Heatmap: Cluster_64 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.22 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.17 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.39 0.49 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.15 0.0 1.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0
0.0 0.49 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.25 0.0 0.1 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0
0.0 0.0 0.22 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.08 0.19 0.0 0.04 0.0 0.17 0.04 0.13 0.08 0.04 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.04 0.0 0.07 0.0 0.08 0.0
0.44 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.28 0.0 0.1 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.63 0.0 0.05 0.0 0.32 0.33 0.0 0.0 0.0 1.0 0.12 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04
0.44 0.0 0.15 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.1 0.0 0.0 1.0 0.0 0.21 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.03 0.0 0.0 0.21 0.0 0.19 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.32 0.0 0.0 0.04 0.36 0.0 0.14 0.25 0.0 0.0
0.12 0.51 0.26 0.03 0.36 0.17 0.1 0.23 0.11 0.15 0.15 0.27 0.06 1.0 0.15 0.03 0.17 0.19 0.2 0.13 0.13 0.13 0.42 0.22 0.05 0.07 0.14 0.12 0.16 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spov3_chr1.01587 (AtNEAP3)
0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 1.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.15 0.0 0.07 0.19 0.48 0.0 0.37 0.15 0.15 0.07 0.2 0.32 1.0 0.26 0.15 0.15 0.12 0.0 0.13 0.18 0.06 0.19 0.39 0.34 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.42 0.27 0.0 0.0
0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.53 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.15 0.0 1.0 0.18 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.4 0.09 0.48 0.24 0.0 0.53 0.0 0.36 0.18 0.41 0.0 0.29 0.61 0.0 0.0 0.19 0.54 0.0 0.0 0.0 0.36 1.0 0.28 0.19 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0
0.59 0.32 0.31 0.0 0.38 0.0 0.4 0.0 0.15 0.34 0.0 0.3 0.5 1.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.26 0.0 0.0 0.56 0.0 0.29 0.32 0.28 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0
0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.35 0.32 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.16 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.18 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.23
0.12 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0
0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.16 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.11 0.3 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 1.0 0.43 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.66 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 0.08 0.0 0.06 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.07 0.08 0.14 0.13 0.0 0.0 0.0 0.16 0.59 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.19 0.0 0.18 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 1.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0
0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spov3_chr3.03854 (MAP65-8)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.12 0.0 0.8 0.34 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.07 0.22 0.07 0.25 0.35 0.0 0.07 0.0 0.12 0.46 0.0 0.19 1.0 0.06 0.2 0.0 0.57 0.0 0.0 0.05 0.11 0.0 0.0 0.06 0.0 0.33 0.48 0.0 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.25 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 1.0 0.44 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.29 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24
0.16 0.22 0.31 0.21 0.12 0.17 0.2 0.21 0.41 0.35 0.32 0.18 0.13 0.49 0.16 0.12 0.08 0.15 0.29 0.22 0.3 0.24 1.0 0.12 0.17 0.2 0.29 0.17 0.12 0.1
0.14 0.13 0.1 0.08 0.12 0.09 0.16 0.18 0.15 0.15 0.15 0.17 0.31 1.0 0.08 0.12 0.15 0.38 0.14 0.09 0.21 0.12 0.96 0.2 0.13 0.08 0.15 0.23 0.05 0.04
0.2 0.0 0.0 0.47 0.0 0.17 0.16 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.12 0.06 0.0 0.17 0.0 0.27 0.0 0.0 0.06 0.0 0.29 0.26 1.0 0.0 0.23 0.0 0.05 0.0 0.31 0.0 0.06 0.14 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.41 0.15 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.74 0.0 0.32 0.0 0.33 0.0 0.0 0.43 1.0 0.59 0.17 0.0 0.0 0.21 0.37 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.18 0.15 0.04 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 1.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.43 0.17 0.09 0.11 0.0 0.0 0.17 0.05 0.09 0.0 0.0
0.0 0.3 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.37 0.22 0.0 0.0 0.0 0.06 0.26 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)