Heatmap: Cluster_242 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_46301.1 (LRL2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_11240.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71	0.48	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	1.02	0.0	1.94	0.0	1.62	1.37	1.32	0.0	2.62	0.0	0.0	2.48	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_116581.1	0.06	0.11	0.0	0.06	0.23	0.19	0.0	0.25	0.13	0.29	0.3	0.16	0.47	0.13	0.45	0.17	0.25	0.09	0.04	0.3	0.12	0.35	0.31	0.04	0.1	0.1	0.53	0.09	0.09	0.22	0.11
Lsat_1_v5_gn_1_130120.1	0.0	0.0	0.05	0.19	0.12	0.02	0.06	0.0	0.05	0.0	0.08	0.11	0.06	0.0	0.18	0.0	0.04	0.02	0.02	0.0	0.05	0.0	0.0	0.02	0.02	0.04	0.19	0.02	0.02	0.15	0.06
Lsat_1_v5_gn_1_2141.1 (GFR)	0.1	0.0	0.05	0.0	0.08	0.04	0.02	0.05	0.0	0.0	0.09	0.02	0.02	0.07	0.02	0.0	0.04	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.09	0.0	0.0	0.04	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_26780.1 (ABCG14)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_30180.1 (HSP21)	0.14	0.14	0.0	0.0	0.07	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.04	0.04	0.14	0.0	0.04	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1
Lsat_1_v5_gn_1_61621.1 (ATC)	2.23	2.88	1.27	1.05	1.77	2.77	4.66	3.8	1.85	6.3	4.79	2.83	0.6	6.6	3.36	3.44	2.68	1.08	6.56	3.79	1.95	5.37	0.0	0.65	2.73	3.13	8.05	1.93	4.16	3.66	5.4
Lsat_1_v5_gn_1_62220.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.02	0.0	0.01
Lsat_1_v5_gn_1_88400.1 (ACP5)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_97781.1 (IRR)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_118061.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.1	0.04	0.03	0.04	0.02	0.0	0.06	0.0	0.0	0.04	0.0	0.01	0.01	0.1	0.06	0.03
Lsat_1_v5_gn_2_19180.1 (MPK9)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.01
Lsat_1_v5_gn_2_41820.1 (YUC7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_61861.1	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.1	0.02	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.02	0.0	0.03	0.01	0.01	0.01	0.0	0.03	0.0	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.05
Lsat_1_v5_gn_2_84020.1 (HEC2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_103321.1	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_110520.1	0.37	0.27	0.13	0.08	0.42	0.21	0.05	0.3	0.27	0.24	0.6	0.82	0.33	0.18	0.53	0.5	0.39	0.3	0.16	0.68	0.12	0.25	0.11	0.2	0.18	0.44	0.82	0.22	0.29	0.89	0.46
Lsat_1_v5_gn_3_127641.1 (PEARLI 4)	0.12	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_36581.1 (BPP6)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.61	0.0	0.0	0.0	0.13
Lsat_1_v5_gn_3_721.1 (NRPB4)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.07	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_98541.1 (IBS1)	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.03	0.02	0.03
Lsat_1_v5_gn_4_105941.1 (RBB1)	0.0	0.0	0.25	0.23	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.0	0.24
Lsat_1_v5_gn_4_145381.1	0.09	0.34	0.19	0.01	0.29	0.1	0.11	0.02	0.0	0.0	0.02	0.01	0.04	0.03	0.04	0.33	0.04	0.5	0.16	0.02	0.07	0.21	0.0	0.02	0.09	0.02	0.28	0.07	0.07	0.02	0.02
Lsat_1_v5_gn_4_160361.1 (GMI1)	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.09	0.06	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.02	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_17740.1 (XPO4)	0.0	1.67	0.0	1.93	0.0	0.31	0.76	2.98	0.0	0.0	1.72	0.31	1.56	0.8	0.0	0.95	0.65	0.0	2.09	1.2	1.79	0.0	0.0	1.59	0.42	1.29	2.83	0.4	1.58	1.95	1.63
Lsat_1_v5_gn_4_182640.1 (CYP79A2)	0.0	0.02	0.01	0.0	0.04	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_61840.1 (PAB2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_118361.1 (HAL3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.04	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_130081.1 (OCP3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_144481.1 (PHYC)	0.87	0.34	0.0	0.65	0.24	0.13	0.35	0.3	0.62	1.42	1.52	0.94	1.15	1.54	0.58	1.61	0.16	0.0	1.25	0.3	0.31	0.41	0.25	0.3	0.63	0.0	1.56	1.29	1.14	0.46	1.33
Lsat_1_v5_gn_5_158841.1 (PAKRP2)	0.0	0.33	0.88	0.0	0.96	0.44	0.09	0.18	1.34	0.91	0.52	0.98	0.32	0.72	0.86	0.91	0.11	0.1	0.72	0.37	0.35	0.5	0.36	0.19	0.2	0.64	1.22	0.29	0.19	1.76	0.27
Lsat_1_v5_gn_5_54861.1 (ADG1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.04	0.12	0.0	0.08	0.04	0.02	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.05	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.06	0.04	0.12	0.06	0.09
Lsat_1_v5_gn_5_57761.1 (FLL1)	0.0	0.92	0.0	0.9	0.55	1.41	0.34	0.0	0.75	2.18	3.84	2.81	0.0	0.37	0.41	2.0	1.98	0.0	0.71	2.52	1.05	1.54	0.0	1.13	3.16	3.07	4.8	1.14	0.42	1.17	0.38
Lsat_1_v5_gn_5_60281.1 (SAUR14)	0.12	0.0	0.0	0.06	0.14	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.47	0.0	0.24	0.0	0.15	0.55	0.0	0.61	0.41	0.0	0.2	0.32
Lsat_1_v5_gn_5_80201.1 (RPS11)	0.0	0.16	0.0	0.08	0.07	0.0	0.2	0.18	0.14	0.11	0.05	0.13	0.19	0.0	0.19	0.41	0.23	0.39	0.08	0.13	0.0	0.14	0.39	0.16	0.05	0.11	0.55	0.05	0.0	0.14	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_3881.1	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_6320.1	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.07	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.04	0.0	0.15	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_73281.1 (RPN1A)	0.0	0.84	0.0	2.34	0.55	0.41	1.34	0.51	1.22	0.0	1.77	1.21	1.58	0.43	0.9	0.75	1.28	1.55	1.91	0.74	3.1	0.0	0.39	0.75	2.82	2.66	0.86	1.68	1.34	1.78	1.47
Lsat_1_v5_gn_6_91081.1	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_103061.1 (TTA1)	0.46	0.14	0.18	0.12	0.18	0.19	0.21	0.09	0.23	0.37	0.03	0.34	0.38	0.18	0.23	0.09	0.21	0.02	0.2	0.32	0.21	0.16	0.14	0.24	0.32	0.22	0.2	0.18	0.3	0.27	0.48
Lsat_1_v5_gn_7_29301.1	0.06	0.05	0.06	0.09	0.26	0.16	0.04	0.01	0.12	0.21	0.14	0.15	0.13	0.07	0.09	0.21	0.17	0.17	0.08	0.14	0.31	0.1	0.19	0.04	0.15	0.06	0.1	0.15	0.25	0.19	0.26
Lsat_1_v5_gn_7_51600.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01
Lsat_1_v5_gn_7_63300.1 (NAP5)	0.0	0.0	0.03	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.05	0.03	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.09	0.1	0.04	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_78621.1 (EXPB2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_83581.1 (RIFP1)	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.18	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.31	0.27	0.0	0.0	0.16	0.0	0.42	0.17	0.19
Lsat_1_v5_gn_8_10581.1	0.0	0.15	0.07	0.47	0.0	0.28	0.25	0.0	0.05	0.0	0.42	0.06	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.06	0.48	0.55	0.41	0.32	0.0	0.26	0.06	0.53	0.39	0.3	0.24	0.54	0.06
Lsat_1_v5_gn_8_55941.1 (IPT5)	0.06	0.0	0.02	0.13	0.03	0.09	0.18	0.25	0.25	0.38	0.05	0.31	0.08	0.09	0.21	0.09	0.19	0.06	0.12	0.13	0.09	0.35	0.02	0.14	0.08	0.19	0.08	0.13	0.12	0.2	0.12
Lsat_1_v5_gn_8_83280.1 (IQD24)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.05	0.0	0.0	0.03	0.03
Lsat_1_v5_gn_9_20320.1 (TPS6)	0.45	7.67	2.05	0.65	1.51	0.87	0.49	0.25	0.18	0.2	0.46	0.08	0.08	0.04	0.4	5.24	5.51	2.12	0.67	0.54	0.64	0.39	0.03	0.29	0.99	0.28	2.78	0.26	0.59	0.38	0.24
Lsat_1_v5_gn_9_43641.1 (FPF1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.05	0.0	0.08	0.04	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_6020.1 (AST12)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.02	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_65721.1	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.13	0.0	0.04	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.04	0.0	0.0	0.22	0.04	0.04
Lsat_1_v5_gn_9_73420.1	0.01	0.0	0.02	0.0	0.04	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)