Heatmap: Cluster_133 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_1_111380.1 (EMB2219)	-0.53	-0.62	-0.59	-0.24	0.03	0.25	-0.09	-0.1	0.03	0.12	0.23	0.15	-0.03	0.51	0.1	0.02	-0.11	-1.25	-0.19	-0.27	-0.14	-0.01	-0.16	0.18	0.06	-0.03	-0.1	-0.4	0.24	0.46	0.94
Lsat_1_v5_gn_1_23241.1 (BDR4)	-0.2	0.01	-0.04	-0.04	0.04	0.19	0.24	0.15	0.05	0.14	0.09	0.04	0.32	-0.1	0.14	0.04	-0.01	-1.19	-0.15	-0.02	-0.06	-0.06	-0.66	-0.15	-0.07	-0.07	-0.03	-0.25	0.21	0.27	0.39
Lsat_1_v5_gn_1_35381.1 (THA8)	-0.35	-0.39	-0.49	-0.45	-0.23	0.22	-0.06	-0.05	-0.32	-0.21	0.01	0.07	0.24	0.35	0.22	0.16	0.01	-0.48	0.36	0.05	0.09	0.06	0.02	0.22	0.13	0.14	0.2	-0.11	-0.07	-0.13	0.19
Lsat_1_v5_gn_1_55000.1	-0.47	-0.57	-0.68	-0.69	-0.36	-0.12	-0.17	0.25	-0.36	-0.21	-0.14	0.18	0.58	0.43	0.07	-0.06	0.13	-0.13	0.57	-0.08	0.02	0.07	-0.06	0.29	0.06	0.02	-0.24	-0.01	0.04	-0.07	0.58
Lsat_1_v5_gn_1_5881.1 (TGD1)	-0.02	-0.28	-0.42	-0.68	-0.17	0.07	-0.12	-0.0	-0.24	-0.17	-0.02	0.06	0.1	0.11	0.11	0.12	0.01	-1.37	0.33	-0.05	0.07	0.2	0.11	0.24	0.15	0.15	0.02	0.12	0.24	0.13	0.26
Lsat_1_v5_gn_1_64681.1 (ACS11)	-0.77	-0.37	-0.79	-0.01	-0.01	-0.01	-0.37	-0.08	-0.3	-0.18	0.08	0.09	0.33	0.57	0.29	0.11	-0.03	-1.43	0.04	0.0	-0.05	-0.08	0.54	-0.27	-0.23	-0.18	0.07	-0.22	0.25	0.32	0.89
Lsat_1_v5_gn_2_103701.1 (PNP)	0.07	-0.21	0.08	0.21	-0.2	0.1	0.08	0.51	-0.16	-0.13	0.03	0.14	0.4	0.28	-0.09	-0.04	-0.01	-1.56	-0.19	-0.13	-0.09	0.03	-0.97	0.16	0.02	-0.03	-0.05	0.05	-0.16	0.09	0.47
Lsat_1_v5_gn_2_108380.1	-0.83	-0.77	-1.04	-1.39	-0.14	0.07	-0.05	0.18	-0.09	-0.01	0.13	0.25	0.49	0.39	-0.01	-0.1	0.03	-0.94	0.19	-0.01	0.03	0.15	-0.02	0.26	-0.02	0.12	-0.07	-0.07	-0.03	0.22	0.96
Lsat_1_v5_gn_2_111420.1	-1.24	-1.0	-1.56	-1.73	-0.23	0.2	-0.07	0.31	-0.04	-0.13	0.12	0.28	0.27	0.52	-0.04	0.05	0.07	-0.93	0.09	-0.05	-0.05	0.1	0.5	0.41	0.27	0.13	0.2	-0.44	0.13	0.23	0.64
Lsat_1_v5_gn_2_116181.1 (NOT4C)	-0.15	-0.12	-0.47	-0.3	0.04	0.24	0.17	0.28	0.03	-0.05	0.06	0.07	0.14	0.3	0.15	0.09	0.08	-0.97	-0.05	-0.08	-0.18	-0.12	-0.12	-0.05	-0.08	-0.07	0.05	-0.05	-0.0	0.1	0.45
Lsat_1_v5_gn_2_66260.1 (ZDS)	0.26	0.05	0.01	-0.09	0.19	0.02	-0.05	0.01	0.04	0.05	0.15	0.22	0.23	0.23	0.06	-0.05	-0.0	-1.58	0.01	-0.14	-0.13	-0.03	-0.43	0.07	-0.02	-0.07	-0.14	-0.04	-0.02	0.07	0.28
Lsat_1_v5_gn_3_125561.1 (CFM3A)	0.17	-0.09	-0.32	-0.34	-0.01	0.21	0.05	0.28	-0.16	-0.13	0.07	0.07	0.24	0.33	-0.02	-0.11	-0.09	-1.39	-0.01	-0.24	-0.09	0.02	0.29	0.03	-0.06	-0.18	-0.09	0.05	0.09	0.05	0.52
Lsat_1_v5_gn_3_49600.1 (emb2004)	-0.43	-0.45	-0.54	-0.46	-0.16	0.06	-0.16	0.1	-0.05	-0.0	0.09	0.26	0.45	0.06	-0.13	-0.12	-0.0	-0.67	0.56	-0.04	-0.17	-0.06	-0.32	0.3	0.09	-0.02	-0.08	-0.01	-0.15	0.09	0.89
Lsat_1_v5_gn_3_71540.1	-0.12	-0.38	-0.21	-0.19	0.1	0.2	-0.17	-0.23	0.05	0.03	0.05	0.1	0.52	-0.06	-0.13	0.13	0.01	-1.54	-0.19	-0.06	0.01	0.05	-0.85	0.13	0.07	0.05	-0.01	0.19	0.2	0.36	0.6
Lsat_1_v5_gn_3_7921.1 (SDR2)	0.31	-0.02	-0.65	-1.4	-0.22	0.24	0.21	0.51	-0.23	-0.43	-0.3	-0.44	-0.28	0.32	0.18	-0.02	0.03	-1.16	0.99	0.15	-0.06	0.09	-2.72	0.46	0.18	-0.2	-0.02	-0.39	0.23	0.35	0.56
Lsat_1_v5_gn_3_86620.1 (EngB-1)	-0.63	-0.92	-1.52	-1.25	-0.28	0.21	-0.05	0.48	-0.28	-0.14	-0.19	0.14	0.11	0.44	0.21	-0.08	-0.04	-0.74	0.06	0.01	0.02	0.09	0.1	0.4	0.25	0.16	0.08	-0.02	0.22	0.21	0.78
Lsat_1_v5_gn_4_103580.1 (MFP1)	0.1	-0.1	-0.07	0.05	0.02	0.06	-0.05	-0.02	-0.05	0.14	0.23	0.27	0.61	-0.14	-0.21	0.04	0.06	-1.28	-0.08	-0.16	-0.15	0.01	-0.78	0.14	0.06	-0.09	-0.07	0.14	-0.16	0.04	0.46
Lsat_1_v5_gn_4_127620.1 (FRA1)	-0.12	-0.05	-0.07	-0.27	0.12	0.1	-0.01	-0.09	-0.17	-0.17	0.0	-0.15	0.28	0.24	0.35	0.23	0.18	-1.07	0.06	-0.1	-0.14	-0.07	-0.51	-0.11	0.01	0.0	0.03	-0.05	0.15	0.27	0.41
Lsat_1_v5_gn_4_134121.1	-0.78	-0.78	-1.08	-1.27	0.04	0.16	-0.06	0.26	-0.06	-0.07	0.08	0.01	0.15	0.47	0.31	0.04	-0.09	-0.71	0.36	-0.28	-0.08	0.18	-0.06	0.2	-0.05	0.15	0.18	-0.15	0.19	0.31	0.65
Lsat_1_v5_gn_4_140001.1 (PUMPKIN)	-0.65	-0.59	-1.06	-1.12	-0.43	0.43	0.14	0.44	-0.31	-0.25	-0.07	0.03	0.05	0.14	-0.15	0.03	0.01	-0.62	0.18	0.08	0.11	0.16	-0.39	0.34	0.2	0.28	0.22	-0.19	0.06	0.29	0.84
Lsat_1_v5_gn_4_143840.1 (AKR)	-0.22	-0.21	-0.59	-0.23	-0.21	-0.11	-0.36	-0.14	0.13	0.09	0.2	0.14	0.23	0.57	0.34	0.05	-0.07	-1.24	-0.08	-0.02	-0.07	0.05	-0.33	0.12	-0.07	0.07	-0.04	-0.22	0.12	0.15	0.77
Lsat_1_v5_gn_4_169480.1 (CGS)	-0.16	-0.09	-0.24	-0.32	-0.35	-0.01	0.24	0.08	0.04	0.06	0.13	0.16	-0.11	-0.33	-0.32	-0.02	0.13	-1.08	0.7	0.21	0.1	0.12	-0.52	0.09	0.13	0.2	0.11	0.07	0.13	-0.01	-0.04
Lsat_1_v5_gn_4_36200.1 (PyrD)	-0.12	-0.12	-0.41	-0.37	-0.03	-0.14	0.2	0.35	0.03	0.08	0.07	0.21	0.21	0.08	0.03	-0.02	0.02	-0.76	-0.18	-0.13	-0.1	0.1	0.2	0.01	0.06	-0.08	-0.21	-0.05	0.04	0.19	0.33
Lsat_1_v5_gn_4_39300.1	0.18	-0.1	-0.16	-0.1	0.2	0.24	-0.08	0.19	-0.27	-0.25	0.01	-0.08	0.08	0.33	0.08	-0.16	-0.29	-1.31	0.16	-0.22	0.05	0.16	0.14	0.07	-0.0	0.04	-0.13	-0.2	0.18	0.11	0.35
Lsat_1_v5_gn_4_5880.1	0.04	-0.54	-0.84	-0.41	0.19	0.19	-0.21	0.09	-0.14	-0.16	-0.03	-0.04	0.21	0.32	0.23	0.1	-0.06	-1.32	0.27	-0.1	-0.08	0.09	0.22	0.14	0.06	0.13	-0.02	0.07	0.05	0.05	0.43
Lsat_1_v5_gn_5_113041.1	0.35	-0.22	-1.61	-2.09	-0.1	0.36	0.61	0.64	-0.44	-0.4	-0.36	-0.34	-0.92	0.5	0.98	0.26	-0.15	-0.51	0.65	0.2	-0.09	-0.13	-2.94	-0.33	-0.18	-0.07	0.02	-0.35	0.61	0.32	0.41
Lsat_1_v5_gn_5_126221.1 (AtIMP1a)	-0.27	-0.74	-0.81	-0.51	-0.21	0.23	-0.05	0.18	-0.21	-0.19	-0.02	-0.1	0.09	0.48	0.14	0.02	0.06	-0.35	-0.02	-0.04	-0.09	-0.14	0.59	0.09	0.28	0.11	0.15	-0.11	-0.11	0.05	0.5
Lsat_1_v5_gn_5_2441.1 (OZ1)	-0.15	-0.14	-0.53	-0.59	-0.28	0.1	-0.01	0.19	-0.12	-0.05	0.03	0.12	0.2	0.15	-0.07	0.17	0.14	-0.88	0.7	0.03	-0.01	0.07	-0.34	0.05	0.05	0.03	0.02	-0.13	0.03	0.14	0.27
Lsat_1_v5_gn_5_25621.1	0.0	-0.1	-0.18	-0.02	0.06	0.04	-0.05	-0.09	-0.03	-0.04	0.03	0.09	0.45	0.17	-0.1	-0.03	0.06	-1.23	-0.15	-0.03	-0.1	-0.01	-0.07	0.06	0.09	-0.03	-0.12	0.22	-0.08	0.11	0.43
Lsat_1_v5_gn_5_53060.1 (OVA2)	-0.02	-0.13	-0.19	-0.25	-0.15	-0.14	-0.07	-0.1	0.05	0.04	0.19	0.25	0.63	0.41	-0.01	-0.04	0.1	-1.85	-0.16	-0.03	-0.15	0.0	-0.82	0.22	0.05	-0.12	-0.09	0.16	-0.11	0.14	0.63
Lsat_1_v5_gn_5_56881.1 (EMB2799)	-0.11	-0.3	-0.45	-0.6	-0.03	0.02	-0.11	-0.3	0.04	0.01	0.2	0.29	0.77	0.23	0.03	-0.03	0.15	-0.97	0.22	-0.03	-0.16	-0.04	-0.86	0.33	0.17	-0.04	-0.13	0.23	-0.33	-0.07	0.56
Lsat_1_v5_gn_5_8001.1	-0.03	-0.3	-0.06	-0.16	0.06	0.29	0.01	-0.02	-0.05	0.07	0.08	0.14	0.35	0.15	0.03	0.09	0.11	-0.81	-0.2	-0.17	-0.18	-0.04	-0.6	0.03	0.07	0.01	0.12	-0.09	0.03	0.19	0.35
Lsat_1_v5_gn_5_89380.1 (SVR9)	-0.21	-0.24	-0.22	-0.13	0.01	0.05	-0.22	-0.29	0.07	0.04	0.16	0.2	0.43	0.43	0.21	0.03	0.05	-1.57	-0.11	0.01	-0.0	-0.02	-0.25	0.25	0.1	0.11	0.07	-0.02	-0.15	-0.04	0.26
Lsat_1_v5_gn_6_111081.1 (CGE2)	-0.11	-0.15	-0.28	-0.4	-0.29	-0.08	-0.1	0.01	-0.02	-0.0	0.16	0.26	0.34	-0.22	-0.4	-0.09	0.05	-1.26	0.09	0.01	0.09	0.11	-0.07	0.19	0.09	0.15	0.08	0.14	0.1	0.15	0.57
Lsat_1_v5_gn_6_115841.1 (FIONA)	0.05	-0.55	-0.56	-0.29	-0.1	0.1	0.11	0.0	0.09	0.08	0.22	0.27	0.6	0.28	-0.14	0.03	0.19	-1.54	-0.24	-0.1	-0.12	0.08	-0.92	0.29	0.25	-0.01	-0.02	0.27	-0.19	-0.07	0.44
Lsat_1_v5_gn_6_12120.1	-0.06	-0.23	-0.55	-0.45	-0.27	0.13	-0.36	-0.19	0.04	-0.11	0.14	0.15	0.17	0.51	0.38	0.06	-0.03	-1.0	0.17	0.15	0.07	0.23	-1.04	0.22	0.15	0.09	-0.02	0.02	0.04	0.11	0.34
Lsat_1_v5_gn_6_31540.1 (EVR3)	-0.14	-0.11	-0.58	-0.86	-0.35	0.03	-0.16	-0.07	0.02	-0.14	0.1	0.23	0.22	0.23	-0.09	0.05	0.04	-1.57	0.37	-0.01	0.04	0.12	-0.19	0.29	0.17	0.09	0.06	0.0	0.1	0.26	0.52
Lsat_1_v5_gn_6_5820.1 (SDP)	0.1	-0.09	-0.18	-0.11	-0.02	0.0	-0.09	-0.34	0.08	0.08	0.2	0.21	0.48	0.36	-0.03	-0.06	0.07	-2.17	-0.11	-0.08	-0.1	0.03	-1.09	0.1	0.07	0.04	0.04	0.18	-0.05	0.1	0.58
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.