Heatmap: Cluster_151 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
5.04 3.86 4.76 5.31 5.48 5.81 4.93 4.55 6.08 6.18 6.89 6.31 8.0 5.59 5.58 6.16 6.04 3.39 5.37 5.83 5.57 6.03 1.82 6.47 6.61 6.46 6.07 6.47 5.4 6.82 9.79
6.58 6.65 6.65 5.44 5.92 7.37 6.18 8.62 9.02 10.46 11.34 11.27 11.72 6.08 6.5 6.08 6.76 3.34 7.33 7.98 7.01 7.97 5.85 9.77 9.44 7.98 7.15 6.26 7.12 9.74 17.37
137.4 141.68 160.79 164.19 148.18 161.88 187.93 166.96 196.06 198.75 187.47 200.01 231.14 129.18 156.82 207.75 238.96 157.91 193.13 223.65 198.41 192.6 79.42 216.97 208.71 228.48 216.63 172.69 184.57 221.0 297.9
8.32 9.04 11.31 16.36 17.7 17.67 17.92 15.95 23.99 27.56 27.13 25.57 37.26 12.23 15.09 22.85 24.28 11.36 15.76 21.68 18.7 21.94 2.14 23.73 23.42 22.26 21.99 20.62 17.29 24.39 36.0
16.4 14.76 22.17 37.02 40.44 35.46 55.43 55.21 60.14 75.67 63.66 95.08 133.94 21.06 52.45 69.49 84.09 60.8 52.13 74.81 54.21 59.87 10.92 58.87 72.27 74.02 66.32 57.15 61.62 77.34 174.27
382.94 516.9 490.85 478.25 299.7 479.5 861.1 988.4 780.97 740.92 780.83 828.86 879.34 120.54 255.82 840.24 924.54 268.69 481.89 808.92 863.16 903.96 40.64 916.8 998.99 1032.21 945.36 597.59 705.72 867.55 1281.71
0.24 0.34 0.55 0.77 0.26 0.21 0.77 0.71 1.37 1.31 0.93 1.85 3.62 0.35 0.68 0.74 1.68 1.68 0.64 1.58 1.19 0.92 0.0 1.52 1.48 1.29 0.76 1.14 0.61 1.06 3.78
36.12 25.74 46.38 57.77 42.21 34.01 23.44 24.61 47.37 47.83 49.71 55.13 44.44 44.1 47.83 47.93 53.11 23.17 35.14 45.83 41.3 47.51 32.25 40.45 42.95 51.61 50.12 41.82 36.09 43.3 55.87
7.36 6.91 8.0 8.59 8.02 9.3 8.96 8.87 10.05 12.03 12.05 12.27 19.44 8.42 9.81 15.45 16.87 8.08 9.84 12.3 11.53 12.26 3.73 12.72 12.83 13.75 12.52 11.38 10.32 13.44 24.24
0.89 1.08 1.1 1.41 2.06 2.14 3.05 3.18 3.12 3.6 3.15 4.12 5.45 2.81 3.72 4.35 4.99 3.68 3.15 3.76 3.57 3.4 0.24 2.99 4.1 4.58 4.47 2.77 3.6 4.55 9.3
0.08 0.35 0.76 0.91 0.06 0.24 0.43 0.74 0.56 0.44 0.76 1.62 2.09 0.28 0.28 0.55 0.9 0.31 0.37 0.38 0.46 0.41 0.01 0.91 0.9 0.27 0.56 0.5 0.44 0.65 2.12
2.72 5.13 6.84 8.96 5.01 7.08 4.11 1.57 9.83 9.53 9.26 8.65 4.54 1.09 1.72 5.88 4.68 4.34 3.73 4.28 4.91 6.42 0.55 5.36 7.05 8.19 7.2 4.58 8.13 9.89 13.46
2.38 1.56 2.8 4.96 4.1 2.6 2.5 2.21 4.41 4.81 4.91 5.38 4.27 3.02 3.45 3.83 3.94 2.04 2.93 3.52 4.09 3.9 2.2 3.08 3.2 3.09 2.91 3.21 3.65 3.61 5.98
0.46 1.88 13.24 43.25 4.42 7.48 4.07 0.0 14.08 16.22 22.37 23.99 8.33 0.0 3.38 11.5 20.09 2.01 1.76 10.05 6.51 10.38 0.0 12.77 19.31 8.13 12.21 6.75 15.73 15.94 23.46
4.36 5.36 5.69 9.38 6.76 7.48 12.35 10.39 13.78 12.58 13.76 9.95 8.34 7.21 9.25 10.79 13.38 5.63 7.28 8.85 8.93 7.79 5.01 6.94 10.58 10.09 9.98 5.54 8.45 14.45 13.47
1.79 1.95 1.53 2.9 2.8 2.93 4.05 2.56 5.7 6.02 6.09 6.77 9.92 2.18 3.82 5.71 6.72 3.03 3.95 6.36 4.63 4.72 0.8 5.55 6.13 5.12 4.47 4.88 4.27 5.44 7.3
14.97 15.35 30.96 28.9 13.62 21.68 30.55 19.62 57.68 45.41 50.81 51.26 38.42 14.92 29.02 55.05 55.77 18.48 25.26 55.1 46.51 41.41 3.0 55.22 61.9 65.98 54.49 37.85 35.72 51.01 85.12
0.69 0.27 1.11 1.48 0.8 0.67 1.99 0.39 3.64 3.32 2.19 3.56 3.19 0.07 0.26 2.31 3.32 0.23 0.1 2.24 2.39 2.73 0.43 1.85 2.89 4.03 2.96 1.75 1.19 2.9 5.49
6.9 6.6 11.08 9.67 6.13 3.85 3.21 0.85 8.14 9.5 7.09 11.76 9.11 0.29 1.63 6.8 7.01 0.91 2.44 10.7 9.56 8.99 1.56 5.59 6.93 11.29 8.31 6.41 4.07 5.51 7.99
3.64 4.56 4.27 6.46 3.28 3.4 5.39 5.39 7.04 6.95 7.41 8.12 12.91 5.86 4.97 6.05 9.3 2.4 5.5 7.07 5.25 6.88 2.27 8.1 6.57 5.32 5.48 6.74 6.47 7.14 12.75
3.18 3.85 4.95 5.72 3.44 4.62 6.65 4.93 7.37 7.5 6.45 7.59 11.87 2.5 4.37 6.4 7.66 7.02 5.5 7.11 5.2 6.21 1.25 6.75 7.69 6.92 6.51 6.34 6.06 7.21 12.16
10.93 14.56 20.09 27.61 13.48 18.08 19.97 18.39 25.88 26.91 26.37 26.76 17.66 21.68 19.77 19.31 19.87 15.06 17.28 20.8 19.48 19.58 10.11 18.73 21.32 21.03 21.73 17.98 23.82 27.91 30.65
3.31 3.08 7.33 9.27 6.67 5.77 7.16 5.33 10.11 12.71 10.81 15.83 18.37 5.43 8.01 12.84 16.23 11.17 8.05 11.36 10.31 10.62 2.81 11.37 11.45 11.69 10.1 10.16 6.93 11.15 22.09
2.96 3.36 4.19 7.0 7.92 8.14 5.46 3.48 6.43 7.28 7.4 7.02 7.42 3.97 5.28 7.92 6.89 7.26 5.79 5.87 6.55 6.78 11.37 6.79 7.3 8.35 8.39 6.12 9.22 10.83 16.13
4.61 4.6 4.12 6.4 4.54 5.78 4.99 4.73 6.68 7.02 7.18 8.27 10.99 5.2 4.97 6.52 5.81 1.83 3.18 5.28 5.16 4.96 2.87 6.06 5.41 6.02 5.22 6.36 5.59 6.43 11.05
6.37 5.85 16.4 18.41 5.95 8.76 8.42 3.7 11.69 15.06 13.13 17.88 12.46 0.47 1.22 10.28 14.18 2.82 5.16 9.37 8.14 7.64 0.73 9.9 12.97 10.54 8.18 10.66 7.39 12.82 13.52
3.88 3.54 6.83 7.93 4.61 4.82 6.7 4.97 6.88 7.91 6.77 6.84 9.6 6.22 6.88 6.98 8.09 3.8 6.73 7.04 6.48 6.16 0.64 7.22 7.06 7.68 7.08 6.58 7.18 7.31 11.6
4.48 6.4 7.63 9.86 12.89 14.98 11.18 9.02 12.82 12.05 13.25 12.5 12.57 8.35 10.47 11.13 9.27 11.08 8.75 8.21 8.87 10.79 10.28 10.91 12.24 12.24 12.9 7.68 11.25 11.58 25.88
2.02 1.96 2.41 2.82 2.44 2.61 4.23 3.68 4.31 4.46 4.97 4.28 7.65 2.05 3.88 5.13 5.39 1.58 2.24 3.86 3.67 3.99 1.09 4.89 3.55 4.43 4.13 3.48 3.62 4.82 9.77
33.38 40.44 62.68 79.82 41.63 44.95 58.97 49.17 81.33 87.55 90.2 97.13 93.39 41.8 52.33 96.48 99.34 34.73 66.64 88.93 79.51 75.6 3.7 73.59 80.24 83.93 78.38 69.53 73.72 89.72 130.72
2.43 4.74 4.14 5.56 4.24 2.45 2.94 2.03 5.86 6.76 6.25 8.49 13.86 0.8 2.15 9.34 9.3 6.53 2.27 4.44 3.27 3.88 3.57 4.28 4.92 4.51 4.06 3.25 3.5 5.61 11.3
4.0 4.63 4.8 4.7 5.6 5.52 5.2 5.18 6.9 7.27 7.64 7.79 12.45 6.23 7.79 7.95 8.12 5.35 5.91 7.48 6.86 5.57 2.0 8.7 7.95 7.82 7.56 5.76 8.61 9.41 14.24
13.39 16.53 21.24 24.33 20.3 20.67 22.51 24.8 25.51 27.71 27.94 28.49 28.11 22.6 21.53 28.47 27.73 9.4 22.55 24.89 23.25 23.05 3.24 25.63 25.78 26.23 25.21 20.25 27.49 31.9 30.39
3.88 3.58 6.72 8.65 4.93 4.3 6.44 6.66 9.18 9.12 8.96 10.59 16.9 3.72 7.83 11.11 12.2 13.6 6.91 8.84 7.79 7.46 2.47 8.49 8.87 10.01 8.8 7.71 6.79 10.99 19.87
0.19 0.16 0.34 2.35 1.84 1.04 1.31 0.82 2.21 3.03 2.44 2.72 2.27 0.78 1.18 1.99 1.92 0.65 0.64 1.66 0.92 1.5 0.15 1.89 1.86 1.74 1.54 1.2 1.06 2.14 3.88
4.44 4.57 7.85 9.21 4.06 3.77 4.22 2.94 7.38 8.2 8.0 8.95 4.61 2.56 5.16 7.56 7.56 2.15 4.82 6.55 5.46 5.3 1.23 5.87 5.57 6.44 5.55 5.45 5.35 6.15 5.07
5.57 5.48 21.55 27.57 26.88 24.51 50.52 32.73 81.45 106.58 83.34 140.16 197.57 9.22 40.28 120.24 134.19 87.55 58.6 104.14 82.67 81.52 7.12 77.42 96.89 92.43 100.25 52.87 55.67 87.38 188.27
0.83 0.37 1.94 3.55 1.63 2.37 1.75 1.57 2.87 4.0 3.3 2.71 1.78 0.87 1.28 3.74 3.05 0.72 1.09 2.56 2.43 1.44 0.38 1.55 2.59 2.3 2.29 1.58 1.52 2.35 1.37
1.66 1.79 2.19 3.63 1.79 1.31 2.69 1.74 3.69 3.28 2.67 3.1 3.31 0.5 1.02 2.47 2.81 1.08 1.77 2.62 2.78 2.26 0.3 2.34 2.18 2.17 2.35 2.55 1.93 2.93 3.5
8.19 8.81 13.92 15.14 16.46 12.46 18.26 14.55 28.93 39.38 31.67 49.59 71.67 8.99 24.59 34.71 42.36 17.07 20.54 32.67 29.23 30.66 2.56 37.29 38.1 35.16 33.95 31.46 25.47 37.24 58.53
9.84 10.36 14.2 19.73 12.7 15.78 18.39 16.58 18.11 19.43 19.58 18.83 24.78 7.06 9.97 18.07 18.13 7.18 13.88 18.79 18.85 20.32 0.91 18.44 18.99 20.64 19.33 17.7 17.04 19.3 26.8
61.44 58.23 82.94 115.36 57.07 63.85 53.73 37.39 73.13 71.37 79.34 65.37 46.79 21.48 26.93 64.87 61.57 14.72 40.32 54.45 60.72 60.7 17.04 57.12 63.48 70.35 66.2 71.37 54.8 59.91 49.05
11.27 10.5 13.49 13.01 13.58 10.17 13.96 19.62 22.68 24.25 26.02 34.79 53.27 18.14 19.47 28.69 33.9 21.91 22.56 29.0 21.36 21.84 3.59 34.26 28.62 24.57 22.25 21.55 25.1 35.5 62.93
12.39 18.72 18.92 26.62 17.78 19.64 19.2 14.14 22.45 24.73 25.52 24.98 29.32 11.42 12.18 21.82 23.64 10.46 16.56 20.14 20.28 21.68 11.22 18.72 20.61 24.51 22.45 19.59 19.84 25.09 30.32
2.26 1.96 4.76 6.29 1.84 4.36 3.25 0.83 4.8 4.81 4.93 5.48 4.44 0.23 0.78 4.43 4.48 2.46 2.63 3.9 3.26 3.92 2.95 3.14 3.73 4.39 4.34 4.45 3.2 3.69 3.57
82.56 82.44 84.98 81.9 132.18 148.46 152.32 154.28 135.96 148.09 161.08 172.0 175.05 67.2 83.08 154.17 172.49 110.9 167.49 151.44 151.01 161.39 34.85 194.44 195.46 175.51 183.94 152.02 163.96 216.27 299.0
0.94 1.44 1.44 3.35 1.05 0.45 2.04 1.48 1.99 2.92 2.25 4.22 7.82 0.4 1.46 2.32 4.17 0.67 1.2 1.71 2.33 1.44 0.0 2.54 2.45 2.09 1.98 2.29 1.55 4.51 8.23
1.1 0.56 1.81 2.19 0.74 0.71 1.27 1.45 2.23 1.97 2.71 3.44 6.59 0.13 1.86 2.38 3.25 0.66 1.15 2.66 1.98 1.7 0.05 2.44 2.86 1.77 1.69 2.19 1.26 3.78 6.27
2.08 2.22 2.55 3.84 5.89 5.31 3.23 2.46 4.54 5.41 6.43 7.73 6.53 2.58 3.6 6.14 7.03 0.77 5.26 5.4 6.0 6.65 0.38 7.5 7.26 7.28 6.72 5.94 5.88 7.19 13.98
5.72 6.1 11.2 13.11 6.89 6.26 7.06 5.28 11.55 12.21 12.43 11.84 8.97 2.99 5.8 10.6 11.1 2.07 5.4 9.06 8.29 8.55 0.47 8.88 10.17 11.25 10.12 5.37 8.93 12.69 15.42
52.35 99.92 263.81 179.09 78.85 72.42 80.63 56.52 151.15 178.91 140.97 212.13 472.91 75.71 135.88 278.29 302.32 196.37 135.99 180.1 154.61 149.78 28.93 211.95 218.95 198.33 189.14 108.91 190.73 252.4 450.54
15.25 19.79 31.59 42.98 20.09 21.78 24.2 17.16 30.48 32.35 31.37 28.1 14.97 7.18 14.2 24.23 22.16 8.04 15.7 20.72 20.66 21.74 5.58 17.89 21.48 24.22 25.49 17.48 22.92 29.55 28.69
11.55 12.71 12.38 13.5 14.95 12.16 11.75 11.73 14.53 16.22 15.88 17.24 16.71 12.53 13.07 13.58 13.85 6.2 11.88 13.5 13.23 13.8 3.61 14.76 14.76 13.58 14.41 13.0 13.87 16.14 19.31
1.55 1.88 3.27 5.29 2.89 2.61 3.39 2.9 5.66 6.29 6.04 7.31 12.77 4.08 5.25 6.39 8.51 6.47 5.03 5.71 4.45 3.51 2.48 5.47 5.35 5.05 4.51 3.99 5.71 8.4 14.32
18.15 16.34 20.46 26.49 16.02 20.16 18.13 15.47 20.72 19.8 21.62 22.83 19.96 13.15 13.74 20.06 19.63 9.11 15.81 19.61 21.94 22.08 18.41 22.34 24.1 22.93 20.88 23.16 19.2 20.66 24.25
1.92 2.63 2.61 2.96 3.87 3.56 1.88 1.87 3.1 2.99 2.73 2.84 2.8 2.74 2.82 2.62 2.48 2.82 2.36 2.11 2.52 2.99 2.15 2.32 2.83 3.47 3.07 1.83 2.69 3.15 5.7
17.88 27.02 31.71 27.93 20.61 21.46 24.93 21.35 32.86 34.21 34.68 39.98 70.76 23.25 28.93 45.33 49.91 25.47 26.78 34.21 30.67 30.38 3.78 31.82 37.57 36.03 35.59 33.74 30.45 39.46 69.11
19.5 20.12 20.87 29.47 18.58 24.28 36.36 29.83 37.98 37.72 36.89 37.96 36.34 5.2 12.27 30.89 33.54 13.11 15.76 27.35 29.14 26.54 3.29 30.07 31.58 30.3 30.76 31.29 23.44 30.19 48.28
4.82 5.75 8.76 10.65 10.03 8.56 9.71 11.29 13.19 15.51 15.67 16.54 11.55 6.28 9.37 11.58 12.4 6.1 10.05 11.46 10.64 11.96 1.4 12.9 13.18 12.33 12.49 11.38 11.73 15.69 20.9
6.58 5.85 10.82 12.33 7.4 5.29 2.95 2.36 12.64 12.89 12.97 15.91 12.38 2.48 4.67 11.63 11.84 0.86 5.42 10.05 8.61 10.2 0.39 8.67 10.9 13.29 11.92 7.16 6.26 11.9 13.13
10.82 12.15 16.14 25.9 19.41 19.99 24.29 20.18 31.17 34.18 31.76 27.63 21.44 23.42 23.77 21.88 26.17 15.2 22.33 22.6 22.73 20.68 10.04 17.24 20.39 23.96 24.68 19.77 27.23 30.75 38.61
7.9 15.34 12.84 14.68 11.77 17.0 21.08 15.88 20.93 21.25 21.55 24.06 19.56 6.22 9.28 18.52 19.83 5.61 12.26 15.8 17.03 17.6 5.69 18.89 19.1 20.81 20.2 18.23 15.06 18.77 18.3
0.15 0.17 0.09 0.37 0.49 0.59 0.7 0.78 0.66 0.95 0.82 1.39 2.59 0.43 0.47 1.24 1.34 0.83 0.87 1.36 1.06 0.94 0.12 1.25 1.41 1.34 1.27 0.81 0.91 1.35 2.43
1.91 1.46 2.72 4.15 3.11 2.53 4.29 4.76 7.1 7.15 8.03 10.2 13.19 2.25 4.69 6.43 8.01 4.64 4.39 7.67 5.28 4.61 0.56 8.77 7.92 6.75 5.47 4.8 4.15 8.44 17.6
4.64 3.17 3.33 4.24 5.48 4.28 3.69 6.2 7.19 7.18 8.73 8.8 8.58 5.32 5.74 6.16 6.26 1.49 5.73 5.99 5.4 5.93 1.14 7.7 6.85 5.52 6.79 6.48 5.27 7.38 10.89
11.56 11.27 19.41 20.51 13.13 13.04 14.99 13.99 19.49 22.73 22.22 24.65 37.86 16.56 18.76 23.77 24.78 12.26 16.8 21.91 18.99 18.42 5.41 20.69 21.05 20.02 18.7 17.56 19.22 23.58 41.9
34.53 31.1 35.37 41.91 35.97 33.91 32.07 32.46 41.91 45.51 48.64 48.09 51.28 25.34 29.93 39.6 36.85 15.15 30.01 35.33 36.63 36.8 25.02 44.03 39.97 37.56 42.93 34.97 36.06 42.92 60.58
10.49 12.85 12.47 16.11 17.84 16.1 18.85 11.46 25.25 28.11 26.39 34.85 30.15 8.9 10.06 25.32 26.12 18.63 18.47 27.2 24.1 20.42 33.77 20.68 27.11 32.14 30.4 23.46 23.93 35.26 47.0
4.24 4.55 4.94 5.45 5.34 5.48 4.52 4.0 5.34 5.71 6.01 6.61 8.71 6.14 5.78 6.55 6.79 2.73 6.21 5.66 5.58 5.51 3.65 5.56 6.16 6.63 6.12 6.69 6.17 6.48 8.64
0.99 1.43 1.23 3.13 2.46 2.9 4.26 3.77 4.31 4.95 4.59 6.01 5.43 1.85 1.46 5.47 5.97 2.89 3.43 6.56 4.99 5.33 0.85 5.12 6.14 5.32 5.95 5.13 4.52 6.5 8.53
10.71 11.94 16.37 22.59 16.57 14.94 16.0 18.82 22.23 23.56 24.38 26.98 27.61 13.76 17.18 21.77 22.84 12.5 16.3 21.28 17.94 16.91 2.96 21.83 21.0 19.38 19.22 17.95 18.25 22.76 32.1
135.49 234.43 331.15 366.26 274.22 377.55 370.86 361.42 456.76 486.99 495.93 612.16 499.71 475.72 348.89 476.11 501.39 163.35 326.12 395.37 395.96 431.59 27.0 429.7 504.58 534.29 517.39 306.69 462.69 485.56 726.21
1.45 1.56 2.64 4.03 2.38 2.44 2.84 2.85 3.9 5.33 4.55 4.89 2.96 1.77 3.56 4.88 4.61 2.6 2.61 4.07 3.34 3.1 0.51 4.3 4.12 4.38 3.75 2.93 3.12 5.65 5.81
0.45 0.82 1.28 2.39 3.28 2.6 2.91 2.94 2.42 3.26 3.89 2.45 1.78 1.04 2.35 4.36 3.31 2.97 1.89 1.92 1.97 1.42 1.47 2.05 1.98 2.12 1.67 1.51 2.83 4.42 4.17
16.71 21.22 35.57 43.26 35.74 28.82 23.34 19.4 40.88 45.88 43.4 43.6 37.61 21.72 29.44 39.58 41.22 25.66 33.04 37.21 31.99 32.54 31.93 28.19 34.2 38.22 37.88 28.77 35.15 43.06 52.6

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)