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Heatmap: Cluster_108 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.22 0.29 0.13 0.38 0.23 -0.23 -0.53 0.25 -0.2 -0.02 -0.22 -0.35 -0.06 -0.05 -0.19 -0.09 -0.01 0.22 -0.38 -0.44 -0.17 -0.19 0.5 -0.18 -0.12 -0.13 -0.06 0.19 0.28 0.25
0.27 0.16 0.25 0.47 -0.07 -0.28 -0.3 0.36 -0.14 -0.08 -0.31 -0.2 -0.11 0.41 -0.16 -0.17 -0.25 0.26 -0.39 -0.31 -0.23 -0.3 0.8 -0.35 -0.22 -0.31 -0.15 0.12 0.13 0.18
0.18 0.2 0.1 0.32 0.04 -0.21 -0.23 0.23 -0.26 -0.14 -0.17 -0.22 0.18 0.13 0.06 0.06 0.06 -0.03 -0.22 -0.31 -0.2 -0.17 0.46 -0.17 -0.26 -0.27 -0.06 0.17 0.08 0.21
0.4 0.37 0.14 0.41 0.16 -0.3 -0.59 0.09 -0.74 -0.07 -0.65 -0.3 0.05 0.52 -0.1 -0.19 -0.2 0.36 -0.58 -0.72 -0.44 -0.34 1.32 -0.52 -0.71 -0.54 -0.47 0.2 0.25 0.6
0.15 0.26 0.17 0.49 0.15 0.03 -0.15 0.3 -0.11 -0.17 -0.09 -0.32 0.06 -0.25 -0.03 -0.04 0.05 -0.07 -0.4 -0.32 -0.06 -0.13 0.44 -0.33 -0.3 -0.09 -0.1 0.11 0.07 0.15
0.32 0.44 0.3 0.64 0.0 -0.2 -0.28 0.5 -0.23 -0.33 -0.28 -0.34 0.07 -0.05 0.05 -0.08 0.09 -0.15 -0.27 -0.3 -0.14 -0.31 0.36 -0.2 -0.24 -0.3 -0.24 0.14 0.08 0.13
-0.47 0.06 0.12 1.33 -0.08 -0.42 -1.66 0.32 -0.47 -0.4 -0.35 -0.55 -0.49 -1.44 -0.65 -0.62 -0.17 0.05 -0.78 -0.81 0.22 -0.4 1.48 -0.69 -0.2 0.12 -0.04 0.46 0.57 0.9
0.11 0.18 0.19 0.4 0.0 -0.14 -0.17 0.37 -0.12 -0.1 -0.29 -0.42 -0.0 0.01 -0.17 -0.24 -0.18 0.2 -0.19 -0.25 -0.2 -0.14 0.36 -0.12 -0.15 -0.19 -0.13 0.3 0.21 0.33
0.17 0.17 0.06 0.24 0.03 -0.07 -0.27 0.01 -0.13 -0.11 -0.13 -0.09 0.02 0.03 0.01 -0.11 -0.14 0.02 -0.35 -0.42 -0.15 -0.11 0.79 -0.2 -0.17 -0.18 -0.06 0.01 0.27 0.29
0.12 0.04 0.06 0.23 0.1 -0.23 -0.27 0.09 -0.09 -0.03 -0.13 -0.11 0.05 0.17 -0.06 -0.0 -0.03 0.0 -0.21 -0.32 -0.11 -0.15 0.38 -0.04 -0.07 -0.09 0.08 0.22 0.15 0.01
0.1 0.29 0.07 0.18 -0.11 -0.18 -0.19 -0.03 -0.3 -0.22 -0.23 -0.07 0.03 0.37 0.01 0.11 0.13 -0.09 -0.51 -0.47 0.08 -0.33 0.46 -0.01 -0.07 -0.18 0.03 0.03 0.18 0.37
0.14 0.24 0.12 0.4 0.01 -0.1 -0.21 0.2 -0.33 -0.21 -0.22 -0.22 0.22 0.28 0.09 -0.11 0.03 -0.04 -0.27 -0.18 -0.13 -0.23 0.63 -0.2 -0.41 -0.24 -0.07 -0.02 -0.01 0.25
0.23 0.17 0.12 0.34 0.11 -0.29 -0.25 0.09 -0.38 -0.13 -0.3 -0.26 -0.28 0.36 -0.13 -0.06 -0.02 0.44 -0.35 -0.14 -0.15 -0.12 0.97 -0.36 -0.39 -0.38 -0.05 -0.03 0.02 0.19
0.14 0.07 0.1 0.2 0.03 -0.28 -0.26 -0.06 -0.04 0.06 -0.06 -0.02 0.09 -0.1 0.04 -0.06 -0.0 -0.06 -0.25 -0.21 -0.22 -0.07 0.78 -0.22 -0.09 -0.05 0.05 0.13 0.0 -0.08
0.28 0.17 0.17 0.34 0.09 -0.01 -0.02 0.25 -0.24 -0.24 -0.19 -0.19 -0.07 0.08 -0.0 -0.03 0.05 -0.19 -0.34 -0.27 -0.16 -0.15 0.42 -0.05 -0.09 -0.31 -0.22 0.26 0.12 0.12
0.15 0.23 -0.03 0.09 0.07 -0.17 -0.05 0.22 -0.23 -0.21 -0.29 -0.22 0.04 0.27 -0.0 0.05 0.03 0.06 -0.51 -0.4 -0.14 -0.12 0.7 -0.17 -0.14 -0.13 -0.08 0.07 0.04 0.29
0.04 0.15 0.04 0.4 -0.25 -0.25 -0.2 0.41 -0.4 -0.32 -0.33 -0.35 0.29 0.31 0.04 0.02 -0.07 0.14 -0.19 -0.24 -0.11 0.01 0.64 -0.17 -0.2 -0.33 -0.11 0.03 -0.1 0.35
0.02 0.04 0.12 0.64 -0.09 -0.05 -0.7 0.35 -0.3 -0.24 -0.16 -0.05 -0.3 -0.35 -0.06 -0.01 0.06 -0.11 -0.51 -0.51 -0.12 -0.27 0.94 -0.33 -0.2 -0.12 -0.02 0.18 0.26 0.58
0.09 0.15 0.17 0.58 -0.22 -0.16 -0.3 0.11 -0.1 -0.18 -0.21 -0.27 0.19 0.09 0.22 0.13 0.18 -0.0 -0.51 -0.41 -0.22 -0.13 0.67 -0.13 -0.11 -0.29 -0.21 0.09 0.03 0.05
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0.22 0.18 0.11 0.37 0.02 -0.09 -0.15 0.41 -0.19 -0.21 -0.15 -0.15 0.13 0.04 0.04 0.03 0.1 -0.17 -0.32 -0.32 -0.24 -0.06 0.35 -0.18 -0.14 -0.3 -0.12 0.2 0.03 0.14
0.19 0.17 0.11 0.05 0.18 -0.12 -0.15 -0.13 -0.1 -0.06 -0.14 -0.13 0.02 0.05 0.03 -0.03 0.0 0.06 -0.32 -0.29 -0.18 -0.24 0.79 -0.24 -0.15 -0.15 -0.07 0.05 0.12 0.18
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0.16 0.1 0.03 0.03 0.0 -0.19 -0.1 0.16 -0.15 -0.1 -0.14 -0.14 0.19 0.28 0.07 -0.06 -0.04 0.08 -0.21 -0.21 -0.15 -0.13 0.49 -0.15 -0.15 -0.2 -0.09 0.12 0.06 0.16
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Spov3_chr3.04365 (RANGAP2)
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0.37 0.32 0.43 0.92 -0.48 -0.65 -0.58 0.67 -0.41 -0.24 -0.44 -0.32 0.01 -0.55 -0.42 -0.3 -0.31 0.75 -0.57 -0.67 -0.5 -0.23 1.03 -0.47 -0.55 -0.39 -0.21 0.11 0.37 0.51
0.22 0.12 0.16 0.3 -0.06 -0.3 -0.22 0.18 -0.2 -0.21 -0.11 -0.15 0.16 -0.0 -0.04 -0.02 0.01 0.09 -0.27 -0.27 -0.16 -0.22 0.72 -0.19 -0.05 -0.22 -0.04 0.22 0.09 -0.05
0.05 0.18 0.05 0.38 -0.18 -0.18 -0.25 0.32 -0.15 -0.08 -0.15 -0.17 0.05 0.34 0.03 0.01 0.06 0.04 -0.39 -0.36 -0.18 -0.18 0.42 -0.18 -0.18 -0.19 -0.09 0.21 0.15 0.15
0.13 0.25 0.16 0.61 -0.22 -0.33 -0.45 0.1 -0.22 -0.21 -0.18 -0.25 0.21 0.31 0.13 0.12 0.09 -0.25 -0.41 -0.47 -0.24 -0.21 0.79 -0.11 -0.15 -0.21 -0.01 0.21 -0.02 -0.07
0.04 0.13 0.3 0.43 -0.04 -0.04 -0.17 0.58 0.0 0.06 -0.26 -0.19 -0.22 0.23 -0.04 -0.22 -0.31 -0.06 -0.41 -0.4 -0.17 -0.32 0.34 -0.32 -0.33 -0.17 -0.18 0.33 0.39 0.26
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-0.15 0.03 0.02 0.16 0.23 -0.27 -0.34 0.15 -0.12 -0.11 -0.19 -0.12 -0.02 0.17 -0.02 -0.19 -0.03 0.14 -0.26 -0.28 -0.12 -0.15 0.81 -0.3 -0.07 -0.07 0.04 0.04 0.22 0.24
0.09 0.19 0.2 0.34 0.03 -0.04 -0.26 0.2 -0.01 -0.05 -0.27 -0.12 0.05 0.14 0.0 -0.03 0.02 0.13 -0.34 -0.45 -0.13 -0.16 0.34 -0.09 -0.25 -0.31 -0.04 0.14 0.15 0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.