 0.15 0.18 0.16 0.17 0.45 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22
0.72 0.71 0.72 0.78 0.91 0.56 0.56 0.65 0.75 0.61 0.69 0.62 0.68 0.65 0.65 0.65 0.59 0.83 0.58 0.61 0.54 0.57 1.0 0.51 0.59 0.61 0.61 0.79 0.86 0.97
0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.3 0.25 0.46 0.47 0.23 0.34 0.31 0.29 0.29 0.28 0.3 0.76 0.26 0.13 0.28 0.21 0.79 0.32 0.25 0.28 0.23 0.36 0.24 0.19 0.27 0.29 0.49 0.41 1.0
0.75 0.73 0.61 0.68 0.87 0.67 0.6 0.75 0.55 0.64 0.6 0.6 0.75 1.0 0.68 0.69 0.69 0.84 0.62 0.54 0.65 0.66 0.78 0.58 0.6 0.63 0.63 0.68 0.72 0.81
0.29 0.21 0.09 0.51 0.36 0.35 0.19 0.0 0.09 0.0 0.29 0.09 0.19 0.37 0.35 0.0 0.47 1.0 0.18 0.09 0.4 0.0 0.25 0.0 0.33 0.0 0.08 0.3 0.71 0.5
0.62 0.64 0.66 0.65 0.64 0.57 0.67 0.65 0.68 0.66 0.74 0.67 0.85 0.63 0.81 0.74 0.79 0.8 0.75 0.71 0.78 0.71 0.9 0.68 0.66 0.74 0.74 0.58 0.64 1.0
0.18 0.62 0.04 0.1 0.37 0.04 0.06 0.04 0.11 0.06 0.03 0.06 0.02 0.15 0.08 0.03 0.05 1.0 0.09 0.06 0.1 0.03 0.25 0.02 0.02 0.04 0.04 0.08 0.37 0.55
0.0 0.02 0.07 0.03 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.06 0.05 0.09 0.06 0.03 0.16 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.29 0.26 0.12 0.06 0.38 0.11 0.08 0.06 0.07 0.15 0.12 0.12 0.3 0.45 0.07 0.1 0.1 0.27 0.15 0.09 0.13 0.17 0.37 0.25 0.21 0.16 0.2 0.19 0.23 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.61 0.64 0.6 0.79 0.6 0.5 0.58 0.64 0.53 0.45 0.56 0.52 0.59 0.57 0.58 0.5 0.52 0.44 0.49 0.47 0.59 0.56 0.82 0.5 0.52 0.58 0.64 0.58 0.72 1.0
0.04 0.0 0.0 0.14 0.0 0.11 0.09 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.21 0.77 0.06 0.0 0.06 0.95 0.0 0.0 0.0 0.05 1.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.04 0.03
0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.2 0.2 0.33 0.46 0.22 0.21 0.07 0.09 0.2 0.22 0.13 0.2 0.29 0.32 0.2 0.17 0.33 0.87 0.11 0.01 0.12 0.19 0.96 0.06 0.14 0.12 0.13 0.22 0.26 1.0
0.0 0.44 0.21 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.2 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.19 0.0 0.63 0.63 1.0
0.73 0.74 0.76 0.87 0.7 0.5 0.56 0.85 0.61 0.72 0.65 0.63 0.76 0.95 0.58 0.59 0.51 0.46 0.66 0.63 0.64 0.74 0.98 0.56 0.69 0.66 0.8 0.76 0.76 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)