Heatmap: Cluster_135 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.16 -0.11 -0.2 -0.31 0.04 -0.25 -0.16 -0.11 -0.29 -0.2 0.03 -0.17 0.37 0.27 0.35 0.16 0.12 0.03 0.1 -0.14 0.04 -0.11 0.7 0.0 0.0 -0.03 0.0 -0.04 -0.37 -0.12
0.82 1.0 -0.22 -0.59 0.09 0.35 0.21 -0.74 -0.18 -0.31 -0.61 -0.35 -0.22 1.55 0.77 0.1 -0.32 -0.67 -1.17 -1.22 -0.74 -0.42 1.1 -0.56 -1.0 -0.49 -0.76 -0.42 0.27 -0.56
0.09 0.03 -0.07 0.1 0.1 -0.1 -0.29 -0.16 -0.06 -0.32 -0.2 -0.07 0.2 0.3 0.1 0.14 0.2 0.03 -0.04 -0.25 -0.09 -0.25 0.41 0.07 -0.05 -0.11 -0.07 0.0 -0.07 0.14
-0.11 -0.14 -0.16 -0.11 0.04 0.11 -0.04 -0.13 -0.12 -0.06 -0.06 -0.08 0.17 0.27 0.38 0.23 0.28 -0.05 -0.14 -0.18 -0.07 -0.1 0.27 -0.04 -0.07 -0.08 0.02 -0.01 -0.12 -0.15
-0.22 -0.13 -0.33 -0.46 -0.21 0.18 0.23 0.15 -0.38 -0.34 -0.1 -0.17 0.24 0.28 0.51 0.25 0.29 -0.03 -0.12 0.04 -0.12 0.01 0.6 0.0 0.01 -0.11 -0.15 -0.22 -0.29 -0.11
0.32 0.24 0.02 0.01 0.25 -0.04 -0.09 -0.16 -0.04 -0.04 -0.11 -0.14 0.03 0.22 0.17 0.06 0.09 -0.35 -0.09 -0.17 -0.08 -0.12 0.24 -0.12 -0.22 -0.13 -0.06 0.13 0.06 -0.16
0.72 0.61 -0.23 -0.54 0.25 0.48 0.06 -0.97 0.06 -0.18 -0.34 -0.24 -0.41 1.29 0.86 0.03 0.04 -0.12 -0.93 -0.83 -0.61 -0.44 0.37 -0.52 -0.32 -0.42 -0.68 0.06 0.12 -0.25
-0.05 -0.18 -0.47 -0.47 0.01 0.55 0.38 -0.09 -0.39 -0.35 -0.21 -0.14 0.18 -0.03 0.49 0.36 0.19 0.09 -0.29 -0.2 -0.07 0.04 0.39 0.23 0.02 -0.05 -0.08 -0.1 -0.45 -0.11
0.57 0.97 -0.06 0.1 -0.07 -0.18 0.09 -0.13 0.17 -0.69 -0.37 -0.08 0.11 0.59 0.03 0.14 -0.08 -0.76 -0.9 -0.92 -0.58 -0.16 0.02 0.08 -0.12 -0.06 0.1 0.29 0.3 -0.18
-0.31 -0.67 -0.74 -0.37 0.76 0.51 -0.65 -1.42 -0.64 -0.66 -0.63 -0.64 0.34 0.56 0.92 1.01 0.98 0.04 -0.76 -0.79 -0.56 -0.7 1.16 -0.1 -0.46 -0.58 -0.61 0.28 -0.28 0.18
-1.17 -0.72 -1.32 -0.93 -0.33 0.7 0.95 -0.03 0.04 -0.24 -0.6 -0.18 0.29 -0.61 0.66 0.95 0.38 -0.59 -0.11 -0.04 -0.13 0.01 0.84 -0.05 0.35 0.12 0.02 -0.9 -0.77 -0.22
-0.61 -0.36 -0.47 -0.95 0.13 0.86 -0.04 -0.17 -0.21 -0.15 -0.3 -0.16 -0.57 0.09 0.67 0.52 0.51 0.33 0.01 -0.02 0.23 0.12 0.49 -0.27 -0.58 -0.06 -0.35 -0.23 -0.4 0.17
-0.14 -0.63 -0.89 -1.16 -1.8 0.92 0.52 -0.45 -0.75 -0.57 -0.24 -2.0 0.82 -0.05 0.89 0.61 0.03 -0.4 -0.87 -0.21 -0.45 -0.56 2.02 0.23 -0.75 -1.31 -0.3 -0.17 -0.93 0.66
0.28 -0.21 -0.15 -0.07 -0.52 0.2 0.13 -0.14 -0.07 -0.22 0.01 -0.02 0.03 0.49 0.34 0.29 0.25 -0.23 -0.16 -0.21 -0.12 -0.12 -0.05 0.06 0.04 -0.13 -0.06 -0.11 -0.08 0.11
-0.13 -0.15 -0.1 -0.11 -0.33 0.02 0.15 0.01 -0.2 -0.21 -0.14 -0.18 0.13 0.3 0.6 0.54 0.45 -0.09 -0.32 -0.26 -0.2 -0.02 0.61 -0.09 -0.28 -0.16 -0.19 -0.12 -0.28 -0.02
-0.57 0.04 -0.2 -0.87 0.04 0.26 -0.09 0.37 -0.41 -0.15 -0.39 -0.49 0.4 -1.29 0.55 0.47 0.32 0.08 -0.16 -0.32 0.17 -0.03 1.21 -0.45 -0.35 0.08 0.04 -0.52 -0.71 0.46
0.0 0.03 -0.12 -0.06 0.18 0.25 0.13 -0.04 -0.2 -0.28 -0.09 -0.06 0.01 0.26 0.4 0.29 0.2 0.19 -0.34 -0.28 -0.2 -0.15 0.4 -0.15 -0.29 -0.15 -0.25 0.01 -0.01 -0.13
-0.03 -0.05 -0.11 -0.05 0.08 0.07 -0.05 0.13 -0.14 -0.14 -0.04 -0.16 0.07 0.31 0.32 0.26 0.37 -0.2 -0.31 -0.28 -0.16 -0.08 0.35 -0.19 -0.17 -0.2 -0.17 0.04 0.01 0.14
0.08 0.12 -0.04 -0.18 -0.04 0.32 0.15 0.03 -0.33 -0.42 -0.24 -0.23 0.01 0.08 0.37 0.36 0.32 -0.59 -0.26 -0.18 -0.08 -0.04 0.98 -0.06 -0.14 -0.07 -0.13 -0.26 -0.37 -0.14
0.09 -0.09 -0.25 -0.26 -0.35 0.23 0.31 0.27 -0.39 -0.59 -0.16 -0.17 0.51 0.03 0.54 0.43 0.34 -0.6 -0.28 -0.25 -0.15 -0.13 0.58 0.25 0.05 -0.19 -0.21 -0.37 -0.28 -0.03
0.12 -0.08 -0.09 -0.31 0.14 0.12 0.2 0.28 -0.14 -0.16 -0.15 -0.04 0.11 -0.04 0.04 0.13 -0.02 -0.41 -0.2 -0.14 -0.28 -0.06 0.53 0.11 -0.06 -0.21 -0.11 0.02 0.08 0.22
-0.77 -0.94 -0.86 -0.97 -1.11 0.47 0.75 -0.31 -0.45 -0.52 -0.06 0.04 0.64 -0.37 1.01 0.9 0.81 -1.37 -0.12 -0.09 0.01 0.07 0.85 0.2 0.15 -0.04 -0.08 -0.84 -0.91 -0.46
0.35 0.11 -0.36 0.05 -0.22 0.22 0.29 0.36 -0.23 -0.27 -0.29 -0.06 0.02 0.05 0.45 -0.02 0.01 -0.3 -0.34 -0.37 -0.3 0.03 0.78 0.29 -0.18 -0.39 -0.6 0.32 0.27 -0.9
-0.14 -0.28 -0.21 -0.22 -0.11 -0.06 0.02 0.15 -0.17 -0.06 -0.0 -0.19 0.2 0.09 0.33 0.19 0.3 -0.22 -0.16 -0.21 0.0 0.07 0.52 -0.02 0.03 -0.05 0.01 -0.03 -0.23 0.1
-0.15 0.06 -0.17 -0.09 -0.14 0.07 -0.02 -0.2 0.07 0.11 0.21 -0.01 -0.01 0.29 0.3 0.45 0.37 -0.34 -0.05 -0.04 0.21 -0.1 -0.18 -0.25 -0.2 0.12 0.07 -0.32 -0.41 -0.12
0.25 0.12 -0.09 -0.12 0.04 0.07 0.12 -0.02 -0.08 -0.18 -0.1 -0.06 0.12 0.2 0.26 0.18 0.2 -0.05 -0.22 -0.12 -0.09 -0.02 -0.01 0.02 -0.22 -0.19 -0.2 0.08 -0.05 -0.04
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0.4 0.21 -0.09 -0.17 0.08 0.2 0.23 0.08 -0.26 -0.29 -0.15 -0.16 0.17 0.36 0.24 0.18 0.13 -0.92 -0.42 -0.4 -0.34 -0.23 0.02 0.01 0.03 -0.16 -0.06 0.17 0.27 0.12
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0.05 -0.03 0.03 -0.05 0.12 0.04 0.06 0.13 -0.07 -0.06 -0.11 -0.01 0.1 0.18 0.21 0.15 0.16 -0.4 -0.26 -0.25 -0.2 -0.08 0.19 0.06 -0.03 -0.16 -0.18 0.11 -0.01 0.1
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-0.07 -0.15 -0.26 -0.27 -0.19 0.14 0.24 0.16 -0.26 -0.27 0.0 -0.12 0.31 0.25 0.41 0.33 0.41 -0.1 -0.18 -0.19 -0.09 -0.13 0.44 -0.04 -0.11 -0.03 -0.02 -0.11 -0.39 -0.3
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0.0 0.02 -0.02 0.01 0.16 0.09 -0.16 -0.14 -0.32 -0.21 -0.12 -0.19 0.17 0.36 0.25 0.21 0.25 -0.05 -0.11 -0.13 -0.01 0.01 0.21 -0.14 -0.07 -0.1 -0.02 -0.09 -0.18 0.06
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0.03 -0.14 -0.28 -0.27 0.06 0.42 0.34 0.14 -0.06 -0.18 -0.35 -0.07 -0.03 0.02 0.46 0.41 0.19 -0.55 -0.26 -0.29 -0.15 -0.11 0.75 0.22 -0.13 -0.14 -0.21 -0.36 0.04 -0.41
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-0.03 0.09 -0.18 -0.18 -0.53 0.1 0.12 0.11 -0.23 -0.24 -0.13 0.02 0.4 0.28 0.39 0.2 0.2 -0.68 -0.38 -0.3 -0.17 0.06 0.22 0.03 -0.05 0.07 0.12 -0.04 -0.01 0.14
0.14 0.22 -0.04 0.12 0.11 0.01 0.04 0.25 -0.03 -0.17 -0.15 -0.14 0.12 0.2 0.15 0.14 0.18 -0.37 -0.3 -0.1 -0.09 -0.09 0.2 -0.29 -0.26 -0.14 -0.06 0.18 -0.16 -0.02
0.13 0.02 -0.06 0.07 -0.1 -0.0 -0.12 0.17 -0.21 -0.09 -0.08 -0.09 0.14 0.04 0.33 0.32 0.31 -0.24 -0.15 -0.08 -0.12 -0.1 0.17 -0.08 -0.03 -0.12 0.02 -0.05 -0.19 -0.06
-0.09 -0.09 -0.11 -0.09 0.15 0.09 0.14 0.2 -0.14 -0.12 -0.03 0.0 0.25 0.5 0.26 0.17 0.1 -0.62 -0.35 -0.25 -0.18 -0.12 0.2 -0.11 -0.07 -0.17 -0.02 0.08 -0.06 0.01
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.