1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_124 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.22 0.0 0.0 0.07 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.0 0.0 0.07 0.0 1.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.08 0.04 0.02 0.02 0.07 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.04 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.07 0.23 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.29 0.07 0.06 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.06 0.04 0.06 0.03 0.02 0.02 0.04 0.01 0.02 0.05 0.02 0.05 0.04 0.05 0.02 0.05 0.06 0.02 0.04 0.04 0.04 1.0 0.03 0.05 0.04 0.06 0.02 0.04 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.18 0.04 0.0 0.23 0.0 0.01 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.05 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.16 0.16 0.15 0.17 0.17 0.16 0.15 0.13 0.13 0.14 0.14 0.15 0.2 0.19 0.16 0.16 0.22 0.15 0.15 0.15 0.15 1.0 0.15 0.14 0.14 0.15 0.19 0.17 0.27
0.05 0.04 0.03 0.0 0.0 0.07 0.05 0.0 0.0 0.08 0.0 0.05 0.15 0.19 0.07 0.05 0.06 0.04 0.05 0.0 0.03 0.1 1.0 0.01 0.0 0.12 0.05 0.0 0.0 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.06 0.05 0.06 0.09 0.03 0.04 0.04 0.04 0.06 0.04 0.05 0.05 0.04 0.02 0.03 0.03 0.05 0.04 0.04 0.05 0.05 1.0 0.07 0.06 0.05 0.07 0.07 0.06 0.05
0.15 0.19 0.11 0.24 0.12 0.01 0.02 0.09 0.03 0.14 0.07 0.09 0.2 0.07 0.04 0.04 0.03 0.2 0.06 0.05 0.09 0.08 1.0 0.14 0.11 0.07 0.14 0.19 0.09 0.06
0.02 0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.04 0.0 0.01 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01
Spov3_chr1.05018 (CYP76C5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.01 0.01 0.02 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spov3_chr2.02368 (EMB1789)
 0.1 0.12 0.1 0.13 0.04 0.02 0.03 0.09 0.05 0.05 0.12 0.08 0.15 0.06 0.04 0.03 0.04 0.13 0.09 0.06 0.09 0.12 1.0 0.11 0.17 0.03 0.15 0.13 0.16 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.13 0.04 0.01 0.01 0.3 0.02 0.02 0.01 0.01 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.06 0.02 0.04 0.01 0.04 0.02 0.07 0.03 0.06 0.0 0.03 0.0 0.11 0.01 0.02 0.0 0.04 0.0 0.02 0.02 0.01 1.0 0.06 0.03 0.0 0.05 0.05 0.08 0.03
Spov3_chr3.03886 (A/N-InvA)
 0.12 0.12 0.14 0.12 0.15 0.15 0.11 0.09 0.14 0.11 0.1 0.1 0.1 0.09 0.16 0.13 0.12 0.14 0.11 0.09 0.11 0.1 1.0 0.08 0.09 0.09 0.1 0.19 0.12 0.16
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.02 0.03 0.03 0.02 0.1 0.02 0.0 0.02 0.01 1.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.03 0.04 0.01 0.03 0.03 0.01 0.05 0.08 0.05 0.07 0.03 0.0 0.01 0.06 0.02 0.01 0.06 0.02 0.07 0.05 1.0 0.01 0.03 0.03 0.05 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.04
0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.11
0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.03 0.01 0.04 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.03 0.23 0.02 0.02 0.02 0.0 1.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.03 0.01 0.03 0.04 0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.06 0.07 0.02 0.04 0.05 0.01 0.02 0.01 0.01 1.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.1 0.06 0.04 0.07 0.03 0.03 0.04 0.04 0.05 0.05 0.04 0.06 0.05 0.04 0.04 0.07 0.2 0.04 0.03 0.03 0.05 1.0 0.04 0.03 0.04 0.06 0.06 0.06 0.07
0.22 0.2 0.18 0.16 0.23 0.14 0.16 0.19 0.21 0.2 0.18 0.19 0.19 0.23 0.18 0.16 0.19 0.43 0.2 0.21 0.19 0.21 1.0 0.18 0.19 0.19 0.18 0.21 0.18 0.15
0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)