Heatmap: Cluster_242 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.18 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.39 0.0 0.74 0.0 0.62 0.52 0.5 0.0 1.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.21 0.0 0.11 0.43 0.36 0.0 0.47 0.25 0.55 0.57 0.3 0.88 0.24 0.85 0.32 0.47 0.17 0.08 0.56 0.23 0.65 0.59 0.08 0.18 0.18 1.0 0.17 0.17 0.41 0.21
0.0 0.0 0.25 1.0 0.6 0.1 0.3 0.0 0.28 0.0 0.41 0.55 0.32 0.0 0.91 0.0 0.21 0.09 0.09 0.0 0.26 0.0 0.0 0.1 0.09 0.18 1.0 0.09 0.11 0.76 0.3
1.0 0.0 0.49 0.0 0.82 0.38 0.19 0.45 0.0 0.0 0.84 0.2 0.2 0.7 0.22 0.0 0.36 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.36 0.86 0.0 0.0 0.38 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0
0.81 0.84 0.0 0.0 0.43 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.25 0.24 0.81 0.0 0.21 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61
0.28 0.36 0.16 0.13 0.22 0.34 0.58 0.47 0.23 0.78 0.6 0.35 0.07 0.82 0.42 0.43 0.33 0.13 0.82 0.47 0.24 0.67 0.0 0.08 0.34 0.39 1.0 0.24 0.52 0.46 0.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.77 0.0 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.31 0.07 0.29 0.34 0.53 0.06 0.15 0.14 0.14 0.97 0.37 0.29 0.38 0.22 0.0 0.57 0.0 0.0 0.42 0.0 0.11 0.13 1.0 0.63 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.29 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.29 0.0 0.0 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.07 0.36 0.11 0.32 0.07 0.34 1.0 0.18 0.46 0.5 0.26 0.17 0.08 0.2 0.0 0.33 0.05 0.05 0.13 0.0 0.28 0.0 0.29 0.15 0.1 0.28 0.47 0.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.41 0.3 0.14 0.1 0.47 0.23 0.05 0.34 0.31 0.27 0.67 0.92 0.36 0.2 0.6 0.56 0.44 0.33 0.18 0.76 0.14 0.28 0.12 0.22 0.2 0.49 0.91 0.24 0.32 1.0 0.52
1.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.28 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.25 0.21 0.22
0.0 0.0 0.27 0.25 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.25
0.18 0.67 0.38 0.01 0.58 0.19 0.22 0.04 0.01 0.0 0.05 0.02 0.08 0.07 0.08 0.66 0.09 1.0 0.32 0.04 0.15 0.41 0.0 0.04 0.19 0.04 0.55 0.15 0.14 0.04 0.05
0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.2 0.87 0.58 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.23 0.0 0.0 0.0
0.0 0.56 0.0 0.65 0.0 0.1 0.26 1.0 0.0 0.0 0.58 0.1 0.52 0.27 0.0 0.32 0.22 0.0 0.7 0.4 0.6 0.0 0.0 0.53 0.14 0.43 0.95 0.13 0.53 0.66 0.55
0.0 0.53 0.26 0.0 1.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.59 0.37 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.72 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.54 0.21 0.0 0.41 0.15 0.08 0.21 0.19 0.39 0.88 0.95 0.58 0.71 0.96 0.36 1.0 0.1 0.0 0.77 0.19 0.19 0.25 0.15 0.19 0.39 0.0 0.97 0.8 0.7 0.28 0.82
0.0 0.19 0.5 0.0 0.54 0.25 0.05 0.1 0.77 0.52 0.29 0.56 0.18 0.41 0.49 0.52 0.06 0.06 0.41 0.21 0.2 0.28 0.21 0.11 0.11 0.37 0.69 0.16 0.11 1.0 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.36 0.94 0.0 0.65 0.35 0.18 0.0 0.18 0.0 0.15 0.0 0.44 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.5 0.34 1.0 0.5 0.7
0.0 0.19 0.0 0.19 0.12 0.29 0.07 0.0 0.16 0.46 0.8 0.58 0.0 0.08 0.08 0.42 0.41 0.0 0.15 0.52 0.22 0.32 0.0 0.24 0.66 0.64 1.0 0.24 0.09 0.24 0.08
0.2 0.0 0.0 0.09 0.23 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.77 0.0 0.39 0.0 0.24 0.9 0.0 1.0 0.68 0.0 0.33 0.52
0.0 0.28 0.0 0.14 0.12 0.0 0.36 0.33 0.25 0.2 0.1 0.23 0.35 0.0 0.34 0.75 0.42 0.71 0.15 0.24 0.0 0.25 0.71 0.29 0.1 0.21 1.0 0.09 0.0 0.25 0.0
0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.46 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.26 0.0 1.0 0.0
0.0 0.27 0.0 0.76 0.18 0.13 0.43 0.17 0.39 0.0 0.57 0.39 0.51 0.14 0.29 0.24 0.41 0.5 0.62 0.24 1.0 0.0 0.13 0.24 0.91 0.86 0.28 0.54 0.43 0.57 0.48
0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
0.96 0.3 0.37 0.25 0.38 0.4 0.43 0.19 0.48 0.76 0.06 0.71 0.79 0.37 0.48 0.18 0.45 0.05 0.41 0.67 0.44 0.33 0.3 0.51 0.67 0.46 0.42 0.37 0.62 0.57 1.0
0.21 0.15 0.19 0.29 0.82 0.5 0.11 0.04 0.38 0.66 0.44 0.48 0.4 0.22 0.3 0.68 0.55 0.53 0.27 0.44 1.0 0.33 0.61 0.14 0.48 0.21 0.32 0.49 0.79 0.61 0.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.27 0.28
0.0 0.0 0.28 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.46 0.26 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.93 1.0 0.44 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.26 0.23 0.0 0.0 0.13 0.0 0.36 0.15 0.17
0.0 0.26 0.12 0.86 0.0 0.5 0.46 0.0 0.1 0.0 0.75 0.1 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.1 0.87 1.0 0.75 0.58 0.0 0.47 0.11 0.96 0.7 0.55 0.44 0.98 0.12
0.16 0.0 0.05 0.34 0.08 0.23 0.48 0.65 0.66 1.0 0.13 0.8 0.21 0.23 0.56 0.23 0.49 0.14 0.33 0.34 0.23 0.92 0.05 0.37 0.22 0.51 0.22 0.34 0.31 0.53 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 1.0 0.0 0.0 0.68 0.68
0.06 1.0 0.27 0.08 0.2 0.11 0.06 0.03 0.02 0.03 0.06 0.01 0.01 0.01 0.05 0.68 0.72 0.28 0.09 0.07 0.08 0.05 0.0 0.04 0.13 0.04 0.36 0.03 0.08 0.05 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.65 0.0 1.0 0.53 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.86 0.0 0.48 0.0 0.0 0.34 0.62 0.0 0.0 0.39 0.33 0.0 0.0 0.94 0.31 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.62 0.0 0.2 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.18 0.0 0.0 1.0 0.19 0.19
0.23 0.0 0.41 0.0 0.67 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.19 0.18 0.19 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)