Heatmap: Cluster_151 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_10501.1 (CDP1)	-0.19	-0.58	-0.28	-0.12	-0.07	0.01	-0.22	-0.34	0.08	0.1	0.26	0.13	0.47	-0.04	-0.05	0.1	0.07	-0.77	-0.1	0.02	-0.05	0.06	-1.66	0.17	0.2	0.16	0.07	0.17	-0.09	0.24	0.76
Lsat_1_v5_gn_0_10520.1	-0.28	-0.26	-0.26	-0.55	-0.43	-0.11	-0.37	0.11	0.18	0.39	0.51	0.5	0.56	-0.39	-0.29	-0.39	-0.24	-1.25	-0.12	0.0	-0.18	0.0	-0.45	0.29	0.25	0.0	-0.16	-0.35	-0.16	0.29	1.12
Lsat_1_v5_gn_1_4180.1	-0.45	-0.4	-0.22	-0.19	-0.34	-0.21	0.0	-0.17	0.07	0.09	0.0	0.09	0.3	-0.54	-0.26	0.15	0.35	-0.25	0.04	0.26	0.08	0.04	-1.24	0.21	0.16	0.29	0.21	-0.12	-0.02	0.24	0.67
Lsat_1_v5_gn_1_56260.1 (BPL4)	-1.25	-1.13	-0.8	-0.27	-0.16	-0.16	-0.14	-0.31	0.28	0.48	0.46	0.37	0.92	-0.69	-0.39	0.21	0.3	-0.8	-0.32	0.14	-0.08	0.15	-3.2	0.27	0.25	0.17	0.16	0.06	-0.19	0.31	0.87
Lsat_1_v5_gn_1_62140.1	-1.89	-2.04	-1.46	-0.72	-0.59	-0.78	-0.14	-0.14	-0.02	0.31	0.06	0.64	1.14	-1.53	-0.21	0.19	0.47	-0.0	-0.22	0.3	-0.17	-0.02	-2.48	-0.05	0.25	0.28	0.12	-0.09	0.02	0.35	1.52
Lsat_1_v5_gn_1_64661.1 (TIP2)	-0.85	-0.41	-0.49	-0.53	-1.2	-0.52	0.32	0.52	0.18	0.1	0.18	0.27	0.35	-2.52	-1.43	0.29	0.42	-1.36	-0.52	0.23	0.32	0.39	-4.08	0.41	0.54	0.58	0.46	-0.21	0.03	0.33	0.9
Lsat_1_v5_gn_1_65560.1 (FLA12)	-2.18	-1.68	-1.01	-0.51	-2.07	-2.4	-0.51	-0.63	0.32	0.26	-0.24	0.75	1.72	-1.64	-0.68	-0.56	0.62	0.61	-0.79	0.53	0.12	-0.25	-	0.47	0.43	0.23	-0.53	0.05	-0.84	-0.06	1.78
Lsat_1_v5_gn_1_84401.1 (CYCP4;1)	-0.23	-0.72	0.13	0.45	-0.01	-0.32	-0.86	-0.79	0.16	0.17	0.23	0.38	0.07	0.06	0.17	0.18	0.32	-0.87	-0.27	0.11	-0.04	0.16	-0.4	-0.07	0.02	0.28	0.24	-0.02	-0.23	0.03	0.4
Lsat_1_v5_gn_2_126301.1 (IRK)	-0.62	-0.71	-0.5	-0.4	-0.5	-0.28	-0.34	-0.35	-0.17	0.09	0.09	0.11	0.78	-0.43	-0.21	0.45	0.57	-0.49	-0.2	0.12	0.02	0.11	-1.6	0.17	0.18	0.28	0.14	0.01	-0.14	0.25	1.1
Lsat_1_v5_gn_2_128681.1 (TDR)	-1.92	-1.64	-1.61	-1.26	-0.71	-0.66	-0.14	-0.08	-0.11	0.1	-0.1	0.29	0.69	-0.26	0.14	0.37	0.57	0.13	-0.1	0.16	0.09	0.01	-3.81	-0.17	0.28	0.44	0.41	-0.28	0.1	0.43	1.47
Lsat_1_v5_gn_2_76980.1 (LAC11)	-2.94	-0.84	0.29	0.54	-3.29	-1.37	-0.55	0.24	-0.16	-0.52	0.28	1.37	1.75	-1.14	-1.13	-0.18	0.53	-1.0	-0.76	-0.73	-0.46	-0.59	-5.7	0.55	0.53	-1.19	-0.15	-0.33	-0.5	0.07	1.76
Lsat_1_v5_gn_3_111880.1	-1.13	-0.22	0.2	0.59	-0.25	0.25	-0.54	-1.92	0.72	0.68	0.64	0.54	-0.39	-2.45	-1.79	-0.02	-0.35	-0.46	-0.68	-0.48	-0.28	0.11	-3.42	-0.15	0.24	0.46	0.27	-0.38	0.45	0.73	1.18
Lsat_1_v5_gn_3_122401.1 (ETR2)	-0.56	-1.17	-0.32	0.5	0.23	-0.43	-0.49	-0.66	0.33	0.46	0.49	0.62	0.29	-0.21	-0.02	0.13	0.17	-0.78	-0.26	0.01	0.22	0.16	-0.67	-0.18	-0.13	-0.18	-0.27	-0.13	0.06	0.04	0.77
Lsat_1_v5_gn_3_12901.1	-4.56	-2.54	0.27	1.98	-1.31	-0.55	-1.43	-	0.36	0.57	1.03	1.13	-0.4	-	-1.7	0.07	0.87	-2.44	-2.64	-0.13	-0.75	-0.08	-	0.22	0.82	-0.43	0.16	-0.7	0.52	0.54	1.1
Lsat_1_v5_gn_3_26900.1	-1.07	-0.77	-0.69	0.04	-0.44	-0.29	0.43	0.18	0.59	0.46	0.59	0.12	-0.13	-0.34	0.02	0.24	0.55	-0.7	-0.33	-0.05	-0.04	-0.23	-0.87	-0.4	0.21	0.14	0.12	-0.72	-0.12	0.66	0.56
Lsat_1_v5_gn_3_34241.1	-1.34	-1.21	-1.57	-0.64	-0.69	-0.62	-0.16	-0.82	0.33	0.41	0.43	0.58	1.13	-1.05	-0.24	0.34	0.57	-0.57	-0.19	0.49	0.03	0.06	-2.49	0.3	0.44	0.18	-0.01	0.11	-0.08	0.27	0.69
Lsat_1_v5_gn_3_44521.1 (RGP5)	-1.38	-1.35	-0.34	-0.44	-1.52	-0.85	-0.35	-0.99	0.56	0.22	0.38	0.39	-0.02	-1.39	-0.43	0.49	0.51	-1.08	-0.63	0.5	0.25	0.08	-3.7	0.5	0.66	0.76	0.48	-0.05	-0.13	0.38	1.12
Lsat_1_v5_gn_3_45161.1 (DEG4)	-1.5	-2.85	-0.81	-0.4	-1.28	-1.55	0.03	-2.33	0.9	0.77	0.17	0.87	0.71	-4.8	-2.89	0.24	0.77	-3.08	-4.34	0.2	0.3	0.48	-2.18	-0.08	0.57	1.05	0.6	-0.15	-0.71	0.57	1.49
Lsat_1_v5_gn_3_45581.1 (SAUR14)	0.1	0.03	0.78	0.58	-0.07	-0.74	-1.01	-2.92	0.34	0.56	0.14	0.87	0.5	-4.47	-1.98	0.08	0.12	-2.82	-1.4	0.73	0.57	0.48	-2.05	-0.21	0.1	0.81	0.37	-0.01	-0.66	-0.23	0.31
Lsat_1_v5_gn_3_79740.1	-0.77	-0.45	-0.54	0.05	-0.92	-0.87	-0.21	-0.21	0.18	0.16	0.25	0.38	1.05	-0.09	-0.32	-0.04	0.58	-1.38	-0.18	0.18	-0.25	0.14	-1.46	0.38	0.08	-0.23	-0.18	0.12	0.06	0.2	1.03
Lsat_1_v5_gn_3_96960.1 (RRT1)	-0.95	-0.68	-0.32	-0.11	-0.84	-0.42	0.11	-0.32	0.26	0.28	0.07	0.3	0.95	-1.3	-0.5	0.06	0.31	0.19	-0.16	0.21	-0.24	0.01	-2.3	0.13	0.32	0.17	0.08	0.04	-0.02	0.23	0.98
Lsat_1_v5_gn_4_114841.1	-0.9	-0.49	-0.02	0.44	-0.6	-0.17	-0.03	-0.15	0.34	0.4	0.37	0.39	-0.21	0.09	-0.05	-0.08	-0.04	-0.44	-0.24	0.03	-0.07	-0.06	-1.01	-0.12	0.06	0.04	0.09	-0.18	0.22	0.45	0.59
Lsat_1_v5_gn_4_144401.1	-1.58	-1.69	-0.44	-0.1	-0.57	-0.78	-0.47	-0.9	0.03	0.36	0.12	0.67	0.89	-0.87	-0.31	0.37	0.71	0.17	-0.3	0.2	0.06	0.1	-1.82	0.2	0.21	0.24	0.03	0.03	-0.52	0.17	1.15
Lsat_1_v5_gn_4_14920.1 (FAB1C)	-1.25	-1.07	-0.75	-0.01	0.17	0.21	-0.37	-1.02	-0.13	0.04	0.07	-0.01	0.07	-0.83	-0.42	0.17	-0.03	0.04	-0.29	-0.27	-0.11	-0.06	0.69	-0.06	0.05	0.24	0.25	-0.21	0.39	0.62	1.19
Lsat_1_v5_gn_4_14941.1	-0.32	-0.32	-0.48	0.16	-0.34	0.01	-0.2	-0.28	0.22	0.29	0.32	0.53	0.94	-0.14	-0.21	0.19	0.02	-1.65	-0.85	-0.12	-0.15	-0.21	-1.0	0.08	-0.09	0.07	-0.14	0.15	-0.04	0.16	0.95
Lsat_1_v5_gn_4_164941.1 (SPT)	-0.56	-0.68	0.81	0.98	-0.65	-0.1	-0.15	-1.34	0.32	0.69	0.49	0.93	0.41	-4.31	-2.94	0.14	0.6	-1.73	-0.86	0.0	-0.2	-0.29	-3.67	0.08	0.47	0.17	-0.19	0.19	-0.34	0.45	0.53
Lsat_1_v5_gn_4_186380.1	-0.75	-0.88	0.07	0.28	-0.5	-0.44	0.04	-0.39	0.08	0.28	0.06	0.07	0.56	-0.07	0.08	0.1	0.31	-0.78	0.05	0.11	-0.01	-0.08	-3.35	0.15	0.12	0.24	0.12	0.01	0.14	0.17	0.83
Lsat_1_v5_gn_4_23060.1 (WOL)	-1.3	-0.78	-0.53	-0.16	0.23	0.44	0.02	-0.29	0.22	0.13	0.27	0.18	0.19	-0.4	-0.07	0.01	-0.25	0.01	-0.33	-0.42	-0.31	-0.03	-0.1	-0.01	0.15	0.15	0.23	-0.52	0.03	0.07	1.23
Lsat_1_v5_gn_4_35880.1	-0.93	-0.97	-0.67	-0.45	-0.66	-0.56	0.13	-0.06	0.16	0.21	0.37	0.15	0.99	-0.91	0.01	0.41	0.49	-1.29	-0.78	0.0	-0.07	0.05	-1.83	0.34	-0.12	0.2	0.1	-0.15	-0.09	0.32	1.34
Lsat_1_v5_gn_4_37720.1 (AGP8)	-1.07	-0.8	-0.17	0.18	-0.76	-0.65	-0.25	-0.52	0.21	0.32	0.36	0.47	0.41	-0.75	-0.43	0.46	0.5	-1.02	-0.08	0.34	0.18	0.1	-4.25	0.07	0.19	0.26	0.16	-0.02	0.07	0.35	0.89
Lsat_1_v5_gn_4_47621.1	-1.06	-0.09	-0.29	0.14	-0.25	-1.05	-0.78	-1.32	0.21	0.42	0.31	0.75	1.45	-2.66	-1.23	0.89	0.88	0.37	-1.15	-0.19	-0.63	-0.38	-0.5	-0.24	-0.04	-0.16	-0.32	-0.64	-0.53	0.15	1.16
Lsat_1_v5_gn_4_64361.1	-0.79	-0.58	-0.53	-0.56	-0.31	-0.33	-0.42	-0.42	-0.01	0.07	0.14	0.17	0.84	-0.16	0.17	0.2	0.23	-0.37	-0.23	0.11	-0.02	-0.32	-1.8	0.33	0.2	0.17	0.12	-0.27	0.31	0.44	1.04
Lsat_1_v5_gn_4_64660.1 (TCP7)	-0.8	-0.49	-0.13	0.06	-0.2	-0.17	-0.05	0.09	0.13	0.25	0.26	0.29	0.27	-0.04	-0.11	0.29	0.25	-1.31	-0.04	0.1	-0.0	-0.01	-2.84	0.14	0.15	0.17	0.12	-0.2	0.24	0.46	0.39
Lsat_1_v5_gn_4_75880.1 (LOTR1)	-1.13	-1.25	-0.34	0.03	-0.79	-0.98	-0.4	-0.35	0.11	0.1	0.08	0.32	0.99	-1.19	-0.12	0.39	0.52	0.68	-0.3	0.06	-0.13	-0.19	-1.78	-0.0	0.06	0.24	0.05	-0.14	-0.32	0.37	1.23
Lsat_1_v5_gn_4_82500.1 (HSD2)	-3.02	-3.22	-2.19	0.62	0.26	-0.56	-0.23	-0.89	0.53	0.99	0.67	0.83	0.57	-0.98	-0.38	0.38	0.33	-1.23	-1.26	0.11	-0.73	-0.03	-3.31	0.31	0.28	0.19	0.01	-0.35	-0.53	0.48	1.34
Lsat_1_v5_gn_4_84981.1 (WRI4)	-0.32	-0.28	0.5	0.73	-0.45	-0.56	-0.39	-0.92	0.41	0.56	0.53	0.69	-0.27	-1.11	-0.1	0.45	0.45	-1.37	-0.2	0.24	-0.02	-0.07	-2.18	0.08	0.0	0.22	-0.0	-0.03	-0.05	0.15	-0.13
Lsat_1_v5_gn_5_113741.1 (AGP9)	-3.72	-3.75	-1.77	-1.42	-1.45	-1.59	-0.54	-1.17	0.15	0.53	0.18	0.93	1.43	-3.0	-0.87	0.71	0.87	0.25	-0.33	0.5	0.17	0.15	-3.37	0.07	0.4	0.33	0.45	-0.48	-0.4	0.25	1.36
Lsat_1_v5_gn_5_121740.1	-1.27	-2.45	-0.04	0.83	-0.29	0.25	-0.19	-0.34	0.53	1.01	0.73	0.44	-0.16	-1.19	-0.64	0.91	0.61	-1.46	-0.87	0.36	0.29	-0.47	-2.4	-0.36	0.38	0.21	0.2	-0.34	-0.39	0.24	-0.55
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Lsat_1_v5_gn_5_124680.1 (FLA7)	-1.78	-1.67	-1.01	-0.89	-0.77	-1.17	-0.62	-0.95	0.04	0.49	0.17	0.82	1.35	-1.64	-0.19	0.31	0.59	-0.72	-0.45	0.22	0.06	0.13	-3.45	0.41	0.44	0.33	0.28	0.17	-0.14	0.41	1.06
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.