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Heatmap: Cluster_102 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.03 0.02 0.25 0.64 -0.17 -0.65 -0.35 0.81 0.2 0.15 0.27 -0.0 0.32 -2.08 -1.14 -0.38 -0.5 -1.24 -0.26 -0.49 -0.03 -0.35 0.14 0.07 0.25 0.09 0.04 0.42 0.6 0.34
0.16 0.08 0.31 0.47 -0.06 -0.4 -0.18 0.52 0.39 0.34 0.11 0.05 -0.29 -0.95 -0.51 -0.23 -0.22 -1.27 -0.12 -0.16 0.11 -0.03 -0.22 -0.08 0.08 0.06 0.1 0.4 0.28 -0.08
0.11 0.12 0.28 0.24 -0.25 -0.37 0.06 0.18 0.47 0.42 0.23 0.24 -0.64 -1.71 -0.52 -0.31 -0.32 -1.18 0.15 0.09 0.14 0.07 -1.1 -0.0 0.19 0.17 0.31 0.37 0.46 -0.14
0.28 0.17 0.41 0.23 -0.2 -0.5 -0.05 0.5 0.26 0.42 0.07 0.13 -0.48 -0.76 -0.6 -0.3 -0.32 -1.2 -0.06 -0.06 -0.04 0.1 -0.27 0.05 0.08 0.09 0.21 0.38 0.33 -0.24
0.18 0.05 0.1 0.11 -0.09 -0.19 0.07 -0.03 0.45 0.44 0.2 0.11 -0.31 -1.72 -0.42 -0.01 -0.07 -1.58 0.16 0.21 0.05 0.03 -1.01 0.05 0.23 0.26 0.24 0.25 0.15 0.05
0.02 -0.15 0.11 0.09 0.2 -0.24 -0.15 -0.08 0.21 0.22 0.13 0.17 -0.27 -0.47 -0.13 -0.11 0.04 -1.21 -0.03 -0.05 0.12 0.11 -0.46 -0.11 0.15 0.11 0.17 0.28 0.31 0.23
0.27 0.09 0.1 0.26 -0.02 -0.16 -0.15 0.68 0.09 0.05 0.0 -0.05 -0.21 -0.4 -0.02 -0.02 0.0 -0.55 -0.41 -0.41 -0.11 -0.13 0.08 -0.33 -0.11 -0.04 0.03 0.42 0.34 0.01
-0.04 -0.04 0.46 0.94 0.61 -0.64 -1.06 0.44 0.6 0.4 -0.07 -0.07 -0.27 -1.04 -1.64 -0.96 -0.81 -0.33 -0.31 -0.75 -0.17 -0.4 -0.82 -0.3 -0.25 -0.06 -0.05 0.93 1.1 0.33
0.25 0.28 0.26 0.17 -0.07 -0.1 0.1 0.06 0.31 0.31 0.14 0.17 -0.52 -1.22 -0.33 -0.21 -0.25 -1.37 0.09 0.02 0.06 0.03 -0.7 0.08 0.14 0.11 0.17 0.32 0.38 -0.2
0.18 0.23 0.2 0.1 0.26 -0.47 -0.13 0.15 0.51 0.36 -0.05 -0.13 -0.79 -0.33 -0.32 -0.31 -0.39 -0.45 -0.04 0.09 -0.16 -0.22 -0.23 0.14 0.16 0.14 0.15 0.34 0.5 -0.48
0.09 0.2 0.18 -0.36 0.61 -0.42 -0.23 0.65 0.44 0.55 -0.07 0.02 -0.28 -0.82 -0.82 -0.77 -0.49 -0.66 -0.1 -0.2 -0.1 -0.14 -0.49 0.11 -0.01 -0.02 -0.08 0.43 0.74 0.18
0.17 0.23 0.22 -0.23 0.49 -0.61 -0.2 0.55 0.45 0.54 0.12 0.27 -0.32 -0.78 -0.65 -0.62 -0.54 -1.25 -0.15 -0.06 -0.27 -0.21 -0.52 0.07 0.03 -0.02 0.02 0.63 0.62 -0.01
0.15 0.01 0.14 0.18 0.02 0.05 0.22 0.2 0.12 0.19 0.04 0.07 -0.05 -1.1 -0.15 0.03 -0.02 -1.25 -0.09 -0.07 -0.01 -0.05 -0.18 0.05 0.12 0.03 0.16 0.23 0.05 0.03
0.28 0.16 0.19 0.23 0.05 -0.22 -0.01 -0.03 0.11 0.19 0.16 0.21 0.2 -0.84 -0.07 -0.04 -0.08 -0.54 -0.09 -0.16 -0.16 -0.09 -0.43 -0.09 -0.0 -0.02 -0.08 0.33 0.15 0.1
0.13 0.25 0.29 0.03 0.81 -0.01 0.01 0.37 0.42 0.39 -0.04 0.13 -0.27 -0.88 -0.69 -0.6 -0.53 -0.91 -0.18 -0.15 -0.22 -0.18 -0.59 -0.19 -0.17 -0.16 -0.14 0.65 0.67 -0.13
0.27 -0.02 0.43 0.71 -0.48 -0.7 -0.3 0.68 0.64 0.24 0.38 0.31 -0.32 -1.94 -0.61 -0.44 -0.36 -1.34 -0.22 -0.13 -0.22 -0.28 -0.32 -0.34 0.09 -0.08 0.17 0.45 0.6 0.14
0.32 0.2 0.37 0.31 0.4 -0.65 -0.38 -0.02 0.66 0.74 0.34 0.13 -1.06 -0.57 -1.13 -0.79 -0.71 -0.32 -0.08 -0.32 -0.04 -0.23 -0.52 -0.3 -0.01 0.16 0.25 0.54 0.6 -0.31
0.05 -0.0 0.17 0.04 0.22 -0.21 -0.13 -0.09 0.27 0.24 0.08 0.21 -0.21 -0.94 -0.29 -0.22 -0.18 -0.8 0.11 0.01 0.05 0.03 -0.32 -0.03 0.2 0.2 0.33 0.25 0.28 -0.08
0.18 -0.02 0.07 -0.08 0.16 -0.08 0.36 0.37 0.26 0.18 0.2 0.06 0.1 -1.75 -0.5 -0.06 -0.02 -2.02 -0.18 -0.14 -0.03 -0.09 -0.53 0.13 0.29 0.17 0.12 0.41 0.2 0.07
0.27 0.28 0.24 0.02 0.14 -0.21 0.1 0.4 0.44 0.33 0.08 0.23 -0.64 -0.61 -0.37 -0.44 -0.39 -1.07 -0.02 -0.04 -0.04 0.0 -0.69 0.0 -0.06 -0.0 0.02 0.3 0.52 -0.09
-0.0 0.03 0.14 0.35 0.18 -0.08 -0.46 0.19 0.0 0.03 -0.02 -0.18 -0.13 -0.14 -0.03 0.06 0.07 -0.04 -0.3 -0.37 0.02 -0.19 -0.03 -0.14 -0.05 0.08 0.15 0.25 0.2 0.09
0.34 0.31 0.19 0.09 0.12 0.01 -0.01 -0.14 -0.0 -0.01 -0.06 -0.07 -0.32 0.02 0.04 -0.01 -0.01 -0.4 -0.04 -0.14 -0.04 0.01 -0.5 -0.02 -0.1 0.01 0.07 0.14 0.17 0.05
0.29 0.35 0.25 0.06 0.14 -0.3 0.02 0.61 0.5 0.45 0.11 0.26 -0.66 -0.88 -0.61 -0.64 -0.65 -1.06 -0.08 -0.14 -0.21 -0.18 -0.84 0.02 -0.11 -0.07 -0.03 0.59 0.69 0.02
0.1 0.1 0.13 0.16 0.05 -0.06 -0.02 0.28 -0.1 -0.07 0.01 0.04 0.07 -0.2 0.21 0.09 0.17 -0.41 -0.26 -0.2 -0.08 0.01 -0.15 -0.16 -0.08 0.0 0.13 0.0 -0.08 0.08
0.37 0.36 0.12 0.21 0.08 -0.12 0.05 0.07 0.17 0.11 -0.11 0.11 -0.19 -0.14 -0.24 -0.15 -0.13 -0.8 -0.2 -0.2 -0.09 -0.05 -0.3 -0.18 0.01 0.02 0.05 0.26 0.27 0.11
Spov3_chr1.02509 (UGT73B3)
 0.6 -0.05 0.47 0.01 0.04 -0.28 -0.14 -0.3 0.69 0.27 0.11 0.35 -0.87 -0.76 -0.6 -0.58 -0.73 -1.35 -0.03 -0.14 -0.2 -0.07 -0.62 -0.05 -0.06 0.16 -0.2 0.53 1.03 0.21
0.08 0.36 1.06 0.89 0.47 -1.74 -1.84 -0.12 1.15 0.93 0.19 0.15 -2.47 -3.76 -1.52 -1.31 -0.91 -2.13 -0.13 -0.66 -0.12 -0.71 -1.65 -0.54 -0.14 0.01 0.17 1.23 1.32 -0.48
-0.08 0.01 0.16 0.2 0.14 -0.27 -0.06 0.41 0.14 0.1 0.02 0.0 -0.08 -0.31 -0.16 -0.09 -0.03 -0.74 -0.1 -0.18 -0.07 -0.06 -0.11 -0.07 0.01 0.0 0.19 0.4 0.2 -0.01
0.07 0.06 0.23 0.41 0.5 -0.07 -0.29 0.15 0.15 0.13 0.03 0.07 -0.05 -1.25 -0.46 -0.38 -0.3 -0.48 -0.27 -0.2 -0.14 -0.11 -0.41 -0.21 0.15 -0.0 0.11 0.57 0.55 0.2
Spov3_chr1.03737 (EMB2219)
 0.18 0.11 0.22 0.24 0.21 -0.04 -0.08 -0.01 0.3 0.3 0.15 0.15 -0.31 -0.33 -0.23 -0.21 -0.08 -0.85 -0.25 -0.2 -0.04 -0.06 -0.61 -0.13 -0.03 0.08 0.02 0.47 0.36 -0.06
Spov3_chr1.03779 (ATPI4K ALPHA)
 0.16 0.06 0.08 0.25 0.14 -0.27 -0.04 -0.09 0.1 0.14 0.05 0.07 -0.04 -0.24 -0.09 -0.18 -0.17 -0.46 -0.13 -0.22 -0.01 0.06 -0.27 -0.08 0.05 0.11 0.22 0.18 0.19 0.13
-0.2 -0.18 0.19 0.24 0.19 -0.26 -0.26 0.6 0.31 0.16 0.05 0.03 -0.09 -0.76 -0.29 0.02 0.17 -1.09 -0.22 -0.29 -0.14 -0.1 -0.3 -0.25 0.01 0.05 0.02 0.44 0.38 0.41
0.09 0.11 0.17 0.16 0.46 0.0 -0.05 0.34 0.03 0.08 0.02 0.03 0.13 -0.93 -0.38 -0.29 -0.19 -0.64 -0.16 -0.2 -0.23 -0.21 -0.23 -0.04 0.01 -0.09 -0.0 0.59 0.38 0.14
0.11 0.03 0.08 0.17 0.03 -0.26 -0.13 0.11 0.28 0.24 0.1 0.03 -0.22 -0.15 -0.24 -0.2 -0.23 -0.22 -0.14 -0.09 -0.02 -0.14 0.15 -0.08 0.01 0.01 0.09 0.24 0.25 -0.07
0.23 0.27 0.19 0.29 0.3 -0.07 -0.11 0.12 -0.03 0.05 -0.08 -0.09 -0.11 -0.13 -0.18 -0.14 -0.16 -0.14 -0.2 -0.3 -0.2 -0.16 -0.23 -0.01 -0.0 -0.07 0.01 0.25 0.32 0.05
0.15 0.13 0.17 0.39 0.34 -0.06 -0.19 0.03 0.06 0.11 -0.11 -0.19 -0.15 -0.33 -0.14 0.02 -0.01 0.06 -0.28 -0.16 0.07 -0.11 -0.27 -0.17 -0.05 -0.04 0.01 0.1 0.16 0.17
Spov3_chr1.04666 (L-GalDH)
 0.22 0.11 0.29 0.19 0.18 -0.43 -0.08 0.12 0.32 0.35 0.05 0.09 -0.29 -0.73 -0.46 -0.21 -0.37 -0.58 -0.03 -0.05 0.01 -0.11 -0.6 -0.05 0.14 0.11 0.16 0.3 0.38 0.1
-0.11 0.01 0.04 0.06 0.32 -0.15 -0.01 0.31 0.26 0.27 0.25 0.22 -0.3 -0.52 -0.23 -0.16 -0.05 -0.86 0.03 -0.01 -0.06 -0.05 -0.51 -0.01 0.17 -0.0 0.14 0.39 0.15 -0.29
0.26 0.23 0.12 0.17 0.16 -0.17 -0.13 0.02 0.14 0.08 0.01 0.01 -0.14 0.07 -0.14 -0.14 -0.26 -0.32 -0.21 -0.12 -0.11 -0.04 -0.15 -0.01 -0.04 -0.07 0.04 0.27 0.2 0.03
0.29 0.2 0.2 0.3 0.03 -0.15 0.05 0.42 0.14 0.15 0.03 0.09 -0.25 -0.71 -0.37 -0.11 -0.24 -0.91 -0.21 -0.41 -0.05 -0.07 -0.27 0.07 0.06 0.02 0.16 0.34 0.31 0.05
0.0 0.07 0.11 -0.35 0.81 -0.95 -0.07 0.97 0.58 0.58 0.01 0.21 -0.13 -1.86 -1.49 -0.84 -0.55 -1.62 0.16 -0.09 -0.41 -0.18 -0.36 0.03 0.5 -0.07 0.01 0.84 0.46 -0.66
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0.16 0.21 0.25 0.36 0.07 -0.23 -0.17 0.15 0.28 0.25 -0.02 -0.14 -0.07 -0.97 -0.33 -0.1 0.03 -0.51 -0.22 -0.33 -0.12 -0.17 -0.37 -0.06 0.1 -0.01 0.12 0.36 0.39 0.24
0.18 0.07 0.15 0.38 0.13 -0.23 0.04 0.27 0.15 0.18 0.07 0.05 0.18 -0.47 -0.22 -0.25 -0.14 -0.87 -0.15 -0.07 -0.1 -0.04 -0.57 -0.09 0.13 -0.06 0.11 0.12 0.23 0.17
0.36 0.4 0.23 0.29 0.23 -0.2 -0.09 0.12 -0.06 0.09 -0.05 -0.08 -0.0 -0.57 -0.07 -0.1 0.01 -0.58 -0.33 -0.39 -0.08 -0.12 -0.3 -0.08 -0.02 0.04 0.14 0.42 0.21 -0.06
0.01 0.3 0.73 0.27 0.15 -1.69 -0.69 1.34 0.79 0.61 -0.37 0.02 -1.89 -1.26 -1.5 -1.27 -1.36 -0.89 -0.11 -0.14 -0.1 -0.4 -1.16 -0.64 -0.35 -0.06 0.07 0.93 1.08 0.56
0.0 -0.15 0.04 0.39 0.33 -0.08 0.06 0.24 0.17 0.17 0.19 0.0 -0.41 -1.07 -0.34 -0.02 -0.1 -1.25 -0.03 -0.15 0.01 -0.08 -0.27 0.18 0.38 0.12 0.29 0.31 0.2 -0.35
-0.06 0.28 0.16 -0.36 0.61 -1.03 -0.65 1.04 0.34 0.35 0.01 0.07 -0.08 -0.53 -0.83 -0.71 -0.4 -0.45 0.0 -0.0 -0.13 -0.21 -0.26 -0.07 -0.07 0.04 -0.04 0.77 0.32 -0.22
0.25 0.28 0.27 0.11 0.01 -0.12 0.14 0.38 0.25 0.21 0.04 0.15 -0.37 -0.83 -0.51 -0.31 -0.26 -1.03 -0.12 -0.12 -0.06 -0.03 -0.46 0.13 0.12 0.07 0.16 0.39 0.32 -0.14
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Spov3_chr5.03347 (emb1027)
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Spov3_chr6.01828 (PDH-E1 BETA)
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.