1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_124 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.16 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 1.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 17.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67
0.04 0.02 0.01 0.01 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.01 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.06 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.21 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.26 0.18 0.23 0.12 0.1 0.08 0.16 0.04 0.08 0.2 0.1 0.2 0.15 0.21 0.08 0.19 0.23 0.1 0.17 0.17 0.18 4.14 0.14 0.2 0.17 0.27 0.09 0.15 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.21 0.04 0.0 0.26 0.0 0.02 0.02 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.09 0.02 0.0 0.06 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 1.14 0.0 0.0 0.04 0.08 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
42.7 44.24 44.79 40.7 48.48 47.94 44.69 42.28 36.19 35.43 39.0 39.74 40.38 54.32 53.88 44.19 44.52 59.93 40.68 40.83 40.52 40.5 277.21 42.06 37.52 39.1 40.56 51.97 48.01 76.2
0.09 0.06 0.05 0.0 0.0 0.11 0.08 0.0 0.0 0.13 0.0 0.08 0.25 0.31 0.12 0.08 0.1 0.07 0.07 0.0 0.05 0.16 1.63 0.02 0.0 0.19 0.08 0.0 0.0 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 1.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 11.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.36 0.41 0.3 0.41 0.6 0.2 0.24 0.26 0.29 0.39 0.29 0.32 0.34 0.26 0.16 0.22 0.2 0.36 0.27 0.29 0.32 0.34 6.64 0.47 0.41 0.35 0.45 0.49 0.37 0.3
0.28 0.35 0.19 0.44 0.21 0.02 0.03 0.16 0.06 0.25 0.12 0.16 0.36 0.12 0.08 0.07 0.06 0.37 0.12 0.08 0.16 0.15 1.84 0.26 0.19 0.13 0.26 0.34 0.17 0.11
0.08 0.06 0.08 0.07 0.12 0.03 0.05 0.03 0.04 0.07 0.09 0.07 0.11 0.07 0.06 0.05 0.02 0.29 0.03 0.05 0.03 0.06 4.58 0.05 0.1 0.14 0.09 0.09 0.11 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.32 1.42 2.64 0.0 4.56 1.43 1.43 1.13 0.0 0.27 0.0 0.0 10.29 17.62 9.52 0.57 1.42 19.69 0.3 3.56 0.0 0.25 231.16 0.64 1.17 0.27 1.3 2.17 3.28 1.53
Spov3_chr1.05018 (CYP76C5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.01 0.01 0.03 0.07 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.11 0.12 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spov3_chr2.02368 (EMB1789)
 0.16 0.2 0.16 0.22 0.07 0.03 0.06 0.15 0.08 0.08 0.19 0.14 0.25 0.1 0.06 0.06 0.06 0.21 0.15 0.1 0.14 0.2 1.65 0.18 0.28 0.05 0.24 0.21 0.26 0.12
0.04 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.04 0.02 0.0 0.0 1.13 0.0 0.0 0.0 0.01 9.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.08 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.09 0.05 0.13 0.0 0.01 2.83 0.0 0.0 0.02 0.0 40.12 0.03 0.01 0.01 0.04 0.02 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.23 2.78 1.0 1.17 3.16 2.88 2.66 1.78 1.27 1.2 0.95 1.29 5.07 14.84 4.14 1.64 1.48 33.49 1.98 1.76 1.03 1.45 113.14 1.64 1.03 1.35 1.51 0.77 2.33 1.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.4 0.02 0.01 0.0 0.02 0.02 0.03 0.01
Spov3_chr3.03886 (A/N-InvA)
 2.67 2.76 3.14 2.66 3.4 3.34 2.56 2.05 3.07 2.5 2.19 2.33 2.2 1.9 3.48 2.84 2.69 3.22 2.39 1.97 2.4 2.17 22.36 1.8 1.97 2.07 2.26 4.32 2.62 3.59
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.14 0.04 0.07 0.06 0.04 0.22 0.03 0.0 0.04 0.03 2.19 0.0 0.01 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.1 0.47 0.63 0.19 0.45 0.46 0.12 0.82 1.26 0.81 1.25 0.45 0.06 0.24 0.93 0.33 0.19 0.94 0.28 1.24 0.82 16.66 0.23 0.49 0.52 0.77 0.24 0.19 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.27 0.19 0.4 0.29 0.22 0.07 0.11 0.0 0.06 0.18 0.03 0.16 0.58 0.28 0.21 0.06 0.0 1.42 0.05 0.08 0.17 0.08 49.33 0.42 0.0 0.19 0.06 0.78 0.7 5.67
0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.74 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 43.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.01 0.04 0.02 0.0 0.0 1.12 0.01 0.0 0.01 0.0 5.28 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.03 0.01 0.06 0.02 0.08 0.02 0.04 0.04 0.0 0.01 0.04 0.03 0.02 0.07 0.04 0.02 0.06 0.48 0.05 0.04 0.05 0.0 2.12 0.02 0.02 0.05 0.04 0.06 0.02 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.57 0.87 0.42 0.85 1.25 0.56 0.21 0.9 0.47 0.23 0.18 0.2 0.26 1.89 2.48 0.71 1.46 1.79 0.24 0.64 0.32 0.18 33.4 0.7 0.37 0.26 0.11 0.5 0.26 0.29
0.03 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.04 0.01 0.04 0.02 0.0 0.05 0.04 0.08 0.03 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 31.58 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.37 0.22 0.13 0.28 0.11 0.13 0.16 0.16 0.19 0.21 0.14 0.23 0.18 0.16 0.16 0.28 0.76 0.16 0.13 0.12 0.18 3.81 0.15 0.11 0.15 0.23 0.23 0.23 0.26
22.85 21.18 18.77 16.72 24.26 14.91 17.02 20.18 21.74 21.51 18.61 20.09 20.01 24.49 18.49 16.48 19.81 45.41 21.1 22.35 20.1 22.02 105.38 18.87 19.94 19.6 19.18 21.81 19.36 15.89
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.64 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.27 0.14 0.0 3.29 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.1 0.0 13.01 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)