Heatmap: Cluster_42 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_10441.1	-0.87	-0.86	-0.78	-0.46	-0.66	-0.45	-0.49	-0.18	0.14	0.29	0.29	0.57	1.26	-0.08	-0.3	-0.04	0.12	-0.73	-0.47	-0.21	-0.19	-0.16	-0.68	0.5	0.19	0.05	-0.07	0.08	-0.21	0.11	1.17
Lsat_1_v5_gn_0_37081.1 (Pnsl5)	-0.22	-0.71	-0.67	-0.61	-1.19	-0.85	-0.48	-0.29	0.29	0.29	0.47	0.85	1.45	-1.17	-1.21	-0.15	0.29	-0.4	-0.1	0.0	-0.11	-0.07	-1.79	0.72	0.38	-0.08	-0.08	0.71	-0.74	-0.27	0.68
Lsat_1_v5_gn_1_10420.1 (ASD)	0.13	-0.6	-0.37	-0.09	-0.8	-0.53	-0.14	-0.26	0.2	0.22	0.3	0.5	1.11	-0.64	-0.74	0.08	0.47	-1.84	-0.38	0.21	0.08	0.09	-1.89	0.59	0.36	0.11	0.13	0.64	-0.54	-0.28	0.13
Lsat_1_v5_gn_1_10500.1 (EMB3003)	-0.5	-0.53	-0.54	-0.37	-0.39	-0.19	0.03	0.08	0.03	0.06	0.14	0.27	0.86	-0.36	-0.3	0.21	0.35	-0.16	-0.22	0.13	0.01	0.06	-0.78	0.23	0.19	0.08	0.03	0.17	-0.12	0.06	0.33
Lsat_1_v5_gn_1_116480.1 (MOD1)	-1.13	-1.22	-1.0	-0.78	-0.56	-0.35	-0.01	0.16	-0.05	0.08	0.22	0.41	1.17	-0.44	-0.58	0.38	0.61	-0.13	-0.4	0.08	0.01	0.13	-1.53	0.41	0.33	0.21	-0.03	0.25	-0.34	0.0	0.64
Lsat_1_v5_gn_1_1541.1 (CYCD2;1)	-2.3	-3.12	-2.83	-1.96	-1.19	-0.72	-0.1	0.12	-0.58	0.16	-0.07	0.45	1.71	-0.6	-0.53	-0.29	0.24	0.65	-0.81	0.06	-0.31	-0.21	-0.66	0.42	-0.05	-0.29	-0.58	0.12	-0.68	0.2	2.13
Lsat_1_v5_gn_1_28341.1 (pat1)	-0.33	-0.5	-0.48	-0.26	-0.37	-0.3	-0.01	-0.03	0.24	0.27	0.3	0.5	0.52	-0.13	-0.23	-0.04	0.26	-0.75	-0.08	0.1	-0.01	0.05	-1.15	0.33	0.18	0.06	0.05	0.34	-0.12	-0.02	0.32
Lsat_1_v5_gn_1_28561.1	-0.36	-0.8	-0.48	-0.15	-0.17	0.11	-0.28	-0.24	0.06	0.13	0.36	0.47	0.88	-0.34	-0.65	0.15	0.29	-0.78	0.1	0.02	-0.15	0.02	-1.62	0.49	0.25	0.11	0.03	0.26	-0.49	-0.08	0.62
Lsat_1_v5_gn_1_32701.1 (GSA1)	-0.37	-0.52	-0.47	-0.1	-0.39	-0.39	-0.26	-0.31	0.16	0.18	0.26	0.4	0.97	-0.33	-0.61	-0.09	0.08	-0.6	-0.42	-0.04	-0.06	-0.07	-0.12	0.52	0.22	-0.06	-0.03	0.23	-0.25	0.1	0.77
Lsat_1_v5_gn_1_3320.1	0.28	-0.38	0.23	0.41	-1.89	-1.74	-0.13	0.03	0.43	0.51	0.49	0.82	1.31	-3.22	-1.89	-0.01	0.5	-3.76	-0.69	0.19	0.15	0.03	-4.2	0.6	0.36	0.01	-0.17	0.63	-0.82	-0.31	0.22
Lsat_1_v5_gn_1_36600.1 (TRM2a)	-0.2	-0.47	-0.28	-0.11	-0.64	-0.48	-0.14	-0.01	0.3	0.18	0.36	0.56	1.16	-0.31	-0.48	-0.01	0.22	-1.63	-0.43	-0.0	0.07	0.03	-0.99	0.42	0.22	0.11	0.03	0.74	-0.74	-0.44	0.14
Lsat_1_v5_gn_1_63701.1 (SLP)	-0.33	-0.68	-0.93	-0.91	-1.08	-0.54	-0.21	0.3	0.02	0.09	0.22	0.65	1.38	-0.32	-0.78	-0.11	0.28	-1.05	-0.47	-0.06	-0.04	0.08	-1.24	0.7	0.37	-0.06	-0.19	0.44	-0.38	0.01	0.87
Lsat_1_v5_gn_1_69920.1 (OEP34)	-0.49	-0.85	-0.72	-0.4	-0.55	-0.27	0.01	0.11	0.02	0.16	0.15	0.39	1.09	-0.59	-0.63	0.04	0.29	-1.12	-0.33	0.02	0.02	0.18	-0.79	0.53	0.3	0.09	0.06	0.28	-0.27	0.09	0.72
Lsat_1_v5_gn_1_7780.1 (PAP8)	-1.29	-1.28	-1.47	-1.12	-0.93	-0.45	-0.54	0.2	-0.23	-0.13	-0.14	0.56	1.31	0.16	-0.39	-0.18	0.08	-0.01	-0.83	-0.3	-0.15	-0.07	-0.62	0.69	0.26	-0.06	-0.38	-0.14	0.05	0.27	1.7
Lsat_1_v5_gn_1_90901.1 (EMB3137)	0.22	-0.36	-0.21	-0.02	-0.47	-0.21	-0.04	-0.11	0.11	0.15	0.25	0.36	0.82	-0.52	-0.56	-0.04	0.28	-2.15	-0.3	0.1	0.05	0.09	-1.18	0.44	0.33	0.08	0.13	0.61	-0.42	-0.15	0.19
Lsat_1_v5_gn_2_112680.1 (ADK2)	-0.52	-0.84	-0.84	-0.64	-0.1	0.05	0.0	0.04	-0.23	-0.04	-0.09	0.14	0.89	-0.16	-0.32	-0.06	0.15	0.0	-0.34	0.02	-0.08	0.04	-0.34	0.3	0.19	0.09	0.05	0.25	0.25	0.22	0.58
Lsat_1_v5_gn_2_121221.1 (PSRP4)	0.14	-0.16	-0.15	-0.17	-0.96	-1.11	-0.1	-0.19	0.31	0.33	0.32	0.55	0.73	-0.85	-0.5	0.14	0.41	-1.7	-0.07	0.42	0.08	0.01	-2.43	0.55	0.27	0.01	0.2	0.31	-0.31	-0.01	0.22
Lsat_1_v5_gn_2_123641.1 (PRPL11)	-0.06	-0.59	-0.35	-0.13	-0.48	-0.41	-0.12	-0.19	0.24	0.33	0.37	0.53	1.18	-0.65	-0.79	-0.05	0.36	-2.1	-0.59	0.06	-0.01	0.08	-1.05	0.48	0.33	-0.03	-0.01	0.68	-0.58	-0.24	0.39
Lsat_1_v5_gn_2_124241.1	-0.53	-0.68	-0.59	-0.54	-0.15	-0.09	-0.15	-0.05	-0.25	0.07	-0.03	0.15	1.05	0.06	-0.09	-0.07	0.04	-0.49	-0.23	0.02	0.03	-0.01	-0.75	0.18	0.02	0.0	-0.07	0.12	0.07	0.25	0.99
Lsat_1_v5_gn_2_125401.1 (HEME2)	-0.0	-0.16	0.17	0.45	-0.57	-0.46	0.22	0.08	0.3	0.41	0.41	0.58	0.75	-1.51	-1.21	-0.11	0.19	-2.01	-0.43	0.13	-0.03	0.01	-1.19	0.37	0.25	0.1	0.02	0.5	-0.43	-0.16	-0.07
Lsat_1_v5_gn_2_133660.1 (PKP2)	-1.58	-1.67	-0.99	-0.28	-0.77	-0.69	0.06	-0.0	0.1	0.23	0.4	0.59	1.44	-0.83	-0.6	0.41	0.65	-0.12	-0.5	0.14	-0.07	-0.06	-1.33	0.41	0.33	-0.02	-0.17	0.44	-0.56	-0.09	0.49
Lsat_1_v5_gn_2_135421.1 (Tric2)	-0.46	-0.73	-0.56	-0.25	-0.6	-0.21	-0.28	0.09	-0.11	-0.02	0.1	0.35	0.98	0.2	-0.19	0.08	0.19	-0.35	-0.16	-0.07	-0.02	0.01	-0.71	0.29	0.09	0.05	0.03	-0.05	-0.05	0.06	0.8
Lsat_1_v5_gn_2_3840.1	-0.08	-0.44	-0.24	-0.12	-0.33	-0.07	-0.08	-0.06	0.1	0.2	0.14	0.37	0.86	-0.36	-0.63	-0.08	0.21	-2.0	-0.34	-0.1	-0.04	0.08	-1.02	0.52	0.26	0.1	0.08	0.48	-0.25	0.1	0.46
Lsat_1_v5_gn_2_39021.1 (CPN20)	-1.22	-1.55	-1.2	-0.93	-1.33	-1.03	-0.45	-0.0	-0.06	0.06	0.2	0.63	1.41	-0.71	-0.84	-0.26	0.2	-0.14	-0.65	-0.07	-0.15	-0.12	-1.14	0.75	0.31	-0.07	-0.22	0.28	-0.37	0.3	1.77
Lsat_1_v5_gn_2_39681.1 (PRPL28)	0.19	-0.24	-0.14	0.04	-0.34	-0.34	-0.24	-0.31	0.28	0.23	0.39	0.51	0.77	-0.42	-0.22	0.1	0.32	-2.16	-0.07	0.17	0.08	-0.03	-1.46	0.33	0.18	0.02	0.07	0.56	-0.45	-0.3	-0.16
Lsat_1_v5_gn_2_40261.1	0.32	-0.26	-0.27	-0.17	-0.39	-0.06	0.09	0.3	0.04	0.1	-0.06	0.34	0.81	-0.06	-0.24	-0.21	0.02	-0.1	-0.31	-0.14	0.05	-0.01	-0.52	0.09	0.16	0.08	-0.16	0.3	-0.32	-0.19	0.01
Lsat_1_v5_gn_2_52041.1 (BIO2)	-0.28	-0.47	-0.45	-0.23	-0.42	-0.14	-0.05	-0.02	0.02	0.18	0.1	0.19	0.76	-0.2	-0.04	0.25	0.35	-0.96	-0.07	0.17	0.04	0.02	-1.58	0.26	0.15	0.09	0.07	0.24	0.06	0.12	0.27
Lsat_1_v5_gn_2_60700.1 (PRPL1)	0.07	-0.3	-0.22	-0.07	-0.42	-0.28	-0.12	-0.17	0.21	0.31	0.36	0.52	0.75	-0.31	-0.37	-0.01	0.28	-2.09	-0.16	0.09	-0.02	0.08	-1.83	0.45	0.26	-0.04	0.01	0.41	-0.27	0.01	0.2
Lsat_1_v5_gn_2_67580.1 (AGT2)	-0.73	-1.41	-0.64	-0.52	-0.25	-0.42	-0.14	-0.45	0.13	0.25	0.18	0.55	1.28	-0.41	-0.09	0.03	0.18	-0.35	-0.6	0.11	0.16	-0.13	-0.33	0.13	-0.0	-0.14	0.04	-0.1	-0.57	0.15	1.16
Lsat_1_v5_gn_2_76281.1	-1.09	-1.11	-1.31	-0.71	-1.65	-1.55	-0.09	0.07	0.42	0.37	0.62	0.7	1.14	-1.02	-0.64	0.14	0.58	-1.96	-0.44	0.28	0.03	0.11	-3.08	0.92	0.48	0.02	0.06	0.29	-0.78	0.17	0.99
Lsat_1_v5_gn_2_91740.1 (RPL12-C)	-0.07	-0.4	-0.29	-0.14	-0.72	-0.49	-0.1	-0.28	0.27	0.28	0.29	0.46	0.82	-0.52	-0.6	0.09	0.34	-1.96	-0.3	0.27	0.17	0.18	-1.06	0.6	0.39	0.13	0.18	0.42	-0.42	-0.18	-0.02
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Lsat_1_v5_gn_2_93120.1 (RPL27)	0.29	-0.22	-0.02	0.21	-0.61	-0.46	0.03	0.0	0.22	0.34	0.41	0.58	0.85	-1.19	-1.13	-0.06	0.25	-2.07	-0.42	0.16	0.04	0.12	-1.78	0.49	0.32	0.14	0.13	0.74	-0.63	-0.39	-0.28
Lsat_1_v5_gn_2_94161.1 (GHS1)	0.04	-0.28	-0.07	0.13	-0.58	-0.28	-0.07	-0.11	0.24	0.23	0.33	0.4	0.53	-0.44	-0.54	-0.03	0.23	-1.69	-0.19	0.2	0.09	0.06	-1.72	0.43	0.32	0.2	0.26	0.32	-0.34	-0.06	0.13
Lsat_1_v5_gn_3_110880.1 (IAN5)	0.14	-0.29	-0.04	0.13	-0.5	-0.46	-0.04	0.03	0.26	0.29	0.4	0.49	0.83	-0.53	-0.29	0.18	0.35	-2.23	-0.36	0.19	0.04	0.16	-2.28	0.31	0.16	0.06	0.11	0.59	-0.79	-0.41	-0.06
Lsat_1_v5_gn_3_121460.1	-0.96	-0.57	-0.78	-0.53	-0.4	-0.03	-0.01	-0.16	-0.02	0.08	-0.03	0.33	1.27	-1.42	-0.68	0.1	0.18	0.2	-1.04	0.19	-0.08	0.19	-1.58	-0.2	0.25	0.29	0.23	0.42	-0.11	0.24	0.94
Lsat_1_v5_gn_3_131281.1	-0.21	-0.59	-0.41	-0.09	-0.56	-0.26	-0.1	-0.04	0.28	0.35	0.55	0.63	0.76	-0.25	-0.39	-0.12	0.07	-1.58	-0.31	0.09	0.03	0.07	-2.09	0.51	0.25	0.08	0.08	0.34	-0.46	-0.05	0.47
Lsat_1_v5_gn_3_140401.1	-1.76	-2.39	-1.67	-1.25	-0.68	-0.53	-0.41	-0.21	-0.25	-0.08	-0.23	0.4	1.45	-1.56	-0.59	0.05	0.31	0.68	-0.29	0.2	-0.24	0.07	-0.19	0.58	0.07	0.1	-0.4	0.26	-0.73	0.24	1.66
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.