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Heatmap: Cluster_161 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.25 0.27 0.03 -0.13 0.27 0.0 0.12 0.27 -0.1 -0.08 -0.13 -0.03 -0.17 0.24 -0.03 -0.03 -0.11 -0.5 -0.1 -0.17 -0.03 -0.03 -0.33 0.09 -0.08 -0.0 0.06 0.28 0.06 -0.22
-0.02 -0.01 0.08 0.17 -0.35 -0.05 0.11 0.41 0.13 0.01 0.07 0.12 0.05 -0.11 0.12 0.14 0.1 -0.75 -0.27 -0.12 -0.14 -0.06 -0.05 0.03 -0.05 -0.08 -0.0 0.08 0.06 0.02
0.11 0.13 0.01 -0.01 0.3 -0.07 -0.15 -0.14 0.17 0.23 0.0 0.16 -0.15 0.01 -0.24 0.02 -0.04 -0.41 -0.05 0.06 -0.0 0.07 -0.41 0.12 0.08 0.07 0.08 0.12 0.01 -0.37
-0.04 0.11 -0.18 -0.09 0.04 0.12 0.13 0.08 0.02 0.0 0.09 0.06 -0.05 0.11 0.1 0.23 0.1 -0.72 0.06 0.08 0.02 -0.04 -0.43 0.18 -0.02 0.02 0.01 -0.06 0.01 -0.28
0.01 -0.12 -0.06 -0.2 -0.02 -0.03 -0.05 -0.29 0.15 0.12 0.13 0.15 -0.12 0.55 -0.08 -0.08 -0.05 -0.77 0.03 0.04 0.08 0.09 -0.35 0.12 0.03 0.14 0.06 0.23 -0.07 -0.1
0.08 -0.07 -0.13 -0.1 0.06 -0.18 0.25 -0.42 0.07 -0.01 0.06 -0.13 -0.14 0.77 0.09 -0.05 -0.07 -0.31 0.13 -0.01 -0.02 -0.06 -0.31 -0.19 0.11 0.05 0.18 0.11 0.01 -0.26
0.21 0.01 -0.1 0.12 0.12 -0.02 0.01 -0.19 0.02 0.1 -0.01 0.01 0.06 0.28 0.13 0.08 0.02 -0.35 -0.13 -0.26 -0.12 -0.11 -0.22 0.0 0.04 -0.05 0.08 0.31 0.01 -0.28
0.19 0.02 -0.11 -0.27 -0.07 -0.06 -0.01 -0.04 0.03 0.05 0.03 0.07 -0.14 0.28 0.15 0.07 0.1 -0.66 -0.1 -0.09 0.05 0.02 -0.14 0.14 0.01 0.04 0.0 0.17 0.12 -0.09
0.48 0.34 0.34 -0.03 -0.24 0.43 0.7 0.35 0.06 -0.11 -0.01 0.35 -0.79 0.32 0.23 0.06 -0.1 -2.23 0.19 -0.12 -0.24 0.02 -1.94 -0.32 -0.34 -0.24 -0.34 0.06 0.42 -0.34
0.46 0.22 0.02 -0.25 -0.68 0.42 0.74 -0.05 0.17 0.27 -0.09 0.22 -0.78 0.38 0.54 0.31 0.08 -2.57 -0.19 -0.13 -0.53 0.37 -1.7 -0.14 -0.26 -0.1 -0.19 0.22 0.48 -0.82
0.14 -0.16 -0.11 -0.13 0.13 0.08 -0.03 -0.11 -0.03 0.06 -0.03 -0.01 -0.05 0.36 0.23 0.1 0.19 -0.27 -0.07 -0.06 -0.02 -0.17 -0.3 0.09 0.05 0.01 0.1 0.21 -0.08 -0.41
0.01 0.22 0.0 0.11 0.06 -0.1 -0.17 0.13 -0.0 0.14 0.05 0.03 0.19 0.47 -0.06 0.03 0.11 -0.41 -0.05 -0.3 0.01 -0.23 -0.37 -0.01 -0.04 -0.17 0.01 0.26 -0.15 -0.12
Spov3_chr1.03784 (AtEAF1B)
 -0.08 -0.23 -0.33 -0.33 0.04 0.09 0.22 -0.24 0.08 0.16 0.14 0.13 -0.06 0.59 0.14 0.17 0.14 -0.36 0.12 -0.07 0.09 0.06 -0.37 -0.15 0.04 0.02 0.02 -0.12 -0.14 -0.22
0.03 -0.08 -0.17 -0.27 0.12 -0.01 0.07 -0.17 0.16 0.04 0.02 0.05 -0.09 0.33 0.08 0.1 0.04 -0.31 0.1 0.04 0.05 0.02 -0.13 0.03 0.12 0.14 0.17 -0.11 -0.16 -0.46
Spov3_chr1.03834 (COR413-PM2)
 -0.15 -0.27 0.21 0.34 0.34 -0.07 -0.18 0.17 0.56 0.43 0.29 0.03 -0.28 -0.28 0.11 0.14 0.18 -0.68 -0.04 -0.09 0.04 -0.14 -0.97 -0.36 -0.1 0.12 0.15 0.07 -0.01 -0.61
-0.35 -1.24 0.41 0.1 1.12 -0.13 -0.02 0.26 0.7 0.44 0.24 0.27 0.11 -0.08 -0.64 -0.31 0.05 -1.3 0.0 -0.12 0.37 -0.06 -1.09 -0.64 -0.19 -0.16 0.27 -0.04 0.1 -0.87
0.01 -0.12 0.08 -0.24 0.41 -0.0 0.39 0.26 0.18 0.34 0.46 0.14 -0.17 -0.3 -0.59 -0.52 -0.11 -0.94 0.41 0.07 0.15 -0.06 -0.7 0.05 0.1 0.01 0.04 -0.16 0.17 -0.5
-0.02 -0.23 -0.15 0.01 0.59 0.06 0.09 -0.1 0.34 0.28 0.38 0.2 -0.15 -0.46 -0.41 0.1 -0.08 -1.62 0.16 -0.04 0.15 0.11 -1.04 0.21 0.18 0.28 0.27 -0.2 -0.03 -0.46
0.11 0.12 -0.03 -0.14 0.24 0.04 -0.09 -0.25 -0.05 0.01 -0.0 -0.01 -0.03 0.5 0.17 0.06 0.14 -0.4 0.0 -0.18 -0.07 -0.04 -0.48 -0.16 -0.08 -0.0 0.03 0.09 0.25 -0.09
Spov3_chr2.00029 (GSM2-LIKE)
 0.19 0.15 -0.02 -0.26 0.33 -0.0 -0.14 -0.17 0.0 0.12 -0.01 0.06 0.16 0.51 0.13 0.02 0.14 -0.33 -0.05 0.01 -0.05 -0.09 -0.48 -0.0 -0.1 0.01 -0.01 -0.08 -0.08 -0.32
0.02 0.01 -0.07 -0.07 0.14 0.13 0.12 -0.01 0.01 0.03 -0.01 -0.02 0.05 0.16 0.25 0.19 0.24 -0.09 -0.06 -0.16 -0.04 -0.06 -0.28 -0.07 -0.02 -0.05 0.02 0.08 -0.16 -0.5
0.14 0.06 -0.08 -0.11 -0.41 0.02 0.19 0.16 0.15 0.02 0.16 0.3 0.06 -0.03 0.17 -0.01 -0.04 -0.59 -0.18 -0.1 -0.16 0.03 -0.26 0.15 -0.05 -0.06 -0.1 0.1 0.15 0.0
-0.45 -0.59 -0.47 -0.86 0.77 0.19 -0.3 -0.8 -0.04 0.47 0.03 -0.18 -0.22 0.88 0.32 0.28 0.1 -0.45 -0.16 -0.33 0.23 -0.01 0.05 -0.06 0.0 0.37 0.47 -0.2 -0.45 -0.44
0.08 -0.05 0.02 -0.01 -0.13 -0.03 0.14 0.17 0.24 0.1 0.13 0.16 -0.04 -0.05 -0.06 -0.08 -0.09 -0.79 -0.14 -0.14 -0.06 -0.06 -0.09 -0.04 -0.01 -0.08 0.01 0.25 0.25 0.05
0.1 0.02 -0.11 -0.29 0.02 -0.13 0.09 -0.02 0.21 0.26 0.16 0.16 0.17 0.08 -0.1 -0.03 -0.01 -0.4 -0.05 0.0 -0.02 -0.05 -0.28 0.09 0.18 0.04 0.04 -0.06 -0.06 -0.22
0.29 0.34 0.04 -0.15 -0.14 0.16 0.06 -0.25 0.21 0.19 0.07 0.15 -0.34 0.26 0.15 0.25 0.1 -0.64 -0.1 -0.16 0.04 -0.08 -0.77 0.08 -0.14 0.11 0.03 -0.08 0.09 -0.42
Spov3_chr3.00727 (ALDH3F1)
 -0.16 -0.21 -0.06 -0.34 0.43 0.09 -0.07 0.07 0.03 0.04 0.12 -0.01 0.01 0.27 0.16 0.27 0.28 -0.14 -0.15 -0.04 0.15 0.01 -0.57 -0.02 0.11 0.02 0.18 -0.03 -0.24 -0.75
-0.03 0.06 -0.06 -0.23 0.18 0.04 0.07 -0.07 0.16 0.18 0.12 0.18 0.06 0.24 -0.12 0.06 -0.04 -0.3 -0.05 -0.15 0.05 0.02 -0.35 -0.05 0.06 0.02 0.0 -0.05 0.03 -0.25
0.34 0.45 0.1 -0.14 -0.46 -0.05 0.05 -0.42 0.36 0.37 0.12 0.2 -0.53 -0.03 0.01 -0.03 0.03 -0.84 -0.2 -0.24 -0.04 -0.1 0.03 -0.09 -0.04 0.19 0.17 0.12 0.09 -0.17
0.15 0.18 -0.13 -0.34 0.19 0.0 -0.07 -0.19 -0.17 0.0 0.02 -0.07 0.12 0.62 0.03 0.07 0.12 -0.62 -0.22 -0.33 -0.07 -0.01 -0.52 0.1 0.21 -0.04 0.02 0.25 0.09 0.04
0.2 0.24 -0.13 -0.06 0.21 -0.05 -0.08 -0.1 0.01 0.11 0.16 0.09 -0.1 0.5 0.06 -0.02 -0.01 -0.59 -0.19 -0.26 -0.08 -0.05 -0.52 -0.06 0.07 -0.03 0.07 0.32 0.03 -0.18
0.17 0.16 0.1 0.13 -0.27 -0.3 -0.16 0.33 0.23 0.25 -0.02 -0.01 -0.21 -0.29 -0.19 -0.31 -0.05 -0.27 -0.02 -0.01 -0.01 -0.02 0.11 -0.02 0.05 0.08 0.01 0.18 0.04 0.02
0.51 0.47 0.16 0.06 -1.38 -0.47 -0.03 -0.04 0.51 0.41 0.32 0.38 -0.81 -0.14 -0.21 -0.28 -0.06 -1.56 0.23 0.02 -0.05 0.02 -1.23 0.16 0.02 0.26 0.2 -0.07 -0.02 0.23
0.0 -0.01 -0.13 -0.04 0.23 -0.11 -0.05 -0.07 0.13 0.07 0.05 -0.08 -0.19 0.33 0.01 0.06 0.18 -0.3 0.07 -0.14 0.0 0.04 -0.21 0.09 0.18 0.13 0.2 -0.21 -0.16 -0.34
0.23 0.19 0.25 0.24 -0.3 -0.31 0.05 0.1 0.14 0.2 0.05 0.05 -0.36 -0.34 -0.13 -0.18 -0.09 -0.62 -0.1 -0.05 0.0 -0.03 0.14 0.0 0.11 0.21 0.18 0.18 -0.01 -0.22
-0.22 -0.35 -0.2 -0.44 -0.18 0.56 0.29 -0.13 0.28 0.1 0.15 0.22 -0.07 0.11 0.61 0.26 0.03 -0.86 0.22 0.28 0.06 -0.0 -1.14 0.08 0.12 0.09 -0.24 -0.06 -0.12 -0.78
0.62 0.61 0.23 -0.18 -0.09 -0.35 -0.04 -0.34 0.25 0.49 -0.06 -0.04 -0.52 0.73 -0.31 -0.19 -0.24 -0.31 -0.14 -0.61 0.01 -0.05 -0.73 0.35 -0.08 0.01 -0.07 0.35 -0.0 -0.77
0.11 0.11 -0.04 -0.28 0.09 -0.11 0.2 0.22 0.24 0.17 0.1 0.25 -0.17 0.38 -0.11 -0.16 -0.06 -1.53 -0.07 0.09 -0.01 -0.0 -0.27 0.02 -0.05 -0.06 0.02 0.25 0.15 -0.37
Spov3_chr4.00930 (CASPL5B2)
 0.04 0.01 -0.09 0.04 0.16 -0.03 0.11 0.09 0.24 0.25 0.18 0.08 -0.01 -0.06 0.04 0.07 -0.04 -0.33 -0.23 -0.1 -0.05 -0.01 -0.28 -0.05 -0.02 0.08 0.02 0.08 -0.05 -0.37
-0.15 -0.09 0.03 0.04 0.07 0.25 0.07 -0.12 0.17 0.18 0.1 0.15 -0.22 0.2 0.21 0.32 0.21 -1.07 0.09 -0.15 0.09 -0.05 -0.74 0.08 0.0 0.11 0.05 -0.13 -0.02 -0.45
-0.35 -0.77 0.59 -0.19 1.77 -0.55 -0.22 -0.4 0.54 0.44 0.3 0.24 -1.59 -0.95 -1.66 -0.56 -1.31 -0.93 0.69 -0.43 0.16 -0.19 -1.65 -0.25 0.38 0.24 0.14 1.13 -0.99 -0.42
0.23 0.09 -0.08 -0.35 -0.04 0.25 0.24 -0.26 0.07 0.13 0.08 0.21 -0.5 0.18 0.34 0.21 0.11 -1.59 0.07 0.09 0.17 0.2 -1.08 0.28 0.07 0.14 0.11 -0.05 -0.23 -0.57
0.04 0.03 -0.26 -0.53 0.44 0.11 0.13 -0.06 0.2 0.26 0.11 0.01 0.06 0.59 -0.1 -0.2 -0.1 0.08 0.06 0.07 -0.21 0.03 -0.24 -0.02 -0.21 0.07 -0.08 -0.13 -0.15 -0.58
-0.36 0.24 0.26 0.23 0.07 0.79 0.54 0.37 0.37 0.24 0.03 0.25 -1.33 0.11 0.29 0.22 -0.45 -1.11 -0.45 -0.03 -0.09 -0.33 -1.09 0.06 -0.42 -0.42 -0.24 0.3 0.03 -0.26
-0.14 0.03 -0.02 -0.03 -0.01 -0.08 -0.07 -0.08 0.11 0.07 0.07 0.07 -0.19 0.23 0.25 0.12 0.19 -0.27 0.01 -0.05 0.12 0.05 -0.67 -0.1 -0.09 0.09 0.16 0.13 0.05 -0.21
0.07 0.02 -0.02 0.02 0.14 -0.05 -0.05 -0.08 0.04 0.15 0.07 -0.01 0.17 0.14 0.18 -0.03 0.01 -0.23 -0.22 -0.18 -0.06 -0.07 -0.0 -0.05 -0.09 -0.06 0.06 0.02 0.07 -0.06
Spov3_chr4.04406 (CYP71A14)
 -0.06 -0.02 -0.11 -0.28 -0.38 0.16 0.18 -0.1 0.13 0.1 0.09 0.18 -0.3 0.12 0.26 0.15 0.09 -0.44 -0.03 -0.12 0.02 0.05 -0.97 0.15 0.01 0.19 0.11 0.1 0.2 -0.05
Spov3_chr4.04407 (CYP71A24)
 0.02 0.11 -0.1 -0.45 -0.3 0.07 0.17 -0.6 -0.05 -0.09 -0.03 0.15 -0.34 0.19 0.18 -0.0 -0.01 -0.3 -0.04 0.01 0.24 0.19 -0.98 0.26 0.07 0.2 0.1 0.17 0.31 0.13
0.29 0.26 0.1 -0.01 -0.34 -0.31 -0.17 -0.35 0.12 0.16 0.06 0.1 -0.2 0.17 -0.06 0.03 -0.07 0.04 -0.19 -0.22 0.04 -0.02 0.01 -0.16 -0.05 0.05 0.14 0.18 0.08 0.06
-0.02 0.02 -0.18 -0.21 -0.06 -0.09 0.1 -0.23 0.13 0.32 0.2 0.11 -0.08 0.19 -0.06 0.11 0.24 -0.56 0.08 -0.08 0.22 -0.15 -0.53 0.04 0.12 0.09 0.1 0.01 -0.06 -0.15
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0.38 0.39 -0.07 -0.55 -0.42 -0.09 0.07 -0.39 0.04 0.14 -0.03 0.13 -0.69 0.75 -0.03 -0.04 0.03 -1.23 0.01 -0.03 0.23 0.2 -0.53 0.12 0.05 0.28 0.2 -0.02 0.02 -0.26
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0.06 -0.02 -0.03 -0.06 0.15 -0.01 0.12 0.06 0.06 -0.08 0.07 0.12 0.04 0.14 0.05 -0.02 0.03 -0.67 -0.0 0.02 0.01 0.01 -0.11 -0.1 -0.03 0.02 -0.0 0.11 -0.06 -0.06
0.1 0.13 0.14 0.09 -0.3 0.15 0.21 0.3 0.18 0.01 0.0 0.1 -0.11 -0.04 0.13 0.04 0.02 -1.06 -0.26 -0.17 -0.1 -0.02 -0.21 0.03 -0.09 -0.05 -0.05 0.18 0.17 -0.03
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.