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Heatmap: Cluster_2 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.04 0.01 0.01 -0.15 0.38 -0.02 -0.38 0.38 -0.18 -0.1 -0.33 -0.33 0.08 0.66 0.04 -0.0 -0.0 0.55 -0.54 -0.41 -0.17 -0.26 0.4 -0.26 -0.33 -0.21 -0.13 0.14 0.01 0.28
0.05 0.21 0.06 0.32 0.05 -0.14 -0.3 0.31 -0.24 -0.38 -0.35 -0.17 0.04 0.7 0.19 0.39 0.22 -0.09 -0.3 -0.21 -0.18 -0.2 0.48 -0.04 -0.27 -0.25 -0.14 -0.14 -0.27 -0.14
0.14 0.12 -0.09 0.09 -0.02 -0.1 -0.28 0.0 -0.39 0.05 -0.13 -0.22 0.21 0.62 0.1 0.19 0.04 0.5 -0.38 -0.21 -0.08 -0.32 0.29 -0.26 -0.23 -0.37 -0.13 0.08 0.01 0.11
0.13 0.16 0.03 0.03 0.04 -0.04 -0.14 0.28 -0.04 -0.1 -0.22 -0.25 -0.2 0.52 0.06 -0.05 0.11 0.44 -0.33 -0.29 -0.19 -0.18 0.46 -0.18 -0.31 -0.12 -0.2 -0.0 -0.06 0.1
0.11 0.29 -0.03 0.12 0.0 0.15 -0.22 0.12 -0.34 -0.31 -0.3 -0.28 0.13 0.79 0.33 0.28 0.1 0.17 -0.52 -0.26 -0.31 -0.3 0.33 -0.16 -0.25 -0.31 -0.15 0.0 0.02 -0.05
0.08 0.06 0.08 0.3 0.09 -0.33 -0.14 0.49 -0.43 -0.31 -0.25 -0.12 0.34 -0.03 0.09 -0.15 0.02 0.03 -0.3 -0.22 -0.17 -0.06 0.58 -0.08 -0.16 -0.16 -0.02 0.15 0.03 0.0
-0.02 0.1 0.09 0.54 -0.07 -0.04 -0.64 0.65 -0.43 -0.22 -0.23 -0.3 -0.13 0.47 0.25 0.27 0.56 -0.15 -0.61 -0.43 -0.11 -0.25 0.32 -0.19 -0.26 -0.09 0.05 0.1 -0.28 -0.05
0.13 0.1 0.01 0.03 -0.08 -0.19 -0.04 0.06 -0.11 -0.13 -0.12 -0.13 0.09 0.2 0.18 0.15 0.16 0.03 -0.13 -0.13 0.03 -0.07 0.25 -0.13 -0.05 -0.01 0.04 -0.03 -0.14 -0.11
0.02 0.08 0.16 0.33 -0.08 -0.37 -0.1 0.19 -0.21 -0.19 -0.12 -0.27 0.13 0.48 0.07 0.06 0.16 0.23 -0.28 -0.3 -0.42 -0.07 0.17 -0.17 -0.35 -0.19 -0.25 0.22 0.15 0.34
0.06 0.08 -0.14 -0.0 -0.08 -0.03 -0.05 0.19 -0.22 -0.25 -0.04 -0.13 0.05 0.38 0.16 0.13 0.08 0.07 -0.13 -0.28 -0.04 -0.12 0.21 0.11 -0.03 -0.11 -0.08 0.02 -0.07 0.05
0.14 0.16 0.11 0.25 -0.04 -0.06 -0.29 0.09 -0.17 0.03 -0.18 -0.15 0.05 0.19 0.15 0.21 0.17 0.16 -0.38 -0.28 -0.18 -0.2 0.43 -0.1 -0.15 -0.08 -0.07 -0.15 0.02 -0.05
0.1 0.24 0.08 0.16 0.15 -0.02 -0.18 0.13 -0.23 -0.15 -0.19 -0.23 0.1 0.42 -0.03 -0.06 0.05 0.25 -0.17 -0.37 -0.13 -0.19 0.33 -0.04 -0.19 -0.26 -0.09 0.04 0.06 0.05
0.1 0.21 0.04 0.25 0.05 -0.05 -0.24 -0.06 -0.12 -0.09 -0.12 -0.18 -0.14 0.34 0.27 0.27 0.31 -0.25 -0.31 -0.28 -0.12 -0.11 0.12 -0.1 -0.21 -0.04 -0.05 0.03 0.01 0.14
0.05 0.16 -0.05 0.1 -0.14 -0.0 -0.25 0.07 -0.22 -0.11 -0.17 -0.11 0.09 0.58 0.24 0.19 0.22 0.31 -0.31 -0.34 -0.18 -0.17 0.11 -0.05 -0.18 -0.08 -0.07 0.0 -0.04 -0.06
0.16 0.3 0.17 0.53 0.27 -0.14 -0.38 0.0 -0.16 -0.16 -0.21 -0.31 -0.01 0.6 0.19 0.24 0.26 0.14 -0.28 -0.3 -0.12 -0.29 -0.12 -0.21 -0.28 -0.34 -0.46 -0.08 0.01 0.21
0.14 0.11 -0.01 0.18 -0.05 -0.15 -0.27 -0.01 -0.06 0.08 -0.07 -0.15 0.08 0.43 -0.02 0.15 0.1 0.14 -0.09 -0.38 -0.17 -0.21 0.23 -0.14 -0.17 -0.11 -0.1 0.06 0.06 0.11
-0.03 0.22 -0.05 0.2 0.09 -0.03 -0.23 0.52 -0.33 -0.19 -0.18 -0.3 -0.02 0.45 0.09 0.05 0.23 0.23 -0.25 -0.27 -0.13 -0.19 0.3 -0.11 -0.15 -0.26 -0.11 -0.09 -0.02 0.06
Spov3_chr2.02251 (EMB3127)
 0.2 0.19 -0.05 -0.11 0.12 -0.25 -0.15 -0.09 -0.29 -0.13 -0.19 -0.39 0.04 0.57 0.13 0.01 0.21 0.59 -0.22 -0.47 -0.13 -0.12 0.39 -0.24 -0.28 -0.02 -0.21 0.12 -0.02 0.09
0.08 0.21 -0.05 0.06 0.07 -0.02 -0.18 0.09 -0.34 -0.07 -0.19 -0.25 0.11 0.64 0.06 0.16 0.23 -0.02 -0.31 -0.35 -0.16 -0.06 0.13 -0.13 -0.04 -0.14 -0.05 -0.09 0.06 0.13
Spov3_chr2.03072 (ABC1K10a)
 -0.31 -0.3 0.12 0.45 0.36 -0.48 -0.47 0.63 0.05 -0.05 0.1 -0.32 0.17 -0.41 -0.1 -0.21 0.18 -0.03 -0.43 -0.28 -0.21 -0.18 0.68 -0.4 -0.08 -0.19 0.02 0.24 0.18 0.24
0.21 0.16 -0.06 -0.0 0.1 -0.07 -0.03 -0.17 -0.08 -0.04 -0.1 -0.12 -0.07 0.53 0.19 0.21 0.13 0.12 -0.18 -0.28 -0.11 -0.13 0.05 0.08 -0.22 -0.09 -0.13 0.0 -0.1 -0.11
0.18 0.22 -0.11 0.31 0.04 -0.22 -0.36 -0.12 -0.54 -0.08 -0.28 -0.27 0.02 0.83 0.2 0.12 0.21 -0.01 -0.27 -0.34 -0.25 -0.09 0.24 -0.29 -0.17 -0.3 -0.06 -0.04 0.12 0.45
0.32 0.09 0.02 -0.01 0.05 -0.16 -0.26 -0.01 -0.23 -0.04 -0.16 -0.19 0.16 0.52 0.09 -0.02 0.03 0.44 -0.17 -0.41 -0.19 -0.31 0.25 -0.08 -0.25 -0.23 -0.09 0.19 0.04 0.13
-0.07 0.1 -0.05 0.37 -0.28 -0.25 -0.29 0.15 -0.32 -0.36 -0.26 -0.3 0.03 0.7 0.22 0.07 0.18 0.49 -0.41 -0.3 -0.02 -0.17 0.35 -0.02 -0.4 -0.15 -0.08 -0.09 0.07 0.26
0.15 0.34 0.24 0.48 0.08 -0.23 -0.26 0.06 -0.28 -0.37 -0.39 -0.36 -0.11 0.5 -0.0 0.29 0.12 0.05 -0.25 -0.14 -0.14 -0.15 0.34 -0.21 -0.17 -0.17 -0.15 0.09 -0.2 0.19
0.09 0.2 0.1 0.6 0.21 -0.11 -0.85 0.45 -0.44 -0.45 -0.54 -0.59 0.22 0.45 0.13 0.28 0.36 0.24 -0.56 -0.53 -0.19 -0.26 0.21 -0.61 -0.84 -0.14 -0.09 0.05 0.15 0.72
0.15 0.15 0.07 0.23 -0.03 -0.23 -0.23 0.31 -0.22 -0.21 -0.22 -0.29 0.17 0.49 0.14 0.01 0.07 0.26 -0.28 -0.29 -0.21 -0.18 0.23 -0.15 -0.21 -0.17 -0.19 0.03 0.11 0.21
0.03 0.19 0.07 0.2 0.09 -0.1 -0.33 0.13 -0.07 -0.07 -0.01 -0.21 0.03 0.25 0.07 0.04 0.17 0.13 -0.29 -0.25 -0.06 -0.07 0.23 -0.22 -0.15 0.01 -0.04 -0.02 -0.01 0.03
Spov3_chr3.03736 (CYCT1;3)
 0.09 0.22 -0.03 -0.12 0.26 -0.11 -0.13 0.02 0.06 0.11 -0.26 -0.08 -0.04 0.48 0.15 0.13 0.12 0.41 -0.39 -0.38 -0.17 -0.4 0.22 -0.27 -0.25 -0.09 -0.04 0.06 0.03 -0.07
-0.06 0.09 -0.01 0.29 0.25 -0.17 -0.23 0.05 -0.19 -0.08 -0.17 -0.21 0.07 0.03 0.17 0.18 0.23 0.2 -0.26 -0.31 -0.05 -0.23 0.5 -0.28 -0.17 -0.14 -0.15 0.02 -0.03 0.24
0.12 0.03 0.03 0.35 0.12 -0.16 -0.11 0.26 -0.38 -0.41 -0.17 -0.3 0.18 0.49 0.16 0.08 0.2 0.2 -0.3 -0.38 -0.26 -0.3 0.32 -0.12 -0.13 -0.16 -0.25 0.14 -0.03 0.15
0.13 0.22 -0.07 -0.04 0.15 -0.06 -0.16 -0.09 -0.14 0.09 -0.02 -0.07 -0.19 0.55 0.23 0.07 0.02 0.24 -0.3 -0.3 -0.21 -0.21 0.18 -0.17 -0.26 -0.12 -0.15 0.0 0.13 0.15
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0.12 0.22 -0.06 0.11 0.2 -0.11 -0.13 0.05 -0.36 -0.23 -0.21 -0.11 0.18 0.4 0.08 -0.02 0.08 0.34 -0.2 -0.45 -0.2 -0.12 0.21 -0.09 -0.16 -0.18 -0.07 0.08 0.12 0.12
0.14 0.3 -0.08 0.07 -0.17 -0.2 -0.26 -0.08 -0.05 -0.02 -0.04 -0.04 0.14 0.54 0.09 0.03 0.11 0.1 -0.28 -0.43 -0.09 -0.25 0.18 -0.14 -0.16 -0.12 -0.07 0.18 0.02 0.17
0.16 0.14 0.03 0.14 -0.07 -0.12 -0.04 -0.05 -0.11 -0.11 -0.18 -0.07 0.08 0.21 0.21 0.13 0.21 -0.04 -0.27 -0.26 -0.1 -0.09 0.35 -0.2 -0.09 -0.1 -0.04 0.01 -0.08 0.13
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0.11 0.23 -0.01 0.21 -0.03 -0.06 -0.17 0.02 -0.11 -0.07 -0.16 -0.05 -0.03 0.35 0.14 0.14 0.15 -0.07 -0.14 -0.3 -0.09 -0.19 0.08 -0.12 -0.12 -0.02 0.05 0.09 0.01 -0.05
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.